Odhad plemenné hodnoty u plemene Salers

Transkript

1 Odhad plemenné hodnoty u plemene Salers

2 Základní statistické analýzy polního testu Rok zpracování 2000 počet průměr smodch min max průběh porodu PP ,09 0,36 1,00 4,00 porodní hmotnost porhm ,91 6,30 20,00 90,00 hmotnost 120 dní Teo ,72 31,06 70,00 270,00 hmotnost 210 dní Teo ,19 50,21 90,00 448,00 hmotnost 365 dní Teo ,49 85,01 150,00 731,00 Rok zpracování 2017 počet průměr smodch min max průběh porodu PP ,10 0,38 1,00 4,00 porodní hmotnost porhm ,96 5,94 10,00 99,00 hmotnost 120 dní Teo ,57 31,62 39,00 355,00 hmotnost 210 dní Teo ,35 47,98 52,00 499,00 hmotnost 365 dní Teo ,67 97,96 69,00 788,00

3 Genetika Kvalitativní znaky Rohatost, bezrohost, barva, Jsou řízeny jedním genem nebo několika geny tzv. velkého účinku (major geny) Mají diskontinuitní proměnlivost. Tvoří alternativní fenotypy. Fenotyp není vůbec nebo jen málo ovlivněn prostředím. Kvantitativní vlastnosti Jedná se především o užitkovost. Jsou řízeny několika geny tj. polygenně a geny tzv. malého účinku (minor geny). Proměnlivost je plynulá kontinuitní odpovídající normálnímu rozdělení. Fenotyp je podstatně ovlivněn prostředím. Genetika populací = každá větší skupina organismů (rostlin, zvířat,.) stejného původu (rozšířená na určitém území). Praktickou aplikací genetiky populací je šlechtění zvířat.

4 ODHAD PLEMENNÉ HODNOTY Y = ROK + PO + VEM + HET + HEM + SRO + PHP + PHM + TP + e Fixní efekty ROK - třídy podle roku narození zvířat s užitkovostí PO - pohlaví telete - skupina VEM - věk matky telete HET - heterózní efekt projevující se na telatech HEM - heterózní efekt projevující se na matkách

5 ODHAD PLEMENNÉ HODNOTY ROK - třídy podle roku narození zvířat s užitkovostí Hmotnost 120 Hmotnost 210 Hmotnost

6 ODHAD PLEMENNÉ HODNOTY PO - pohlaví telete - skupina Průběh porodu Porodní hmotnost 0,045 0,04 0,035 0,03 0,025 0,02 0,015 0,01 0,005 0 byk jalovice dv_byk dv_jalovice byk jalovice dv_byk dv_jalovice byk jalovice dv_byk dv_jalovice H120 H210 H365

7 ODHAD PLEMENNÉ HODNOTY VEM - věk matky telete 0-0,02-0,04-0,06-0,08-0,1-0,12-0,14-0,16 Průběh porodu ,8 1,6 1,4 1,2 1 0,8 0,6 0,4 0,2 0 Hmotnost při narození Hm120 Hm210 Hm365

8 ODHAD PLEMENNÉ HODNOTY HET - heterózní efekt projevující se na telatech HEM - heterózní efekt projevující se na matkách Průběh porodu Vliv heterózního efektu jedince na hmotnost 0-0,005-0,01-0,015-0,02-0,025 0,1 0,2 0,3 0,4 0,5 0,6 0,7 0,8 0, ,8 1,6 1,4 1,2 1 0,8 0,6 0,4 0,2 0 0,1 0,2 0,3 0,4 0,5 0,6 0,7 0,8 0,9 1 het. Efekt Jedinec het. Efekt Matky Hm120 Hm210 Hm Vliv heterózního efektu matky na hmotnost telat 0-1 0,1 0,2 0,3 0,4 0,5 0,6 0,7 0,8 0,9 1-2 Hm120 Hm210 Hm365

