ÚVODNÍ SLOVO VEDOUCÍHO LÉKAŘE

Transkript

1 2014 VÝROČNÍ ZPRÁVA

2

3 obsah Úvodní slovo vedoucího lékaře... 5 I. Úvod... 6 II. Výsledky prenatální diagnostiky... 6 III. Výsledky centra asistované reprodukce... 7 IV. Preimplantační diagnostika (PGD)... 8 V. Postnatální laboratorní diagnostika VI. Kontrola kvality VII. Publikační činnost VIII. Personální obsazení GENNET (stav k )...14

4

5 ÚVODNÍ SLOVO VEDOUCÍHO LÉKAŘE Vážení klienti, kolegové a spolupracovníci, dostává se Vám do rukou výroční zpráva společnosti GENNET, ve které si Vás dovolujeme seznámit s výsledky za rok Tento rok byl pro nás zlomovým rokem zejména proto, že jsme se stali součástí skupiny FutureLife, která zúročí naší dlouholetou spolupráci s kolegy ze spolupracujících center Reprofit, ISCARE a Sanus. V roce 2014 jsme snížili cenu PRENASCANU na Kč a dále připravujeme i vlastní test u nás v laboratoři. V roce 2014 jsme v rámci projektu PRENASCAN ve spolupráci s ostatními centry sdruženými v Asociaci center lékařské genetiky ČR v partnerské laboratoři společnosti BGI vyšetřili těhotných žen (neinvazivní prenatální test trizomie chromozomů 13, 18 a 21). Mezi speciální laboratorní metody asistované reprodukce jsme zařadili použití Embryoglue, implantačního média zvyšujícího šanci na přichycení embrya k děložní stěně a minimalizujícího nežádoucí pohyby embrya v děloze. Embryoglue je přírodní přípravek obsahující poměrně vysokou koncentraci hyaluronu a nejbezpečnější možný zdroj proteinů, rekombinantní albumin. Připravili jsme rovněž technické podmínky pro zavedení karyomappingu, který je nejmodernější metodou preimplantační diagnostiky, a podmínky pro rutinní prenatální vyšetření metodami microarray. Nově jsme v roce 2014 zavedli vyšetření DNA fragmentace spermií, které odhaluje poškozenou DNA v hlavičce spermie. Díky tomuto vyšetření lze zvolit optimální metodu asistované reprodukce a další laboratorní metody. Naším cílem je poskytovat klientům i nadále excelentní péči, a proto jsme opět kladli nejvyšší důraz na odbornou kvalitu poskytovaných služeb a prováděných vyšetření. Po splnění podmínek kontrolního auditu jsou naše genetické a IVF laboratoře akreditovány dle normy ČSN EN ISO 15189:2007, a to až do května roku Náš tým také posílili další zkušení kolegové, a proto věříme, že i rok 2015 bude minimálně stejně úspěšný jako ten uplynulý. Děkujeme za Vaši důvěru. MUDr. David Stejskal vedoucí lékař Výroční zpráva 2014 stránka 5

