Rozbor řešení grantového projektu a program prací pro další rok

Transkript

1 Grantová agentura České republiky Část DC Rozbor řešení grantového projektu a program prací pro další rok Jméno řešitele: Doc. RNDr. Milan Konečný, CSc. Registrační číslo projektu: 205/07/1278 Název projektu: Kartografická vizualizace a modelování současných trendů vývoje zdravotního stavu a zdravotní péče v České republice I. Postup prací při řešení grantového projektu na pracovišti řešitele a spoluřešitelů: V úvodním roce projektu probíhaly práce v pěti základních oblastech, které byly vytýčeny v návrhu projektu: Oblast 1. Pilotní zpracování dostupných historických údajů zdravotního stavu a zdravotní péče V prvním kroku byly analyzovány data pocházející ze 4 hlavních zdrojů: Registr nádorů ČR (NOR) - databáze nemocných, nahlášených do registru nádorů od května 1976 se základními epidemiologickými charakteristikami, doplněnými pro mezinárodní komparaci závaznými kriterii IARC Lyon. Globocan 2002 IARC Lyon - aktuální světový odhad počtu nově zjištěných, zemřelých a přežívajících mužů a žen s nádory podle diagnóz a jednotlivých zemí. Data ÚZIS - databáze 730 ukazatelů za období 1996, respektive , zahrnující vývoj demografie, zdravotního stavu, zdravotní péče, ekonomických nákladů, životního prostředí a nádorů. Data FNB - databáze nemocničního informačního systému Hospital Cost, zahrnující roční údaje o 1 mil. ambulantně ošetřených a přes 40 tis. hospitalizovaných. Předání vstupních dat z ÚZIS a FN Brno bylo zajištěno smluvně v anonymizované podobě s vazbou kontroly, interpretace a prezentace výsledků ze strany poskytovatele. Oblast 2. Analýza a homogenizace datových sad Podle grantové anotace byly jako podklad pro kartografickou vizualizaci a související statistické zpracování provedeny následující práce zaměřené na analýzu a následnou homogenizaci datových sad. a) Z dat registru nádorů byly zpracovány přehledy týkající se 21 diagnostických skupin nádorů u mužů a 23 u žen za ČR a kraje. Dostupná data epidemiologie (incidence a mortality za roky ) byla doplněna o dobu zjištění nemoci, klinická stadia, léčbu v chirurgii, radioterapii a chemoterapii (za roky ). U každé diagnózy byl zpracován vývoj počtu žijících/léčených u mužů a žen ve věku let a let za období v ČR a krajích, zpracován model vývoje jejich prevalence pro období Údaje za ČR byly doplněny recentními stavy ve světě z databáze Globocan 2002 IARC Lyon. b) Z celostátní databáze DPS byl zpracován vývoj incidence, mortality a prevalence podle stavu dostupnosti a dílčího časového horizontu za období pro skupinu nádorů, cévních nemocí mozku a diabetu, doplněný trendy hospitalizace, invalidity a lázeňské péče. Objem zdravotní péče byl doplněn údaji o výdajích zdravotního pojištění z přehledů ČSÚ v letech c) K podrobnějšímu vymezení přímých nákladů zdravotní péče bylo zahájeno zpracování skupin pacientů FN Brno za rok 2006, zahrnujících 1,1 mil. ambulantně ošetřených diagnóz a 75 tis. hospitalizovaných. Vybrané diagnózy byly předány ke kartografickému zpracování (viz. Oblast 4). Sjednocení jejich nákladů, vztažených k anonymizovanému identifikátoru