9 Náhodné efekty SRO - skupina vrstevníků, uvnitř které je jedinec porovnáván na základě vlastní užitkovosti PHP - jedinec, plemenná hodnota pro přímý genetický efekt jedince ( jeho vlastní růstová schopnost) se zohledněním vzájemných příbuzností a skupin podle plemene. Dědí se na potomstvo. PHM - jedinec, plemenná hodnota pro maternální genetický efekt jedince ( vliv mléčnosti matky na růst potomstva, ale i dalších jejích vlastností) se zohledněním vzájemných příbuzností a skupin podle plemene. Dědí se na potomstvo. TP - trvalé mateřské prostředí pro krávy s užitkovostí ( se zváženými telaty ) e - působení náhodných nekontrolovatelných činitelů na projev užitkovosti

10 SRO - skupina vrstevníků, uvnitř které je jedinec porovnáván na základě vlastní užitkovosti Sdružuje jedince se stejnými podmínkami prostředí Umožňuje posouzení vlivu genetiky a prostředí Genetický vliv => posouzení odchylek mezi skupinami geneticky příbuzných zvířat Vliv prostředí => posouzení uvnitř různých skupin příbuzných zvířat Plemeno - skupina neznámých předků v rodokmenu 0,15 0,1 0,05 0-0,05-0, Vývoj PH obtížnost porodu přímý efekt MS HE AA CH

11 PHP - plemenná hodnota pro přímý genetický efekt jedince PHM - plemenná hodnota pro maternální genetický efekt jedince

12 PHP - plemenná hodnota pro přímý genetický efekt jedince PHM - plemenná hodnota pro maternální genetický efekt jedince Otec BINGO LOSER Dědičné založení jedince Matka BINGO LOSER Tele BINGO BINGO

13 PHP - plemenná hodnota pro přímý genetický efekt jedince PHM - plemenná hodnota pro maternální genetický efekt jedince Otec BINGO LOSER Dědičné založení jedince Matka BINGO LOSER Tele LOSER LOSER

14 PHP - plemenná hodnota pro přímý genetický efekt jedince PHM - plemenná hodnota pro maternální genetický efekt jedince Otec BINGO LOSER Dědičné založení jedince Matka BINGO LOSER Tele BONEO LOSER

15 PHP - plemenná hodnota pro přímý genetický efekt jedince PHM - plemenná hodnota pro maternální genetický efekt jedince Dědičné založení jedince Otec Matka ½ přímý ½ maternální ½ přímý ½ maternální Tele

16 PHP - plemenná hodnota pro přímý genetický efekt jedince PHM - plemenná hodnota pro maternální genetický efekt jedince Užitkovost jedince Otec Matka ½ přímý efekt ½ přímý efekt Maternální efekt matky Trvalé prostředí matky Tele

17 PHP - plemenná hodnota pro přímý genetický efekt jedince PHM - plemenná hodnota pro maternální genetický efekt jedince Maternální Užitkovost efekt jedince od otce? Otec Matka ½ přímý efekt ½ přímý efekt Maternální efekt matky Projeví se až u potomků telete!!!! Trvalé prostředí matky Tele

18 PHP - plemenná hodnota pro přímý genetický efekt jedince PHM - plemenná hodnota pro maternální genetický efekt jedince Proč není MeRU ukazatelem mléčnosti krávy: MeRU = 1/3 (MeRU120 + MeRU210 + MeRU365) Největší vliv matky na užitkovost potomka

19 Býci BA ve Francii podle MERPSev odstavová hmotnost potomstva u dcer Nom Animal N Animal IFNAIS CRSEV DMSEV DSSEV ISEVR/Cd AVEL ALAIT MERPSEV IVMAT/Cd MAXWELL FR , ,45 VALLON FR , ,80 VERTIGE FR , ,80 EON FR , ,64 VELOURS FR , ,95 Býci BA ve Francii podle ALAIT mléčnost dcer Nom Animal N Animal IFNAIS CRSEV DMSEV DSSEV ISEVR/Cd AVEL ALAIT MERPSEV IVMAT/Cd CLAIRON FR , ,80 ELEGANT FR , ,70 OPOSSUM FR , ,70 JACQUOT FR , ,62 PANACHE FR , ,73 Vysvětlivky: IFNAIS snadnost telení, CRSev odstavová hmotnost, DMSev osvalení DSSev skelet, ISEVR syntetický index pro přímý efekt, AVEL snadnost telení dcer, ALAIT mléčnost, MERPsev odstavová hmotnost potomstva dcer, IVMAT syntetický index pro maternální efekt,

