Standardizace a validace
|
|
- Žaneta Benešová
- před 5 lety
- Počet zobrazení:
Transkript
1 Standardizace a validace v rutinní molekulárně mikrobiologické diagnostice - aneb statistika v klinické praxi - P. Hložek
2 Část I. Metrologická terminologie v molekulární mikrobiologii Popis použitých statistických metod Část II. Ukázky využití statistických metod v molekulární mikrobiologii
3 Část I. Metrologická terminologie v molekulární mikrobiologii Popis použitých statistických metod
4 Výchozím zdrojem pro metrologickou terminologii v medicíně je soubor standardizovaných biochemických diagnostických metod. V tomto oboru jsou již přesně terminologicky ukotveny a definovány jednotlivé statistické parametry a postupy vedoucí k jejich výpočtu. Metrologická terminologie v analytické laboratoři ( VIM3: International Vocabulary of Metrology (
5 Bohužel je nutno říci, že v molekulární mikrobiologii je až na výjimky kvalita a především jednotnost v postupech a terminologii určující základní statistické parametry diagnostik více než nepřehledná. Jedno z mála harmonizující doporučení pro validace a verifikace s přímým vztahem k molekulárně biologickým metodám je možno najít zde: VALIDACE A VERIFIKACE MOLEKULÁRNĚ BIOLOGICKÝCH METOD ZALOŽENÝCH NA ANALÝZE EXTRAHUMÁNNÍHO GENOMU Doplněk k doporučení výboru České společnosti klinické biochemie o validaci a verifikaci analytických metod v klinických laboratořích (z )
6 Jak přistoupit k pochopení základních metod metrologie použitých při charakterizaci molekulárně mikrobiologických stanovení?
7 Pochopení pojmů v metrologii Citlivost měřicího systému (Sensitivity of measuring system) Consensus value Definiční nejistota (Definitional uncertainty) Drift měřicího přístroje Etalon, standard měření, standard (Measurement standard, etalon) Externí hodnocení kvality (EHK) (External Quality Assessment EQA) Horwitzova křivka Horwitzův vztah (Horwitz curve) Chyba měření (Measurement error) Ishikawův diagram (Ishikawa diagram) IVD MD (In Vitro Diagnostic Medical Devices) Jakost Kalibrace (Calibration) Kalibrační a měřicí schopnost (Calibration and measurement capability - CMC) Kalibrační laboratoř (Calibration laboratory) Kalibrátor (Calibrator) Koeficient rozšíření k (Coverage factor) Komponenta Komutabilita referenčního materiálu (Commutability of a reference material) Konfirmace Konfirmace identity (Confirmation of identity) Kontrolní materiál (Control material) Konvenční hodnota veličiny, konvenční hodnota (Conventional quantity value, conventional value)
8 V případě vyšetření v molekulární mikrobiologii využívající jako metodu stanovení technologii Real Time PCR se zaměřujeme na základní charakteristiky, pomocí kterých jsme schopni dostatečně popsat parametry a limity použitého měření: Přesnost a správnost Specifita Limit detekce Limit kvantitativního stanovení Linearita měření Pochopení pojmů v metrologii Pamatujme však, že výchozím zdrojem pro metrologickou terminologii v molekulární mikrobiologii stále zůstává soubor standardizovaných biochemických diagnostických metod bez přímé návaznosti na zcela rozdílné technologické pozadí metod qpcr
9 Pochopení pojmů v metrologii Přesnost a správnost Se skládá: Specifita Limit detekce Limit kvantitativního stanovení Z definování základních pojmů používaných v metrologii obecně Z metodiky potřebné k ověření definovaných parametrů v případě molekulární mikrobiologie Lineární rozsah měření
10 Správnost a přesnost Přesnost a správnost Specifita Přesnost (Precision): těsnost shody mezi naměřenou hodnotou veličiny a pravou hodnotou měřené veličiny (zjednodušeně míra chyby). Nemá vztah ke skutečné hodnotě. Obvykle se uvádí ve formě směrodatné odchylky. Limit detekce Limit kvantitativního stanovení Přesnost měření můžeme dále rozdělit na: Lineární rozsah měření
11 Správnost a přesnost Přesnost a správnost Specifita Limit detekce Limit kvantitativního stanovení Lineární rozsah měření Přesnost za podmínek opakovatelnosti - Opakovatelnost (Repeatibility): Vyjadřuje těsnost souhlasu mezi výsledky nezávislých měření stejného analytu, provedených stejnou metodou, stejným pracovníkem, na stejném přístroji, na stejném místě, za stejných podmínek v krátkém časovém intervalu. Opakovatelnost je vlastností metody, ne výsledku. Přesnost za podmínek reprodukovatelnosti. Reprodukovatelnost (Reproducibility): Vyjadřuje těsnost souhlasu mezi výsledky měření stejného analytu ve vzorcích stejného materiálu, kdy jsou jednotlivá měření prováděna za různých podmínek (pracovník, přístroj, místo, podmínky, čas, avšak stejná metoda).
12 Správnost a přesnost Přesnost a správnost Specifita Správnost (Accuracy): těsnost shody mezi aritmetickým průměrem nekonečného počtu opakovaných naměřených hodnot veličiny a referenční hodnotou veličiny (zjednodušeně míra systematické chyby). Správnost je spojitou kombinací přesnosti a pravdivosti. Limit detekce Limit kvantitativního stanovení Pravdivost (Trueness): Těsnost souhlasu mezi průměrnou hodnotou získanou z velkého počtu výsledků měření a dohodnutou referenční hodnotou (skutečnou hodnotou). Pravdivý výsledek je zatížen nulovou systematickou chybou. Lineární rozsah měření Za předpokladu, že výsledky použité metody vykazují nulovou nebo malou chybu, správnost = přesnost. Správnost lze zjistit pouze experimentálně.
13 Správnost a přesnost Přesnost a správnost Specifita Limit detekce Limit kvantitativního stanovení Vztah mezi přesností a správností aneb k čemu to vlastně je? Lineární rozsah měření
14 Přesnost a správnost Specifita Limit detekce Nepřesné a nesprávné Přesné, ale nesprávné Limit kvantitativního stanovení Lineární rozsah měření
15 Přesnost a správnost Specifita Limit detekce Nepřesné a správné Přesné a správné Limit kvantitativního stanovení Lineární rozsah měření
16 Přesnost a správnost Specifita Limit detekce Limit kvantitativního stanovení Při vývoji měřícího systému je VŽDY vhodné dosáhnout toho, aby byl nejprve SPRÁVNÝ a potom se teprve zabývat jeho PŘESNOSTÍ Lineární rozsah měření
17 Specifita Přesnost a správnost Specifita Limit detekce Specifičnost (analytická) je schopnost měřicího postupu stanovovat v komplexním (tedy reálném) vzorku pouze tu měřenou veličinu, která má být stanovena. Specifičnost je tím vyšší, čím nižší je stupeň interferencí s ostatními částmi (komponentami) vzorku. Specifická metoda = metoda oproštěná od vlivu matrice. Limit kvantitativního stanovení Lineární rozsah měření
18 Metodiky určení specifity Přesnost a správnost Specifitu metody můžeme na úrovni molekulární mikrobiologie při použití PCR (qpcr) technik ověřovat na dvou úrovních: Pomocí in siliko analýzy Specifita Limit detekce Limit kvantitativního stanovení Pomocí experimentální analýzy Lineární rozsah měření Využití sbírkových kmenů, které mají klinickou relevanci s místem odběru vzorku, typem klinického materiálu, případně mohou působit v koinfekci s detekovaným patogenem a mohou být zdrojem nespecifity (cross reactivity)
19 Specifita Přesnost a správnost! POZOR! Specifita v molekulární mikrobiologii nemusí platit Limit detekce Limit kvantitativního stanovení plně specifická metoda = kvalitní a použitelná metoda (správně zvolená metoda) Lineární rozsah měření
20 Specifita Přesnost a správnost Při experimentálním stanovení specifity (např. Real Time PCR metodou) je nutné zároveň znát sensitivitu (limit detekce), protože v molekulární mikrobiologii jsou tyto dva parametry Specifita Limit detekce Sensitivita Limit kvantitativního stanovení Lineární rozsah měření v reálné praxi při interpretaci výsledku vyšetření v křehké rovnováze a pro správnou volbu testu je! NUTNÉ JE ZNÁT A ROZUMĚT JIM!
21 Specifita Přesnost a správnost 100% SENSITIVITA 0% SENSITIVITA Specifita Limit detekce Limit kvantitativního stanovení 100% SPECIFITA 0% SPECIFITA Lineární rozsah měření Takový test pravděpodobně neexistuje Takový test naštěstí nemůže existovat
22 Specifita/limit detekce - příklad Přesnost a správnost Stojí před námi vyšetření 100 pacientů s podezřením na nákazu velice nebezpečným patogenem: Inkubační doba - 24 hod. Specifita Plný rozvoj příznaků - 48 hod. po nakažení Morbidita a mortalita - 100% Limit detekce Existuje 100% účinný lék Limit kvantitativního stanovení Lineární rozsah měření Máme na výběr dva testy pro detekci Test A Test B 100%sensitivita, 50% specifita 50% sensitivita, 100% specifita Který test je v tomto případě lepší?
