Hledání chemického modelu regresní analýzou VIS spekter

Podobné dokumenty
Počet světlo-absorbujících částic v rovnovážné směsi faktorovou analýzou spekter

Thermodynamické disociační konstanty antidepresiva Vortioxetinu

Spektrofotometrické stanovení termodynamických disociačních konstant vybraných cytostatik

http: //meloun.upce.cz,

Protonační rovnováhy léčiv faktorovou analýzou a nelineární regresí absorbanční responzní plochy

Univerzita Pardubice Fakulta chemicko technologická Katedra analytické chemie Licenční studium Management systému jakosti

Faktorová analýza a nelineární regrese absorbanční responzní plochy v protonačních rovnováhách vybraných léčiv

Kalibrace a limity její přesnosti

Spektrofotometrické stanovení pk léčiv

UŽITÍ FAKTOROVÉ ANALÝZY A NELINEÁRNÍ REGRESE PŘI STANOVENÍ DISOCIAČNÍCH KONSTANT LÉČIV

UNIVERZITA PARDUBICE

UNIVERZITA PARDUBICE

UNIVERZITA PARDUBICE. 4.4 Aproximace křivek a vyhlazování křivek

SPEKTROSKOPICKÉ VLASTNOSTI LÁTEK (ZÁKLADY SPEKTROSKOPIE)

vzorek vzorek

SEMESTRÁLNÍ PRÁCE X. Aproximace křivek Numerické vyhlazování

UNIVERZITA PARDUBICE Fakulta chemicko-technologická Katedra analytické chemie Nám. Čs. Legií 565, Pardubice

AVDAT Nelineární regresní model

Statistická analýza jednorozměrných dat

AVDAT Klasický lineární model, metoda nejmenších

1 Tyto materiály byly vytvořeny za pomoci grantu FRVŠ číslo 1145/2004.

Univerzita Pardubice Chemicko-technologická fakulta Katedra analytické chemie

Základy fotometrie, využití v klinické biochemii

UNIVERZITA PARDUBICE Fakulta chemicko-technologická Katedra analytické chemie Nám. Čs. Legií 565, Pardubice

Stanovení manganu a míry přesnosti kalibrace ( Lineární kalibrace )

1. Příloha 1 Návod úlohy pro Pokročilé praktikum z biochemie I

Pravděpodobnost v závislosti na proměnné x je zde modelován pomocí logistického modelu. exp x. x x x. log 1

KALIBRACE A LIMITY JEJÍ PŘESNOSTI. Semestrální práce UNIVERZITA PARDUBICE. Fakulta chemicko-technologická Katedra analytické chemie

UNIVERZITA PARDUBICE Fakulta chemicko-technologická Katedra analytické chemie Nám. Čs. Legií 565, Pardubice

Kalibrace a limity její přesnosti

Statistická analýza jednorozměrných dat

Tvorba nelineárních regresních modelů v analýze dat

Určujeme neznámé hodnoty parametru základního souboru. Pomocí výběrové charakteristiky vypočtené z náhodného výběru.

přesnost (reprodukovatelnost) správnost (skutečná hodnota)? Skutečná hodnota použití různých metod

Plánování experimentu

Plánování experimentu

UNIVERZITA PARDUBICE

Statistika. Regresní a korelační analýza Úvod do problému. Roman Biskup

UNIVERZITA PARDUBICE

Kurz 1 Úvod k biochemickému praktiku

6. Lineární regresní modely

Univerzita Pardubice Fakulta chemicko-technologická Katedra analytické chemie

Analytické znaky laboratorní metody Interní kontrola kvality Externí kontrola kvality

Profilování vzorků heroinu s využitím vícerozměrné statistické analýzy

2 Zpracování naměřených dat. 2.1 Gaussův zákon chyb. 2.2 Náhodná veličina a její rozdělení

EXPERIMENTÁLNÍ MECHANIKA 2 Přednáška 5 - Chyby a nejistoty měření. Jan Krystek

SEMESTRÁLNÍ PRÁCE. Leptání plasmou. Ing. Pavel Bouchalík

Aproximace a vyhlazování křivek

Střední průmyslová škola, Karviná. Protokol o zkoušce

Tvorba grafů v programu ORIGIN

Kompendium 2012, Úloha B8.01, str. 785, Model A

Univerzita Pardubice Fakulta chemicko technologická Katedra analytické chemie Licenční studium chemometrie

Balmerova série. F. Grepl 1, M. Benc 2, J. Stuchlý 3 Gymnázium Havlíčkův Brod 1, Gymnázium Mnichovo Hradiště 2, Gymnázium Šumperk 3