6 I. Úvod Na klinikách v Praze a Liberci poskytujeme našim pacientům komplexní péči v oblasti lékařské genetiky, fetální medicíny a asistované reprodukce. V roce 2014 jsme vyšetřili pacientů a rodin. II. Výsledky prenatální diagnostiky Výsledky screeningu vrozených vad v I. a II. trimestru. Celkem bylo hodnoceno prenatálních screeningových testů ve screeningových centrech Praha a Liberec. Bylo hodnoceno: kombinovaných testů v I. trimestru (průměrný věk testovaných osob 33 let; 3,1 % pozitivních s rizikem trizomie chromozomu č. 21 1/100 a vyšším) integrovaných testů v I. a II. trimestru (průměrný věk testovaných 31 let; 1,9 % pozitivních s rizikem trizomie chromozomu č. 21 1/150 a vyšším) triple testů ve II. trimestru (průměrný věk testovaných 31 let; 4,9 % pozitivních s rizikem trizomie chromozomu č. 21 1/250 a vyšším) Ultrazvukem bylo primárně zjištěno nebo následně potvrzeno 190 vrozených vad plodu. Celkem bylo provedeno: ultrazvukových vyšetření v I. trimestru ultrazvukových vyšetření ve II. a III. trimestru Invazivní výkony Bylo vyšetřeno: 208 odběrů choria CVS s 72 (34,6 %) nálezy chromozomálních vad amniocentéz AMC s 69 (4,9 %) nálezy chromozomálních vad. U všech vyšetření choriových klků a 85 % vyšetření plodových vod byla provedena rychlá diagnostika nejčastějších chromozomálních vad technikou QF-PCR. Prenatální vyšetření technikou SNP microarray bylo provedeno u 250 plodů. U 30 (12 %) byl zjištěn nález. Neinvazivní prenatální testy (NIPT) V projektu Prenascan bylo ve spolupráci s ostatními členy Asociace center lékařské genetiky ČR ( vyšetřeno celkem vzorků. Bylo diagnostikováno a přímým vyšetření plodu potvrzeno 21 trizomií chromozomu č. 21, 3 trizomie chromozomu č. 18 a 1 trizomie chromozomu č. 13. Z celkového počtu vzorků bylo nutné u 26 vzorků (1,5 %) odběr krve opakovat vzhledem k nedostatečné koncentraci DNA plodu v krvi matky. Celkové výsledky prenatální diagnostiky Byly zjištěny celkem 292 prenatální vrozené vady: 141 nálezů chromozomálních vrozených vad (111 závažných) 215 morfologických vad (65 s chromozomální aberací) 173 těhotných požádalo o přerušení těhotenství z genetické indikace Chromozomální VVV Downův syndrom (trizomie 21) 52 Edwardův syndrom (trizomie 18) 25 Patauův syndrom (trizomie 13) 4 Turnerův syndrom (X0) 8 Aneuploidie pohlavních chromozomů 6 Triploidie 3 Strukturální aberace 43 Všechny závažné aberace 111 Morfologické VVV (mnohočetné vvv uváděny opakovaně) Defekty neurální trubice (rozštěpy páteře) 18 Vady CNS 23 Orofaciální vady (rozštěpy rtu) 15 Defekty přední stěny břišní 16 Srdeční vady 75 Vady hrudníku a nitrohrudních orgánů 9 Vady trávicího ústrojí 6 Jiné 30 Vady močopohlavního ústrojí 31 Vady končetin 35 Vyšetření produktů koncepce (spontánní potraty v I. trimestru) Molekulárně genetickými technikami bylo vyšetřeno celkem 195 produktů koncepce na nejčastěji se vyskytující aneuploidie (chromozomů č. 2, 7, 13, 14, 15, 16, 18, 21, 22a chromozomů X, Y), triploidie a uniparentální diploidie (kompletní mola) a trombofilní mutace (FVL Leidenská). U 24 % produktů koncepce byla zjištěna chromozomální etiologie potratu. Výroční zpráva 2014 stránka 6

7 III. Výsledky centra asistované reprodukce Úspěšnost metod, které pacientům nabízíme, se stále pohybuje na skvělé úrovni. Stále více pacientů využívá dnes možnosti preimplantační diagnostiky a následného kryoembryotransferu a klesá tedy počet Díky individuální péči, při níž má každý pacient svého lékaře, jsme dosáhli maximální spokojenosti našich pacientů. Všechna centra GENNET jsou vybavena Time lapse systémem EmbryoScope. transferů v jednom cyklu. Stoupá také počet single embryo transferů. Výsledky klinik GENNET v roce 2014 ve vybraných metodách: IVF/ICSI OPU ET Těhotenství Těhotenství na ET v% 31 % 33 % 37 % 44 % 43 % 40 % 46 % 43 % 41 % KET ET Těhotenství Těhotenství na ET v% 22 % 26 % 22 % 36 % 33 % 39 % 39 % 36 % 39 % ED ET Těhotenství Těhotenství na ET v% 51 % 54 % 53 % 61 % 69 % 68 % 67 % IVF/ICSI KET ET Těhotenství ET Těhotenství ED ET Těhotenství Výroční zpráva 2014 stránka 7

