Struktura proteinů - testík na procvičení Vladimíra Kvasnicová
Mezi proteinogenní aminokyseliny patří a) kyselina asparagová b) kyselina glutarová c) kyselina acetoctová d) kyselina glutamová
Mezi proteinogenní aminokyseliny patří a) kyselina asparagová b) kyselina glutarová toto není aminokyselina c) kyselina acetoctová toto není aminokyselina d) kyselina glutamová
O struktuře postranního řetězce aminokyselin platí: a) serin obsahuje SH- skupinu b) threonin obsahuje OH-skupinu c) histidin obsahuje pyridinový heterocyklus d) lyzin obsahuje guanidinovou skupinu
O struktuře postranního řetězce aminokyselin platí: a) serin obsahuje SH- skupinu obsahuje OH-skupinu b) threonin obsahuje OH-skupinu c) histidin obsahuje pyridinový heterocyklus d) lyzin obsahuje guanidinovou skupinu histidin obsahuje imidazolový heterocyklus lyzin obsahuje v postranním řetězci -NH 2 skupinu (guanidin je součástí struktury argininu)
Proteinogenní aminokyseliny obsahují a) α-aminoskupinu (s výjimkou prolinu) b) chirální uhlík (s výjimkou glycinu) c) D-konfiguraci na 2. uhlíku (s výjimkou Gly) d) alespoň jednu karboxylovou funkční skupinu
Proteinogenní aminokyseliny obsahují a) α-aminoskupinu (s výjimkou prolinu) b) chirální uhlík (s výjimkou glycinu) c) D-konfiguraci na 2. uhlíku (s výjimkou Gly) d) alespoň jednu karboxylovou funkční skupinu prolin je iminokyselina (obsahuje -NH- sk.) proteinogenní aminokyseliny mají konfiguraci L-
Aminokyseliny v proteinech L-α-aminokarboxylové kyseliny 21 kódovaných (proteinogenních) AMK další AMK vznikají posttranslační modifikací
Aminokyseliny můžeme rozdělit do skupin podle postranního řetězce: a) větvené: Val, Leu, Ile b) aromatické: Phe, Tyr, Trp, His, Pro c) obsahující síru: Cys, Met d) bazické: Asn, Gln
Aminokyseliny můžeme rozdělit do skupin podle postranního řetězce: a) větvené: Val, Leu, Ile b) aromatické: Phe, Tyr, Trp, His, Pro bez Pro c) obsahující síru: Cys, Met d) bazické: Asn, Gln amidy nemají bazický charakter (bazické: Lys, Arg, His)
V postranním řetězci a) glutamové kyseliny se může vytvořit záporný náboj b) serinu se vyskytuje sekundární alkoholová skupina c) cysteinu se vyskytuje thiolová skupina d) tyrozinu se vyskytuje fenolové jádro
V postranním řetězci a) glutamové kyseliny se může vytvořit záporný náboj Glu COOH Glu-COO - + H + b) serinu se vyskytuje sekundární alkoholová skupina primární (sek. alkoholovou sk. obsahuje threonin) c) cysteinu se vyskytuje thiolová skupina -SH d) tyrozinu se vyskytuje fenolové jádro
O vlastnostech aminokyselin platí a) valin má polární postranní řetězec b) tryptofan absorbuje záření v UV oblasti c) aminokyseliny jsou bezbarvé látky d) aminokyseliny patří mezi amfoterní látky
O vlastnostech aminokyselin platí a) valin má polární postranní řetězec nepolární b) tryptofan absorbuje záření v UV oblasti c) aminokyseliny jsou bezbarvé látky d) aminokyseliny patří mezi amfoterní látky v závislosti na ph roztoku mohou mít kladný nebo záporný náboj, při ph izoelektrického bodu je jejich celkový náboj nulový
Izoelektrický bod (pi) = ph při němž je celkový náboj sloučeniny nulový pi = (pk COOH + pk NH3+ ) / 2 Roztok AMK patří mezi amfolyty AMFION (= amfoterní elektrolyty)
AMK s nepolárním postranním řetězcem a) jsou dobře rozpustné ve vodě b) se podílejí na hydrofóbních interakcích c) mohou obsahovat aromatický kruh d) mají v postranním řetězci buď kladný nebo záporný náboj
AMK s nepolárním postranním řetězcem a) jsou dobře rozpustné ve vodě naopak b) se podílejí na hydrofóbních interakcích c) mohou obsahovat aromatický kruh Phe, Trp d) mají v postranním řetězci buď kladný nebo záporný náboj nemají žádný náboj v postranním řetězci
Při posttranslační modifikaci se může a) na serin vázat fosfát b) na threonin vázat sacharid c) cystein redukovat na cystin d) lyzin oxidačně deaminovat na allyzin
Při posttranslační modifikaci se může a) na serin vázat fosfát esterifikace b) na threonin vázat sacharid tvorba O-glykosidové vazby c) cystein redukovat na cystin jde o oxidaci 2 cysteinů d) lyzin oxidačně deaminovat na allyzin jde o důležitou modifikaci ε-aminoskupiny lyzinu (místo ní vzniká aldehydová skupina), díky níž se mezi molekulami kolagenu v extracelulární matrix vytvářejí kovalentní vazby za vzniku kolagenních vláken
Absorpce UV záření Tyr a Trp silně absorbují v UV oblasti při 250 300 nm možnost fotometr. stanovení Vazba jiných sloučenin na protein Ser, Thr, Tyr vazba fosfátu Ser, Thr vazba sacharidu Asn vazba sacharidu Tvorba disulfidových můstků (oxidace): 2 Cys-SH Cys-S-S-Cys ( cystin ) + 2H
K posttranslačně hydroxylovaným aminokyselinám patří a) 4-hydroxyfenylalanin b) 4-hydroxyprolin c) 5-hydroxylyzin d) 5-hydroxycitrulin
K posttranslačně hydroxylovaným aminokyselinám patří a) 4-hydroxyfenylalanin = tyrozin b) 4-hydroxyprolin vyskytuje se v kolagenu c) 5-hydroxylyzin vyskytuje se v kolagenu d) 5-hydroxycitrulin citrulin není kódovaná aminokyselina, tj. neúčastní se translace a tím pádem ani posttranslační modifikace
Modifikované AMK
Peptidová vazba a) je kovalentní vazba b) má planární strukturu c) vzniká kondenzací NH 2 skupiny jedné a COOH skupiny druhé aminokyseliny d) má vzorec CO-NH 2 -
Peptidová vazba a) je kovalentní vazba b) má planární strukturu c) vzniká kondenzací NH 2 skupiny jedné a COOH skupiny druhé aminokyseliny d) má vzorec CO-NH 2 - -CO-NH-
AMK jsou spojeny peptidovými vazbami pořadí AMK (primární struktura) je dáno geneticky sekvence AMK se čte od N- k C- konci
Ve struktuře proteinů mohou být tyto vazby: a) disulfidová vazba SH-SHb) iontová vazba COO - + H 3 N- c) hydrofóbní vazba mezi postranními řetězci dvou serinů d) vodíkový můstek mezi kyslíkem jedné a vodíkem druhé peptidové vazby
Ve struktuře proteinů mohou být tyto vazby: a) disulfidová vazba SH-SH- -S-S- v terciální strukt. b) iontová vazba COO - + H 3 N- v terc. a kvart. struktuře c) hydrofóbní vazba mezi postranními řetězci dvou serinů serin je polární AMK, může tvořit vodíkové můstky d) vodíkový můstek mezi kyslíkem jedné a vodíkem druhé peptidové vazby tento typ vazby se uplatňuje v sekundární struktuře proteinů
O struktuře proteinů platí: a) prim. struktura se čte od C- k N-konci b) skládaný list je příklad terciální struktury c) sekundární struktura je fixovaná H-můstky d) kvarterní strukturu mají jen proteiny složené z 2 a více polypeptidových řetězců
O struktuře proteinů platí: a) prim. struktura se čte od C- k N-konci b) skládaný list je příklad terciální struktury c) sekundární struktura je fixovaná H-můstky d) kvarterní strukturu mají jen proteiny složené z 2 a více polypeptidových řetězců primární struktura se čte od N- k C- konci skládaný list je příklad sekundární struktury kvarterní strukturu mají pouze proteiny složené z tzv. podjednotek
Čtyři úrovně struktury proteinu primární struktura sekundární struktury terciální struktura kvarterní struktura
Alosterický efekt a) souvisí se změnou prostorového uspořádání proteinu b) se vyskytuje u proteinů majících kvarterní strukturu c) má vždy za následek denaturaci proteinu d) souvisí s vytvořením kovalentních vazeb mezi podjednotkami
Alosterický efekt a) souvisí se změnou prostorového uspořádání proteinu a tím je ovlivněna i biologická aktivita proteinu b) se vyskytuje u proteinů majících kvarterní strukturu tj. u proteinů složených z podjednotek c) má vždy za následek denaturaci proteinu d) souvisí s vytvořením kovalentních vazeb mezi podjednotkami mezi podjednotkami se v různé míře uplatňují jen slabé nevazebné interakce
denaturace = ztráta sek., terc. a kvart. struktury proteinu a tím i jeho biologické aktivity; příčiny: teplo, mechanické účinky (třepání), záření prudké změny ph, soli těžkých kovů, organická rozpouštědla, detergenty
Fibrilární proteiny a) se označují jako sferoproteiny b) bývají ve vodě nerozpustné c) se vyskytují např. v extracelulární matrix d) mají ve své molekule převahu jednoho typu sekundární struktury
Fibrilární proteiny a) se označují jako sferoproteiny skleroproteiny b) bývají ve vodě nerozpustné např. kolagen c) se vyskytují např. v extracelulární matrix d) mají ve své molekule převahu jednoho typu sekundární struktury
Proteiny mají tyto vlastnosti: a) barevné jsou pouze pokud obsahují hodně aromatických AMK b) účinkem vysoké teploty často denaturují c) jsou-li rozpustné vytvářejí koloidní roztoky d) chovají se jako amfolyty
Proteiny mají tyto vlastnosti: a) barevné jsou pouze pokud obsahují hodně aromatických AMK barevné mohou být díky prostetické sk. b) účinkem vysoké teploty často denaturují c) jsou-li rozpustné vytvářejí koloidní roztoky d) chovají se jako amfolyty tj. v závislosti na ph jsou molekuly proteinů buď kladně nebo záporně nabité, při ph izoelektrického bodu je celkový náboj proteinu nulový