20 TP - trvalé mateřské prostředí pro krávy s užitkovostí (se zváženými telaty) Negenetický efekt nepředává se na potomky, ale ovlivňuje je Určuje, jestli je dobrá matka => selekce uvnitř stáda Do jisté míry koriguje genetickou predispozici Zohledňuje špatný odchov nebo jiné skutečnosti, kvůli kterým je objektivně špatnou matkou Jedná se o dobrou matku? ½ přímý efekt + maternální efekt + trvalé prostředí matky

21 Užitkovost vybraných krav jed porot mezid Teo120 Teo210 Te365 Ph120 Ph210 Ph PE 6,51 16,92 20,39 ME 7,62 10,78 13,49 TP 10,28 16,56 22, PE 14,33 21,76 12,28 ME -7,43-13,01-16,05 TP -6,06-12,40-13, PE 9,05 10,94 19,18 ME -9,64-11,77-19,71 TP -6,93-8,34-1, PE 4,45 18,40 24,86 ME -0,97-4,10-3,23 TP -6,42-5,42-9, PE 2,43 20,04 24,63 ME 0,90-2,34-0,70 TP 5,53 6,53 4,77

22 Co dále ovlivňuje předpověď PH? DATABÁZE

23 Co dále ovlivňuje předpověď PH? Záznamy porodních hmotností a průběhu porodu Harémové připouštění opravy původů Vážení telat Hlášení úhynů, porodů

24 Záznamy porodních hmotností Co dále ovlivňuje předpověď PH?

25 GENETICKÉ KORELACE PRO ČESKOU REPUBLIKU Plemeno Vlastnost FRA GBR IRL DEU CHE DFS Odstavová hmotnost 0,79 0,74 0,85 0,77 0,86 0,88 LIM Průběh porodu 0,61 0,73 0,61 0,72 Hmotnost při narození 0,92 0,80 0,84 0,85 Odstavová hmotnost 0,90 0,78 0,78 0,78 0,88 CHA Průběh porodu 0,68 0,72 0,70 Hmotnost při narození 0,59 0,66 0,64

26 Co dále ovlivňuje předpověď PH? Počty a podíl telat po harémech (stav k ) celkem otec je harém Plem chovů telat chovů telat podíl AA ,8% BA ,7% HE ,3% CH ,3% LI ,3% MS ,8% UU ,5% PI ,6% Celkem ,3%

27 Co dále ovlivňuje předpověď PH? Harémové připouštění opravy původů odhad RPH k odhad RPH k Harém otec 1 otec 2 otec 3 Harém otec 1 otec 2 otec 3 otec 4 PePP PeRU MePP MeRU telat ks

28 Co dále ovlivňuje předpověď PH? vážení telat Vývoj počtu vážených zvířat ročník narození 2016 podle termínu zpracování plemenných hodnot Zpracování telat 120 dní podíl% 210 dní podíl% 365 dní podíl% ,8% 0 0,0% 0 0,0% ,2% 19 11,9% 0 0,0% ,2% 54 28,7% 2 1,1% ,7% 98 52,1% 25 13,3% ,3% ,2% 45 23,9% ,3% ,3% 49 26,1% ,3% ,3% 51 27,1% Přehled o počtu vážení telat - ročník 2016 Ke zvážení 1x podíl % 2x podíl % 3x podíl % 0 podíl % ,6% 55 37,2% 27 18,2% 18 12,2%

29 Frekvence vážených telat v KUMP podle vybraných plemen - ČR Plemeno CH k vážení váženo 1x váženo 2x váženo 3x neváženo ,0% ,6% ,5% 394 8,9% Plemeno LI k vážení 1x podíl 2x podíl 3x podíl 0 podíl ,1% ,0% ,9% ,0% Plemeno MS k vážení 1x podíl 2x podíl 3x podíl 0 podíl ,6% ,5% ,6% ,3% Plemeno AA k vážení 1x podíl 2x podíl 3x podíl 0 podíl ,7% ,6% ,9% 0 0 Plemeno GA k vážení 1x podíl 2x podíl 3x podíl 0 podíl ,0% 60 25,4% 59 25,0% 65 27,5%