23 Test A 100%sensitivita, 50% specifita Přesnost a správnost 50 pacientů je zdravých 50 pacientů je nakažených Specifita 25 negativních výsledků 50% specifita 25 falešně pozitivních výsledků 50% specifita 50 pozitivních výsledků detekce 100% sensitivita Všichni pacienti přežijí, ale až 25 pacientů léčíme necíleně Limit detekce Test B 50% sensitivita, 100% specifita Limit kvantitativního stanovení 50 pacientů je zdravých 50 pacientů je nakažených Lineární rozsah měření 50 negativních výsledků detekce 100% specifita 25 pozitivních výsledků 50% sensitivita 25 falešně negativních výsledků 50% sensitivita Žádného pacienta neléčíme necíleně, ale až 25 pacientů může zemřít
24 Limit detekce/sensitivita Přesnost a správnost První interpretační a experimentální nejednotnost mezi biochemickou normou (ze které se při definování parametrů PCR souprav vychází) a realitou molekulární mikrobiologie Specifita Mez detekce daného analytického postupu je dána nejmenším množstvím analytu ve vzorku, které může být detekováno, ale které nemusí být stanovitelné jako exaktní hodnota. Limit detekce Limit kvantitativního stanovení Stanovení meze detekce (L D ): dle IUPAC se určí mez detekce obecně podle vztahu: L D = 3,29. s bl kde je s bl směrodatná odchylka blanku - slepého pokusu Lineární rozsah měření
25 Limit detekce/sensitivita Přesnost a správnost Mez detekce = limit detekce (LoD, limit of detection) analytického postupu je dána nejmenším množstvím analytu ve vzorku, které může být detekováno, ale které nemusí být stanovitelné jako exaktní hodnota. Specifita 100% úspěšných záchytů 60% úspěšných záchytů Limit detekce Limit kvantitativního stanovení Jsme nad limitem detekce Ale jak vysoko? Jsme pod limitem detekce Ale jak hluboko? Lineární rozsah měření LoD je nutno definovat na hranici, kde začíná detekční systém selhávat
26 Metodika určení LoD Přesnost a správnost PROBIT ANALÝZA Statistická technika, pomocí níž je vyjádřen vztah mezi odezvou a podnětem. Pro výpočet limitu detekce využívá Weibullovo rozložení (zdroj Specifita Distribuční funkce tohoto rozdělení je Limit detekce for x 0, and F(x; k; λ) = 0 for x < 0. Limit kvantitativního stanovení Lineární rozsah měření Pro účely stanovení limitu detekce za použití Real Time PCR (limit of detection = LoD) lze probit analýzu transformovat buď pomocí grafu nebo tabelovaných hodnot na zájmová % zasažení. Výsledkem tohoto stanovení je pak hodnota limitu detekce vyjádřená ve zvolených jednotkách (v případě molekulární mikrobiologie v IU/ml, případně v kopiích/ml) s definovanou pravděpodobnosti (95%).
27 Metodika určení LoD Přesnost a správnost PROBIT ANALÝZA Statistická technika, pomocí níž je vyjádřen vztah mezi odezvou a podnětem. Specifita Concentration in IU/ml 1st PCR 2rd PCR 3rd PCR Total hits from 18 PCR Limit detekce Limit kvantitativního stanovení Lineární rozsah měření
28 Metodika určení LoD Přesnost a správnost PROBIT ANALÝZA Grafický výstup analýzy Specifita Limit detekce Limit kvantitativního stanovení Lineární rozsah měření
29 Metodika určení LoD Přesnost a správnost PROBIT ANALÝZA Tabelový výstup analýzy Specifita Limit detekce Limit kvantitativního stanovení Lineární rozsah měření
30 Limit kvantifikace a linearita Přesnost a správnost Specifita Druhá interpretační a experimentální nejednotnost mezi biochemickou normou (ze které se při definování parametrů PCR souprav vychází) a realitou molekulární mikrobiologie Mez stanovitelnosti (limit kvantitativního stanovení) metody je nejnižší množství analytu ve vzorku, které může být stanoveno jako exaktní hodnota s požadovanou hodnotou nejistoty. Limit detekce Limit kvantitativního stanovení Lineární rozsah měření Problém je, že není určeno o jakou míru nejistoty se jedná nejistota 0,5 log, nebo 1 log? Někdy bývá označováno též jako dynamický rozsah kvantitativního stanovení a v případě biochemických analytických metod se udává jako 3xLoD. Linearita kalibračního vztahu (zkráceně linearita) rozsah hodnot obsahu, množství či koncentrací, ve kterém je analytický signál lineární funkcí hodnot obsahu, množství či koncentrace. Problém je, že není určeno o jaký typ linearity se jedná řádová linearita?
31 Limit kvantifikace a linearita Přesnost a správnost Specifita Experimentální a interpretační pozadí metod nutné k popisu výše definovaných parametrů není v případě použití metod založených na kvantitativní Real Time PCR podrobně popsáno a ošetřeno žádnou normou. Limit detekce Limit kvantitativního stanovení Lineární rozsah měření Tento fakt umožňuje bohužel velký prostor pro volnou interpretaci a nejednotnost (neporovnatelnost) výsledků popisujících právě parametry linearity a meze stanovitelnosti. Pro popis přesnosti měření byl proto navržen vlastní experimentální model
32 Experimentální model validace CMV PCR popisuje přesnost měření PCR kitu bez vlivu izolace* popisuje odchylky měření v rozsahu LoD (c/ml) * Model počítá přesnost měření PCR Kitu za předpokladu účinnosti izolace 100%
33 Experimentální model validace CMV PCR Připravena koncentrační řada kvantitativně definované kontroly v rozsahu až 0 kopií/ml (zapsáno ve formátu log) 10 9,5 9,0 8,5 8,0 7,5 7,0 6,5 6,0 5,5 5,0 4,5 4,0 3,5 3,3 3,0 2,4 2,1 1,1 0 Každý člen připravené řady byl kvantitativně stanoven v 6 měřeních 6x 6x 6x 6x 6x 6x 6x 6x 6x 6x 6x 6x 6x 6x 6x 6x 6x 6x 6x 6x Výsledek stanovení byl vynesen do grafu a byly stanoveny odchylky měření pro každou detekovanou koncentraci
34 Odchylka měřené hodnoty - c/ml - log10 1,50 1,25 Validace měření CMV - c/ml 1,00 0,75 0,50 0,25 0,00-0,25-0,50-0,75-1,00-1, ,5 9,0 8,5 8,0 7,5 7,0 6,5 6,0 5,5 5,0 4,5 4,0 3,5 3,3 3,0 2,4 2,1 1,1 0 Nominální hodnota - c/ml-log10
35 Odchylka měřené hodnoty - c/ml - log10 1,50 1,25 1,00 Validace měření CMV - c/ml PŘESNOST MĚŘENÍ +/- 0,25 log10 0,75 0,50 0,25 0,00-0,25-0,50-0,75-1,00-1, ,5 9,0 8,5 8,0 7,5 7,0 6,5 6,0 5,5 5,0 4,5 4,0 3,5 3,3 3,0 2,4 2,1 1,1 0 Nominální hodnota - c/ml-log10
36 Odchylka měřené hodnoty - c/ml - log10 1,50 1,25 1,00 Validace měření CMV - c/ml PŘESNOST MĚŘENÍ +/- 0,5 log10 0,75 0,50 0,25 0,00-0,25-0,50-0,75-1,00-1, ,5 9,0 8,5 8,0 7,5 7,0 6,5 6,0 5,5 5,0 4,5 4,0 3,5 3,3 3,0 2,4 2,1 1,1 0 Nominální hodnota - c/ml-log10
37 Odchylka měřené hodnoty - c/ml - log10 1,50 1,25 1,00 Validace měření CMV - c/ml Pravděpodobný LoD 0,75 0,50 0,25 0,00-0,25-0,50-0,75-1,00-1, ,5 9,0 8,5 8,0 7,5 7,0 6,5 6,0 5,5 5,0 4,5 4,0 3,5 3,3 3,0 2,4 2,1 1,1 0 Nominální hodnota - c/ml-log10
38 VALIDACE CMV PCR ZÁVĚR 10 9,5 9,0 8,5 8,0 7,5 7,0 6,5 6,0 5,5 5,0 4,5 4,0 3,5 3,3 3,0 2,4 2,1 1, c/ml c/ml (+/- 0,25 log10) 10 3 c/ml c/ml (+/- 0,5 log10) Mez stanovitelnosti (limit kvantitativního stanovení) 10 2 kopií/ml s maximální odchylkou měření (mírou nejistoty) 0,5 log Linearita kalibračního vztahu (zkráceně linearita) V rozsahu c/ml c/ml je systém měření řádově lineární s maximální chybou 0,25 log
39 Definice a metodiky v metrologii a jejich pochopení (v jakkoliv velkém rozsahu) zůstává stále hrubě nedostačující znalostí, pokud zároveň nepochopíme Vztahy v metrologické terminologii bez pochopení těchto vztahů nebudeme moci jakékoliv intelektuálně uchopené metody relevantně a na správném místě použít!
40 Vztahy v Metrologické terminologii Přesnost a správnost Specifita SOUBOR PARAMETRŮ VALIDACE Validace potvrzuje, že měřící postup je schopen plnit požadavky na ně kladené. Jinak řečeno, že úroveň měření je dostatečná, postupy měření korektní a s řádně provedenou kalibrací. Deklaruje schopnost PCR soupravy poskytovat klinicky relevantní (klinikou vyžadovaná) a použitelná data Limit detekce Limit kvantitativního stanovení Lineární rozsah měření SOUBOR PARAMETRŮ VERIFIKACE Verifikací pak rozumíme, že měřící postup je plně funkční v konkrétní laboratoři. Potvrzuje schopnost PCR soupravy dosahovat parametrů uvedených ve validaci
41 Vztahy v Metrologické terminologii Přesnost a správnost SOUBOR PARAMETRŮ VALIDACE Specifita Validace je prováděna výrobcem diagnostika podle předepsaných, nebo doporučených testů. Výsledkem validace je soubor technických parametrů popisující celý systém měření včetně jeho limitů a omezení. Limit detekce Limit kvantitativního stanovení Lineární rozsah měření SOUBOR PARAMETRŮ VERIFIKACE Verifikace je prováděna koncovým uživatelem diagnostika (diagnostickou laboratoří) podle předepsaných, nebo doporučených testů, které by měly být shodné s testy ve validaci. Výsledkem verifikace je soubor testů potvrzující parametry deklarované výrobcem při validaci.
42 Při ideálním stavu je tedy výsledek: Verifikace parametrů uživatelem = parametrům uvedeným při Validaci výrobcem Pokud jsou všechny parametry přesně a jasně popsány (experimentálně, statisticky a interpretačně) a provedeny ve validaci a verifikaci stejným způsobem.
