Test aktivity a cytotoxicity lymfocytů

Podobné dokumenty
Bakteriální bioluminiscenční test. Stanovení účinnosti čištění odpadních vod pomocí bakteriálního bioluminiscenčního testu

1 Metody sledování komplementového systému

Praktický kurz Monitorování toxicity vybraných cytostatik pomocí MTT testu a real-time monitoringu xcelligence.

Cvičení ke kurzu Obecná ekotoxikologie. Úloha A - Stanovení ekotoxicity v testu klíčení rostlin

IZOLACE DNA (KIT DNeasy Plant Mini)

Protokol č. 7 Pozorování živých a mrtvých buněk kvasinek Vitální test

ZÁVĚREČNÝ PROTOKOL O TESTOVÁNÍ BIOAKTIVNÍCH VLASTNOSTÍ LÁTKY CYTOPROTECT

Makrofágy a parazitární infekce

Úloha č. 1 Odměřování objemů, ředění roztoků Strana 1. Úkol 1. Ředění roztoků. Teoretický úvod - viz návod

Přímé stanovení celkového počtu buněk kvasinek pomocí Bürkerovy komůrky Provedení vitálního testu

Jednotné pracovní postupy zkoušení krmiv

Zkouška inhibice růstu řas

ANALÝZA MARKERŮ OXIDAČNÍHO POŠKOZENÍ DNA, PROTEINŮ A LIPIDŮ PO IN VITRO APLIKACI LÁTEK NA BUNĚČNÉ KULTURY HEL a A549

Funkční testy: BasoFlowEx Kit FagoFlowEx Kit

Nové metody v průtokové cytometrii. Vlas T., Holubová M., Lysák D., Panzner P.

Podrobný seznam vyšetření - imunologie

2) Připravte si 3 sady po šesti zkumavkách. Do všech zkumavek pipetujte 0.2 ml roztoku BAPNA o různé koncentraci podle tabulky.

Ovládání Open Office.org Calc Ukládání dokumentu : Levým tlačítkem myši kliknete v menu na Soubor a pak na Uložit jako.

Protokoly Transformace plasmidu do elektrokompetentních buněk BL21 Pracovní postup:

METODY VYŠETŘOVÁNÍ BUNĚČNÉ IMUNITY. Veřejné zdravotnictví

Tkáňový homogenizátor MagNA Lyser od společnosti Roche

MagPurix Blood DNA Extraction Kit 200

Praktické cvičení: Izolace a purifikace rekombinantního proteinu

Progrese HIV infekce z pohledu laboratorní imunologie

STANOVENÍ ANTIOXIDAČNÍ KAPACITY METODOU FOTOCHEMILUMINISCENCE NA PŘÍSTROJI PHOTOCHEM

Podrobný seznam vyšetření - imunologie

Column DNA Lego Kit UNIVERZÁLNÍ SOUPRAVY PRO RYCHLOU IZOLACI ČISTÉ DNA (Katalogové číslo D201 + D202)

Téma: Testy životaschopnosti a Počítání buněk

MTI Cvičení č. 2 Pasážování buněk / Jana Horáková

Řasový test ekotoxicity na mikrotitračních destičkách

LRR/BUBCV CVIČENÍ Z BUNĚČNÉ BIOLOGIE 3. TESTY ŽIVOTASCHOPNOSTI A POČÍTÁNÍ BUNĚK

Humorální imunita. Nespecifické složky M. Průcha

Jednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU SELENU METODOU ICP-OES

Chemické výpočty II. Vladimíra Kvasnicová

53. ročník 2016/2017

Cvičení č. 2: Pasážování buněk. 1) Teoretický základ

2) Připravte si 7 sad po pěti zkumavkách. Do všech zkumavek pipetujte 0.2 ml roztoku BAPNA o různé koncentraci podle tabulky.

Parametry metod automatické fotometrické analýzy

Western blotting. 10% APS 20,28 µl 40,56 µl 81,12 µl 20,28 µl 40,56 µl 81,12 µl

DIAGNOSTICKÝ KIT PRO DETEKCI MINIMÁLNÍ REZIDUÁLNÍ CHOROBY U KOLOREKTÁLNÍHO KARCINOMU

ANALYTICKÝ SYSTÉM PHOTOCHEM

TEORETICKÝ ÚVOD. Počítání buněk

DIAGNOSTICKÝ KIT PRO DETEKCI MINIMÁLNÍ REZIDUÁLNÍ CHOROBY U KARCINOMU PANKREATU

MagPurix Viral/Pathogen Nucleic Acids Extraction Kit B

ATP bioluminiscenční metoda teoretická část

Kurz 1 Úvod k biochemickému praktiku

PRAKTIKUM č.2. ÚKIA, LF MU, Mgr. Olga TICHÁ

CA15-3 IRMA Souprava CA15-3 IRMA umožňuje přímé in-vitro kvantitativní stanovení s tumorem asociovaného antigenu CA15-3 v lidském séru

Jednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU KOBALTU METODOU ICP-MS

DETEKCE MIKROORGANISMŮ Srovnání s jinými mikrobiologickými metodami Praktické aplikace. Ladislav Čurda Ústav technologie mléka a tuků VŠCHT Praha

OBMI OKBHI Laboratorní příručka OKBHI Příloha č. 3 Podrobný seznam vyšetření - IMUNOLOGIE

Validace sérologických testů výrobcem. Vidia spol. s r.o. Ing. František Konečný IV/2012

RNDr. Ivana Fellnerová, Ph.D. Katedra zoologie, PřF UP Olomouc

STANOVENÍ CYTOTOXICITY LÉČIV IN VITRO (XTT ASSAY)

Specifická imunitní odpověd. Veřejné zdravotnictví

Cvičení č. 2: Pasážování buněk. 1) Teoretický základ

Fluorescence (luminiscence)

SOUHRN ÚDAJÚ O PŘÍPRAVKU. energií 172 kev (91 %) a 246 kev (94 %). Vnitřní konverzí vzniká záření rentgenové s energií 23 kev a 26 kev.

Jana Fauknerová Matějčková

Molekulárně biologické metody v mikrobiologii. Mgr. Martina Sittová Jaro 2014

Metody testování humorální imunity

Princip testu. Kdy se PAT provádí (1) Kdy se PAT provádí (2) PAT kvalitativní a kvantitativní stanovení na ID-gelových kartách

Microsoft Excel kopírování vzorců, adresování, podmíněný formát. Mgr. Jan Veverka Střední odborná škola sociální Evangelická akademie

Úvod do problematiky ÚPRAVY TABULKY

T lymfocyty. RNDr. Jan Lašťovička, CSc. Ústav imunologie 2.LF UK, FN Motol

MagPurix Viral Nucleic Acid Extraction Kit

Izolace genomové DNA ze savčích buněk, stanovení koncentrace DNA pomocí absorpční spektrofotometrie

PŘEVODY JEDNOTEK. jednotky " 1. základní

Transfuziologie. medici

1. Příloha 1 Návod úlohy pro Pokročilé praktikum z biochemie I

1. Metodika. Protokol č. F1-4 Metodika: Srovnávací analýza efektivity přípravy rekombinantního proteinu ve fermentoru

CHEMICKÉ VÝPOČTY I. ČÁST LÁTKOVÉ MNOŽSTVÍ. HMOTNOSTI ATOMŮ A MOLEKUL.

Výskyt MHC molekul. RNDr. Ivana Fellnerová, Ph.D. ajor istocompatibility omplex. Funkce MHC glykoproteinů

Imunochemické metody. na principu vazby antigenu a protilátky

PRACOVNÍ SEŠIT MS EXCEL KOMPLET. Optimálním doplňkem stálého vzdělávání jsou elektronické kurzy.

DIAGNOSTICKÝ KIT PRO DETEKCI MINIMÁLNÍ REZIUDÁLNÍ CHOROBY MRD EGFR

Recognoil RRW Manager rychlý návod k obsluze

Příloha č. 2 Technické podmínky

Hmotnostní detekce biologicky významných sloučenin pro biotechnologie část 3 - Provedení štěpení proteinů a následné analýzy,

5. Úloha: Stanovení počtu kopií plazmidů (plasmid copy number PCN) v buňce

Chromoprobe Multiprobe - T System

Nová rodina vybraných produktů pod vlastní značkou

RNA Blue REAGENS PRO RYCHLOU PŘÍPRAVU ČISTÉ A NEDEGRADOVANÉ RNA (katalogové číslo R011, R012, R013)

Komplement fixační antigen Influenza A (KF Ag Influenza A)

HbA1c. Axis - Shield. Společnost je zapsána v obchodním rejstříku Městského soudu v Praze, odd. C vložka 1299

strojů umožň lní vstupní infiltraci Mgr. Silvie Dudová, RNDr. Iva Burešová, Drahomíra Kyjovská

Excel tabulkový procesor

Veronika Janů Šárka Kopelentová Petr Kučera. Oddělení alergologie a klinické imunologie FNKV Praha

IZOLACE DNA PRO STANOVENÍ GMO METODOU PCR (KIT NUCLEOSPIN FOOD)

Jednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU SEMDURAMICINU METODOU HPLC

CRP. Axis - Shield. SINGLE TESTS CRP kvantitativní stanovení pomocí přístroje NycoCard Reader II

Postup: Nejprve musíme vyplnit tabulku. Pak bude vypadat takto:

ProFlow Rotavirus-Adenovirus Combi

Gymnázium Vysoké Mýto nám. Vaňorného 163, Vysoké Mýto

Popis výukového materiálu

CVIČENÍ 3: VODNÍ PROVOZ (POKRAČOVÁNÍ), MINERÁLNÍ VÝŽIVA. Pokus č. 1: Stanovení celkové a kutikulární transpirace listů analýzou transpirační křivky

immuclone Anti-H Galileo, IgM (klon C 11) 5 ml 2 roky. Lektiny pro aglutinační test Anti-A(1) (Lectin) Galileo 5 ml 2 roky

Jeden z mírně náročnějších příkladů, zaměřený na úpravu formátu buňky a především na detailnější práci s grafem (a jeho modifikacemi).

Spektrofotometrické stanovení fosforečnanů ve vodách

Transkript:

Test aktivity a cytotoxicity lymfocytů Teorie: Proliferace je jedním z fyziologických jevů buněčné aktivace. Existuje několik způsobů zjišťování aktivity lymfocytů. Jedna z nejznámějších je použitím radioaktivně značeného thymidinu ( 3 H-thymidin), kdy jsme schopni v laboratoři proliferaci lymfocytů kvantitativně vyšetřit, neboť thymidin se zabuduje do DNA dělících se buněk a takto je označí. Tvorba nové DNA je úměrná množství buněčných dělení. Další variantou pro rychlé stanovení proliferace a cytotoxicity savčích buněk je stanovení množství buněčného ATP (adenosin trifosfát). Tento test nahrazuje inkorporaci 3 H thymidinu.. K dělení můžeme lymfocyty stimulovat in vitro polyklonálně a nebo specificky. Lektiny, rostlinné proteiny vážící se na membránové glykoproteiny buňky, působí jako polyklonální mitogeny. Aktivují lymfocyt nezávisle na jeho antigenní specificitě. Pro stimulaci T-buněk se používají phytohemaglutinin (PHA) a konkavalin A (Con A), k aktivaci B-buněk pak pokeweed mitogen (PWM). Monoklonálních protilátek lze také použít, příkladem může být anti-cd3 protilátka. Tetanického toxoidu (antigenu) využíváme ke specifické stimulaci, podobně též E. coli nebo tuberkulinu. Přítomnost buněk prezentujících antigen, jako jsou monocyty, je zde nezbytná. V našem cvičení nebudeme lymfocyty stimulovat, ale změříme jen jejich aktivitu bez přidání stimulujících látek. Technický přehled Tento kit (BioThema) se dá použít pro detekci bioluminiscence adenozin 5 -trifosfátu (ATP) uvolněného ze suspenze živých somatických buněk. Koncentrace buněk se dá vypočítat za předpokladu, že se množství ATP na každou buňku příliš nemění. Množství živých somatických buněk se počítá selektivně, protože, když buňka zemře, její ATP se významně sníží. Obecně vzato, živá somatická buňka obsahuje 1 pikogram (10-12 gramů) nebo 2 femtomoly (2 x 10-15 molů) ATP. Přesnější údaj pro určitou buněčnou linii a růstové médium lze získat z literatury nebo obarvením a počítáním živých buněk. ATP živé somatické buňky může být definován jako: ATP + D-luciferin + O 2 Oxyluciferin + AMP + CO 2 + PPi + světlo

Když je ATP limitujícím faktorem, vyzářené světlo je úměrné množství přítomného ATP, které je postupně úměrné počtu somatických buněk ve vzorku. Vzhledem k různým vlastnostem buněk (nejde o stoprocentně homogenní kulturu), ne zcela přesně zjištěné koncentraci buněk pomocí počítání v Bűrkerově komůrce (lidská chyba), eventuálním nepřesnostem při ředění apod. slouží eventuálně vypočítané množství ATP pouze jako orientační údaj. Cíl: Testy aktivity a cytotoxicity lymfocytů V našem cvičení nebudeme lymfocyty stimulovat, ale A) změříme jen aktivitu bez přidání stimulujících látek kontrola B) měříme cytotoxicitu lymfocytů pomocí přidání urč. Koncentrace koloidního stříbra Materiál: centrifuga, komůrky na počítání buněk, eppendorfky, zkumavky, nastavitelné mikropipety a špičky, 0,87% NH 4 Cl, PBS roztok na uchování lymfocytů, myší slezina Pracovní postup: Izolace lymfocytů ze sleziny myši 1. Vykrvit myši krční tepnou a vyjmout slezinu. 2. Slezinu homogenizovat v PBS. 3. Suspenzi buněk se zbytky sleziny opatrně přelít přes gázu a centrifugujovat 10 min při 1000 ot/min. 4. Sediment resuspendovat v asi 300 l NH 4 Cl a centrifugovat 10 min při 1500 ot/min. 5. Sediment resuspendovat v asi 300 l PBS (3x). 6. Buňky resuspendovat asi v 1-1,5 ml PBS (záleží na počtu buněk) a spočítat. V roztoku se nachází kromě lymfocytů také monocyty a granulocyty. Počítání v Bűrkerově komůrce:

