Zuzana Kufová , Mikulov. Analýza u amyloidóz, hereditárních amyloidóz

HTML
DOWNLOAD

Rozměr: px

Začít zobrazení ze stránky:

Download "Zuzana Kufová 10.4.2015, Mikulov. Analýza u amyloidóz, hereditárních amyloidóz"

Lukáš Prokop
před 9 lety
Počet zobrazení:

1 Zuzana Kufová , Mikulov Analýza u amyloidóz, hereditárních amyloidóz

2 Obsah přednášky Hereditární amyloidózy - hereditární amyloidózy - proteiny akutní fáze AL amyloidóza

3 Hereditární amyloidózy Zdroj:

4 Hereditární amyloidózy Vyšetřeno 33 vzorků (duben ) Ostrava - 27, Brno - 2, Olomouc 4 29 ATTR, 3 AFIB Poz. ATTR 1, AFIB 2 Kompletní set genů (7) Izolace ze suché kapky krve Zdroj: Klinika hematoonkolgie

ATTR 1, AFIB 2 Kompletní set genů (7) Izolace ze suché

5 Amyloidogenní prekurzorové proteiny 7 základních genů (Comitte of ISA)

6 Sekvenování nové generace (NGS) NGS ovládlo DNA diagnostiku Všech 11 genů 4 raritní (PRP, APP, AβM, ABri) Unikátní set 330 vzorků kardiom. Platforma Illumina MiSeq (48/run) Vyloučení AL amyloidózy Předpokládáme 5% záchyt (ALA+HA) Finanční hledisko: Zdroj: Snižuje razantně finanční náklady na diagnostiku, ale případě, že je prováděn screening u více vzorků v jednom běhu sekvenace!

Platforma Illumina MiSeq (48/run) Vyloučení AL amyloidózy Předpokládáme 5% záchyt (ALA+HA) Finanční

7 Pokrytí genů u NGS

8 Proteiny akutní fáze (PAP) Řadíme mezi HA, SAA amyloid Monogenní onem., AD i AR Porucha regulace zánětu Period. horečky a autoinf. onem. 25 genů Amyloidóza asi u 60-70% Endemické oblasti výskytu Manifestace již v dětském věku Zdroj:

onem. 25 genů Amyloidóza asi u 60-70% Endemické oblasti výskytu

9 Přehled mutací v genech PAP Zdroj:

10 Přehled autoinflamatorních onemocnění Zdroj:

11 AL amyloidóza Zdroj:

12 Genomický profil AL amyloidózy Metaanalýza dat z databáze GEO (Gene Expression Omnibus) ID souborů: GSE6477, GSE24128 HD (n=15), MGUS (n=21), SMM (n=24), MM (n=69) and ALA (n=16) Cíl: odhalit změny expresního profilu ALA oproti MM, SMM, MGUS a HD

(n=15), MGUS (n=21), SMM (n=24), MM (n=69) and ALA (n=16)

13 Height SMM New MM SMM AL amyloidosis New SMM MM New MM New SMM New SMM New SMM New MM AL amyloidosis AL amyloidosis AL amyloidosis AL AL amyloidosis amyloidosis AL amyloidosis AL amyloidosis AL AL amyloidosis amyloidosis Normal donor Normal donor Normal Normal donor MGUS donor Normal donor Normal donor Normal Normal donor donor Normal donor MGUS Normal donor MGUS SMM SMM SMM New MGUS New SMM MM MGUS MGUS Normal MGUS donor SMM MGUS MGUS SMM MGUS SMM MGUS New SMM New MGUS MM c(1, 2, 5, 7, 6, 8) Genomický profil AL amyloidózy Cluster Dendrogram Normal donors MGUS SMM MM AL amyloidosis SMM MGUS MGUS SMM New SMM AL amyloidosis AL amyloidosis MGUS MGUS SMM MGUS SMM MGUS MGUS MGUS SMM Index MM1 MM2

Normal donor MGUS SMM SMM SMM New MGUS New SMM MM MGUS MGUS Normal MGUS donor SMM MGUS MGUS SMM MGUS SMM MGUS New SMM New MGUS MM c(1, 2, 5, 7, 6, 8) 1 2 3 4 5 6 7 Genomický profil AL

14 Genomický profil AL amyloidózy Unikátní genomický profil ALA: 256 genů 16 genů geny, které mají nejlepší prediktivní schopnost diferenciace pacientů AL z ND, MGUS, SMM nebo z MM

16 Genomický profil AL amyloidózy Bližší studium genů - geny spojené s ribozomy (strukturní geny, iniciační faktory) a geny pro imunoglobulinové řetězce (stavební proteiny) GEP, qrt PCR potřeba více dat pro AL validace modelu Analýza výsledku GEP z MM: ALA-like profile

imunoglobulinové řetězce (stavební proteiny) GEP, qrt PCR potřeba

17 Klonální diverzifikace aberantních plazmatických buněk u amyloidózy lehkých řetězců imunoglobulinů Projekt AZVČR Popsat vznik a klonální diverzifikaci aberantních klonů plazmatických buněk identifikovaných pomocí NGS u nemocných ALA v kombinaci s MM Žádost o vzorky: AL, AL+MM - periferní krev v EDTA 7 ml - kostní dřeň min. 30 ml Klinika hematoonkolgie

plazmatických buněk identifikovaných pomocí NGS u nemocných ALA v kombinaci s MM Žádost

18 Poděkování/Acknowledgement Tým pro MDS a myeloproliferace prof. MUDr. Elena Tóthová, CSc. MUDr. Lukáš Stejskal MUDr. Cecília Bodzásová MUDr. Zuzana Kučerová MUDr. Petra Richterová CLL tým prof. MUDr. Roman Hájek, CSc. MUDr. Jana Zuchnická Ostatní lékaři KHO MUDr. Jana Fečková Mihályová Výzkumný tým KHO MUDr. Fedor Kryukov, Ph.D. MUDr. Elena Kryukova, Ph.D. Mgr. Zuzana Kufová Bc. Jana Filipová ALA a WM tým prof. MUDr. Roman Hájek, CSc. MUDr. Lenka Zahradová, Ph.D. MUDr. Hana Plonková MUDr. Tomáš Jelínek MUDr. Michal Kaščák Tým pro trombózu a hemostázu prim. MUDr. Jaromír Gumulec prim. MUDr. Milan Matuška, Ph.D. Tým pro ALL/AML MUDr. Zdeněk Kořístek, Ph.D. MUDr. Petra Richterová Myelomový tým prof. MUDr. Roman Hájek, CSc. MUDr. Lenka Zahradová, Ph.D. MUDr. Hana Plonková MUDr. Tomáš Jelínek Lymfomový tým MUDr. Juraj Ďuraš MUDr. Milan Navrátil MUDr. Michal Kaščák Laboratorní tým KHO Mgr. Jana Smejkalová, Ph.D. Mgr. Lucie Adamusová Mgr. Lukáš Grebeníček Bc. Petra Vrublová Mgr. Hana Svěchová Sesterský tým pod vedením: Mgr. Kateřiny Hašové Kateřiny Horákové Mgr. Františky Vyhnánkové Petry Ramikové Datamanažerský tým pod vedením: Mgr. Martiny Januškové Spolupráce: MUDr. Tomáš Pika, Ph.D. Klinika hematoonkolgie

MUDr. Roman Hájek, CSc. MUDr. Lenka Zahradová, Ph.D. MUDr. Hana Plonková MUDr. Tomáš Jelínek MUDr. Michal Kaščák Tým pro trombózu a hemostázu prim. MUDr. Jaromír Gumulec prim. MUDr. Milan Matuška, Ph.

19 Děkuji za pozornost Klinika hematoonkolgie

Podobné dokumenty

Mgr. Zuzana Kufová , Mikulov. Genomické analýzy u Waldenströmovy makroglobulinémie

Mgr. Zuzana Kufová , Mikulov. Genomické analýzy u Waldenströmovy makroglobulinémie Mgr. Zuzana Kufová 10.4.2015, Mikulov Genomické analýzy u Waldenströmovy makroglobulinémie Obsah přednášky Genomický profil u WM Mutace v genu MYD88 Mutace v genu CXCR4 Diagnostika Výsledky http://socratic.org/questions/how-do-functional-groups-affect-the-structure-and-function-of-macromolecules