43 Molekulární mikrobiologie Přesnost a správnost Specifita SOUBOR PARAMETRŮ VALIDACE Provedení a způsob interpretace jednotlivých testů je ve velké míře v režii konkrétního výrobce diagnostika. Normy bohužel určují způsob provedení a rozsah testů pouze rámcově = neexistuje jednotný a přesný popis pro validaci qpcr metod. Limit detekce SOUBOR PARAMETRŮ VERIFIKACE Limit kvantitativního stanovení Nelze provést podle jednotných testů, protože v dnešní době v podstatě neexistují. K verifikaci bývá proto velmi často využíváno panelů určených k externímu hodnocení kvality (EHK, EQA). Pomocí těchto panelů jsme schopni posoudit: Lineární rozsah měření 1. Minimální kvalitu diagnostika (a celého laboratorního postupu) při stanovení konkrétního patogena 2. Kvalitu práce laboratoře při stanovení konkrétního patogena ve srovnání s ostatními účastníky EHK
44 Externí hodnocení kvality Doporučení č. 1 České společnosti klinické biochemie ČLS JEP (dále jen ČSKB) a Referenční laboratoře pro klinickou biochemii MZ ČR (dále jen RL) k systému externího hodnocení kvality (dále jen EHK). Podstata externího hodnocení kvality EHK je součástí procesů zajištění kvality měření. Principem EHK je provádění mezilaboratorních porovnávání zkoušek. Je organizováno a vyhodnocováno organizátory EHK (organizátoři EHK se označují termínem EQA providers). EHK v molekulární mikrobiologii Pro zajištění kvality měření a mezilaboratorní porovnání při použití Real Time PCR metod pro detekci patogenů jsou k dispozici následující panely: 1. INSTAND e.v. (Germany) 2. QCMD (Quality Control for Molecular Diagnostics, GB) 3. EHK SZU (Czech Republic)
45 Složení QCMD Odběr, transport a uchování vzorků Izolace nukleových kyselin Real Time PCR Hodnocení a interpretace výsledků Panel obsahuje sadu slepých vzorků o různých koncentracích. Tato sada je po doručení zpracována podle standardních postupů používaných laboratoří k detekci uvedeného patogena. Sample CMV08-08 CMV08-01 CMV08-10 CMV08-07 CMV08-04 CMV08-02 CMV08-09 CMV08-05 CMV08-03 CMV08-06 Výhodou panelu je možnost popsat velkou část diagnostického procesu v laboratoři: - Kvalitu použitého izolační postupu - Kvalitu použité qpcr metody - Správnost a přesnost vyhodnocení
46 Kvalitativní vyhodnocení QCMD Vyhodnocení vzorků podle definovaného klíče: 1. Core samples klinicky důležité s největší váhou při hodnocení 2. Educational samples sledují vývoj kvality a citlivosti v čase. Menší váha při hodnocení
47 Kvalitativní vyhodnocení QCMD Konečné srovnání ve vztahu k ostatním účastníkům tohoto panelu
48 Kvantitativní vyhodnocení QCMD Kvantitativní vyhodnocení: 1. Každému vzorku je přiřazena konsensuální hodnota (uvedeno v log10) 2. Kolem každé konsensuální hodnoty je stanovena SD (uvedeno v log10)
49 Kvantitativní vyhodnocení QCMD Konečné srovnání ve vztahu k ostatním účastníkům tohoto panelu
50 Část II. Ukázky využití statistických metod v molekulární mikrobiologii
51 SPECIFITA
52 Případ I Detekce Chlamydia trachomatis Jako nejvhodnější cíl pro detekci Chlamydia trachomatis byl zvolen úsek kryptického plasmidu (CP) Většina komerčních souprav detekuje CP pomocí stejných párů primerů Citlivost detekce je díky multikopiovému cíli vysoká Specifita je vysoká KVALITNÍ DIAGNOSTICKÝ NÁSTROJ PRO DETEKCI Chlamydia trachomatis
53 Případ I Švédsko do roku 2005 Diagnostikované a hlášené případy Chlamydia trachomatis ve Švédsku plynule rostou (v letech o 120%!) V roce 2005 je zaznamenán nárůst pouze o 2% a v roce 2006 dokonce klesá o 2%! Jaký je důvod změny tohoto trendu? REASONS FOR THE SHARP INCREASE OF GENITAL CHLAMYDIA INFECTIONS REPORTED IN THE FIRST MONTHS OF 2007 IN SWEDEN. I Velicko, S Kühlmann-Berenzon, A Blaxhult. Eurosurveillance, Volume 12, Issue 10, 01 October 2007.
54 Případ I Švédsko - rok 2006 až 2008 V označené části Švédska byla poprvé provedena konfirmace 2 nezávislými testy Každý z testů byl cílen do jiných částí genomu Chlamydia trachomatis Byl zjištěn. Emergence and Spread of Chlamydia trachomatis Variant, Sweden. Björn Herrmann, Anna Törner, Nicola Low, Markus Klint, Anders Nilsson, Inga Velicko, Thomas Söderblom, and Anders Blaxhult. CDC, Volume 14, Number 9 September 2008
55 Případ I Švédsko - rok 2006 až 2008 CP jako cíl detekce Jiný cíl detekce 10% pokles detekovaných infekcí Ch. trachomatis v případě PCR zacílené do CP 1% nárůst detekovaných infekcí v případě PCR zacílené do jiné části genomu Chlamydia trachomatis. Změna trendu je pravděpodobně způsobena chybnou detekcí nové genetické varianty Chlamydia trachomatis v populaci. Impact of a genetic variant of Chlamydia trachomatis on national detection rates in Sweden. T Söderblom, A Blaxhult, H Fredlund, B Herrmann. Eurosurveillance, Volume 11, Issue 49, 07 December 2006.
56 Varianta s mutací CP Případ I Švédsko nová genetická varianta Ch. trachomatis Jedná se o deleci 377bp v oblasti CDS1 Tato oblast je nejčastějším cílem pro komerčně dodávané PCR diagnostické sety Co-evolution of genomes and plasmids within Chlamydia trachomatis and the emergence in Sweden of a new variant strain. Seth-Smith HM, Harris SR, Persson K, Marsh P, Barron A, Bignell A, Bjartling C, Clark L, Cutcliffe LT, Lambden PR, Lennard N, Lockey SJ, Quail MA, Salim O, Skilton RJ, Wang Y, Holland MJ, Parkhill J, Thomson NR, Clarke IN. BMC Genomics May 21;10:239. doi: / May 21;10:239. doi: /
57 Švédsko - rok 2007 A thrilling story in Sweden, with global impact (Björn Herrmann) Případ I V roce 2006 byla objevena ve Švédsku nová varianta Chlamydia trachomatis Tato nová varianta uniká detekci pomocí PCR souprav Abbott m2000 (Abbott Diagnostics, Chicago, IL, USA), nebo Cobas Amplicor/TaqMan48 (Roche Diagnostics, Basel, Switzerland) se zacílením do části CP Odhaduje se, že do roku 2007 uniklo detekci zhruba 8000 případů infekce Chlamydia trachomatis A new genetic variant of Chlamydia trachomatis. Björn Herrmann. Sex Transm Infect July; 83(4):
58 Případ I Švédsko - rok 2008 V roce 2007 je zaznamenán opět výrazný nárůst diagnostikovaných a hlášených případů Chlamydia trachomatis Tento výrazný nárůst je způsoben změnou diagnostických setů a jejich zacílení Použita jiná část CP plasmidu jako cíl Použita duplexní detekce dvou nezávislých genů Emergence and Spread of Chlamydia trachomatis Variant, Sweden. Björn Herrmann, Anna Törner, Nicola Low, Markus Klint, Anders Nilsson, Inga Velicko, Thomas Söderblom, and Anders Blaxhult. CDC, Volume 14, Number 9 September 2008
59 Co se vlastně stalo? Případ I
60 Patogen Otevřený, dynamický a živý systém vystavený selekčnímu tlaku vnějšího prostředí
61 Nová diagnostická souprava Patogen Uzavřený a vůči patogenu statický systém in vitro Otevřený, dynamický a živý systém vystavený selekčnímu tlaku vnějšího prostředí
62 PPV Boj začíná Diagnostická souprava Patogen 95,00% 90,00% 85,00% 80,00% 75,00% 70,00% 65,00% 60,00% 55,00% 50,00% Čas Vysoká specifita Vysoká sensitivita
63 PPV Variabilita genomu Boj začíná Diagnostická souprava Patogen 95,00% 6,00% 90,00% 85,00% 5,00% 80,00% 4,00% 75,00% 70,00% 3,00% 65,00% 2,00% 60,00% 55,00% 1,00% 50,00% Čas 0,00% Čas Vysoká specifita Vysoká sensitivita Variabilita genomu je relativně nízká, ale v důsledku úspěšné diagnostiky a nasazení účinné terapie
64 Variabilita genetické informace Po nějakém čase 14,00% Nová genetická varianta patogenu Diagnostická souprava 12,00% 10,00% 8,00% 6,00% 4,00% 2,00% 0,00% Čas dochází v čase k nárůstu změn v genetické informaci a jejich fixaci v důsledku selekčního tlaku vnějšího prostředí.