upraveno podle http://www.who.int/vaccines/en/poliolab/webhelp/figure_4.2.htm Převzato z http://www.lo-laboroptik.de/englisch/info/info.html

(viz též http://www.superior.de/pgr06_info_e.htm) K výpočtu množství buněk v 1 ml suspenze je třeba znát tloušťku vzorku nad mřížkou. Každý z 25 čtverců obvykle měří 0,2 x 0,2 x 0,1 mm a má tedy objem 0,004 mm 3. Takže 25 čtverců má objem 0,1 mm 3. Po vynásobení zjištěného počtu buněk v 25 čtvercích hodnotou 10 000 dostaneme tedy počet buněk v 1 ml suspenze. Stanovení relativního množství ATP ATP Reagent SL - lyofilizát obsahující D-luciferin, luciferázu a stabilizátory, Lysing Diluent - roztok Tris (hydroxymethyl) aminomethanu, EDTA, lyzující látka, inhibitor ATPázy. Slouží k rozpuštění ATP Reagent SL Postup práce-kit: Celý obsah lahvičky s ATP Reagent SL rozpustit přidáním veškerého objemu další lahvičky Lysing Diluent. Pozn. Výsledkem bude 12ml roztoku, který je třeba vyčerpat nebo se pak, když zbude, zamrazí, ale není garantovaný přesný výsledek po rozmražení. 1. Použít 3 různá ředění roztoku s buňkami ve dvou opakování u každého ředění musí být kontrola bez stříbra, koncentrovaný, 2x ředěný a 4x ředěný, všechny v množství 50 ul. 3x Blank: blank bez buněk, bez buněk se stříbrem, s buňkami a se stříbrem. Ke každému naředěnému vzorku přidat 50 ul roztoku nanostříbra v koncentraci 50ppm (50mg/l), nechat 15min kultivovat při 37 C 2. Buňky v PBS, u nichž stanovujeme množství ATP, v objemu 100ul napipetovat v triplikátech do jamek ve stripu. Kromě toho použijeme jako blank pouze PBS. 3. Do každé jamky přidat 50 ul rozpuštěného ATP Reagent SL a zamíchat. Pozn. multikanálovkou a pak jí také zamíchat 4. Změřit luminiscenci (RLU) odpovídající množství ATP Vyhodnocení: Po odečtení průměrné hodnoty luminiscence blanku do grafu vynést průměrné hodnoty luminiscence proti příslušné koncentraci/množství buněk ve 50 l pipetovaných do jamky ve stripu (3 průměrné hodnoty luminiscence proti třem hodnotám množství buněk u aplikaci stříbra a u kontrol) a zhodnotit, jakou měrou se měnila hodnota luminiscence. Př. Vyhodnocení:

Výsledky ATP bez přidání stříbra Výsledky cytotoxicity naměřené luminiscence vzorku jednotlivých ředění se stříbrem, příklad

Pozn. Nastavení a měření na Luminometru Ihned po napipetování všech jamek měříme destičku na luminometru v režimu: Protokol-vlastnosti-zaškrtnout konec po uplynutí celkové doby měření, doba měření napsat 2s Počet cyklů měření a vše ostatní nechat, pozor, teplota ne!!! Ukládání: 1.Ulož data, 1.ulož v excelu Zobraz výsledky-export do XLS, pak zavřít a poslat internetem na mailovou adresu nebo si dát na flashku. Otevřít soubor v excelu. Pak dva kroky: 1. Vzít výsledky do bloku a změnit tečky na čárky 2. formát číslo a na dvě desetinné čísla Označit-nástroje- nahradit tečky za čárky CtrlF vyhldávat nahradit najít dám tečku. Nahradit dám čárku, Vlevo dole nahradit vše. Změnit-formát- číslo a označit na 2 desetiny