2 pacienta a příslušné diagnóze bylo řešeno náročným výstupem z databáze NIS, aby byly získány všechny relevantní nákladové položky (ZUM. ZUL aj.). d) K využití a srovnání údajů zdravotních a ekonomických z databáze OECD byly připraveny podmínky včetně metodického posouzení rozptylu jejich hodnot a odlišné validity podle státu. Teprve po jejich srovnání budou v následných letech řešení data komparována s výsledky grantu. e) Byl vytvořen návrh databáze, která umožní správu zpracovávaných prostorově-vztažených dat pro účely následné kartografické vizualizace. Návrh databáze mj. zohledňuje různorodost atributů (zpracovávaných dat), časovou a regionální platnost hodnot těchto atributů a vztahy mezi regiony na různých úrovních. Oblast 3. Formulování vstupních hypotéz Pozornost byla soustředěna na metody predikce a na hypotézy o budoucím vývoji časových řad obsahujících prevalenci jednotlivých typů nádorových onemocnění. Na základě grafického znázornění jednotlivých časových řad bylo rozhodnuto použít k modelování a predikci jednotlivých časových řad lineární regresní model s lineárním nebo kvadratickým trendem. Byly ověřeny hypotézy linearity trendu a podle výsledků testů zvolen příslušný model. Použití regresního modelu bylo odůvodněno též velmi nízkou variabilitou analyzovaných řad kolem trendové funkce Trend počtu žijících s nádory prsů a rodidel v ČR nádory prsů nádory vulvy a vaginy nádory cervixu 247 nádory dělohy 234 nádory vaječníků Obr. 1: Ukázka zpracování trendu vývoje vybrané onkologické diagnózy Oblast 4. Návrh kartografické symboliky a vizualizace změn. V oblasti kartografické vizualizace vybraných dat zdravotního stavu byla provedena rozsáhlá literární rešerše historického vývoje mapování zdravotních dat, jednotlivých metodik a současného stavu poznání. Souběžně byly analyzovány dostupné nástroje sloužící pro vizualizaci změn a explorační analýzy, zkoumány jejích možnosti, technologické postupy a využitelnost v rámci projektu. Jmenovitě šlo o programy CCmaps, Geoda, ESTAT, Geoviz, Improvise, Mapresso a další. Výsledky analýzy včetně popisu současných metod byly prezentovány na metodické konferenci v Plzni (publikace 10). Ve spolupráci s oblastí 1 a 2 bylo v průběhu roku 2007 byla vytvořena řada mapových výstupů zdravotních dat pomocí standardních nástrojů. Cílem uvedeného kartografického zpracování bylo navržení prezentační metodiky a odpovídající kartografické vizualizace pro jejich prvotní zpracování a ověření možností dalšího zpracování. V průběhu roku byl vytvořen původní návrh tiskové podoby map a následně vytvořeno 60 map vybraných onkologických diagnóz v anglické a české jazykové verzi. V dalším kroku byla navržena kartografická vizualizace a zpracována celkem 31 mapa vybraných cévních diagnóz. Oba výše uvedené typy mapových výstupů jsou prostorově vztaženy k administrativním jednotkám krajů.

3 Obr.2: Ukázka návrhu mapového výstupu pro vybranou onkologickou diagnózu v ČR Oblast 5. Specifikace statistických modelů Vzhledem k tomu, že se při analýze časových řad prevalence potvrdily stanovené hypotézy lineárního respektive kvadratického trendu, byly ke statistickému zpracování vybraných zdravotních dat byly použity metody regresní analýzy. Pomocí bodových i intervalových odhadů byly stanoveny predikce budoucího vývoje sledovaných řad. Tato metodika byla použita pro většinu časových řad, které byly popsány v oblasti 2 této zprávy. Pro řady, které vykazovaly větší variabilitu a kde nebylo možné jejich trend popsat jednoduchou analytickou funkci, byly rozpracované metody založené na markovských řetězcích, zejména byla studována možnost použití procesů zrodu a zániku. Metody pro popis dynamiky prevalence jsou paralelně studovány s časovými řadami incidence a mortality. Dále ve spolupráci s prof. Ivanovem z WCSU, USA je diskutována možnost použití neuronových sítí. Obr.3: Ukázka návrhu mapového výstupu pro vybranou diagnózu pacientů FNB II. Využití technického a přístrojového vybavení pořízeného z grantu Z rozpočtu grantu nebylo v prvním roce zakoupeno žádné technické ani přístrojové vybavení. III.Zpráva o průběhu a výsledcích zahraničních cest V rámci pracoviště řešitele byly uskutečněny zahraniční cesty na konference v Německu (Muenster), Rusku (Moskva) a Ukrajinu (Kijev). Na všech konferencích byly předneseny a diskutovány referáty související s problematikou grantového úkolu, a to konkrétně oblast rozvoje kartografických exploračních nástrojů, možnosti mezinárodní spolupráce na problematice mapování dat zdravotního stavu v rámci Mezinárodní kartografické asociace

4 (ICA) a problematiku modelování dynamiky nádorových onemocnění pomocí markovských modelů. Spoluřešitel FNB neuskutečnil zahraniční cesty. IV. Seznam publikací, sdělení, přednášek, zpráv a dalších dílčích výsledků řešení grantového projektu V rámci projektu byla zřízena webová stránka ( která slouží jako informační médium pro dílčí výsledky projektu Medicarto. 1. GERYK, Edvard; ODEHNAL, Jakub; ŠTAMPACH, Radim; KOZEL, Jiří; KUBÍČEK, Petr; MICHÁLEK, Jaroslav; HOLUB, Jiří. Časové a prostorové rozložení nemocných s maligními lymfomy v ČR v letech XIV. JIHOČESKÉ ONKOLOGICKÉ DNY. Český Krumlov GERYK, Edvard; ODEHNAL, Jakub; KUBÍČEK, Petr; HOLUB, Jiří. Epidemiologie non-hodgkinského lymfomu v ČR. XIV. JIHOČESKÉ ONKOLOGICKÉ DNY. Český Krumlov GERYK, Edvard; DÍTĚ, Petr. Epidemiologie karcinomů GIT v ČR. Mezinárodní seminář gastroonkologů, Kaprun, Rakousko, GERYK, Edvard; KOŠKA, Petr; ODEHNAL, Jakub; ŠTAMPACH, Radim; KUBÍČEK, Petr; KONEČNÝ, Milan; MICHÁLEK, Jaroslav; HOLUB, Jiří. Časoprostorová distribuce žijících s nádory respiračního traktu v ČR v letech Sborník přednášek XV. Západočeské pneumoonkologické dny, , s. 25, ISBN Proceedings of XV. Pnemooncology Conference. Vydal: FN Plzeň a nakl. Euroverlag Plzeň. 5. GERYK, Edvard; KUBÍČEK, Petr; KONEČNÝ, Milan; KOŠKA, Petr; HOLUB, Jiří; ODEHNAL, Jakub; ŠTAMPACH, Radim. Prevalence nádorů v České republice - časové a prostorové rozložení. Zdravotnictví v ČR, 2007, 3, 10, s GERYK, Edvard; ODEHNAL, Jakub; ŠTAMPACH, Radim; KUBÍČEK, Petr; KONEČNÝ, Milan; MICHÁLEK, Jaroslav; HOLUB, Jiří. Vývoj prevalence karcinomů plic a hrtanu v krajích ČR. Trend of prevalence of lung and larynx cancers in Czech regions. Sborník posterů XV. Západočeské pneumoonkologické dny, , s , ISBN Proceedings of XV. Pnemooncology Conference. Vydal: FN Plzeň a nakl. Euroverlag Plzeň. 7. GERYK, Edvard; ŠTAMPACH, Radim; ODEHNAL, Jakub; KUBÍČEK, Petr; HOLUB, Jiří; MICHÁLEK, Jaroslav. Epidemiologie maligních lymfomů v ČR. Epidemiology of malignant lymphoma in the Czech Republic. Supplementum Farmakoterapie, 2007, 2, s ODEHNAL, Jakub; MICHÁLEK, Jaroslav; IVANOV, Todor; GERYK, Edvard. Support of cancer analysis by the time and space modeling in the Czech Republic. In Book of Abstracts, TIES Mikulov. ISBN , s Mikulov 9. Vývoj prevalence a incidence cévní mozkové příhody dg. I60-I69 v letech Development of prevalence and incidence of cerebrovascular disease dg. I60-I69 in Rozbor pro Odbor zdravotnictví KÚ Brno, PP prezentace, Analysis for Health Authority of Regional Committee of Brno, PP version GERYK, Edvard; ŠTAMPACH, Radim; KUBÍČEK, Petr. Metody kartografické vizualizace dat zdravotního stavu obyvatelstva. In: Sborník konference Metody geografického výzkumu. Plzeň , v tisku. V. Plán řešení a úkolů v roce 2008 do DC: Práce na projektu budou v roce 2008 pokračovat podle předpokládaného harmonogramu, hlavní pozornost bude soustředěna na následující oblasti: a) Dokončené podklady z registru nádorů budou doplněny daty prevalence za rok 2005 a počty metachronních novotvarů. b) Upřesněná data z DPS budou kartograficky vizualizována s posouzením predikce jejich vývoje podle směrodatné odchylky rozptylu. c) Nákladové položky léčby budou postupně získané z NIS FN Brno podle skupin nemocí za rok 2006, na podzim pak za rok 2007 s návrhem kartografické distribuce nemocných a jejich dalších charakteristik podle anotace v regionu JHM podle souhlasu poskytovatele vstupních dat. Jejich doplnění z přehledů OECD bude navrženo koncem podzimu, aby koherentní výsledky odpovídaly koncizním datům.

5 d) Zpracovávaná prostorově vztažená data budou importována do databáze vytvořené pro účely následné kartografické vizualizace. e) Bude zahájen vývoj dvou kartografických analyticko-vizualizačních nástrojů. Prvním bude nástroj na vizualizaci časových řad, v němž bude věnována pozornost i plynulým přechodům mezi jednotlivými časovými body pomocí animace kartografické anamorfózy. Druhým bude nástroj na zjišťování vzájemného vztahu jedné až tří proměnných, který vychází z metody nazývané map plot, (tj. " mapová matice "). Oba nástroje budou vyvíjeny pro webové rozhraní a budou pracovat nad databází, jejíž návrh byl vytvořen na základě analýzy dostupných prostorově vztažených zdravotních dat. Součástí nástrojů bude uživatelské rozhraní umožňující výběr vizualizovaných dat, výběr z různých typů barevných stupnic a dalších prvků pro správnou kartografickou vizualizaci dat.