VIRY JAKO PŮVODCI STŘEVNÍCH INFEKCÍ INTEGROVANÝ PREKLINICKÝ BLOK MIKROBIOLOGIE, PATOLOGIE, INFEKČNÍHO LÉKAŘSTVÍ A DALŠÍCH KLINICKÝCH OBORŮ

Transkript

1 VIRY JAKO PŮVODCI STŘEVNÍCH INFEKCÍ INTEGROVANÝ PREKLINICKÝ BLOK MIKROBIOLOGIE, PATOLOGIE, INFEKČNÍHO LÉKAŘSTVÍ A DALŠÍCH KLINICKÝCH OBORŮ

2 AKUTNÍ PRŮJMOVÁ ONEMOCNĚNÍ CELOSVĚTOVĚ: 3-5 miliard případů ročně / 5-10 mil úmrtí 700 mil děti < 5 let / 3-5 mil úmrtí ročně u dětí jsou nejčastějšími původci viry ČR: cca případů ročně EPIDAT ČR r r Salmonelózy Kampylobakteriózy Virové gastroenteritidy Gastroenteritis vs. infekční

3 VIROVÉ GASTROENTERITIDY od r viry podezřívány z etiologie r identifikace Norwalk viru ve stolici /Kapikian et al./ r rotaviry /Bishop et al./ r astroviry, střevní adenoviry Coronaviry /SARS-CoV, Toroviry/, Parechoviry, Picobirnaviry příčina mnoha akutních GE zůstává neznámá i v rozvinutých zemích PCR určí etiologii 85% klinicky významných případů a pouze 46% u mírných GE

4 VIROVÉ GASTROENTERITIDY viry vylučovány stolicí ( /ml stolice) neobalené viry odolné v zevním prostředí rezistentní vůči běžným desinfekčním prostředkům odolné vůči účinkům žluči, střevních proteáz fekálně-orální přenos malá infekční dávka ( virů) přímý kontakt kontaminované předměty potraviny, voda nozokomiální infekce

5 DIAGNOSTIKA etiologickou diagnózu je možné stanovit pouze na základě průkazu virů v nativní stolici ostatní laboratorní vyšetření jsou nezbytná pouze k posouzení stupně dehydratace

6 DIAGNOSTIKA PRŮKAZ VIRU VE STOLICI: 1. ELEKTRONOVÁ MIKROSKOPIE náročné na vybavení, nízká dostupnost v ČR 2. (KULTIVACE nevhodná pro rutinní diagnostiku - náročná, pomalá noroviry nelze kultivovat) 3. DETEKCE ANTIGENU - komerčně dostupné, rychlé (10 15 min), rutinně latexová aglutinace EIA imunochromatografie 4. DETEKCE NUKLEOVÉ KYSELINY /PCR/ - vysoká citlivost, vysoká cena, zatím ne rutinní diagnostika

7 ELEKTRONOVÁ MIKROSKOPIE

8 LATEXOVÁ AGLUTINACE

9 EIA, IMUNOCHROMATOGRAFIE

10 ROTAVIRY Č: Reoviridae R: Rotavirus neobalené RNA viry v el. mikroskopu tvar kola s loukotěmi (dvojitá kapsida) 7 séroskupin (A-G) lidské A,B,C v každé séroskupině několik sérotypů (G1-G15, P1-P20) G,P proteiny jsou schopné vyvolat tvorbu neutralizačních protilátek

11 ROTAVIRY reinfekce jsou časté pro nekompletní a krátkodobou imunitu ke kompletní imunitě je třeba opakovaných infekcí vnímavost k nákaze je celoživotní imunita - lokální střevní IgA protilátky novorozenci, kojenci < 2 měsíce onemocní vzácně (kolostrum, mat.mléko - IgA) největší riziko pro malé děti (4 měsíce 3 roky) těžký průběh primoinfekce dehydratace dospělí bezpříznakově, lehký průběh starší, imunokompromitovaní těžký průběh

12 ROTAVIRY vylučují se 7 10 dní po nákaze (protrahované vylučování u imunokompromitovaných) sezónní výskyt zima, časné jaro (leden-květen) nevyvolávají velké epidemie lokální epidemie v menších kolektivech (jesle, školky, domovy důchodců) inkubační doba 48 hodin projevy horečka, zvracení, průjem primoinfekce těžký průběh s dehydratací, často hospitalizace (v Evropě odpovídají za % případů GE vyžadujících hospitalizaci) nejčastější nozokomiální nákaza na dětských odděleních

13 ROTAVIRY VAKCINACE od r v ČR k dispozici 2 živé perorální atenuované vakcíny ROTARIX atenuované lidské rotaviry 2 dávky ROTATEQ bovinní rotaviry s genem pro lidský VP 7 (G protein) 3 dávky děti > 6 týdnů, nezahajovat po 15 týdnu o 85 96% redukují potřebu hospitalizace z důvodů těžkých infekcí

14 Č: Caliciviridae R: Norovirus R: Sapovirus KALICIVIRY (NOROVIRY) neobalené RNA viry zatím se nepodařilo vykultivovat nelze serotypizovat pouze RT-PCR a sekvenace 5 genoskupin (u lidí nejspíše GI, GII)

15 NOROVIRY sezónní výskyt zimní měsíce velké epidemie (armáda, výletní lodi, školy) postihují spíše starší děti a dospělé krátkodobá imunita, opakované infekce běžné vylučování stolicí až 2 týdny inkubační doba 12 až 48 hodin průběh většinou mírný (2-3 dny) zvracení, křeče, průjem /většinou afebrilní/

16 Č: Astroviridae ASTROVIRY R: Mamastrovirus savčí (lidské HAstV 1-8) R: Avastrovirus ptačí neobalené RNA viry v el. mikroskopu tvar 5-ti nebo 6-ticípé hvězdy není sérotypově zkřížená imunita, existence sérotypově specifické imunity zatím není úplně zřejmá opakované infekce běžné

17 ASTROVIRY celosvětově rozšířené častěji u malých dětí a starších dospělých sezónní výskyt pozdní zima, jaro vylučování viru až 2 týdny inkubační doba 3 dny průběh mírný, kratší trvání a lehčí průběh než ostatní virové GE obvykle bez horečky a zvracení hospitalizace jen vzácně

18 STŘEVNÍ ADENOVIRY Č: Adenoviridae neobalené DNA viry 51 sérotypů průjmová onemocnění způsobují tzv. enteroadenoviry sérotypy 40, 41

19 celoroční výskyt STŘEVNÍ ADENOVIRY postihuje především malé děti inkubační doba 8-10 dní průběh horečka, zvracení, průjem (lehčí než rotavirová GE), delší trvání (1-2 týdny) rozvinutých zemích incidence 1 8 %

20 DALŠÍ MOŽNÍ PŮVODCI VIROVÝCH GASTROENTERITID KORONAVIRY (RNA viry) SARS-CoV 38 % infikovaných pacientů mělo průjem, někteří jako jediný projev infekce tropismus viru také ke střevnímu epitelu pouze mírné onemocnění, žádné úmrtí v souvislosti s průjmovým onemocněním TOROVIRY GE u imunokompromitovaných pacientů PARECHOVIRY (RNA viry) dříve řazeny pod ECHOVIRY (ECHO 22,23) mírné projevy GE a resp. infekce PICOBIRNAVIRY (RNA viry) GE u imunokompromitovaných pacientů CMV HIV

21 VIROVÉ GASTROENTERITIDY Pazdiora P. a spol., Epidemiol Mikroiol Imunol Nov:58(4): pacientů FN Plzeň s akutní GE v r Salmonella spp. 15,4 %, rotavirus 11,2 %, noroviry 10,0 %, Campylobacter spp. 3,9 % a střevní ADV 3,6 % (detekce astrovirů neprováděna)