30 Rozbor konkrétního chovu Počty narozených a zvážených telat - vrstevníci rok počet teo120 teo210 teo

31 Průměrné hmotnosti rok počet porhm teo120 teo210 teo průměr

32 Hmotnosti a počty podle datumu vážení pro 210 dní rok Dat vaz počet porhm teo120 teo neváženo Celkový součet

33 Rozdělení odhadu plemenných hodnot podle plemen Plemenné hodnoty k nerozdělené, společný výpočet pp porhm teo120 teo210 teo365 Mpp MporHm Mteo120 Mteo210 Mteo365 HI Počet Průměr -0,04-8,09-38,84-67,77-111,55-0,04 1,07-2,63-2,79-9,25 GA Počet Průměr -0,05-5,44-22,22-38,29-63,59-0,03 0,54-2,63-3,06-8,22 TX Počet Průměr -0,03-3,44-13,88-23,94-32,91-0,02 0,35-1,39-1,02-3,89 SS Počet Průměr -0,01-1,01 1,24-0,50-3,26 0,01 0,31 0,50 1,15 0,52 Plemenné hodnoty k rozdělená plemena, oddělený výpočet pp porhm teo120 teo210 teo365 Mpp MporHm Mteo120 Mteo210 Mteo365 HI počet Průměr 0,00-1,61-15,22-33,19-50,50-0,02-0,51-4,53-1,77-5,92 GA Počet Průměr -0,01 0,02 0,47 1,32-5,42-0,01 0,41 0,54 0,09-1,94 TX Počet Průměr -0,03-2,03-2,38-21,58-21,48-0,01-0,19-0,78 2,36 0,66 SS Počet Průměr 0,02 1,96 21,55 37,96 61,49 0,04 0,35 4,92 6,46 10,93

34 Salers variabilita počtu zvířat a hmotností podle období zpracování PH Zpracování PorHM PP Teo120 Teo210 Teo365 k Počet Průměr Smodch k Počet Průměr Smodch k Počet Průměr Smodch k Počet Průměr smodch Podíl rozdílů RPH podle zpracování (odchylka -5 nebo +5) Zpracování PePP PeRU MePP MeRU ,21% 93,65% 95,04% 93,30% ,04% 98,55% 99,01% 98,33% Korelace mezi RPH podle zpracování PePP PeRU MePP MeRU ,998 0,955 0,968 0, ,998 0,985 0,982 0, ,999 0,991 0,994 0,983 PePP PeRU MePP MeRU ,998 0,979 0,973 0, ,998 0,979 0,985 0, ,999 0,991 0,994 0,983

35 Odhad plemenných hodnot k korelace RPH a PP PorHm Přímý efekt 120 dní 210 dní 365 dní mapp mapor HM Maternální index ma120 ma210 ma365 PePP PeRU MePP MeRU AA 0,995 0,997 0,998 0,998 0,996 0,989 0,991 0,996 0,996 0,994 0,995 0,998 0,989 0,996 BA 0,997 0,998 0,998 0,997 0,995 0,995 0,989 0,994 0,989 0,992 0,997 0,997 0,991 0,992 MS 0,994 0,997 0,996 0,995 0,996 0,984 0,989 0,990 0,988 0,991 0,996 0,996 0,985 0,990 CH 0,995 0,997 0,997 0,997 0,995 0,987 0,985 0,993 0,993 0,994 0,996 0,997 0,983 0,993 LI 0,989 0,995 0,997 0,997 0,996 0,982 0,984 0,992 0,990 0,991 0,993 0,997 0,982 0,992 GA 0,983 0,994 0,996 0,995 0,985 0,984 0,977 0,980 0,973 0,926 0,988 0,993 0,980 0,965 SA 0,992 0,997 0,994 0,995 0,995 0,982 0,984 0,983 0,991 0,975 0,995 0,995 0,986 0,984 Odchylky RPH mezi odhadem a odchylka od +5 do -5 PePP PeRU MePP MeRU AA 99,9% 99,9% 99,4% 99,8% BA 99,9% 99,8% 99,7% 99,7% MS 99,9% 99,6% 99,1% 99,6% CH 99,9% 99,7% 98,9% 99,7% LI 99,7% 99,8% 99,1% 99,7% GA 99,9% 99,2% 99,1% 96,2% SA 99,5% 99,5% 99,5% 88,6%