65 Variabilita genetické informace Po nějakém čase 14,00% Nová genetická varianta patogenu Diagnostická souprava 12,00% 10,00% 8,00% 6,00% 4,00% 2,00% 0,00% Čas dochází v čase k nárůstu změn v genetické informaci a jejich fixaci v důsledku selekčního tlaku vnějšího prostředí. Změny v genetické informaci zasáhnou místo zacílení dg. soupravy
66 Variabilita genetické informace SPECIFITA Po nějakém čase 14,00% 12,00% 10,00% Nová genetická varianta patogenu Diagnostická souprava 95,00% 90,00% 85,00% 80,00% 8,00% 75,00% 6,00% 4,00% 2,00% 70,00% 65,00% 60,00% 55,00% 0,00% Čas 50,00% Čas dochází v čase k nárůstu změn v genetické informaci a jejich fixaci v důsledku selekčního tlaku vnějšího prostředí. Dochází k poklesu specifity Sensitivita se často nemění
67 Výsledek Nová genetická varianta patogenu Diagnostická souprava
68 Výsledek Nová genetická varianta patogenu Diagnostická souprava Falešně negativní výsledek
69 LIMIT DETEKCE LoD Využití Probit analýz pro stanovení bezpečného postupu citlivé detekce při směšování vzorků
70 Směšování vzorků Pool Příprava poolu pro kontrolu krevních produktů a derivátů pomocí PCR je standardní postup CONTROL AUTHORITY BATCH RELEASE OF BLOOD PRODUCTS Validation Of Nucleic Acid Amplification Technology (NAT) For The Detection Of Hepatitis C Virus (HCV) RNA In Plasma Pools
71 Směšování vzorků Pool Příprava poolu pro kontrolu krevních produktů a derivátů pomocí PCR je standardní postup CONTROL AUTHORITY BATCH RELEASE OF BLOOD PRODUCTS Validation Of Nucleic Acid Amplification Technology (NAT) For The Detection Of Hepatitis C Virus (HCV) RNA In Plasma Pools Příprava poolu z důvodu naředění hraničně pozitivních vzorků přináší větší riziko selhání vyšetření
72 Stanovení citlivosti PCR metody Analytická citlivost pro testy NAT musí být vyjádřena s 95% hraniční pozitivní hodnotou cut-off a výpočtem pomocí vhodné statistické analýzy. Požadavky komise 2009/108/ES pro společné technické specifikace pro diagnostické zdravotnické prostředky in vitro
73 Stanovení citlivosti HCV Stanovení meze detekce s pravděpodobností 95% %P Koncentrace Chyba Dolní mez Horní mez 1 0, , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , ,2531 2, , , ,8872 3, , , ,1567 7, , , ,6964 8, , , ,5990 9, , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , ,485 33, , ,672 Percent % Stanovená mez detekce HCV je ,8180 IU/ml s rozptylem 36,1734 IU/ml až 102,751 IU/ml s 95% hraniční hodnoty cut-off Cumulative Plot for HCV PCR Kit Weibull - 95% CI Probit Data - ML Estimates Table of Statistics Shape 0, Scale 10,8338 Mean 14,1798 StDev 21,5645 Median 6,30324 IQ R 15, , koncentrace
74 Stanovení citlivosti HCV %P Koncentrace Chyba Dolní mez Horní mez 1 0, , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , ,2531 2, , , ,8872 3, , ,6619 Při vyšetření 100 vzorků o průměrné koncentraci 90 37,1567 7, , , ,6964 8, , , ,5990 9, , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , ,485 33, , ,672 54,8180 IU/ml bude 95 vzorků pozitivních (Pravděpodobnost selhání je 5%)
75 1 ml 1 ml 1 ml 1 ml 1 ml 1 ml Směšování vzorků HCV Pool Teoretický model Vzorky plasmy 54,8 IU HCV 0 IU HCV 0 IU HCV 0 IU HCV 0 IU HCV 0 IU HCV Stanovená citlivost PCR metody je 54,8 IU/ml při vyšetření každého vzorku samostatně
76 6 ml Směsný vzorek 1:6 Směšování vzorků HCV Pool Teoretický model Otázka I 9,13 IU/ml HCV Jak bude vypadat citlivost metody v takto připraveném poolu vzorků?
77 Odpověď %P Koncentrace Chyba Dolní mez Horní mez 1 0, , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , ,2531 2, , , ,8872 3, , , ,1567 7, , , ,6964 8, , , ,5990 9, , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , ,485 33, , ,672 Stanovení citlivosti HCV Teoretický model Teoreticky dojde k výraznému nárůstu pravděpodobnosti selhání vyšetření (z 5 % zhruba na 40 %)
78 6 ml Směsný vzorek 1:6 Směšování vzorků HCV Pool Teoretický model Otázka II 9,13 IU/ml HCV Lze zachovat ekonomický přínos poolování vzorků při současném zachování deklarované citlivosti vyšetření?
79 Směšování vzorků HCV Pool Teoretický model Odpověď Ano, teoreticky toho lze dosáhnout pomocí opakování vyšetření poolu vzorků Izolace I Izolace II 3 vyšetření - alespoň 1 pozitivní - Citlivost 10,8 ø v IU/ml Izolace III PCR I PCR II PCR III Opakováním vyšetření se dramaticky zvyšuje citlivost metody Počet opakování Koncentrace ø v IU/ml 1 54, , , , , , , , , ,8247
80 6 ml Směsný vzorek 1:6 Směšování vzorků HCV Pool Teoretický model Shrnutí: Ekonomického přínosu poolování při zachování deklarované citlivosti lze teoreticky dosáhnout: 9,13 IU/ml HCV 1. Nastavením správného počtu opakování vyšetření 2. Nastavením správného počtu vzorků v poolu
81 6 ml 6 ml 6 ml 6 ml Směšování vzorků HCV Pool Nastavení počtu opakování vyšetření 4 sady 20 nezávisle připravených poolů 1 vzorek 54,8 IU/ml + 5 vzorků negativních Směsné vzorky Směsné vzorky Směsné vzorky Směsné vzorky 1:6 1:6 1:6 1:6 9,13 IU/ml HCV 9,13 IU/ml HCV 9,13 IU/ml HCV 9,13 IU/ml HCV 1 opakování vyšetření 2 opakování vyšetření 3 opakování vyšetření 4 opakování vyšetření
82 6 ml 6 ml 6 ml 6 ml Směšování vzorků HCV Pool Nastavení počtu opakování vyšetření Pool 1:6 1 opakování 2 opakování 3 opakování 4 opakování Pozitivních Negativních P selhání 45% 20% 5% < 5% 9,13 IU/ml HCV 9,13 IU/ml HCV 9,13 IU/ml HCV 9,13 IU/ml HCV
83 6 ml 2 ml Směšování vzorků HCV Pool Nastavení počtu vzorků v poolu Pool 1:6 Pool 1:2? 3 opakování vyšetření 1 opakování vyšetření
84 Směšování vzorků HCV Pool Nastavení počtu vzorků v poolu Pool 1:6 Pool 1:2 Pozitivních Negativních 1 4 P selhání 5% 20% 3 opakování vyšetření 1 opakování vyšetření
85 Směšování vzorků HCV Pool Závěry Opakování vyšetření dramaticky zvyšuje sensitivitu Počet opakování vyšetření Koncentrace ø v IU/ml 1 54, , , , , , , , , ,8247
86 Směšování vzorků HCV Pool Závěry Pool 1:2 Pool 1:6 1 opakování detekce 3 opakování detekce P selhání 20% 5% Menší pool méně opakování vyšetření < Při stejné citlivosti Větší pool více opakování vyšetření
87 Směšování vzorků HCV Pool Závěry Správnou kombinací počtu vzorků v poolu a počtu opakování vyšetření je možno zachovat deklarovanou citlivost vyšetření Počet vzorků v poolu Počet opakování 1 3 ~ 5 ~ 9 ~ 10 P selhání 5% 5% 5% 5% 5%
88 Směšování vzorků HCV Pool Závěry Správnou kombinací počtu vzorků v poolu a počtu opakování vyšetření je možno zachovat deklarovanou citlivost vyšetření Počet vzorků v poolu Počet opakování 1 3 ~ 5 ~ 9 ~ 10 P selhání 5% 5% 5% 5% 5% Úspora 0% 50% ~ 58% ~ 64% ~ 80% Čím větší počet vzorků v poolu je použit, tím je ekonomický efekt vyšší při zachování stejné citlivosti vyšetření
89 Směšování vzorků HCV Pool Závěry Systém směšování vzorků je ekonomický pouze při malé míře pozitivit v celém souboru vyšetření Pokud smícháme n vzorků, kde pravděpodobnost výskytu HCV je p, pak ve směsi může být 0 až n pozitivních vzorků, kde počet pozitivních vzorků se řídí binomickým rozdělením. Binomické rozdělení (popis tzv. náhodného výběru s vracením) Bi(n, p), kde n je přirozené číslo, p je reálné číslo, 0 p 1: n x p( x) p 1 p x n x Pro vytváření poolu 1:6 pro detekci HCV s citlivostí 54,8 IU/ml je tento proces výhodný do 10 % pozitivních vzorků
90 Využití parametrů kvantitativního stanovení pro určení odezvy na léčbu Jak přesná je přesná kvantifikace? Jak interpretovat kvantitativní výsledky?
91 RaR studie Stanovení přesnosti a rozlišitelnosti měření testovaných koncentrací v rozsahu kalibrační přímky
92 Vložená koncentrace kopií/µl Rozptyl měření kopií/µl PCR reakce je schopna bezpečně odlišit změny koncentrací v rozsahu kalibrační přímky s definovanou variabilitou
93 Jak interpretovat na základě předchozí charakteristiky měřená data? Hustota pravděpodobnosti Koncentrace (kopie/ul) ,86 0,96 0,23 Naměřené hodnoty (kopie/ul) ,96 0,86 0,23 - -
94 Případ: - Pacient po transplantaci ledviny - Podezření na CMV infekci - Nasazena terapie Vyšetření Výsledek kopií/ml 1. den den den Kdy došlo k prokazatelnému poklesu virové nálože ve vzorku a reakci na léčbu?
95 Hustota pravděpodobnosti 10e5 10e4 Koncentrace (kopie/ml) Vyšetření Výsledek kopií/ml 1. den den den K prokazatelnému poklesu virové nálože ve vzorku došlo až při 3. vyšetření (oproti 1. a 2. vyšetření)
96 Při stanovování klinicky významné hladiny je třeba počítat s variabilitou měření dané laboratoře a daného postupu Vložená koncentrace kopií/µl Rozptyl měření kopií/µl Klinicky významná hladina
97 Využití Probit analýzy při volbě diagnostika Reálný příklad problému srovnání dvou PCR diagnostik podle parametrů validace uvedených výrobcem
98 Validace LoD Chlamydia trachomatis Souprava A Souprava B Mez detekce (Limit of Detection) V případě obou výrobců stanoven pomocí Probit analýzy (standardní postup pro tento účel)
99 Validace LoD Chlamydia trachomatis Souprava A Souprava B 0,3 kopie/µl 1,5 kopie/µl Cumulative Plot for CHT PLUS SYSTEM Weibull - 95% CI Probit Data - ML Estimates Percent Table of Statistics Shape 0, Scale 0, Mean 0, StDev 0, Median 0, IQ R 0, ,0 0,5 1,0 1,5 2,0 Concentration/µl 2,5 3,0
100 Validace LoD Chlamydia trachomatis Souprava A Souprava B Souprava A LoD výrazně nižší oproti soupravě B. 0,3 kopie/µl 1,5 kopie/µl Cumulative Plot for CHT PLUS SYSTEM Weibull - 95% CI Probit Data - ML Estimates Percent Table of Statistics Shape 0, Scale 0, Mean 0, StDev 0, Median 0, IQ R 0, ,0 0,5 1,0 1,5 2,0 Concentration/µl 2,5 3,0
101 Reálný limit detekce? Chlamydia trachomatis Souprava A Souprava B 0,3 kopie/µl 1,5 kopie/µl Připraven verifikační test Hypotéza: LoD souprava A < LoD souprava B
102 1 ml Souprava A Verifikace LoD Chlamydia trachomatis Vzorek moči Souprava B Chlamydia trachomatis +++ Označení vzorku Ředění 0 1:1 1:1 1:1 1:1 1:1 1:1 1:1 1:1 1:1 1:1 Počet izolací Opakování PCR
103 Verifikace LoD Chlamydia trachomatis Souprava A Souprava B Očekávaný výsledek: LoD souprava A < LoD souprava B Označení vzorku SOUPRAVA A SOUPRAVA B Opakování PCR
104 Verifikace LoD Chlamydia trachomatis Souprava A Souprava B Dosažený výsledek LoD souprava A -? - LoD souprava B Označení vzorku SOUPRAVA A SOUPRAVA B Opakování PCR
105 Verifikace LoD Chlamydia trachomatis Souprava A Souprava B Cumulative Plot for events Normal - 95% CI Probit Data - ML Estimates Percent Gage GeneProof QIAGENE Table of Statistics Mean StDev -0, , , , ,0-1,5-1,0-0,5 0,0 LOGTEN(conc) 0,5 1,0 Statisticky bylo prokázáno, že soupravy mají s pravděpodobností 95% stejný LoD.
106 LoD Chlamydia trachomatis Souprava A Souprava B Kde leží příčina tak rozdílných výsledků validace parametru LoD výrobci?
107 Analýza parametrů VALIDACE Souprava A Souprava B POUŽITELNÝ VÝSLEDEK Vstupní kontrola v testu Provedení testu Statistické vyhodnocení Interpretace výsledku
108 Analýza parametrů VALIDACE Souprava A Souprava B LÍBIVÉ VÝSTUPY STATISTICKY KOREKTNÍ VÝSTUPY Vstupní kontrola v testu Provedení testu Statistické vyhodnocení Interpretace výsledku Vstupní kontrola v testu Provedení testu Statistické vyhodnocení Interpretace výsledku
109 Analýza parametrů VALIDACE Souprava A Souprava B LÍBIVÉ VÝSTUPY STATISTICKY KOREKTNÍ VÝSTUPY
110 Souprava A Souprava B Na základě parametru uvedeného ve VALIDACI nelze porovnat LoD soupravy A versus B
111 věřím, že příčinou naší nepřipravenosti na nestandardní události je především setrvačnost našeho myšlení v podobě přílišné důvěry ve statistiky.. Raději budu mít vždy alespoň přibližně pravdu, než abych se, byť jedinkrát, přesně mýlil Nassim Nicholas Taleb Černá labuť
112 Děkuji za pozornost
Validace a verifikace molekulárně biologických metod v analýze humánního a extrahumánního genomu
Validace a verifikace molekulárně biologických metod v analýze humánního a extrahumánního genomu - hledání racionálního konsensu místo hry s čísly - P. Hložek 1, M. Sittová 1, M. Dendis 1, J. Mrázek 2
VíceChyby spektrometrických metod
Chyby spektrometrických metod Náhodné Soustavné Hrubé Správnost výsledku Přesnost výsledku Reprodukovatelnost Opakovatelnost Charakteristiky stanovení 1. Citlivost metody - směrnice kalibrační křivky 2.
VíceAnalytické znaky laboratorní metody Interní kontrola kvality Externí kontrola kvality
Analytické znaky laboratorní metody Interní kontrola kvality Externí kontrola kvality RNDr. Alena Mikušková FN Brno Pracoviště dětské medicíny, OKB amikuskova@fnbrno.cz Analytické znaky laboratorní metody
VíceZABEZPEČENÍ KVALITY V LABORATOŘI
ZABEZPEČENÍ KVALITY V LABORATOŘI David MILDE, 2014-2017 QUALITY KVALITA (JAKOST) Kvalita = soubor znaků a charakteristik výrobku či služby, který může uspokojit určitou potřebu. Kvalita v laboratoři=výsledky,které:
VíceÚvod do problematiky měření
1/18 Lord Kelvin: "Když to, o čem mluvíte, můžete změřit, a vyjádřit to pomocí čísel, něco o tom víte. Ale když to nemůžete vyjádřit číselně, je vaše znalost hubená a nedostatečná. Může to být začátek
VíceValidace sérologických testů výrobcem. Vidia spol. s r.o. Ing. František Konečný IV/2012
Validace sérologických testů výrobcem Vidia spol. s r.o. Ing. František Konečný IV/2012 Legislativa Zákon č. 123/2000 Sb. o zdravotnických prostředcích ve znění pozdějších předpisů Nařízení vlády č. 453/2004
VíceZákladní terminologické pojmy (Mezinárodní metrologický slovník VIM3)
Základní terminologické pojmy (Mezinárodní metrologický slovník VIM3) Přesnost a správnost v metrologii V běžné řeči zaměnitelné pojmy. V metrologii a chemii ne! Anglický termín Measurement trueness Measurement
VíceExterní kontrola kvality sekvenačních analýz
Externí kontrola kvality sekvenačních analýz Radka Bolehovská 1, Lenka Plíšková 2, Kateřina Hrochová 2 Úsek molekulární biologie, 1 Ústav klinické mikrobiologie 2 Ústav klinické biochemie a diagnostiky
VíceKalibrace analytických metod. Miroslava Beňovská s využitím přednášky Dr. Breineka
Kalibrace analytických metod Miroslava Beňovská s využitím přednášky Dr. Breineka Měřící zařízení (zjednodušeně přístroje) pro měření fyzikálních veličin musí být výrobci kalibrovaná Objem: pipety Teplota
VíceNejistota měř. ěření, návaznost a kontrola kvality. Miroslav Janošík
Nejistota měř ěření, návaznost a kontrola kvality Miroslav Janošík Obsah Referenční materiály Návaznost referenčních materiálů Nejistota Kontrola kvality Westgardova pravidla Unity Referenční materiál
VíceMATEMATICKO STATISTICKÉ PARAMETRY ANALYTICKÝCH VÝSLEDKŮ
MATEMATICKO STATISTICKÉ PARAMETRY ANALYTICKÝCH VÝSLEDKŮ Má-li analytický výsledek objektivně vypovídat o chemickém složení vzorku, musí splňovat určitá kriteria: Mezinárodní metrologický slovník (VIM 3),
VíceSkrytá tvář laboratorních metod? J. Havlasová, Interimun s.r.o.
Skrytá tvář laboratorních metod? J. Havlasová, Interimun s.r.o. Vlastnosti charakterizující laboratorní metodu: 1. z hlediska analytického přesnost/ správnost ( nejistota měření ) analytická citlivost
VíceVerifikace sérologických testů v imunologických laboratořích ISO 15189 5.5 Postupy vyšetření
Verifikace sérologických testů v imunologických laboratořích ISO 15189 5.5 Postupy vyšetření Andrea Vinciková Centrum imunologie a mikrobiologie Zdravotní ústav se sídlem v Ústí nad Labem Validace Ověřování,
VíceKalibrace analytických metod
Kalibrace analytických metod Petr Breinek BC_Kalibrace_2010 Měřící zařízení (zjednodušeně přístroje) pro měření fyzikálních veličin musí být výrobci kalibrovaná Objem: pipety Teplota (+37 C definovaná
VíceStavba slovníku VIM 3: Zásady terminologické práce
VIM 1 VIM 2:1993 ČSN 01 0115 Mezinárodní slovník základních a všeobecných termínů v metrologii VIM 3:2007 International Vocabulary of Metrology Basic and General Concepts and Associated Terms Mezinárodní
VíceNová doporučení o interní kontrole kvality koagulačních vyšetření. RNDr. Ingrid V. Hrachovinová, Ph.D. Laboratoř pro poruchy hemostázy, ÚHKT Praha
Nová doporučení o interní kontrole kvality koagulačních vyšetření RNDr. Ingrid V. Hrachovinová, Ph.D. Laboratoř pro poruchy hemostázy, ÚHKT Praha Proč vnitřní kontrola kvality (VKK) ve vyšetření hemostázy?
Vícepřesnost (reprodukovatelnost) správnost (skutečná hodnota)? Skutečná hodnota použití různých metod
přesnost (reprodukovatelnost) správnost (skutečná hodnota)? Skutečná hodnota použití různých metod Měření Pb v polyethylenu 36 různými laboratořemi 0,47 0 ± 0,02 1 µmol.g -1 tj. 97,4 ± 4,3 µg.g -1 Měření
VíceKonsolidovaná laboratoř, organizace práce na laboratoři, kontrola kvality, laboratorní informační systém. Miroslav Průcha
Konsolidovaná laboratoř, organizace práce na laboratoři, kontrola kvality, laboratorní informační systém Miroslav Průcha Centralizace a konsolidace Nekonsolidovaná laboratoř - samostatné laboratoře OKB,
VíceStatistika a chemometrie v klinické biochemii
Statistika a chemometrie v klinické biochemii (S jakými aplikacemi i statistiky ti tik pracujeme v laboratoři klinické biochemie nejčastěji?) P. Breinek PF_statistika a chemometrie 2011 1 Kvalita (jakost)
VíceMezinárodn metrologických pojmů a chemická
Mezinárodn rodní slovník metrologických pojmů a chemická a bioanalytická měření Zbyněk k Plzák Ústav anorganické chemie AV ČR, v. v. i Zlatá pravidla vědeckv deckého života... Terminologií se většinou
VíceVÝZNAM NĚKTERÝCH FAKTORŮ PREANALYTICKÉ FÁZE V MOLEKULÁRNÍ BIOLOGII
VÝZNAM NĚKTERÝCH FAKTORŮ PREANALYTICKÉ FÁZE V MOLEKULÁRNÍ BIOLOGII Plíšková L., Hrochová K., Kutová R. Ústav klinické biochemie a diagnostiky FN Hradec Králové PREANALYTICKÁ FÁZE V MOLEKULÁRNÍ BIOLOGII
VíceKomutabilita referenčních materiálů a bias měření v laboratorní medicíně
Komutabilita referenčních materiálů a bias měření v laboratorní medicíně B.Friedecký, J.Kratochvíla, SEKK Pardubice Komutabilita-vlastnost RM Je podmíněna přiměřeností matrice RM a dostatečností její shody
VíceNová doporučení o interní kontrole kvality krevního obrazu. Soňa Vytisková
Nová doporučení o interní kontrole kvality krevního obrazu Soňa Vytisková 1 2 3 4 5 ÚVOD Programy vnitřní kontroly kvality klinických laboratoří mají sice svá obecná pravidla, ale je nutné je individuálně
VíceNová metrologická terminologie. Marta Farková
Nová metrologická terminologie Marta Farková 14. 11. 2013 DŘÍVE POUŽÍVANÉ POJMY Anglicky: Accuracy Precision Reliability Česky: Správnost Přesnost Spolehlivost 2 SOUČASNÝ STAV Anglicky: Trueness Precision
VíceKALIBRACE. Definice kalibrace: mezinárodní metrologický slovník (VIM 3)
KALIBRACE Chemometrie I, David MILDE Definice kalibrace: mezinárodní metrologický slovník (VIM 3) Činnost, která za specifikovaných podmínek v prvním kroku stanoví vztah mezi hodnotami veličiny s nejistotami
VíceVOLBA OPTIMÁLNÍ METODY
VOLBA OPTIMÁLNÍ METODY Jak nalézt z velkého množství metod nejlepší ( fit for purpose ) postup? (c) David MILDE Jak na to? 1. Identifikovat problém požadovaná informace (kvalitativní či kvantitativní analýza,
VíceČESKÝ INSTITUT PRO AKREDITACI, o.p.s. Dokumenty ILAC. ILAC Mezinárodní spolupráce v akreditaci laboratoří
ČESKÝ INSTITUT PRO AKREDITACI, o.p.s. Opletalova 41, 110 00 Praha 1 Nové Město Dokumenty ILAC ILAC Mezinárodní spolupráce v akreditaci laboratoří Číslo publikace: ILAC - G17:2002 Zavádění koncepce stanovení
VíceMonitoring složek ŽP - instrumentální analytické metody
Monitoring složek ŽP - instrumentální analytické metody Seznámení se základními principy sledování pohybu polutantů v životním prostředí. Přehled používaných analytických metod. Způsoby monitoringu kvality
VíceDoplňuje vnitřní kontrolu kvality. Principem je provádění mezilaboratorních porovnávacích zkoušek (srovnatelnost výsledků)
Externí hodnocení kvality (EHK) Petr Breinek BC_EHK_N2011 1 Externí hodnocení kvality (EHK) také: Zkoušení způsobilosti nepoužívat: Externí kontrola kvality (od 07/2011) norma ISO 17043 Doplňuje vnitřní
VícePRINCIPY ZABEZPEČENÍ KVALITY
(c) David MILDE, 2013 PRINCIPY ZABEZPEČENÍ KVALITY POUŽÍVANÁ OPATŘENÍ QA/QC Interní opatření (uvnitř laboratoře): pravidelná analýza kontrolních vzorků a CRM, sledování slepých postupů a možných kontaminací,
VíceVyjadřování přesnosti v metrologii
Vyjadřování přesnosti v metrologii Měření soubor činností, jejichž cílem je stanovit hodnotu veličiny. Výsledek měření hodnota získaná měřením přisouzená měřené veličině. Chyba měření výsledek měření mínus
VíceVOLBA OPTIMÁLNÍ METODY
VOLBA OPTIMÁLNÍ METODY Jak nalézt z velkého množství metod nejlepší ( fit for purpose ) postup? Jak na to? 1. Identifikovat problém požadovaná informace (kvalitativní či kvantitativní analýza, ). 2. Nalézt
Více8/2.1 POŽADAVKY NA PROCESY MĚŘENÍ A MĚŘICÍ VYBAVENÍ
MANAGEMENT PROCESŮ Systémy managementu měření se obecně v podnicích používají ke kontrole vlastní produkce, ať už ve fázi vstupní, mezioperační nebo výstupní. Procesy měření v sobě zahrnují nemalé úsilí
Vícepro validace metod molekulární genetiky určených
Doporučení Společnosti lékařské genetiky ČLS JEP Analytická validace metod molekulární genetiky určených pro analýzu lidského genomu Brdička, R. 1, Vraná, M. 1, Otáhalová, E. 1, Štambergová, A. 2, Čamajová,
VíceDiagnostika infekce Chlamydia trachomatis pomocí molekulárně genetické metody real time PCR nejen u pacientek z gynekologických zařízení
Diagnostika infekce Chlamydia trachomatis pomocí molekulárně genetické metody real time PCR nejen u pacientek z gynekologických zařízení Mgr. Klára Vilimovská Dědečková, Ph.D. Synlab genetics s.r.o. Molekulární
VíceAplikace molekulárně biologických postupů v časné detekci sepse
Aplikace molekulárně biologických postupů v časné detekci sepse Mgr. Jana Ždychová, Ph.D. IKEM PLM - LLG Sepse je častou příčinou úmrtí během hospitalizace. Včasné nasazení odpovídající ATB terapie je
VíceDIAGNOSTIKA A MONITOROVÁNÍ INFEKCÍ ZPŮSOBENÉ LIDSKÝMI PAPILLOMAVIRY VYSOCE RIZIKOVÉHO TYPU POMOCÍ REAL TIME PCR
DIAGNOSTIKA A MONITOROVÁNÍ INFEKCÍ ZPŮSOBENÉ LIDSKÝMI PAPILLOMAVIRY VYSOCE RIZIKOVÉHO TYPU POMOCÍ REAL TIME PCR Michaela Kavanová, DiS. tel.: +420 221 985 476 mobil: +420 725 004 523 e-mail: michaela.kavanova@synlab.cz
VíceKontrola kvality. Marcela Vlková ÚKIA, FNUSA Veronika Kanderová CLIP, FN Motol
Kontrola kvality Marcela Vlková ÚKIA, FNUSA Veronika Kanderová CLIP, FN Motol Kontrola kvality Výsledky analytických měření mají silný dopad v praxi: v klinických laboratořích mohou rozhodným a někdy i
VíceZpracování a vyhodnocování analytických dat
Zpracování a vyhodnocování analytických dat naměřená data Zpracování a statistická analýza dat analytické výsledky Naměř ěřená data jedna hodnota 5,00 mg (bod 1D) navážka, odměřený objem řada dat 15,8;
VíceZajištění kvality výsledků laboratorních vyšetření v hematologické laboratoři dle ČSN EN ISO 15189:2013. Soňa Vytisková
Zajištění kvality výsledků laboratorních vyšetření v hematologické laboratoři dle ČSN EN ISO 15189:2013 Soňa Vytisková 1 ČIA Principy akreditace zdravotnických laboratoří Vybudování funkčního systému akreditace
VíceMezilaboratorní porovnávací zkoušky jeden z nástrojů zajištění kvality zkoušení. Lenka Velísková, ITC Zlín Zákaznický den,
Mezilaboratorní porovnávací zkoušky jeden z nástrojů zajištění kvality zkoušení Lenka Velísková, ITC Zlín Zákaznický den, 17. 3. 2011 Zákazník požadavek na zjištění vlastností nebo parametrů výrobku /
VíceResolution, Accuracy, Precision, Trueness
Věra Fišerová 26.11.2013 Resolution, Accuracy, Precision, Trueness Při skenování se používá mnoho pojmů.. Shodnost měření, rozlišení, pravdivost měření, přesnost, opakovatelnost, nejistota měření, chyba
VíceObecné zásady interpretace výsledků - chemické ukazatele
Obecné zásady interpretace výsledků - chemické ukazatele Ivana Pomykačová Konzultační den SZÚ Hodnocení rozborů vody Výsledek měření souvisí s: Vzorkování, odběr vzorku Pravdivost, přesnost, správnost
VíceNEJISTOTA MĚŘENÍ. David MILDE, 2014 DEFINICE
NEJISTOTA MĚŘENÍ David MILDE, 014 DEFINICE Nejistota měření: nezáporný parametr charakterizující rozptýlení hodnot veličiny přiřazených k měřené veličině na základě použité informace. POZNÁMKA 1 Nejistota
VíceFilozofie validace. Je validace potřebná? Mezinárodní doporučení pro provádění validací ve forenzně genetických laboratořích
INVESTICE DO ROZVOJE VZDĚLÁVÁNÍ Vzdělávání v oblasti forenzní genetiky reg. č. CZ.1.07/2.3.00/09.0080 Mezinárodní doporučení pro provádění validací ve forenzně genetických laboratořích INVESTICE DO ROZVOJE
VíceZa hranice nejistoty(2)
Za hranice nejistoty(2) MUDr. Jaroslava Ambrožová OKB-H Nemocnice Prachatice, a.s. 19.5.2014 1 TNI 01 0115: VIM EP15-A2 User Verification of performance for Precision and Trueness C51-A Expression of measurement
VíceValidační protokol LT CRP HS II (ADVIA 1800)
Validační protokol LT CRP HS II (ADVIA 1800) Datum vydání: 9.5.2011 Zpracoval: Ing. Luděk Šprongl Pracoviště: Centrální laboratoř, Šumperská nemocnice a.s. Validační protokol LT CRP HS II 1. CÍL, PŘEDMĚT
VíceNárodní informační středisko pro podporu jakosti
Národní informační středisko pro podporu jakosti STATISTICKÉ METODY V LABORATOŘÍCH Ing. Vratislav Horálek, DrSc. Ing. Jan Král 2 A.Základní a terminologické normy 1 ČSN 01 0115:1996 Mezinárodní slovník
VíceZávěrečná zpráva. PT#M/34/2016 (č. 953) Průkaz DNA HSV a VZV. Zkoušení způsobilosti v lékařské mikrobiologii (Externí hodnocení kvality)
Státní zdravotní ústav Expertní skupina pro zkoušení způsobilosti Poskytovatel programů zkoušení způsobilosti akreditovaný ČIA, Podle ČSN EN ISO/IEC 17043, reg. č. 7001 Šrobárova 48, 100 42 Praha 10 Vinohrady
VíceVÝSKYT PROTILÁTEK TŘÍDY IgM PO VAKCINACI PROTI VIROVÉ HEPATITIDĚ A
VÝSKYT PROTILÁTEK TŘÍDY IgM PO VAKCINACI PROTI VIROVÉ HEPATITIDĚ A Ing. František Štumr, Ph.D., RNDr. Stanislava Fabiánová, Ing. Barbara Štumrová, MUDr. Zuzana Kala Grofová PharmDr. Jiří Skalický, Ph.D.
VíceChyby měření 210DPSM
Chyby měření 210DPSM Jan Zatloukal Stručný přehled Zdroje a druhy chyb Systematické chyby měření Náhodné chyby měření Spojité a diskrétní náhodné veličiny Normální rozdělení a jeho vlastnosti Odhad parametrů
VíceRegulační diagramy (RD)
Regulační diagramy (RD) Control Charts Patří k základním nástrojům vnitřní QC laboratoře či výrobního procesu (grafická pomůcka). Pomocí RD lze dlouhodobě sledovat stabilitu (chemického) měřícího systému.
VíceMSA-Analýza systému měření
MSA-Analýza systému měření Josef Bednář Abstrakt: V příspěvku je popsáno provedení analýzy systému měření v technické praxi pro spojitá data. Je zde popsáno provedení R&R studie pomocí analýzy rozptylu
VíceNÁVOD K POUŽITÍ VÁPNÍK 600 KATALOGOVÉ ČÍSLO 207
NÁVOD K POUŽITÍ VÁPNÍK 600 KATALOGOVÉ ČÍSLO 207 POUŽITÍ Souprava Vápník 600 se používá ke kvantitativnímu stanovení koncentrace vápenatých iontů v séru a moči. SOUHRN V lidském organismu je vázána převážná
VícePŘÍRUČKA ŘEŠENÝCH PŘÍKLADŮ
1999-2011 PŘÍRUČKA ŘEŠENÝCH PŘÍKLADŮ EFFIVALIDATION 3 EffiChem your validation software Lesní 593, 679 71 Lysice http://www.effichem.com 2/57 EffiChem můţe vlastnit patenty, podané ţádosti o patenty, ochranné
VíceMETROLOGIE V CHEMII DAVID MILDE, 2013. Metrologie = věda o měření a jeho aplikaci
METROLOGIE V CHEMII DAVID MILDE, 2013 Metrologie = věda o měření a jeho aplikaci Měření - proces experimentálního získávání jedné nebo více hodnot veličiny (měření = porovnávání, zjišťování počtu entit).
Více2012 STÁTNÍ ÚSTAV PRO KONTROLU LÉČIV
2 Novinky a změny v mikrobiologických textech, moderní mikrobiologické metody a trochu matematiky Ing. Ivana Kohoutová 3 Nové a revidované texty v ČL 2017 Doplněk 2018 5.1.1 Metody přípravy sterilních
VíceParametry metod automatické fotometrické analýzy
Parametry metod automatické fotometrické analýzy Každá metoda prováděná automatickým biochemickým analyzátorem má v softwaru řídícího počítače nadefinované parametry: číslo (aplikační kód) metody název
VícePROCES REALIZACE ANALÝZY
PROCES REALIZACE ANALÝZY Vznik požadavku na analýzu a související vazby Analytický proces soubor vztahů mezi: a) požadavky zadavatele b) náklady na provedení analýzy c) vlastním analytickým postupem Důvod
VíceObecné zásady interpretace výsledků - mikrobiologie vody
Obecné zásady interpretace výsledků - mikrobiologie vody Hodnocení rozborů vody Konzultační den RNDr. Jaroslav Šašek ČSN P ENV ISO 13843: 2002 Jakost vod - Pokyny pro validaci mikrobiologických metod Mez
VíceNAT testování dárců krve v ÚVN Praha
Oddělení hematologie a krevní transfuze NAT testování dárců krve v ÚVN Praha Ludmila Landová Organizace laboratorního vyšetření dárců krve - OHKT ÚVN Praha Konsolidované řešení ZVÝŠENÍ bezpečnosti pro
VíceBezpečnostní opatření
Bezpečnostní opatření 181344, Rev. A říjen 212 ADVIA Centaur CP Souprava Ferritin změna analytické citlivosti a upravení hodnot kalibrátoru C Dle našich záznamů jste obdrželi ADVIA Centaur kalibrátor C
Více31. 3. 2014, Brno Hanuš Vavrčík Základy statistiky ve vědě
31. 3. 2014, Brno Hanuš Vavrčík Základy statistiky ve vědě Motto Statistika nuda je, má však cenné údaje. strana 3 Statistické charakteristiky Charakteristiky polohy jsou kolem ní seskupeny ostatní hodnoty
VícePožadavky kladené na úřední laboratoře v oblasti kontroly potravin
SZPI Požadavky kladené na úřední laboratoře v oblasti kontroly potravin Petr Cuhra (VŠCHT, 1.2.2013) Státní zemědělská a potravinářská inspekce Za Opravnou 6, Praha 5, petr.cuhra@szpi.gov.cz www.szpi.gov.cz
VíceÚloha 1: Lineární kalibrace
Úloha 1: Lineární kalibrace U pacientů s podezřením na rakovinu prostaty byl metodou GC/MS měřen obsah sarkosinu v moči. Pro kvantitativní stanovení bylo nutné změřit řadu kalibračních roztoků o různé
VíceDetekční schopnost analytické metody, mez detekce, mez stanovitelnosti
Metodický list 7 EURACHEM-ČR 2011 Editor: Zbyněk Plzák (plzak@iic.cas.cz) Detekční schopnost analytické metody, mez detekce, mez stanovitelnosti Charakterizace detekční schopnosti analytické měřící metody
VícePOSTUP PRO VALIDACI/VERIFIKACI METODY 1
POSTUP PRO VALIDACI/VERIFIKACI METODY 1 Před zavedením nové analytické metody do rutinního laboratorního provozu je třeba prověřit, že její charakteristiky splňují požadavky na ní kladené a validovat ji.
VícePOSTUP PRO VALIDACI/VERIFIKACI METODY 8
Příloha č. 2 - Připomínky POSTUP PRO VALIDACI/VERIFIKACI METODY 8 Před zavedením nové analytické metody do rutinního laboratorního provozu je třeba prověřit, že její charakteristiky splňují požadavky na
VíceZáklady teorie pravděpodobnosti
Základy teorie pravděpodobnosti Náhodná veličina Roman Biskup (zapálený) statistik ve výslužbě, aktuálně analytik v praxi ;-) roman.biskup(at)email.cz 12. února 2012 Statistika by Birom Základy teorie
VíceMarcela Vlková ÚKIA, FNUSA, Brno Veronika Kanderová CLIP, 2. LF UK a FN Motol, Praha VALIDACE A VERIFIKACE V PRŮTOKOVÉ CYTOMETRII
Marcela Vlková ÚKIA, FNUSA, Brno Veronika Kanderová CLIP, 2. LF UK a FN Motol, Praha VALIDACE A VERIFIKACE V PRŮTOKOVÉ CYTOMETRII KONTROLA KVALITY Výsledky analytických měření mají silný dopad v praxi:
VíceTuhá alterna,vní paliva validace metody pro stanovení obsahu biomasy podle ČSN EN Ing. Šárka Klimešová, Výzkumný ústav maltovin Praha, s.r.o.
Tuhá alterna,vní paliva validace metody pro stanovení obsahu biomasy podle ČSN EN 15 440 Ing. Šárka Klimešová, Výzkumný ústav maltovin Praha, s.r.o. Předchozí přednáška popsala laboratorní metodu jako
VíceP13: Statistické postupy vyhodnocování únavových zkoušek, aplikace normálního, Weibullova rozdělení, apod.
P13: Statistické postupy vyhodnocování únavových zkoušek, aplikace normálního, Weibullova rozdělení, apod. Matematický přístup k výsledkům únavových zkoušek Náhodnost výsledků únavových zkoušek. Únavové
VícePředpoklad o normalitě rozdělení je zamítnut, protože hodnota testovacího kritéria χ exp je vyšší než tabulkový 2
Na úloze ukážeme postup analýzy velkého výběru s odlehlými prvky pro určení typu rozdělení koncentrace kyseliny močové u 50 dárců krve. Jaká je míra polohy a rozptýlení uvedeného výběru? Z grafických diagnostik
VíceCHEMOMETRIE S jakými aplikacemi statistiky pracujeme v klinické biochemii nejčastěji?
CHEMOMETRIE S jakými aplikacemi statistiky pracujeme v klinické biochemii nejčastěji? aplikace statistiky pro analytická měření statistické zpracování experimentálních dat KVALIMETRIE je soubor poznatků
VíceZávěrečná zpráva. Zkoušení způsobilosti v lékařské mikrobiologii (Externí hodnocení kvality) PT#M/32/2010 (č. 677) Identifikace herpetických virů
Státní zdravotní ústav Expertní skupina pro zkoušení způsobilosti Organizátor programů zkoušení způsobilosti akreditovaný ČIA, reg. č. 7001 Šrobárova 48, 100 42 Praha 10 Vinohrady Závěrečná zpráva Zkoušení
VíceUZ vyšetření jako měřená veličina v rámci screeningu VVV
UZ vyšetření jako měřená veličina v rámci screeningu VVV Loucký Jaroslav (loucky@imalab.cz) http://www.imalab.cz/ 1 Souhrn Screening VVV je multidisciplinární oblastí vyšetřování Je žádoucí dokumentovat
VíceIVD A AKREDITACE LABORATOŘÍ
IVD A AKREDITACE LABORATOŘÍ Petr Šmídl DIAGNOSTICKÉ ZDRAVOTNICKÉ PROSTŘEDKY IN VITRO klinická biochemie hematologie imunochemie (včetně serologie a imunologie) histopatologie mikrobiologie PRÁVNÍ A NORMATIVNÍ
VíceVYBRANÁ ROZDĚLENÍ. SPOJITÉ NÁH. VELIČINY Martina Litschmannová
VYBRANÁ ROZDĚLENÍ SPOJITÉ NÁH. VELIČINY Martina Litschmannová Opakování hustota pravděpodobnosti f(x) Funkce f(x) je hustotou pravděpodobností (na intervalu a x b), jestliže splňuje následující podmínky:
Více3/8.4 PRAKTICKÉ APLIKACE PŘI POUŽÍVÁNÍ NEJISTOT
PROKAZOVÁNÍ SHODY VÝROBKŮ část 3, díl 8, kapitola 4, str. 1 3/8.4 PRAKTICKÉ APLIKACE PŘI POUŽÍVÁNÍ NEJISTOT Vyjadřování standardní kombinované nejistoty výsledku zkoušky Výsledek zkoušky se vyjadřuje v
VíceNormy ČSN a ČSN ISO z oblasti aplikované statistiky (stav aktualizovaný k 1.1.2008)
Normy ČSN a ČSN ISO z oblasti aplikované statistiky (stav aktualizovaný k 1.1.2008) Ing. Vratislav Horálek, DrSc., předseda TNK 4 při ČNI 1 Terminologické normy [1] ČSN ISO 3534-1:1994 Statistika Slovník
VíceVYSOKONAPĚŤOVÉ ZKUŠEBNICTVÍ. #2 Nejistoty měření
VYSOKONAPĚŤOVÉ ZKUŠEBNICTVÍ # Nejistoty měření Přesnost měření Klasický způsob vyjádření přesnosti měření chyba měření: Absolutní chyba X = X M X(S) Relativní chyba δ X = X(M) X(S) - X(M) je naměřená hodnota
VíceKvalita v laboratorní a kontrolní praxi
Kvalita v laboratorní a kontrolní praxi Část: Rozhodování o shodě se specifikací (limitem) Vladimír Kocourek Praha, 2016 Shoda se specifikací / limitem Posuzování shody se specifikací / limitem Cílem měření
VícePojem management Standardní operační postup (SOP) Management potravinářské laboratoře
Pojem management Standardní operační postup (SOP) Management potravinářské laboratoře 1.roč. nav. MSP LS 2013/2014 Mgr. Kateřina Járová FVHE VFU Brno POJETÍ MANAGEMENTU Ačkoli pojem management v naší běžné
VíceAnalýza dat na PC I.
CENTRUM BIOSTATISTIKY A ANALÝZ Lékařská a Přírodovědecká fakulta, Masarykova univerzita Analýza dat na PC I. Popisná analýza v programu Statistica IBA výuka Základní popisná statistika Popisná statistika
VíceT- MaR. Ústav technologie, mechanizace a řízení staveb. Teorie měření a regulace. Podmínky názvy. 1.c-pod. ZS 2015/ Ing. Václav Rada, CSc.
Ústav technologie, mechanizace a řízení staveb Teorie měření a regulace Podmínky názvy 1.c-pod. ZS 2015/2016 2015 - Ing. Václav Rada, CSc. MĚŘENÍ praktická část OBECNÝ ÚVOD Veškerá měření mohou probíhat
VíceKontrola kvality, normy a akreditace. L. Šprongl, CL Šumperská nemocnice
Kontrola kvality, normy a akreditace L. Šprongl, CL Šumperská nemocnice Obsah Teorie kvality Definice Přehled norem Stav norem Druhy kontrol Kvalita Celkový souhrn vlastností a znaků výrobků nebo služeb,
VíceVYUŽITÍ A VALIDACE AUTOMATICKÉHO FOTOMETRU V ANALÝZE VOD
Citace Kantorová J., Kohutová J., Chmelová M., Němcová V.: Využití a validace automatického fotometru v analýze vod. Sborník konference Pitná voda 2008, s. 349-352. W&ET Team, Č. Budějovice 2008. ISBN
VícePosouzení přesnosti měření
Přesnost měření Posouzení přesnosti měření Hodnotu kvantitativně popsaného parametru jakéhokoliv objektu zjistíme jedině měřením. Reálné měření má vždy omezenou přesnost V minulosti sloužila k posouzení
VíceStanovení manganu a míry přesnosti kalibrace ( Lineární kalibrace )
Příklad č. 1 Stanovení manganu a míry přesnosti kalibrace ( Lineární kalibrace ) Zadání : Stanovení manganu ve vodách se provádí oxidací jodistanem v kyselém prostředí až na manganistan. (1) Sestrojte
VíceZavedení nového přístroje v hematologické laboratoři
Doporučení laboratorní sekce České hematologické společnosti ČLS JEP Zpracoval: S. Vytisková, J. Juráňová, I. Malíková Recenzent: - Schváleno Laboratorní sekcí ČHS ČLS JEP: 9.3.2017 Schváleno výborem ČHS
VíceSada artus HBV QS-RGQ
Sada artus HBV QS-RGQ Výkonnostní charakteristiky Sada artus HBV QS-RGQ, verze 1, 4506363, 4506366 Před samotným testem si ověřte dostupnost nových revizí elektronického značení na adrese www.qiagen.com/products/artushbvrgpcrkitce.aspx.
VíceKATALOG PRODUKTŮ 2015
KATALOG PRODUKTŮ 2015 www.geneproof.com Váš specialista na PCR diagnostiku! KATALOG PRODUKTŮ 2015 GeneProof a.s. je biotechnologická společnost zabývající se molekulární in vitro diagnostikou závažných
VíceSoučasný stav rutinní analytiky některých biochemických markerů. J. Vávrová, B. Friedecký, M. Tichý Ústav klinické biochemie a diagnostiky LF UK
Současný stav rutinní analytiky y některých biochemických markerů J. Vávrová, B. Friedecký, M. Tichý Ústav klinické biochemie a diagnostiky LF UK Fakultní nemocnice, Hradec Králové 22.9.2009 Laboratorní
VíceLaboratorní di agnostik HBV HCV a Vratislav Němeček Státní zdravotní stav ústav
Laboratorní diagnostika HBV a HCV Vratislav Němeček Státní zdravotní ústav Rozdílná role sexuálního 30 přenosu HBV a HCV 25 Rozdíly v četnosti virové nálože 20 15 10 HCV RNA HBV DNA HBV 5 hlavní způsoby
VíceNormy ČSN,ČSN ISO a ČSN EN
Normy ČSN,ČSN ISO a ČSN EN z oblasti aplikované statistiky (stav aktualizovaný k 1.1.2013) Ing. Vratislav Horálek, DrSc. předseda TNK 4 při ÚNMZ 1 A Terminologické normy 2 [1] ČSN ISO 3534-1:2010 Statistika
VíceStatistické metody - nástroj poznání a rozhodování anebo zdroj omylů a lží
Statistické metody - nástroj poznání a rozhodování anebo zdroj omylů a lží Zdeněk Karpíšek Jsou tři druhy lží: lži, odsouzeníhodné lži a statistiky. Statistika je logická a přesná metoda, jak nepřesně
VícePrincipy zajištění spolehlivosti. Zdenek Kubíček
ZÁKLADY OBECNÉ A KLINICKÉ BIOCHEMIE 2004 Principy zajištění spolehlivosti Zdenek Kubíček kapitola ve skriptech - 4.1.3 Definice kvality Chemický měřící proces je podle definice analytický postup definované
VíceCharakterizují kvantitativně vlastnosti předmětů a jevů.
Měřicí aparatura 1 / 34 Fyzikální veličiny Charakterizují kvantitativně vlastnosti předmětů a jevů. Můžeme je dělit: Podle rozměrů: Bezrozměrné (index lomu, poměry) S rozměrem fyzikální veličiny velikost
VíceNáhodná veličina a rozdělení pravděpodobnosti
3.2 Náhodná veličina a rozdělení pravděpodobnosti Bůh hraje se světem hru v kostky. Jsou to ale falešné kostky. Naším hlavním úkolem je zjistit, podle jakých pravidel byly označeny, a pak toho využít pro
VícePRINCIPY ZABEZPEČENÍ KVALITY
PRINCIPY ZABEZPEČENÍ KVALITY (C) DAVID MILDE, 013 POUŽÍVANÁ OPATŘENÍ QA/QC Interní opatření (uvnitř laboratoře): pravidelná analýza kontrolních vzorků a CRM, sledování slepých postupů a možných kontaminací,
Více