Univerzita Pardubice Fakulta chemicko-technologická Katedra analytické chemie STATISTICKÉ ZPRACOVÁNÍ EXPERIMENTÁLNÍCH DAT

Regulační diagramy (RD)

Posouzení přesnosti měření

ANOVA. Semestrální práce UNIVERZITA PARDUBICE. Fakulta chemicko-technologická Katedra analytické chemie

Regresní a korelační analýza

STŘEDNÍ ODBORNÁ ŠKOLA a STŘEDNÍ ODBORNÉ UČILIŠTĚ, Česká Lípa, 28. října 2707, příspěvková organizace

Regresní a korelační analýza

Fakulta chemicko technologická Katedra analytické chemie licenční studium Management systému jakosti Kalibrace a limity její přesnosti

Chyby spektrometrických metod

Tvorba modelu sorpce a desorpce 85 Sr na krystalických horninách za dynamických podmínek metodou nelineární regrese

POLYNOMICKÁ REGRESE. Jedná se o regresní model, který je lineární v parametrech, ale popisuje nelineární závislost mezi proměnnými.

6. Lineární regresní modely

Regresní analýza. Ekonometrie. Jiří Neubauer. Katedra ekonometrie FVL UO Brno kancelář 69a, tel

Odhad parametrů N(µ, σ 2 )

Tvorba nelineárních regresních

Numerická matematika 1

ZABEZPEČENÍ KVALITY V LABORATOŘI

Úvod do problematiky měření

Zkušenosti s tvorbou náročných grafů editorem ORIGIN

Úloha 1. Napište matici pro případ lineárního regresního spline vyjádřeného přes useknuté

Základní terminologické pojmy (Mezinárodní metrologický slovník VIM3)

REGRESNÍ ANALÝZA V PROSTŘEDÍ MATLAB

Fakulta chemicko-technologická Katedra analytické chemie. 3.2 Metody s latentními proměnnými a klasifikační metody

Regresní analýza 1. Regresní analýza

Návrh a vyhodnocení experimentu

PROTOLYTICKÉ ROVNOVÁHY

Ústřední komise Chemické olympiády. 55. ročník 2018/2019 NÁRODNÍ KOLO. Kategorie E. Řešení praktických částí

Lineární regrese. Komentované řešení pomocí MS Excel

Kalibrace a limity její přesnosti

STATISTIKA A INFORMATIKA - bc studium OZW, 1.roč. (zkušební otázky)

Náhodná proměnná. Náhodná proměnná může mít rozdělení diskrétní (x 1. , x 2. ; x 2. spojité (<x 1

Regresní a korelační analýza

UNIVERZITA PARDUBICE Fakulta chemicko-technologická Katedra analytické chemie. Nám. Čs. Legií 565, Pardubice. Semestrální práce ANOVA 2015

Adsorpce barviva na aktivním uhlí

SPEKTRÁLNÍ METODY. Ing. David MILDE, Ph.D. Katedra analytické chemie Tel.: ; (c) David MILDE,

IDENTIFIKACE BIMODALITY V DATECH

Tvorba nelineárních regresních modelů v analýze dat

Metoda nejmenších čtverců Michal Čihák 26. listopadu 2012

4EK211 Základy ekonometrie

Odhad parametrů N(µ, σ 2 )

Aproximace a interpolace

AVDAT Geometrie metody nejmenších čtverců

Automatická potenciometrická titrace Klinická a toxikologická analýza Chemie životního prostředí Geologické obory

Předpoklad o normalitě rozdělení je zamítnut, protože hodnota testovacího kritéria χ exp je vyšší než tabulkový 2

KATEDRA MATERIÁLOVÉHO INŽENÝRSTVÍ A CHEMIE. Stanovení základních materiálových parametrů

Transkript:

Hledání chemického modelu regresní analýzou VIS spekter Milan Javůrek 1 a Milan Meloun 2 1 Katedra řízení procesů, Fakulta elektrotechniky a informatiky, Univerzita Pardubice, Milan.Javurek@upce.cz 2 Katedra analytické chemie, Fakulta chemicko-technologická, Univerzita Pardubice, Milan.Meloun@upce.cz Abstrakt: Určení chemického modelu, tj. stechiometrie částic, jejich koncentrace a disociační konstanty (nebo konstanty stability), je velmi důležité pro posouzení vlastností a acidobazického chování látek v roztocích. V článku je řešena věrohodnost stanovení při použití nelineární regrese absorbančních responzních ploch. 1. Úvod Záporný dekadický logaritmus disociační konstanty při porovnání se stupnicí ph určuje, zda se daná látka chová jako kyselina příp. zásada. Jsou-li jednotlivé komponenty barevné, nejčastěji se používá pro svoji jednoduchost, spolehlivost i přesnost metoda měření a analýzy spekter. Pro různé koncentrace jednotlivých komponent a proměňované hodnoty ph v potřebném rozsahu jsou pak naměřena celá spektra ve viditelné oblasti. Nevýhodou této metody je omezená platnost Lambertova Beerova zákona, kdy můžeme měřit pouze v určitém rozsahu koncentrací a pak některé z částic nemusí být identifikovatelné pro svou malou koncentraci. V těchto případech musíme použít jinou metodu např. potenciometrickou titraci, kdy rozsah koncentrací může být o několik řádů větší. Text této přednášky vychází z článku [1], kde lze najít další podrobnosti vč. kompletního přehledu literatury. 2. Data a model Acidobazické chování látek v roztocích popisuje Guldbergův Waageův zákon, který charakterizuje rovnovážný stav popsaný rovnicí: z + z L + H HL (1) pomocí protonační (disociační resp. deprotonační pro opačný průběh) konstanty: z HL KH = (2) z + L H Hranaté závorky vyjadřují rovnovážný (ustálený) stav. Tak se v roztoku mohou vyskytovat různě protonizované částice látky: L, HL, H 2 L, H 3 L, tj. obecně H r L, takže lze definovat konstanty stability libovolně protonovaných částic: β LH = L q r qr q r [ H] Každá z těchto částic může absorbovat světlo, tj. má své vlastní spektrum. Absorpci světla jednotlivými částicemi popisuje Lambertův Beerův zákon: n c ij ε j, ncn n= 1 A = (4) (3)

kde ε jn, je tzv. molární absorpční koeficient charakteristický pro látku n a vlnovou délku j a c n je koncentrace látky n. Veličinu nazýváme absorbance, vyjadřuje nám míru barevnosti roztoku, resp. míru absorpce světla roztokem. Při měření spekter pak získáváme celkovou absorbanci, tj. vlastně součet příspěvků absorbancí světla jednotlivými částicemi. 3. Metoda Předpokladem k určení chemického modelu je znalost skutečného počtu barevných částic v roztoku. Absorbanční matice pro n koncentrací a j vlnových délek je podrobena faktorové analýze podle Wernimontovy Kankareho metody [2]. Zde zlom na Cattelově grafu směrodatné odchylky reziduí absorbance určuje počet barevných částic. Při vlastním regresním výpočtu užijeme metodu nejmenších čtverců, tj. počítáme sumu odchylek absorbancí experimentálních a vypočtených. Vypočtená absorbance se vyčísluje jako součet příspěvků jednotlivých látek, přičemž koncentrace odpovídajících částic se počítají z rovnice (3) pro daný odhad konstanty stability. Doplňkovou podmínkou je znalost celkových koncentrací jednotlivých komponent. Rovněž iteračním způsobem se dopočítávají molární absorpční koeficienty těchto částic. Východiskem pro každý iterační krok jsou tedy odhadnuté hodnoty disociačních konstant (tj. pro zvolený chemický model). Zlepšující kroky hodnot těchto konstant se počítají z celé matice absorbancí, což v případě derivační metody představuje součty parciálních derivací ve všech bodech (derivujeme podle parametrů, tj. hodnot disociačních konstant). 4. Verifikace výsledků Výše popsaným způsobem lze provést více výpočtů pro různé varianty chemického modelu. Zde potřebujeme jednoznačná kritéria pro porovnání dosažených výsledků, resp. dosažené těsnosti proložení regresního výpočtu. Prvotní je fyzikální významnost parametrů (hodnot disociačních konstant), jejich odhadnuté chyby z nelineární regrese a spočtené volné koncentrace jednotlivých částic. Koncentrace nižší než 5% se zpravidla zanedbávají, tj. příslušná částice nemá fyzikálně chemický význam. Pro hodnocení kvality proložení máme v případě nelineární regrese k dispozici pouze statistickou analýzu reziduí. Jelikož však data jsou tvořena celou maticí, je možné analyzovat rezidua buď po řádcích (pro určitou koncentraci přes všechny vlnové délky) nebo po sloupcích (přes všechny koncentrace po jednotlivých vlnových délkách). Užívanější je postup první. Vypočítávají se statistické charakteristiky, tj. všechny čtyři centrální momenty, medián a Hamiltonův R-faktor, které nám dostatečně vypovídají o parametrech polohy a tvaru daného souboru reziduí. Zajímavé je porovnání aritmetického průměru a mediánu, které by se pro normální rozdělení měly shodovat. Kromě klasických reziduí je také možno užít i jiné varianty zde připadají v úvahu standardizovaná a Jackknife rezidua, která se používají k identifikaci odlehlých bodů. Zde ovšem musíme ještě dopočítávat projekční matici P = J (J T J) -1 J T (kde J je Jakobián, matice prvních parciálních derivací, viz [3]), kdy se potřebné derivace opět sčítají po řádcích absorbanční matice. 5. Simulace dat Velmi významným nástrojem pro ověření kvality výpočtu je zařazení možnosti vygenerování syntetických dat pro předvolené hodnoty koncentrací a parametrů. Tato matice absorbancí je zatížena náhodnými chybami s normálním rozdělením a následně analyzována stejně jako data experimentální. Shoda předvolených a nalezených hodnot parametrů včetně

analýzy reziduí je jednoznačným kritériem při posouzení především správnosti výpočtu. Tím je také vytvořena platforma pro hodnocení různých algoritmů. 6. Testování algoritmů Pro analyzování spektrálních dat byla publikována řada algoritmů. Na našem pracovišti je po řadu let s úspěchem používán program SQUAD(84), viz [4]. Dále se podařilo získat program SPECFIT/32, viz [5], který je podstatně novější. Bylo provedeno jejich testování jak na autentických experimentálních datech, tak na sérii dat simulovaných s různou hodnotou směrodatné odchylky souboru chyb s normálním rozdělením, kterými jsou zatěžována vygenerovaná data. Celý průběh testování, shrnutý do přehledné tabulky a doplněný grafickými schématy, lze najít v [1]. Obr. 1 (a) Absorbanční responzní plocha čili (b) vějíř spekter tvoří data, (c) křivky molárních absorpčních koeficientů a distribuční diagram částic protonančního modelu tvoří výsledek. Závěr Bylo provedeno testování dvou rozličných algoritmů pro analýzu spektrálních dat za účelem stanovení chemického modelu. Program SPECFIT/32 je novější, je z numerického hlediska podstatně vyspělejší je zde užita Levenbergova Marquardtova minimalizační metoda, proto rychleji a přesněji konverguje. Program SQUAD(84) užívá metodu Newtonovu Raphsonovu. Obsahuje však řadu diagnostických nástrojů, především kompletní analýzu reziduí, což umožňuje objektivněji posuzovat průběh výpočtu zejména v případě, analyzujeme-li neznámý vzorek. Po provedeném testování lze říci, že oba programy dosahovaly shodných výsledků co do správnosti nalezených parametrů, ale program SPECFIT/32 dosahoval vyšší těsnosti proložení a tudíž i vyšší přesnosti stanovených parametrů.

Pro spolehlivé určení chemického modelu je klíčová přesnost a správnost experimentálních dat. To je umožněno na dnes již běžných měřicích přístrojích, které umožňují měřit absorbanci s přesností na šest desetinných míst. Obr. 2 Správnost a přesnost nalezených odhadů čtyř disociačních konstant v závislosti na vloženém šumu s inst (A) přístroje. Svislice značí šum použitého spektrofotometru firmy GBC.

Obr. 3 Věrohodnost určení počtu světlo-absorbujících částic Cattelovým grafem v závislosti na velikosti šumu přístroje s inst (A). Literatura [1] MELOUN, M., FERENČÍKOVÁ, Z., JAVŮREK, M. Reliability of dissociation constants and resolution capability of SQUAD(84) and SPECFIT/32 in the regression of multiwavelength spectrophotometric ph-titration data, Spectrochim. Acta A: Mol. Biomol. Spectrosc. (2011), doi: 10.1016/j.saa.2011.10.041. [2] KANKARE, J.J. Computation of Equilibrium Constants for Multicomponent Systems from Spectrophoto-metric Data, Anal. Chem. 42 (1970) 1322. [3] MELOUN, M.,MILITKÝ, J. Statistická analýza experimentálních dat, Praha: Academia, 2004, 953 s., ISBN 80-200-1254-0. [4] MELOUN, M., JAVŮREK, M., HAVEL, J. Multiparametric curve fitting. 10. A structural classification of programs for analyzing multicomponent spectra and their use in equilibrium-model determination, Talanta 33 (1986), 513-524 [5] SPECFIT/32, Spectrum Software Associates, 197M Boston Post Road West, Marlborough, MA, 01752 USA, 2004.