36 Porovnání hmotností býků narozených podle odchylek RPH mezi výpočtem za prosinec a březen - SALERS a více -5 až a méně hn h120 h210 h365 narození počet podíl % až ,62% a méně 5 3,16% a víc 43 27,22%

37 Změny RPH pro růst u telat stav k stav k jedinec pohl porhm pp teo120 teo210 teo365 rph120 rph210 rph365 rozdíl teo120 teo210 teo365 rph120 rph210 rph365 1 b j j Změny RPH pro průběh porodu stav k stav k jedinec pohl porhm pp rphpp rphpohm rozdíl rphpp rphpohm 1 prvot

38 Práce s RPH v chovu plemeno SA Hmotnosti býků podle RPH matky MsirPePP PoHm Teo120 Teo a méně celkem Otec rph 95 a méně MsirPePP PoHm Teo120 Teo a méně celkem Otec rph 106 a víc MsirPePP PoHm Teo120 Teo a méně celkem

39 Býci BA podle IFNAIS 120 až 139 ve Francii z 5424 býků jich je 54 kusů, maternál jich má 33 CRSev DMSev DSSev Avel pásmo počet podíl počet podíl počet podíl počet podíl 85 až ,9% 3 5,6% 23 42,6% 15 45,5% 90 až ,2% 6 11,1% 14 25,9% 6 18,2% 95 až ,5% 9 16,7% 9 16,7% 7 21,2% 100 až ,1% 12 22,2% 5 9,3% 2 6,1% 110 až ,6% 18 33,3% 3 5,6% 3 9,1% 115 až ,7% 3 5,6% 0 0,0% 0 0,0% 116 a víc 0 0,0% 3 5,6% 0 0,0% 0 0,0%

40 Hmotnosti býků podle RPH matky MsirPeRU PoHm Teo120 Teo a méně a víc celkem Otec rph 95 a méně MsirPeRU PoHm Teo120 Teo a méně a víc celkem Otec rph 106 a víc MsirPeRU PoHm Teo120 Teo a méně a víc celkem

41 Hmotnosti býků podle RPH matky (mat. efekt) MsirMeRU PoHm Teo120 Teo a méně a více celkem Otec rph 95 a méně MsirMeRU PoHm Teo120 Teo a méně a více celkem Otec rph 106 a víc MsirMeRU PoHm Teo120 Teo a méně a více celkem

42 Vývoj PH podle ročníku narození narození počet pp porhm 120 dní 210 dní 365 dní ,098-3,70-2,96-14,90-19, ,103-3,52-1,00-8,81-10, ,089-3,63-2,94-11,29-13, ,098-3,03 4,29-3,88-14, ,092-2,75 3,77-3,41-8, ,093-2,98 3,18-4,70-9, ,091-2,85-0,02-9,80-20, ,093-3,01 2,17-7,60-7, ,088-3,12 1,19-6,44-7, ,084-3,29 2,57-1,80 2, ,084-3,21 0,68-5,36-0, ,078-3,04 3,04 0,05 6, ,071-2,64 5,93 3,65 11, ,071-2,76 6,96 4,62 10, ,061-2,14 8,06 7,48 15, ,050-2,61 5,41 4,88 11, ,059-2,39 6,98 6,25 14, ,052-1,77 6,70 5,59 15,77 celkem ,073-2,69 4,37 0,39 3,97

43 Flavie ED FR narozena: plemeno LI efekt RPH ČR PH ČR spol CHE DEU DFS FRA GBR IRL Vlastní užitkovost a potomstvo Potom. 4 vlastní 1 P0tom. 5 vlastní 0 přímý inter. maternál inter. přímý ČR mater ČR ,6 0,36 10,7 17,6 17,1 14,4 18,6 22, ,8 0,42 6,2 16,9 8,4 6,2 6,4 11, , ,3 Výpočet RPH podle zapojených zemí pro krávu Flávie ED CZE CHE DEU DNK FRA GBR IRL PeRU MeRU

44 Děkuji za pozornost Karel Šeba Dne: