Návod k použití. Devyser Resolution 13 v2 Kat. No.: 8-A Devyser Resolution XY v2 Kat. No.: 8-A012.2-XY. For in vitro Diagnostic Use
|
|
- Richard Svoboda
- před 7 lety
- Počet zobrazení:
Transkript
1 Devyser Resolution 21 v2 Kat. No.: 8-A Devyser Resolution 18 v2 Kat. No.: 8-A Devyser Resolution 13 v2 Kat. No.: 8-A Devyser Resolution XY v2 Kat. No.: 8-A012.2-XY For in vitro Diagnostic Use Návod k použití Stránka 1 z 32
2 Obsah Obsah 2 1. Seznámení se systémem Devyser Resolution v2 4 Použití 4 Obsah soupravy 4 Postup 4 Princip metody 4 2. Upozornění 6 3. Symboly použité na štítcích 7 4. Požadovaný materiál Součástí kitu 8 Konfigurace 8 Složky Devyser Resolution 21 v2 8 Složky Devyser Resolution 18 v2 8 Složky Devyser Resolution 13 v2 8 Složky Devyser Resolution XY v Požadované položky, které nejsou v soupravě 8 Příprava reagencií 8 Extrakce DNA 8 Amplifikace 9 Detekce 9 Size Standard Souprava pro barevnou kalibraci 9 5. Skladování a nakládání se soupravou Požadavky na vzorek 11 Klinické vzorky 11 Postup a skladování 11 Kontroly Návod k použití Pracovní postup Devyser Resolution 21, 18, 13 a XY v Příprava vzorků a amplifikace PCR 12 Extrakce DNA 12 Přidání vzorku 12 Amplifikace Detekce 14 Příprava vzorků 14 Příprava vzorku pro kapilární elektroforézu 14 Příprava přístroje 14 Run Modules Výsledky a analýza 16 Stránka 2 z 32
3 Principy QF-PCR 16 Marker pro X chromozóm 18 Nepolymorfní markery 19 Pseudoautozomální XY markery 19 Přehled markerů Devyser Resolution v2 20 Přehled markerů Devyser Resolution 18 v2 20 Přehled markerů Devyser Resolution 13 v2 21 Přehled markerů Devyser Resolution XY v2 21 Provádění analýzy 22 Poměrová kritéria (Ratio Criteria RC) 22 Markery se dvěma píky 22 Markery se třemi píky 22 Výškový poměr 22 Interpretace výsledků 22 Troubleshooting 23 Artefakty PCR 24 Elektroforetické artefakty Klinická studie 27 Devyser Resolution v2 (8-A012.2) 27 Sensitivita 27 Specificita 27 Opakovatelnost Limitace použití Reference Upozornění zákazníkům Kontaktní informace 32 Stránka 3 z 32
4 1. Seznámení se systémem Devyser Resolution v2 Použití Souprava Devyser Resolution v2 je in vitro diagnostický produkt pro diagnózu aneuploidií chromozomů 21. Souprava Devyser Resolution 18 v2 je in vitro diagnostický produkt pro diagnózu aneuploidií chromozomů 18. Souprava Devyser Resolution 13 v2 je in vitro diagnostický produkt pro diagnózu aneuploidií chromozomů 13. Souprava Devyser Resolution XY v2 je in vitro diagnostický produkt pro diagnózu aneuploidií chromozomů X a Y. Obsah soupravy Souprava Devyser Resolution v2 obsahuje reagencie připravené k použití pro PCR amplifikace genetických markerů. Postup DNA extrakce: Souprava Devyser Resolution v2 byla validována s použitím QIAamp DNA Blood Mini Kit (Qiagen, kat. č ) pro extrakci DNA z lidské krve a amniotické tekutiny; QIAamp DNA Mini Kit (Qiagen, kat. č ) pro extrakci DNA z biopsií choriových klků. Amplifikace: Souprava Devyser Resolution v2 byla validována s využitím PCR cycleru ABI GeneAmp System Detekce: Genetické analyzátory Applied Biosystems (ABI 310, 3100, 3130, 3500, 3730) a MegaBACE podporující detekci Dye-Set DEV-5. Princip metody Kvantitativní fluorescenční PCR (QF-PCR) zahrnující amplifikaci, detekci a analýzu krátkých opakujících se sekvencí (STR) a konzervativních sekvencí. Pro amplifikaci chromozom specifických sekvencí se používají fluorescenčně značené primery, takže počet kopií každé sekvence odpovídá počtu příslušných chromozomů. Vzniklé PCR produkty jsou separovány a analyzovány pomocí automatického genetického analyzátoru. Relativní množství každé alely je kvantifikováno pomocí výpočtu poměru obsahu píků, příp. jejich výšek. Normální diploidní vzorek obsahuje příspěvek obou somatických chromozomů. Dvě alely chromozom specifické STR sekvence jsou detekovány jako dva píky v poměru 1:1, pokud je marker heterozygotní a jako jeden pík, pokud je marker homozygotní. Stránka 4 z 32
5 Detekce další alely prostřednictvím tří píků v poměru 1:1:1 nebo jako dva píky v poměru 2:1 resp. 1:2 znamená přítomnost další STR sekvence, která může znamenat přítomnost dalšího chromozomu, jako je tomu u trizomie. Stránka 5 z 32
6 2. Upozornění A. Devyser Resolution 21, 18, 13 a XY v2 sady byly ověřeny pomocí PCR celkový reakční objem 25 µl.změna reakčního objemu může vést k nesprávným výsledkům. B. Předejděte mikrobiální kontaminaci při vyjímání alikvotů z reakčních zkumavek. Doporučujeme používat špičky s filtry. C. Nemíchejte reagencie z různých šarží ani z různých zkumavek stejné šarže. D. Nepoužívejte soupravu s prošlou záruční lhůtou. E. Nepoužívejte otevřené nebo poškozené reagenční zkumavky. F. Práce v laboratoři má postupovat jedním směrem. Začíná přípravou reagencií, postupující do prostoru pro extrakci DNA, do prostoru pro amplifikaci DNA a nakonec do prostoru pro detekci.příprava reagencií a extrakce DNA provádějte v oddělených prostorách. Přístroje i spotřební materiál má být lokalizován pouze v příslušném prostoru a nesmí se přenášet mezi těmito oddělenými prostory. V příslušném prostoru používejte rukavice a při jeho opouštění je vyměňte za nové.přístroje ani spotřební materiál pro přípravu reagencií nepoužívejte pro extrakci DNA. Přístroje a spotřební materiál pro amplifikaci a detekci nepřenášejte mimo tyto prostory. Přístroje ani spotřební materiál pro přípravu reagencií nepoužívejte pro extrakci DNA. Přístroje a spotřební materiál pro amplifikaci a detekci nepřenášejte mimo tyto prostory. G. Nakládání s reagenciemi a vzorky, jejich použití, skladování a likvidace musí splňovat požadavky ČSN pro nakládání s biohazardním materiálem. H. Při práci se vzorky a reagenciemi soupravy používejte nepudrované rukavice, laboratorní plášť a ochranu očí. Po skončení práce se vzorky a reagenciemi si řádně omyjte ruce. Stránka 6 z 32
7 3. Symboly použité na štítcích Šarže Exspirace Výrobce Počet testů In vitro diagnostický medicínský prostředek Skladujte při teplotě nižší nebo rovné Katalogové číslo Stránka 7 z 32
8 4. Požadovaný materiál 4.1 Součástí kitu Konfigurace Devyser Resolution 21, 18, 13 a XY v2 sady obsahují reagencie pro analýzu 25 vzorků každého. Složky Devyser Resolution 21 v2 Barva víčka Barva Zkumavky Štítek Katal.č. Obsah soupravy Oranžová Čirá PCR Activator 4-A018 1 Žlutá Hnědavá Resolution 21 v2 4-A180 1 Složky Devyser Resolution 18 v2 Barva víčka Barva Zkumavky Štítek Katal.č. Obsah soupravy Oranžová Čirá PCR Activator 4-A018 1 Bílá Hnědavá Resolution 18 v2 4-A179 1 Složky Devyser Resolution 13 v2 Barva víčka Barva Zkumavky Štítek Katal.č. Obsah soupravy Oranžová Čirá PCR Activator 4-A018 1 Oranžová Hnědavá Resolution 13 v2 4-A178 1 Složky Devyser Resolution XY v2 Barva víčka Barva Zkumavky Štítek Katal.č. Obsah soupravy Oranžová Čirá PCR Activator 4-A018 1 Red Hnědavá Resolution XY v2 4-A Požadované položky, které nejsou v soupravě Příprava reagencií Plast pro termocykler Pipeta /multikanálová pipeta/ nebo dispenzor a špičky s filtry. Nepudrované chirurgické rukavice Extrakce DNA Reagencie a přístroje dle požadavků výrobce extrakční soupravy. Pipeta nebo dispenzor a špičky s filtry. Stránka 8 z 32
9 Amplifikace Thermocycler: ABI GeneAmp PCR System 9700 v módu 9600.Pro použití jiných PCR thermocyclerů je nutno použít ramping: ohřev 0,8 C/s, chlazení 1,6 C/s. Pipeta /multikanálová pipeta/ nebo dispenzor a špičky s filtry. Detekce Applied Biosystems Genetic Analyzer (ABI 310, 3100, 3130, 3500, 3730) Metodika je validovaná na polymerech: POP-4 a POP-7 Hi-Di Formamide, čistota pro genetickou analýzu 1x Genetic Analyzer Buffer Pipeta /multikanálová pipeta/ nebo dispenzor a špičky s filtry. Size Standard 560 SIZER ORANGE (Devyser cat.# 8-A402) nebo GeneScan 600 LIZ Size Standard (Life Technologies cat.# ) 4.3 Souprava pro barevnou kalibraci ABI 3100, 3130, 3730: Použijte kit DEV-5 Dye Set MultiCap kit (Devyser cat# 8-A401) jako Any5Dye dye set. ABI 3500: Použijte DEV-5 Dye Set MultiCap kit (Devyser cat# 8-A401) a vytvořte DEV-5 dye set. ABI 310 Matrix file generation: Použijte DEV-5 Dye Set SingleCap kit (Devyser cat# 8-A400). Zvolte soubor modulu GS STR POP4 (1 ml) G5.md5 Stránka 9 z 32
10 5. Skladování a nakládání se soupravou A. Skladujte všechny komponenty při maximální teplotě -18 C. B. Smíchané reakční mixy (připravené přidáním Resolution 21, 18, 13 a XY v2 Mix do PCR Activator) je možné skladovat při +2 to +8 C po dobu 7 dní nebo při méně než -18 C po dobu 90 dní. Vyhněte se opakovanému rozmrazování a zmrazování. C. Likvidace zbytků reagencií musí být v souladu s legislativou ČR. D. Nemíchejte reagencie z různých šarží. Stránka 10 z 32
11 6. Požadavky na vzorek Klinické vzorky Souprava Devyser Resolution v2 je určena pro použití s lidskou genomovou DNA izolované z plné krve, amniové tekutiny a choriové tkáně. Postup a skladování Dle pokynů výrobce. Kontroly Je doporučeno používat vhodné kontroly v každém runu jako například zdravou DNA a negativní kontrolu (bez DNA). Stránka 11 z 32
12 7. Návod k použití 7.1 Pracovní postup Devyser Resolution 21, 18, 13 a XY v2 Smíchané master mixy (Mix + activator) je vhodné připravit před použitím a celý process dokončit v jednom dni. Pouze pokud extrahujete vzorky předchozí den, připravte master mixy den následující. Aktivované reakční směsi se připraví přidáním každého z rezoluce 21, 18, 13 a XY v2 směsi oddělit zkumavky PCR aktivátoru. Devyser Resolution v2 byl validován při použití celkového amplifikačního objemu 25 µl. Změna reakčního objemu může vést k nesprávným výsledkům. Ujistěte se, že je Resolution Mix kompletně rozmražen. 1. Stočte krátce každou zkumavku. V tomto kroku zkumavky nevortexujte. 2. Přidat 500 ul každého z Resolution v2 směsi na samostatné trubky PCR Activator. 3. Opatrně promíchejte reakční master mix několikerým nasátím pipetou od spodu zkumavky. 4. Vortexujte reakční master mix a lehce centrifugujte. 5. Napipetujte 20 µl smíchaného master mixu do PCR zkumavek. 6. Uzavřete zkumavky a krátce je stočte. 7. Pokračujte ke kroku 7.2 Smíchaný reakční master mix je stabilní při +2-8 C po dobu 7 dní a při méně než -18 C po dobu 90 dní. Vyhněte se opakovanému rozmrazování a zmrazování. 7.2 Příprava vzorků a amplifikace PCR Extrakce DNA Dle pokynů výrobce. Pokud chcete použít jinou izolační soupravu pro diagnostické účely, musíte tento izolační postup nejprve validovat v kombinaci se Soupravou Devyser Resolution 21, 18, 13 a XY v2.doporučená koncentrace DNA pro analýzu soupravou Devyser Complete v2 je 2 až 30 ng/pcr reakci(0,4-6 ng genomové DNA/µL vzorku). Přidání vzorku Vzorky a kontroly by měl být přidán na vyhrazeném místě odděleném od přípravy reagencie, amplifikační a detekční oblasti. Stránka 12 z 32
13 1. Přidejte 5 µl vzorku (0,4-6 ng genomové DNA/µL vzorek) do každé PCR zkumavky se smíchaným reakčním master mixem(z kroku 7.1) 2. Zkumavky uzavřete a krátce stočte. Amplifikace Nejméně 30 minut před amplifikací zapněte termocykler. Pro ABI GeneAmp System 9700 nastavte ramp speed na 9600 mode. Pro použití jiných PCR termocyklerů použijte tento ramping: ohřev 0,8 C/s, chlazení 1,6 C/s. Amplifikační prostor: Naprogramujte termocykler pro amplifikaci dle následujícího teplotního profilu (přečtěte si manuál pro podrobné informace o programování termocykleru): 95 C 15 min 94 C 30 sec; 58 C 1 min 30 sec; 72 C 1 min 30 sec for 27 cycles 72 C 30 min 4 C FOREVER 1. Nastavte reakční objem 25 µl. 2. Spusťte amplifikaci (délka cca 3 hodiny). 3. Po amplifikaci vyjměte zkumavky s amplifikační reakcí z termocykleru, vložte je do stojánku a stočte. Odstředivka krátce sbírat obsah. Opatrně sejměte víčka, abyste zabránili kontaminaci aerosolem.amplifikovaný materiál nepřenášejte do předamplifikačních prostor. Amplifikovaný materiál musí zůstat v amplifikačním a detekčním prostoru. Stránka 13 z 32
14 7.3 Detekce Příprava vzorků Řiďte se manuály pro příslušný analyzátor ABI ohledně údržby a nastavení přístroje. Před spuštěním analýzy soupravou Devyser Resolution v2, přístroj musí být kalibrován na dye set DEV-5.Detaily v sekci 4.3. Příprava vzorku pro kapilární elektroforézu 1. Připravte nanášecí směs smícháním 2 µl velikostního standardu (560 SIZER ORANGE) s 100 µl Hi-Di TM Formamidu (směs stačí pro 6 jamek/zkumavek). 2. Vortexujte 15 s. 3. Do jamek mikrotitrační destičky (nebo do jednotlivých zkukmavek v případě ABI310) napipetujte po 15 μl nanášecí směsi před vložením do analyzátoru. 4. Přidejte 1,5 µl PCR amplifikátu vzorku do příslušné jamky/zkumavky s ELFO nanášecí směsí. 5. Uzavřete destičku/zkumavky. Příprava přístroje Připravte si pracovní protokol s využitím software analyzátoru s následujícím nastavením: Sample ID Dye Set: Any5Dye/DEV-5 Doporučený run Module: Viz níže pro jednotlivé polymery a přístroje. Run Modules Množství PCR produktu nasátého do kapiláry může být upraveno změnou injekčního napětí a injekční doby. ABI 310(Běh s modulem souboru "GS STR POP4 (1 ml) G5.md5") Run Parameters POP-4 Capillary length 47 cm Run temperature 60 C Injection voltage 15 kv Injection time 5-15 s Run voltage 15 kv Run time 40 min Stránka 14 z 32
15 ABI 3100/3130 Run Parameters Capillary length Run temperature Injection voltage Injection time Run voltage Run time POP-4/POP-7 36 cm 60 C 1,5 kv 20 s 15 kv 1500 s ABI 3500 Run Parameters Capillary length Run temperature Injection voltage Injection time Run voltage Run time POP-7 50 cm 60 C 1,6 kv 15 s 19,5 kv 1500 s Stránka 15 z 32
16 8. Výsledky a analýza Doporučené postupy pro diagnostiku aneuploidií pomocí QF-PCR byly stanoveny sdružením Clinical Molecular Genetics Society (UK) a Association for Clinical Cytogenetics (UK) a jsou dostupné na: Principy QF-PCR Chromozom specifické krátké opakované DNA sekvence (small tandem repeats STR) jsou amplifikovány PCR. Vizualizací fluorescenčně značených primerů můžeme kvantifikovat PCR produkty. Kvantifikace se provádí výpočtem plochy píku příslušné STR pomocí automatického DNA sekvenátoru. STR se liší mezi jedinci velikostí, podle toho, kolikrát se opakují čtveřice nukleotidů v každé alele. DNA amplifikovaná z normálního heterozygotního jedince (má alely s různou velikostí) pro specifickou STR sekvenci bude mít dva píky s odlišnou délkou v daném rozsahu (viz obr. 8.1).STR marker, které jsou heterozygotní jsou považovány za informativní. Obr Heterozygotní marker (poměr ploch 1:1) DNA amplifikované z trizomických jedinců vykáže buď další pík (tři různé alely) se stejnou plochou (obr 8.2), nebo jen dva píky (dvě různé alely), z nichž jeden má dvojnásobnou plochu než druhý pík (viz obr. 8.3.). Stránka 16 z 32
17 Obr Trizomický marker (poměr ploch 1:1:1) Obr Trizomický marker (poměr ploch 2:1 a 1:2) Přítomnost jen jednohu píku znamená homozygozitu (všechny alely mají stejnou délku) a jsou považovány za neinformativní. Jedinci, kteří jsou homozygotní nebo monosomický pro specifický STR marker mají jen jeden pík (obr. 8.4.). Stránka 17 z 32
18 Obr Homozygotní/monozomní marker Marker pro X chromozóm Markery T1 a T3 jsou nepolymorfní marker chromozómu X a mohou být použity pro určení počtu chromozómů X u monozomií chromozomu X. Markery X chromozómu jsou v sekvencích na chromozómu X a na autozomálních chromozómech amplifikovaných stejnou sadou primerů. Amplifikované markery jsou separovány podle délky. Markery X chromozómu jsou v sekvencích na chromozómu X a na autozomálních chromozómech amplifikovaných stejnou sadou primerů. Amplifikované markery jsou separovány podle délky. U zdravé ženy je poměr markerů 1:1 Stránka 18 z 32
19 Obrázek 8.5. Markery T1, T2 a T3 u zdravé ženy (poměr 1:1). Obrázek 8.6. Markery T1, T2 a T3 u muž ženy. Nepolymorfní markery Markery AMELXY a SRY jsou umístěny v nepolymorfních sekvencích na chromozómu X (AMELX) a chromozómu Y (AMELY a SRY) a jsou použity pro detekci přítomnosti Y chromozómu. AMELXY může být použit k určení relativního počtu chromozómů X a Y. Pseudoautozomální XY markery Markery XY2 a XY3 jsou polymorfní STR marker jsou umístěny na obou X a Y chromozómech. Marker ZFYX je ne-polymorfní marker (není to STR marker), který je přítomen na obou chromozómech X i Y. Tyto markery, pokud jsou informativní, mohou být použity pro určení celkového počtu pohlavních chromozómů.není možné určit, která alela je na X nebo na Y chromozómu. Stránka 19 z 32
20 Přehled markerů Devyser Resolution v2 ID Pozice 1 Markeru Velikost markeru (bp) 2 Barva fluoroforu 21A 21q21.3 D21S Modrá 21B 21q21.1 D21S Modrá 21C 21q22.3 D21S Žlutá 21D 21q22.13 D21S Žlutá 21H 21q21.3 D21S Red 21I 21q21.1 D21S Žlutá 21J 21q22.2 D21S Modrá 21K 21q21.2 D21S Zelená 21M 21q22.11 D21S Zelená 1. UCSC 2. Na základě získaných velikostí markerůna přístroji ABI3130, POP-7 polymer a 560 SIZER ORANGE.Vezměte, prosím, na vědomí, že velikost markerůse může lišit v závislosti na použitém přístroji, typu polymeru a size markeru během elektroforézy. Přehled markerů Devyser Resolution 18 v2 ID Pozice 1 Markeru Velikost markeru (bp) 2 Barva fluoroforu 18A 18p11.31 D18S Modrá 18B 18q12.3 D18S Žlutá 18C 18q12.3 D18S Žlutá 18D 18q22.1 D18S Zelená 18G 18q11.2 D18S Modrá 18I 18q21.31 D18S Žlutá 18J 18p11.31 D18S Žlutá 18M 18p11.32 GATA178F Red 18P 18q22.1 D18S Zelená 1. UCSC 2. Na základě získaných velikostí markerůna přístroji ABI3130, POP-7 polymer a 560 SIZER ORANGE.Vezměte, prosím, na vědomí, že velikost markerůse může lišit v závislosti na použitém přístroji, typu polymeru a size markeru během elektroforézy. Stránka 20 z 32
21 Přehled markerů Devyser Resolution 13 v2 ID Pozice 1 Markeru Velikost markeru (bp) 2 Barva fluoroforu 13A 13q12.12 D13S Zelená 13B 13q q21.33 D13S Modrá 13C 13q31.3 D13S Žlutá 13D 13q13.3 D13S Zelená 13E 13q22.1 D13S Žlutá 13F 13q12.2 D13S Modrá 13G 13q14.11 D13S Žlutá 13I 13q.31.1 D13S Zelená 13K 13q21.1 D13S červený 1. UCSC 2. Na základě získaných velikostí markerůna přístroji ABI3130, POP-7 polymer a 560 SIZER ORANGE.Vezměte, prosím, na vědomí, že velikost markerůse může lišit v závislosti na použitém přístroji, typu polymeru a size markeru během elektroforézy. Přehled markerů Devyser Resolution XY v2 ID Pozice 1 Markeru Velikost markeru (bp) 2 Barva fluoroforu AMELXY Xp22.2 / Yp11.2 AMELX / AMELY X = 104, Y = 110 (+/- 2bp) Zelená SRY Yp11.31 SRY 235 (+/- 2bp) Modrá ZFYX Yp11.31 / Xp22.11 ZFY / ZFX Žlutá sy625 Yq11.21 sy (+/- 2bp) Zelená T1 7q34 / Xq13-7 = 180 / X = 200 (+/- 2 bp) Zelená T2 Xq23 / 2p X= 118 / 2 = 121 (+/- 2 bp) Žlutá T3 3p24.2 / Xq = 137 X = 141 (+/- 2bp) červený X1 Xq26.2 DXS Zelená X2 Xq13.1 DXS Zelená X3 Xq XHPRT Žlutá X4 Xq21.33 DXS Modrá X5 Xq DXS Zelená X8 Xq21.31 DXS Modrá X9 Xq27.1-q27.2 DXS červený X10 Xp22.32 DXS Modrá XY2 Xq21.31 / Yp11.31 DXYS Modrá XY3 Xp22.33 / Yp11.32 DXYS červený Stránka 21 z 32
22 1. UCSC 2. Na základě získaných velikostí markerůna přístroji ABI3130, POP-7 polymer a 560 SIZER ORANGE.Vezměte, prosím, na vědomí, že velikost markerůse může lišit v závislosti na použitém přístroji, typu polymeru a size markeru během elektroforézy. Provádění analýzy Při provádění manuální analýzy identifikujete píky markerů v elektroforetogramu podle specifických velikostních rozpětí markerů uvedených v seznamu markerů. Vezměte, prosím, na vědomí, že velikost markerůse může lišit v závislosti na použitém přístroji, typu polymeru a size markeru během elektroforézy. Analýza heterozygótních marker s dvěma píky se provádí kalkulací poměru pík1/pík2. Pík1 je plocha píku kratšího fragmentu, pík2 je plocha píku delšího fragmentu. Viz níže poměrová kritéria pro interpretaci. Pro marker se třemi píky se poměr počítá z plochy od nejmenšího píku, tj. pík1/pík2/pík3. Homozygotní markery se označují jako neinformativní. Poměrová kritéria (Ratio Criteria RC) RC 1 je použit pro píky se vzdáleností <24bp RC 2 je použit pro píky se vzdáleností 24bp Poměr alel se nesmí kalkulovat v případě, že je vzdálenost/rozdíl mezi alelalmi vyšší než 40 bp, protože v tomto případě mohlo dojít k preferenční amplifikaci, která může ovlivnit poměry alel. Markery se dvěma píky Ratio 1:2 Neprůkazný 1:1 Neprůkazný 2:1 RC 1 <0,65 0,65-0,74 0,75-1,44 1,45-1,75 >1,75 RC 2 <0,65 0,65-0,74 0,75-1,54 1,55-1,75 >1,75 Markery se třemi píky Poměr Neprůkazný 1:1:1 Neprůkazný RC 1 <0,74 0,75-1,44 >1,45 RC 2 <0,74 0,75-1,54 >1,55 Výškový poměr Výškový poměr lze použít, když je poměr ploch hodnocen jako "inconclusive" (neprůkazný). Použijí se stejná poměrová kritéria, jako pro výpočet poměrů ploch. Interpretace výsledků K interpretaci výsledku jako normálního pro chromozóm je nutné mít minimálně dva informativní markery daného chromozómu a ostatní markery musí být neinformativní. Stránka 22 z 32
23 K interpertaci výsledku jako abnormálního pro chromozóm je nutné mít minimálně dva markery informativní jako abnormální a ostatní markery musí být neinformativní. Normální alelický pattern: Markerů se dvěma píky obdobné plochy/výšky, jejichž poměr je hodnocen 1:1. Abnormaníl alelický pattern: a) Markerů se dvěma píky odlišné plochy/výšky, jejichž poměr je hodnocen 2:1 nebo 1:2. b) Markery se třemi píky se stejnými nebo podobnými poměry výšky/plochy, jejichž poměr je hodnocen 1:1:1 Monosomy X pattern is determined by: a) All X and XY markers showing homozygous allelic pattern. b) Pokud píky AMELY a SRY nejsou detekovány. c) Marker T1 ukazuje 2 píky s odlišnou plochou/výškou, kde je poměr píků hodnocen jako 2:1. d) Marker T2 ukazuje 2 píky s odlišnou plochou/výškou, kde je poměr píků hodnocen jako 1:2. e) Marker T3 showing two peaks of differing height/area and the peak ratio is classified as 2:1. Můžou se objevit píky markerů s délkou mimo dané rozpětí, tyto v rámci systému Devyser Resolution v2 nehodnotíme. Poměr alel se nesmí kalkulovat v případě, že je vzdálenost/rozdíl mezi alelalmi vyšší než 40 bp, protože v tomto případě mohlo dojít k preferenční amplifikaci, která může ovlivnit poměry alel. Troubleshooting Pokud marker vykáže neprůkazné výsledky, nebo není detekován, může to mít řadu příčin:» Chromozomální mosaicismus» Copy number variation (CNV)» Microvarianty způsobené specifickými opakováními mutací» Částečná chromozomální trizomie» Stutter pík převyšuje, nebo překrývá specifický alelický pík.» Překryv barevného signálu mezi kanály» Elektroforetické spiky» Asymetrická amplifikace» Kontaminace DNA: druhý genotyp, PCR amplikony» Polymorfismus v oblasti nasedání primeru» Somatická microsatelitní mutace» DNA koncentrace je příliš vysoká, nebo příliš nízká.» DNA použitá v PCR je degradovaná.» Submicroskopická duplikace/delece některého z markerů» Velikost alela je rozdíl větší než 40 bp způsobuje šikmé poměry alel. Stránka 23 z 32
24 Ve výjimečných případech byla zjištěna chyba amplifikace sekvence AMELY kvůli mutaci v místě nasedání primeru. Ve vyjímečných případech byla zjištěna chyba amplifikace sekvence marker T1 kvůli poměr zkreslen kvůli mutaci v místě nasedání primeru. Pokud je získán normální I abnormální výsledek pro jeden chromozóm, je doporučeno použít jinou metodiku pro určení příčiny chyby. Počet variací (CNVs) byl pozorován u markerů 13A, 13B, 13C, 13D, 18B, 18C, 18D-1, 18D-2, 21B, 21C, 21G, X2, X3, XY3, AMELXY, ZFYX a T1. Pokud je elektroferogram nízké kvality, data není možné vyhodnotit.pcr produkt můžeme opakovaně nanést do analyzátoru a analyzovat znovu. Artefakty PCR Stutter píky (obr. 8.7) jsou detekovány jako samostatné píky, které jsou o jednu nebo několik repetic menší, než aktuální STR alela. Stutter píky můžeme zahrnout do výpočku poměrů.typický stutter pík má obsah menší, než 15% vůči příslušnému STR píku. Obr Stutter pík je označen šipkou. -A píky (obr. 8.8) jsou detekovány jako samostatné píky, které jsou o jeden pár bazí kratší, než PCR produkt s plnou délkou (+A pík). A píky můžeme zahrnout do výpočku poměrů. Stránka 24 z 32
25 Obr A a +A píky jsou vyznačeny šipkami. Elektroforetické artefakty Během detekce může dojít k přesahu signálu mezi jednotlivými detekčními kanály (Obr 8.9). Crosstalk se jeví jako stejně vysoké vrcholy v sousedních barevných kanálech a měla by být vyloučena z analýzy. Obr 8.9. Pík přesahující ze green do blue kanálu je označen šipkou. Dye blobs se mohou objevit v rozsahu analýzy (obr. 8.10). Obecně platí, že barva dye blobs se objeví jako široký pík bez definovaného vrcholu jedné barvy a vyskytují se v datech relativně brzy na začátku. Stránka 25 z 32
26 Obr Dye blob je označen šipkou. Stránka 26 z 32
27 9. Klinická studie Pro testování kitu Devyser Resolution v2 bylo analyzováno 257 vzorků. Všechny výsledky analýzy kitem Devyser Resolution v2 byly porovnány s daty z karyotypování nebo QF-PCR analýzy. Z analyzovaných 257 vzorků bylo 225 normálních/zdravých a 30 mělo aneuploidii alespoň u jednoho z testovaných chromozomů. 255 vzorků mělo analyzovatelný výsledek a všechny se plně shodovaly s výsledky karyotypování. Tabulka 1. Výsledky testování 276 vzorků. Výsledek Devyser Resolution v2 Předchozí testování* Normální Trisomie Trisomie Trisomie Triploid , X , XXY , XYY , XXXX 1 1 Výrazná kontaminace mateřskými buňkami 1 1 Kontaminace dalších genotypem 1 1 Neinformativní 0 0 Celkem *) karyotypování a/nebo QF-PCR analýza Devyser Resolution v2 (8-A012.2) Sensitivita Definice: Podíl (%) pacientů s dobře definovanou chromozomální aberací ve zkušební hodnotě v rámci definované rozhodovací meze. Výsledek: >97% sensitivita Specificita Definice: Podíl (%) pacientů bez dobře definované chromozomální aberací a jejichž výsledky byly negativní ve zkušební hodnotě v rámci definované rozhodovací meze. Výsledek: >99% specifita Stránka 27 z 32
28 Opakovatelnost Definice: Stupeň (%) shody mezi měřeními provedenými na stejných vzorcích za rozdílních měnících se podmínek. Experimentální design: Normalní mužský vzorek (46, XY) byl amplifikován 102-krát při šesti různých podmínkách a prováděných různými operatory na různých PCR cyclerech a genetických analyzátorech. Všech 102 replikátů vyšlo stejně. Výsledek: >99% opakovatelnost Stránka 28 z 32
29 10. Limitace použití A. Používat tento product smí jen osoba vyškolená v technikách PCR a kapilární elektroforézy. B. Souprava Devyser Resolution v2 byla validována na použití s termocycylerem ABI Thermal Cycler GeneAmp Pokud chcete pro klinickou diagnostiku použít jiný termocykler, je nutná validace soupravy Devyser Resolution v2 pro tento cykler. C. Souprava Devyser Resolution v2 je validována s izolačními soupravami QIAamp DNA Blood Mini Kit pro extrakci DNA z plné lidské krve a amniotické tekutiny; QIAamp DNA Mini Kit pro extrakci DNA z biopsií choriových klků.analýza s dalšími matricemi a izolačními soupravami nebyla validována a může způsobit falešně negativní nebo falešně pozitivní výsledky. D. Souprava Devyser Resolution v2 je určena pouze pro detekci specifických chromozomálních aneuploidií dle návodu k použití. Souprava nebyla testována pro detekci strukturálních změn, mozaiky ani abnormalit v jiných, než uvedených chromozomech. Výsledky obdržené použitím soupravy Devyser Resolution v2 mohou být aplikovány pouze na tkáně nebo specifické vzorky. Kontaminace mateřskými buňkami neo u placentálního masaicismu může způsobit nesrovnalosti mezi výsledky získanými soupravou Devyser Resolution v2 a jinými technikami. Stránka 29 z 32
30 11. Reference PROFESSIONAL GUIDELINES FOR CLINICAL CYTOGENETICS AND CLINICAL MOLECULAR GENETICS. QF-PCR FOR THE DIAGNOSIS OF ANEUPLOIDY BEST PRACTICE GUIDELINES (2012), v3.01, January Stránka 30 z 32
31 12. Upozornění zákazníkům Výsledky obdržené pomocí soupravy Devyser Resolution v2 musí být interpretovány s přihlédnutím k dalším laboratorním výsledkům a klinickému obrazu pacienta.devyser AB nezodpovídá za následná klinická rozhodnutí. LIZ a GeneAmp jsou registrovanými obchodními známkami společnosti Life Technologies Corporation. GeneScan TM, POP-4 TM, POP-7 TM a Hi-Di TM jsou ochrannými známkami společnosti Life Technologies Corporation. Koupí tohoto produktu nezískáváte licenci k provádění PCR podléhající patentům vlastněným třetí stranou. Stránka 31 z 32
32 13. Kontaktní informace Devyser AB Instrumentvägen 19 SE Hägersten SWEDEN Phone: Homepage: Technická podpora Phone: Stránka 32 z 32
Devyser AZF. Návod k použití
Devyser AZF Kat.č. 8-A019 Pro in vitro diagnostiku Návod k použití Devyser AZF, Návod k použití, 7-A012-CZ, May-2012 Strana 1 z 20 Devyser AZF, Návod k použití, 7-A012-CZ, May-2012 Strana 2 z 20 Obsah
VíceDevyser UPD-15, Návod k použití, 7-A016-CS, verze Strana 1 z 19 Devyser AB
č Devyser UPD-15, Návod k použití, 7-A016-CS, verze 2015-05-21 Strana 1 z 19 Obsah Strana 1. Seznámení se systémem Devyser UPD-15 3 2. Upozornění 4 3. Symboly použité na štítcích 5 4. Požadovaný materiál
VíceDevyser CFTR Core. Návod k použití
Devyser CFTR Core Kat. č.: 8-A031 Pro in vitro diagnostiku Návod k použití Strana 1 z 38 OBSAH OBSAH 2 1. SEZNÁMENI SE SYSTÉMEM DEVYSER CORE 4 Použití 4 Obsah soupravy 4 Postup 4 Background 4 Princip metody
VíceEGFR XL StripAssay. Kat. číslo 5-630. 20 testů 2-8 C
EGFR XL StripAssay Kat. číslo 5-630 20 testů 2-8 C Popis stripu Pracovní postup 1. Izolace DNA Pro izolaci DNA použijte vhodný izolační kit. Doporučené kity jsou následující: Pro izolaci čerstvých nebo
Víceα-globin StripAssay Kat. číslo 4-160 10 testů 2-8 C
α-globin StripAssay Kat. číslo 4-160 10 testů 2-8 C Popis stripů: Pracovní postup Izolace DNA Doporučujeme použít následující kit pro izolaci DNA z plné krve nebo jiných typů vzorků: Spin Micro DNA Extraction
VíceBraf V600E StripAssay
Braf V600E StripAssay Kat. číslo 5-570 20 testů 2-8 C Popis stripu: Pracovní postup 1. Izolace DNA Pro izolaci čerstvých nebo mražených biopsií použijte soupravy Qiagen QIAmp DNA Mini nebo Micro. Pro izolaci
VíceNRAS StripAssay. Kat. číslo 5-610. 20 testů 2-8 C
NRAS StripAssay Kat. číslo 5-610 20 testů 2-8 C Popis stripu: Pracovní postup 1. Izolace DNA Pro izolaci DNA musí být použita vhodná metoda vzhledem k typu tkáně vzorku. Pro doporučení vhodné metody kontaktujte
VíceVýrobky Elucigene QST*R Návod k použití
Výrobky Elucigene QST*R Návod k použití Výrobek Velikost Katalogové číslo Elucigene QST*Rplusv2 50 testů AN0PLB2 Elucigene QST*R 50 testů AN003B2 Elucigene QST*R-XYv2 50 testů AN0XYB2 Elucigene QST*R-13
VíceDevyser CFTR Italia v2. Návod k použití
Devyser CFTR Italia v2 Kat. No.: 8-A032.2 Pro in vitro diagnostiku Návod k použití Strana 1 z 34 OBSAH OBSAH 2 1. SEZNÁMENÍ SE SYSTÉMEM DEVYSER ITALIA v2 4 Použití 4 Součástí kitu 4 Postup 4 Background
Vícecdna synthesis kit First-Strand cdna Synthesis System Verze 1.2
cdna synthesis kit First-Strand cdna Synthesis System Verze 1.2 Obsah soupravy a její skladování Tato souprava pro reverzní transkripci obsahuje reagencie potřebné k provedení reverzní transkripce (RT)
VíceSystém pro kvantitativní multiplex amplifikaci DNA PLEXAMP KIT. PXT5 Detekce genomové přestavby genu BRCA2 NÁVOD K POUŽITÍ
Systém pro kvantitativní multiplex amplifikaci DNA PLEXAMP KIT PXT5 Detekce genomové přestavby genu BRCA2 NÁVOD K POUŽITÍ REFERENCE: PXT5-01.01.25: 25 testů PXT5-01.01.50: 50 testů PXT5-01.01.100: 100
VíceBraf 600/601 StripAssay
Braf 600/601 StripAssay Kat. číslo 5-560 20 testů 2-8 C Popis stripu: Pracovní postup Kit umožňuje detekci 9 mutací v genu BRAF (kodón 600 a 601) Další informace najdete v OMIM Online Mendelian Inheritance
VíceMagPurix Blood DNA Extraction Kit 200
MagPurix Blood DNA Extraction Kit 200 Kat. č. ZP02001-48 Doba zpracování: 50-60 minut pro MagPurix 12S 50-70 minut pro MagPurix 24 Použití Souprava MagPurix Blood DNA Extraction Kit 200 je určena pro izolátor
VíceMagPurix Forensic DNA Extraction Kit
MagPurix Forensic DNA Extraction Kit Kat. č. ZP02010 Doba zpracování: 40-50 minut pro MagPurix 12S 40-60 minut pro MagPurix 24 Použití Souprava MagPurix Forensic DNA Extraction Kit je určena pro izolátor
VíceFilozofie validace. Je validace potřebná? Mezinárodní doporučení pro provádění validací ve forenzně genetických laboratořích
INVESTICE DO ROZVOJE VZDĚLÁVÁNÍ Vzdělávání v oblasti forenzní genetiky reg. č. CZ.1.07/2.3.00/09.0080 Mezinárodní doporučení pro provádění validací ve forenzně genetických laboratořích INVESTICE DO ROZVOJE
VíceFastFraX TM FMR1 Sizing kit
FastFraX TM FMR1 Sizing Kit Katalogové číslo: F2-050-V Manuál Pro In vitro diagnostiku Skladování: 2-8 C pro okamžité použití -20 C pro dlouhodobé skladování Chraňte před světlem 1. Úvod Syndrom fragilního
VíceCVD-T StripAssay. Kat. číslo 4-360. 20 testů 2-8 C
CVD-T StripAssay Kat. číslo 4-360 20 testů 2-8 C Popis stripu Pracovní postup Izolace DNA Použijte čerstvou nebo zmraženou krev s EDTA nebo citrátem, jako antikoagulans, vyhněte se krvi s obsahem heparinu.
VíceMentype AMLplex QS. Návod k použití. Důkaz chromozomálních aberací Akutní myeloidní leukémie. Diagnostika in vitro. Vyrobeno v Německu
Návod k použití Důkaz chromozomálních aberací Akutní myeloidní leukémie Diagnostika in vitro Srpen 2019 45-31220-0010 45-31220-0025 45-31220-0100 45-31220-0400 Biotype GmbH Moritzburger Weg 67 D-01109
VíceChromoprobe Multiprobe - T System
Návod k použití REF: PMP 009/PMP 008/ PMP 007 Chromoprobe Multiprobe - T System Pouze pro profesionální použití Fluorescenční In Situ Hybridizace (FISH) je technika, která umožňuje detekci DNA sekvencí
VíceChromozomální aberace nalezené u párů s poruchou reprodukce v letech
Chromozomální aberace nalezené u párů s poruchou reprodukce v letech 2000-2005 Jak přistupovat k nálezům minoritních gonozomálních mozaik? Šantavá A., Adamová, K.,Čapková P., Hyjánek J. Ústav lékařské
VíceNOVÁ VERZE. Systém pro kvantitativní multiplex amplifikaci DNA PLEXAMP KIT. PXT3 Detekce genomové přestavby genů MSH2 a MSH6 NÁVOD K POUŽITÍ
NOVÁ VERZE Systém pro kvantitativní multiplex amplifikaci DNA PLEXAMP KIT PXT3 Detekce genomové přestavby genů MSH2 a MSH6 NÁVOD K POUŽITÍ REFERENCE: PXT3-02.01.25: 25 testů PXT3-02.01.50: 50 testů PXT3-02.01.100:
VíceYi TPMT. Diagnostická souprava. Návod k použití. Haasova 27 Brno Česká republika. tel.:
Yi TPMT Diagnostická souprava Návod k použití Výrobce: YBUX s.r.o. Haasova 27 Brno 616 00 Česká republika IČ 63487951 tel.: +420 541 423 710 e-mail: ybux@ybux.eu Název: Yi TPMT Popis: Diagnostická souprava
Vícenastavení real-time PCR cykleru Rotor Gene 3000
Verze: 1.4 Datum poslední revize: 25. 3. 2015 nastavení real-time PCR cykleru Rotor Gene 3000 (Corbett Research) generi biotech OBSAH: 1. Nastavení teplotního profilu a spuštění cykleru... 3 2. Zadání
VíceGenetický polymorfismus jako nástroj identifikace osob v kriminalistické a soudnělékařské. doc. RNDr. Ivan Mazura, CSc.
Genetický polymorfismus jako nástroj identifikace osob v kriminalistické a soudnělékařské praxi doc. RNDr. Ivan Mazura, CSc. Historie forenzní genetiky 1985-1986 Alec Jeffreys a satelitní DNA 1980 Ray
VíceDIAGNOSTICKÝ KIT PRO DETEKCI MINIMÁLNÍ REZIDUÁLNÍ CHOROBY U KOLOREKTÁLNÍHO KARCINOMU
Úvod IntellMed, s.r.o., Václavské náměstí 820/41, 110 00 Praha 1 DIAGNOSTICKÝ KIT PRO DETEKCI MINIMÁLNÍ REZIDUÁLNÍ CHOROBY U KOLOREKTÁLNÍHO KARCINOMU Jednou z nejvhodnějších metod pro detekci minimální
VíceKras XL StripAssay. Kat. číslo 5-680. 20 testů 2-8 C
Kras XL StripAssay Kat. číslo 5-680 20 testů 2-8 C Popis stripu: Pracovní postup 1. Izolace DNA Musí být použity vhodné metody extrakce DNA, v závislosti na typu vzorku, který má být vyšetřován. Doporučení
VíceKvantitativní fluorescenční polymerázová řetězová reakce (QF-PCR)
Kvantitativní fluorescenční polymerázová řetězová reakce (QF-PCR) QF-PCR Kvantitativní fluorescenční polymerázová řetězová reakce (QF-PCR) představuje metodu vhodnou k rychlé diagnostice nejčastějších
VíceDIAGNOSTICKÝ KIT PRO DETEKCI MINIMÁLNÍ REZIDUÁLNÍ CHOROBY U KARCINOMU PANKREATU
Úvod IntellMed, s.r.o., Václavské náměstí 820/41, 110 00 Praha 1 DIAGNOSTICKÝ KIT PRO DETEKCI MINIMÁLNÍ REZIDUÁLNÍ CHOROBY U KARCINOMU PANKREATU Jednou z nejvhodnějších metod pro detekci minimální reziduální
VíceCYCLER CHECK. Test pro validaci teplotní uniformity cyklérů. Připraveno k použití, prealiquotováno. REF 7104 (10 testů) REF (4 testy)
CZ Návod k použití CYCLER CHECK Test pro validaci teplotní uniformity cyklérů Připraveno k použití, prealiquotováno REF 7104 (10 testů) REF 71044 (4 testy) Obsah 1. Popis výrobku... 2 2. Materiál... 3
VíceSeznam použitých chemikálií
PŘÍLOHY Tabulky Tabulka č. 1. Přehled výsledků teplot tání pro amplifikáty primeru G3010A. Testování teplot tání rozředěného zásobího roztoku o koncentraci ndna 1ng / 1μl, ředění uvedeno v tabulce. Tabulka
VíceUživatelská příručka
PGM Barcoding Set 1-8 Navrženo pro PGM ION-TORRENT KÓD PRODUKTU: 2001 (1-8) BALEN9: 32 testů Uživatelská příručka Rev02.2015 Str. 1 Rejstřík 1. POUŽITÍ VÝROBKU 3 2. OBSAH KITU 4 3. SKLADOVÁNÍ 4 4. STABILITA
VíceJednotné pracovní postupy zkoušení krmiv
Národní referenční laboratoř Strana KVANTITATIVNÍ STANOVENÍ GENETICKÝCH MODIFIKACÍ METODOU qpcr POMOCÍ ROTOR-GENE PROBE PCR KITU Účel a rozsah Postup slouží ke kvantitativnímu stanovení genetických modifikací
VíceNaléhavé bezpečnostní upozornění
Analyzátory ADVIA Chemistry Naléhavé bezpečnostní upozornění CHC 15-07 11220075, Rev. A Březen 2015 Doporučený protokol opakování testu lipázy Dle našich záznamů mohla vaše laboratoř obdržet následující
VíceDY D NE N X Hana Vlastníková
DYNEX Hana Vlastníková Molekulární biologie: Vybavení laboratoře na klíč Přístrojová technika Kompatibilní diagnostické soupravy Profesionální přístup SOP Technická podpora Servis Přístrojové vybavení:
VíceDIAGNOSTICKÝ KIT PRO DETEKCI MINIMÁLNÍ REZIUDÁLNÍ CHOROBY MRD EGFR
Úvod IntellMed, s.r.o., Václavské náměstí 820/41, 110 00 Praha 1 DIAGNOSTICKÝ KIT PRO DETEKCI MINIMÁLNÍ REZIUDÁLNÍ CHOROBY MRD EGFR Jednou z nejvhodnějších metod pro detekci minimální reziduální choroby
VícePísemná zpráva zadavatele
Písemná zpráva zadavatele veřejné zakázky zadávané dle zákona č. 137/2006 Sb., o veřejných zakázkách, ve znění účinném ke dni zahájení zadávacího řízení (dále jen ZVZ ). Veřejná zakázka Název: Ostatní
VíceTestovací kity Protrans HLA SBT 1 1.0 Strategie Protrans sekvenování 3 2.0 PROTRANS HLA Sekvenační systém 4 2.0 PROTRANS Sekvenačníí kity (S4, S3,
Návod k použití Obsah Strana Testovací kity Protrans HLA SBT 1 1.0 Strategie Protrans sekvenování 3 2.0 PROTRANS HLA Sekvenační systém 4 2.0 PROTRANS Sekvenačníí kity (S4, S3, Domino Stones, S2, S1) 4
Vícenastavení real-time PCR cykléru CFX 96 Real-Time System
nastavení real-time PCR cykléru CFX 96 Real-Time System (BioRad) generi biotech OBSAH 1. Spuštění již existujícího či nastavení nového teplotního profilu...3 1.1. Spuštění již uloženého teplotního profilu...3
VíceMagPurix Viral Nucleic Acid Extraction Kit
MagPurix Viral Nucleic Acid Extraction Kit Kat. č. ZP02003 Doba zpracování: 40-55 minut pro MagPurix 12S 40-60 minut pro MagPurix 24 Použití Souprava MagPurix Viral Nucleic Acid Extraction Kit je určena
VíceDYNEX nabízí komplexní řešení v oblasti zpracování a analýzy biologických materiálů pomocí molekulárně biologických metod.
DYNEX nabízí komplexní řešení v oblasti zpracování a analýzy biologických materiálů pomocí molekulárně biologických metod. Od 1.1.2014 DYNEX jediným OFICIÁLNÍM (autorizovaným) distributorem společnosti
VíceMagPurix Viral/Pathogen Nucleic Acids Extraction Kit B
MagPurix Viral/Pathogen Nucleic Acids Extraction Kit B Kat. č. ZP02012 Doba zpracování: 45-60 minut pro MagPurix 12S 45-65 minut pro MagPurix 24 Použití Souprava MagPurix Viral/Pathogen Nucleic Acids Extraction
VíceReal time PCR detekce bakterií Legionella pneumophila+micdadei, Mycoplasma pneumoniae, Chlamydia pneumoniae a Bordetella pertussis
Real time PCR detekce bakterií Legionella pneumophila+micdadei, Mycoplasma pneumoniae, Chlamydia pneumoniae a Bordetella pertussis In vitro diagnostikum -80 až -20 C Viz. obal RT-PPX-050 Viz. obal POPIS
Vícegeneri biotech nastavení real-time PCR cykleru Applied Biosystems 7300 a 7500 Fast Real-Time System (Applied Biosystems)
Verze: 1.2 Datum poslední revize: 24.9.2014 nastavení real-time PCR cykleru Applied Biosystems 7300 a 7500 Fast Real-Time System (Applied Biosystems) generi biotech OBSAH 1. Nastavení nového teplotního
VíceReal time PCR detekce Borrelia burgdorferi Sensu Lato
Real time PCR detekce Borrelia burgdorferi Sensu Lato In vitro diagnostikum -80 až -20 C Viz. obal RT-BBSL-050 Viz. obal POPIS SOUPRAVY Real Time PCR souprava pro detekci Borrelia burgdorferi Sensu Lato
VíceUrčeno pro obecné laboratorní užití. Není určeno pro použití v diagnostických postupech. POUZE PRO POUŽITÍ IN VITRO.
Určeno pro obecné laboratorní užití. Není určeno pro použití v diagnostických postupech. POUZE PRO POUŽITÍ IN VITRO. PCR Nucleotide Mix Předem připravený roztok ultračistých PCR deoxynukleotidů (datp,
VíceReal time PCR detekce bakterií Haemophilus influenzae, Neisseria meningitidis, Streptococcus pneumoniae a Listeria monocytogenes
Real time PCR detekce bakterií Haemophilus influenzae, Neisseria meningitidis, Streptococcus pneumoniae a Listeria monocytogenes In vitro diagnostikum -80 až -20 C Viz. obal RT-HNSL-050 Viz. obal POPIS
VíceÚLOHA C Klonování PCR produktu do plasmidu
Jméno a učo: Datum: ÚLOHA C Klonování PCR produktu do plasmidu TEORETICKÝ ÚVOD Při klonování PCR produktů do plasmidů se využívá vlastnosti Taq polymerasy, a jiných non-proofreading polymeras, přidávat
VíceRapid-VIDITEST. Rota-Adeno Card. (Jednokrokový kazetový test pro in vitro diagnostiku rotavirů a adenovirů) Návod k použití soupravy
Rapid-VIDITEST Rota-Adeno Card (Jednokrokový kazetový test pro in vitro diagnostiku rotavirů a adenovirů) Návod k použití soupravy Výrobce: VIDIA spol. s r.o., Nad Safinou II č. 365, Vestec, 252 42 Jesenice
VíceSure-MeDIP I. with magnetic beads and MNase. www.krd.cz
Sure-MeDIP I with magnetic beads and MNase www.krd.cz 1 Obsah soupravy a skladování MeDIP souprava obsahuje reagencie na provedení 25 reakcí. Souprava je rozdělen do dvou částí, jedna je distribuována
Vícenastavení real-time PCR cykleru CFX 96 Real-Time System
Verze: 1.2 Datum poslední revize: 24.9.2014 nastavení real-time PCR cykleru CFX 96 Real-Time System (BioRad) generi biotech OBSAH 1. Spuštění již existujícího či nastavení nového teplotního profilu...3
VíceJEDINEČNÁ INFORMACE. Jediný prenatální krevní test, který analyzuje všechny chromozomy vašeho miminka
JEDINEČNÁ INFORMACE Jediný prenatální krevní test, který analyzuje všechny chromozomy vašeho miminka MaterniT GENOME test nabízí více informací o chromozomech vašeho miminka než kterýkoliv jiný prenatální
VíceEvropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti NUKLEOVÉ KYSELINY
Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti NUKLEOVÉ KYSELINY 3 složky Nukleotidy dusík obsahující báze (purin či pyrimidin) pentosa fosfát Fosfodiesterová vazba. Vyskytuje se mezi
VíceKonečná zpráva hodnocení různých způsobů přípravy vzorků pro AMPLICOR HPV test firmy Roche
Konečná zpráva hodnocení různých způsobů přípravy vzorků pro AMPLICOR HPV test firmy Roche Charakteristika testu: Set AMPLICOR HPV vyráběný firmou Roche je určený pro detekci vysoko-rizikových typů lidských
VíceHbA1c. Axis - Shield. Společnost je zapsána v obchodním rejstříku Městského soudu v Praze, odd. C vložka 1299
Lékařská technika a speciální zdravotní materiál Společnost je zapsána v obchodním rejstříku Městského soudu v Praze, odd. C vložka 1299 Obchodní 110, 251 70 Praha Čestlice Tel. +420 296 328 300 Fax. +420
VícePGT- A a mosaicismus. RNDr. Martina Hrubá, Ph.D.
PGT- A a mosaicismus RNDr. Martina Hrubá, Ph.D. KAZUISTIKA (A.CH.,*1987) VSTUPNÍ ANAMNÉZA 2010 2015: 3 opakované spontánní potraty v prvním trimestru, asthenozoospermie u manžela (bez trombofilních mutací,
VíceLW Color Compensation Kit Uživatelská příručka
LW Color Compensation Kit Uživatelská příručka 04 847 148 001 Pro všeobecné použití v laboratoři Obsah 3 (16) Obsah 1 Úvodní informace pro LW Color Compensation Kit... 2 Požadovaný materiál... 2.1 Složení
VíceTESTOVÁNÍ GMO Praktikum fyziologie rostlin
Teoretický úvod: TESTOVÁNÍ GMO Praktikum fyziologie rostlin 1 Teoretický úvod: TESTOVÁNÍ GMO Obecně na úvod Určitě jste už slyšeli pojem geneticky modifikovaný organismus (GMO). Úprava vlastností přirozeně
VíceRapid-VIDITEST RSV. (Jednokrokový kazetový test pro in vitro diagnostiku Respiračního syncytiálního viru z nosních výtěrů, výplachů a aspirátů)
Rapid-VIDITEST RSV (Jednokrokový kazetový test pro in vitro diagnostiku Respiračního syncytiálního viru z nosních výtěrů, výplachů a aspirátů) Návod k použití soupravy Výrobce: VIDIA spol. s r.o., Nad
Více5. Úloha: Stanovení počtu kopií plazmidů (plasmid copy number PCN) v buňce
5. Úloha: Stanovení počtu kopií plazmidů (plasmid copy number PCN) v buňce pomocí Q Cílem této úlohy bude stanovit počet kopií penicilinázového plazmidu u Staphylococcus aureus (pusa300houmr like) na bakteriální
VíceSouprava je určená výhradně pro výzkumné účely, nikoliv pro diagnostické postupy.
We take care of our customers Výrobky CARE jsou určené pro zásobování našich zákazníků na celém světě vysoce kvalitními spotřebními materiály, příslušenstvím a speciálními soupravami. Řada výrobků CARE
VíceProFlow Rotavirus-Adenovirus Combi
KATALOGOVÉ ČÍSLO: PL.3010 (20 testů) ProFlow Rotavirus-Adenovirus Combi ZAMÝŠLENÉ POUŽITÍ ProFlow Rotavirus-Adenovirus je jednoduchý, rychlý imunologický test pro kvalitativní detekci antigenů Rotaviru
VíceC V C. Návod k použití pro Biofortuna SSPGo TM HLA No Template Control Kit BF-40-02. Revize 2. Červenec 2014
DOT130v1 Instructions for Use Biofortuna SSPGo TM HLA No Template Control Kit BF-40-02 Strana 1 / 7 Návod k použití pro Biofortuna SSPGo TM HLA No Template Control Kit BF-40-02 Revize 2 Červenec 2014 DOT130v1
VíceValidace sérologických testů výrobcem. Vidia spol. s r.o. Ing. František Konečný IV/2012
Validace sérologických testů výrobcem Vidia spol. s r.o. Ing. František Konečný IV/2012 Legislativa Zákon č. 123/2000 Sb. o zdravotnických prostředcích ve znění pozdějších předpisů Nařízení vlády č. 453/2004
VíceFragment Analyzer UNIKÁTNÍ KAPILÁROVÝ FRAGMENTAČNÍ ANALYZÁTOR VÝBORNÉ VÝSLEDKY UNIKÁTNÍ VLASTNOSTI
Fragment Analyzer UNIKÁTNÍ KAPILÁROVÝ FRAGMENTAČNÍ ANALYZÁTOR VÝBORNÉ VÝSLEDKY UNIKÁTNÍ VLASTNOSTI Výborný přístroj, výborné výsledky Fragmentační analyzátor je automatizovaný kapilárový systém s CE značkou
VíceList protokolu QIAsymphony SP
List protokolu QIAsymphony SP Srpen 2015 Tissue_LC_200_V7_DSP a Tissue_HC_200_V7_DSP (uživatelem validovaný pro použití s minisadou QIAsymphony DSP DNA) Tento dokument Tissue_LC_200_V7_DSP a Tissue_HC_200_V7_DSP
Vícenastavení real-time PCR cykléru icycler iq5 Multi-Color Real-Time PCR Detection System
Verze: 1.0 Datum poslední revize: 2.1.2014 nastavení real-time PCR cykléru icycler iq5 Multi-Color Real-Time PCR Detection System (BioRad) generi biotech OBSAH: 1. Spuštění již existujícího či nastavení
VíceSada artus HBV QS-RGQ
Sada artus HBV QS-RGQ Výkonnostní charakteristiky Sada artus HBV QS-RGQ, verze 1, 4506363, 4506366 Před samotným testem si ověřte dostupnost nových revizí elektronického značení na adrese www.qiagen.com/products/artushbvrgpcrkitce.aspx.
VíceList protokolu QIAsymphony SP
List protokolu QIAsymphony SP PC_AXpH_HC2_V1_DSP protokol Použití Pro diagnostické použití in vitro. Tento protokol byl vytvořen k použití s cervikálními vzorky uloženými v roztoku PreservCyt s využití
VíceINTRODUCING OF SNAPSHOT METHOD FOR POLYMORPHISM DETECTION ZAVEDENÍ SNAPSHOT METODIKY PRO DETEKCI POLYMORFISMŮ
INTRODUCING OF SNAPSHOT METHOD FOR POLYMORPHISM DETECTION ZAVEDENÍ SNAPSHOT METODIKY PRO DETEKCI POLYMORFISMŮ Civáňová K., Knoll A. Ústav genetiky, Agronomická fakulta, Mendelova zemědělská a lesnická
VíceSD Rapid test TnI/Myo Duo
SD Rapid test TnI/Myo Duo Návod k použití soupravy Výrobce: STANDARD DIAGNOSTICS, INC. 156-68 Hagal-dong, Giheung-gu, Yongin-si, Kyonggido, Korea. Tel: +82 31 899 2800, fax: +82 31 899 2840, www.standardia.com
VíceManuál. Vyrobeno v Německu. AMLGAv3cz xxx* *xxx definuje velikost balení
Manuál Novinka v detekci chromozomálních aberací spojených s akutní myeloidní leukémií 45-31220-0xxx* *xxx definuje velikost balení Vyrobeno v Německu Biotype Diagnostic GmbH vyvíjí, vyrábí a prodává vlastní
VíceManuál. Verze Duben Novinka v detekci chromozomálních aberací spojených s akutní myeloidní leukémií. Mentype AMLplex QS Duben 2015 LEUGAAMLv2cz
Mentype AMLplex QS Manuál Novinka v detekci chromozomálních aberací spojených s akutní myeloidní leukémií Verze Duben 2015 Vyrobeno v Německu Biotype Diagnostic GmbH vyvíjí, vyrábí a prodává vlastní detekční
VíceCHORUS COPROCOLLECT. Výrobce: DIESSE Diagnostica Senese Via delle Rose Monteriggioni (Siena) Itálie
CHORUS COPROCOLLECT 86602 Výrobce: DIESSE Diagnostica Senese Via delle Rose 10 53035 Monteriggioni (Siena) Itálie OBSAH 1 Úvod... 3 2 Princip testu... 3 3 Složení soupravy... 3 4 Další potřebné vybavení
VíceHR1 BRCA 1/2 NGS IVD KIT
HR1 BRCA 1/2 NGS IVD KIT Navrženo pro PGM ION-TORRENT KÓD PRODUKTU: PRG-HR1-01 VELIKOST BALENÍ: 16 TEST Uživatelská příručka Rev03.2015 Str. 1 Obsah 1. ÚVOD 3 2. ÚČEL POUŽITÍ 3 3. OBSAH KITU 4 4. SKLADOVÁNÍ
VíceRapid-VIDITEST Adenovirus Resp.
Rapid-VIDITEST Adenovirus Resp. (Jednokrokový kazetový test pro in vitro diagnostiku Adenoviru z nosních výtěrů, výplachů a aspirátů) Návod k použití soupravy Výrobce: VIDIA spol. s r.o., Nad Safinou II
VíceProflow Adenovirus. KATALOGOVÉ ČÍSLO: PL.3011 (20 testů)
KATALOGOVÉ ČÍSLO: PL.3011 (20 testů) Proflow Adenovirus ZAMÝŠLENÉ POUŽITÍ Proflow Adenovirus je jednoduchý, rychlý imunologický test pro kvalitativní detekci antigenu Adenoviru ve vzorku stolice. Tento
VíceKVANTITATIVNÍ REAL-TIME PCR (q-real-time PCR)
KVANTITATIVNÍ REAL-TIME PCR (q-real-time PCR) Metoda Real-time PCR slouží pro kvantifikaci DNA a transkripce. Metoda je založena na klasické PCR, ovšem s využitím speciálního cycleru, který v průběhu PCR
VícePříručka pro sadu artus HCV QS- RGQ
Leden 2016 Příručka pro sadu artus HCV QS- RGQ Verze 1 24 (katalogové č. 4518363) 72 (katalogové č. 4518366) In vitro diagnostikum pro kvantitativní stanovení Pro použití s přístroji QIAsymphony SP/AS
VíceBlueWell Intrinsic Factor IgG ELISA Cat.. IF01-96
BlueWell Intrinsic Factor IgG ELISA Cat.. IF01-96 96 D-tek s.a. rue René Descartes 19 BE-7000 Mons BELGIUM Tel. +32 65 84 18 88 Fax. +32 65 84 26 63 Email: info@d-tek.be Domovská stránka www.d-tek.be R.C.
VíceDNA TECHNIKY IDENTIFIKACE ŽIVOČIŠNÝCH DRUHŮ V KRMIVU A POTRAVINÁCH. Michaela Nesvadbová
DNA TECHNIKY IDENTIFIKACE ŽIVOČIŠNÝCH DRUHŮ V KRMIVU A POTRAVINÁCH Michaela Nesvadbová Význam identifikace živočišných druhů v krmivu a potravinách povinností každého výrobce je řádně a pravdivě označit
VíceRapid-VIDITEST Influenza A+B
Rapid-VIDITEST Influenza A+B (Jednokrokový blisterový test pro in vitro diagnostiku viru Influenzy typu A a B z nosních výtěrů, výplachů a aspirátů) Návod k použití soupravy Výrobce: VIDIA spol. s r.o.,
VíceHR1 BRCA 1/2 NGS IVD KIT
HR1 BRCA 1/2 NGS IVD KIT Navrženo pro PGM ION-TORRENT KÓD PRODUKTU: PRG-HR1-01 VELIKOST BALENÍ: 16 TEST Uživatelská příručka Rev05.2015 Str. 1 Obsah 1. ÚVOD 3 2. ÚČEL POUŽITÍ 3 3. OBSAH KITU 4 4. SKLADOVÁNÍ
VíceIL-6. Laterální imunodifuze pro semikvantitativní měření lidského interleukinu 6 (IL- 6)
IL-6 Laterální imunodifuze pro semikvantitativní měření lidského interleukinu 6 (IL- 6) Lateralní průtokový imunologický test pro kvantitativní stanovení lidského interleukinu-6 (IL-6), vyhodnocení pomocí
VíceVerze: 1.2 Datum poslední revize: 24.9.2014. Nastavení real-time PCR cykleru. Light Cycler 480 Instrument. (Roche) generi biotech
Verze: 1.2 Datum poslední revize: 24.9.2014 Nastavení real-time PCR cykleru Light Cycler 480 Instrument (Roche) generi biotech OBSAH 1. Nastavení teplotního profilu...3 1.1. Nastavení nového teplotního
VícePROGENSA PCA3 Urine Specimen Transport Kit
Pokyny pro lékaře Pokyny PROGENSA PCA3 Urine Specimen Transport Kit Určeno pro diagnostické použití in vitro. Pouze pro export z USA. 1. Chcete-li zajistit dostatečný odběr moči, může pomoci, když pacient
VícePokročilé biofyzikální metody v experimentální biologii
Pokročilé biofyzikální metody v experimentální biologii Ctirad Hofr 1/1 Proč biofyzikální metody? Biofyzikální metody využívají fyzikální principy ke studiu biologických systémů Poskytují kvantitativní
VíceNÁVOD K POUŽITÍ PRO HER2 DNA QUANTIFICATION KIT
IČ: 80 DIČ: CZ80 sales@intellmed.eu NÁVOD K POUŽITÍ PRO HER DNA QUANTIFICATION KIT IČ: 80 DIČ: CZ80 sales@intellmed.eu OBSAH Návod k použití pro HER DNA QUANTIFICATION KIT.... Úvod.... Označení.... Rozsah
VíceRapid-VIDITEST. H. pylori. (Jednokrokový blisterový test pro in vitro diagnostiku Helicobacter pylori ve stolici) Návod k použití soupravy
Rapid-VIDITEST H. pylori (Jednokrokový blisterový test pro in vitro diagnostiku Helicobacter pylori ve stolici) Návod k použití soupravy Výrobce: VIDIA spol. s r.o., Nad Safinou II 365, Vestec, 252 42
VíceCRP. Axis - Shield. SINGLE TESTS CRP kvantitativní stanovení pomocí přístroje NycoCard Reader II
Lékařská technika a speciální zdravotní materiál Společnost je zapsána v obchodním rejstříku Městského soudu v Praze, odd. C vložka 1299 Obchodní 110, 251 70 Praha Čestlice Tel. +420 296 328 300 Fax. +420
VíceAKTUÁLNÍ KONTROVERZE A NOVÉ SMĚRY V PREIMPLANTAČNÍM GENETICKÉM TESTOVÁNÍ EMBRYÍ. Mgr. Jakub Horák, Ph.D.
AKTUÁLNÍ KONTROVERZE A NOVÉ SMĚRY V PREIMPLANTAČNÍM GENETICKÉM TESTOVÁNÍ EMBRYÍ Mgr. Jakub Horák, Ph.D. PGD/PGS - JAK TO BYLO? Preimplantační genetická diagnostika (PGD) cíleně zaměřené vyšetření k detekci
VíceVÝZNAM NĚKTERÝCH FAKTORŮ PREANALYTICKÉ FÁZE V MOLEKULÁRNÍ BIOLOGII
VÝZNAM NĚKTERÝCH FAKTORŮ PREANALYTICKÉ FÁZE V MOLEKULÁRNÍ BIOLOGII Plíšková L., Hrochová K., Kutová R. Ústav klinické biochemie a diagnostiky FN Hradec Králové PREANALYTICKÁ FÁZE V MOLEKULÁRNÍ BIOLOGII
VíceZeptejte se svého lékaře
Jednoduchý a bezpečný krevní test, který nabízí vysokou citlivost stanovení Neinvazivní test, který vyhodnocuje riziko onemocnění chromozomálního původu, jako je např. Downův syndrom, a nabízí také možnost
VíceLaboratorní workshop s teoreticko praktickou ukázkou molekulárně biologických technik ve spolupráci s firmou ROCHE
BiochemNet vytvoření sítě pro podporu spolupráce biomedicínských pracovišť a zvýšení uplatnitelnosti absolventů biochemických oborů v praxi Laboratorní workshop s teoreticko praktickou ukázkou molekulárně
VícePříručka pro sadu artus EBV RG PCR
Prosinec 2014 Příručka pro sadu artus EBV RG PCR Verze 1 24 (katalogové č. 4501263) 96 (katalogové č. 4501265) In vitro diagnostikum pro kvantitativní stanovení Pro použití s přístrojem Rotor-Gene Q 4501263,
VíceChromoprobe Multiprobe - CLL
Návod k použití REF: PMP 018/PMP 017/ PMP 016/ PMP 020 Chromoprobe Multiprobe - CLL Pouze pro profesionální použití Fluorescenční In Situ Hybridizace (FISH) je technika, která umožňuje detekci DNA sekvencí
VíceRapid-VIDITEST RSV. (Jednokrokový kazetový test pro in vitro diagnostiku Respiračního syncytiálního viru z nosních výtěrů, výplachů a aspirátů)
Rapid-VIDITEST RSV (Jednokrokový kazetový test pro in vitro diagnostiku Respiračního syncytiálního viru z nosních výtěrů, výplachů a aspirátů) Návod k použití soupravy Výrobce: VIDIA spol. s r.o., Nad
VíceIMMUVIEW L. PNEUMOPHILA AND L. LONGBEACHE URINARY ANTIGEN TEST
Dodává: GALI spol. s r.o., Ke Stadionu 179, Semily 513 01 tel. 481 689 050 fax. 481 689 051 info@gali.cz www.gali.cz IMMUVIEW L. PNEUMOPHILA AND L. LONGBEACHE URINARY ANTIGEN TEST 1 IMMUVIEW L. PNEUMOPHILA
VícePro použití při přípravě a izolaci purifikovaných lymfocytů z plné krve PŘÍBALOVÁ INFORMACE. Pro diagnostické použití in vitro PI-TT.
Pro použití při přípravě a izolaci purifikovaných lymfocytů z plné krve PŘÍBALOVÁ INFORMACE Pro diagnostické použití in vitro PI-TT.610-CZ-V5 Informace pro použití Použití Činidlo T-Cell Xtend je určeno
VíceDiagnostika infekce Chlamydia trachomatis pomocí molekulárně genetické metody real time PCR nejen u pacientek z gynekologických zařízení
Diagnostika infekce Chlamydia trachomatis pomocí molekulárně genetické metody real time PCR nejen u pacientek z gynekologických zařízení Mgr. Klára Vilimovská Dědečková, Ph.D. Synlab genetics s.r.o. Molekulární
VícePolymorfismus délky restrikčních fragmentů
Polymorfismus délky restrikčních fragmentů Princip: Chemikálie: PCR produkt z předchozího praktického cvičení Endonukleáza KpnI 10 U μl -1 Pufr pro KpnI 10 koncentrovaný (Tris-HCl 100 mmol l -1 ph 7,5,
Více