8 IV. Preimplantační diagnostika (PGD) Naše akreditované laboratoře provádějí PGD pro ostatní IVF centra v Čechách i v zahraničí. V současnosti jsou dostupné tyto metody: PGS screening aneuploidií metodou Array CGH (24sure+ BlueGnome) PGD (u nosičů translokací) metodou Array CGH (24sure+ BlueGnome) PGD metodou PCR u monogenních chorob Pro optimální výsledek doporučujeme metodu tzv. PGD dislokace, kdy k transferu dochází v následujícím cyklu po vitrifikaci embryí a jejich vyšetření. PGS byl proveden ve 299 cyklech. Výsledky potvrzují, že pouze 46 % vyšetřených embryí je euploidních (tzn., že mají normální počet chromozomů). Ve 203 cyklech bylo doporučeno alespoň jedno embryo k embryotransferu. Podle předběžných výsledků z PGS metodou Array nejvíce profitují pacientky starší 40 let. PGD (u nosičů translokací) byla provedena v 17 cyklech. 23 % vyšetřených embryí bylo doporučeno k ET. PGS/PGD array výsledky 2014 PGS screening aneuploidií PGD translokace Počet cyklů Bioptovaná embrya Úspěšná amplifikace DNA 829 (91 %) 61 (98 %) Úspěšná array Euploidní embrya 381 (46 %) 14 (23 %) Počet cyklů s ET 203 (68 %) 7 (41 %) PGD metodou PCR byla v roce 2014 provedena ve 112 cyklech, celkem bylo provedeno již 451 cyklů. Pro vyšetření monogenních chorob používáme nepřímou metodu užívající výsledky haplotypové rodinné analýzy. Tuto metodu lze použít prakticky u všech monogenních chorob. Pracujeme na kombinaci haplotypové analýzy s PGS založené na NGS (sekvenování nové generace). Tato možnost bude pro naše pacienty dostupná v první polovině příštího roku. PGD monogenních onemocnění Rok Dokončené přípravy (nové geny) Provedené cykly Celkem Výsledky Počet cyklů (SC) 451 Embryotransfer (ET) 332 Klinické těhotenství (CP) 124 CP/ET 38,10 % Výroční zpráva 2014 stránka 8

9 Seznam monogenních chorob připravených pro preimplantační diagnostiku NÁZEV ONEMOCNĚNÍ ZKRATKA TYP DĚDIČNOSTI GEN CHROMO- ZOM NÁZEV ONEMOCNĚNÍ ZKRATKA TYP DĚDIČNOSTI GEN CHROMO- ZOM Výroční zpráva 2014 stránka 9

10 V. Postnatální laboratorní diagnostika Cytogenetická laboratoř provedla kultivací a karyotypizací, z toho 69 patologií (2,3 %). Metody molekulární cytogenetiky (FISH) byly použity u 88 případů (včetně prenatalních). Metodou SNP microarray byli vyšetřeni 453 pacienti. U 91 (20 %) byl nález pozitivní. Molekulárně genetická laboratoř vyšetřila postnatálně celkem vzorků. Seznam provedených vyšetření: vyšetření trombofilních mutací vyšetření mutací CFTR genu 147 vyšetření delecí dlouhého raménka chr. Y 487 Vyšetření polymorfismu N680S pro FSHr 151 vyšetření expanze v genu pro FRAXA 154 vyšetření delecí genu SMN1 337 vyšetření skupin onkogenů metodou NGS 89 prediktivní test NGS sekvenační analýza genu 10 vyšetření mikrosatelitové nestability - MSI 20 vyšetření nejčastějších mutací HFE genu 71 vyšetření genů SPG3,SPG4,SPG vyšetření genu COX26 4 vyšetření genu SOD1 11 vyšetření genu MARVELD2 5 vyšetření genu NBS1 5 vyšetření mutace CMS_1267del G 4 postnatální vyšetření trizomie 21 VI. Kontrola kvality Naším cílem je, aby výsledek každé léčby byl úspěšný. K dosažení tohoto cíle je nutné, abychom pacientům poskytovali kvalitní a odbornou péči, což potvrzujeme každý rok při absolvování auditu certifikace systému řízení jakosti podle normy ČSN EN ISO 9001:2009. Zároveň jsme také držiteli akreditace ČSN EN ISO 15189:2007 pro naši zdravotnickou laboratoř č Výroční zpráva 2014 stránka 10

11 Každoročně se cytogenetická a molekulárně genetická laboratoř účastní mezilaboratorních kontrol kvality, a to na republikové i mezinárodní úrovni. CEQAS: Amniotic Fluid, PGD microarray blastomere, Prenatal array UK Neqas for molecular genetics: PGD microarray/ngs pilot Mezilaboratorní externí kontrola kvality: Stanovení vrozených genetických trombofilních markerů Československá společnosti pro forenzní genetiku: Mezilaboratorní porovnávání forenzně genetických zkoušek Výroční zpráva 2014 stránka 11

12 FN Brno: Mezilaboratorní kontrola kvality práce v rámci DNA laboratoří. Stanovení pohlaví a vyšetření mikrodelecí azoospermatického faktoru. SGS: Biocoat Incorporated Splněním podmínek a kritérií potřebných pro získání certifikátů kontroly kvality a akreditace jsme potvrdili svou odbornost, objektivitu a nezávislost nezbytnou pro vykonávání naší práce. Výroční zpráva 2014 stránka 12

13 VII. Publikační činnost PUBLIKACE V IMPAKTOVANÝCH ČASOPISECH Drábová, J. Trková, M.1 Hančarová, M. Novotná, D. Hejtmánková, M.1 Havlovicová, M. Sedláček, Z. (1Gennet, Prague, Czech Republic): A 15 Mb large paracentric chromosome 21 inversion identified in Czech population through a pair of flanking duplications. Mol Cytogenet Aug 19, 7:51, doi: / Žmolíková, M. Puchmajerová, A. Hecht, P. Lebl, J. Trková, M.1 Křepelová, A. (1Gennet, Prague, Czech Republic): Coarctation of the aorta in Noonan-like syndrome with loose anagen hair. Am J Med Genet A May, 164A(5), , doi: /ajmg.a PUBLIKACE V ODBORNÝCH ČASOPISECH Gao, Y. Stejskal, D. Jiang, F. Wang, W.: False-negative trisomy 18 non-invasive prenatal test result due to 48, XXX,+18 placental mosaicism. Ultrasound Obstet Gynecol Apr, 43(4), Hynek, M. Smetanová, D. Stejskal, D. Zvárová, J.: Exponentially weighted moving average chart as a suitable tool for nuchal translucency quality review. Prenat Diagn Apr, 34(4), Šípek, A. Gregor, V. Horáček, J. Šípek, A. jr.: National Registry of Congenital Anomalies of the Czech Republic: commemorating 50 years of the official registration. Cent Eur J Public Health Dec, 22(4), Mokrá, V. Petr, I. Soukeník, J.: Význam ultrazvukově asistované hydrolaparoskopie v rozhodovacím algoritmu péče o neplodný pár, Výsledky Centra AR Gennet Liberec Česká gynekologie, červen 2014, 79, č. 3, POSTERY NA MEZINÁRODNÍCH KONFERENCÍCH European Human Genetics Conference, May 31 June 3, 2014, Milan, Italy Abstracts Hodačová, J. Bečvářová, V. Jenčíková, N. Peková, H. Horáček, J. Sehnalová, J. Loučková, M. Mansfeldová, R. Svobodová, E. Nedomová, V. Hnyková, L. Hroncová, H. Putzová, M. Soldátová, I. Krautová, L. Stejskal, D. Trková, M. (Gennet, Prague, Czech Republic). P M. Could a combination of QF-PCR and SNP-array methods replace standard karyotyping in CVS? Horáčková, S. Marešová, I. Zembol, F. Putzová, M. (Gennet, Prague, Czech Republic): Our experience with non-invasive prenatal aneuploidy examination by NGS Trková, M.1 Veselá, K.2 Bečvářová, V.1 Hnyková, L.1 Hroncová, H.1 Horáček, J.1 Stejskal, D.1 (1Gennet, Prague, Czech Republic, 2First Faculty of Medicine, UK, Prague, Czech Republic). P S. SNP array revealed maternal UPD16 in a boy with short stature,craniosynostosis and psychomotor retardation. PŘEDNÁŠKY NA TUZEMSKÝCH A MEZINÁRODNÍCH KONFERENCÍCH X. Hradecký genetický den a den hemotoonkologické genetiky, Hradec Králové Horáčková, S. Marešová, I. Zembol, F. Honysová, B. Krutílková, V. Černá, L. Putzová, M. Stejskal, D.: NGS ONKO PANEL Pracovní den a shromáždění členů Společnosti lékařské genetiky ČLS JEP, Kaprasův den Klinická genetika, , Praha 2 Trková, M. Krutílková, V. Smetanová, D. Bečvářová, V. Hlavová, E. Jenčíková, N. Hodačová, J. Hnyková, L. Hroncová, H. Horáček, J. Stejskal, D.: Prenatální záchyt homozygotní delece genu ISPD u plodů s manifestací syndromu Walker-Warburg. Bečvářová, V. Hnyková, L. Hroncová, H. Filipová, M. Hlavová, E. Hejtmánková, M. Krutílková, V. Rašková, D. Křečková, G. Hynek, M. Smetanová, D. Zemánková, E. Horáček, J. Stejskal, D. Trková, M.: Submikroskopické aberace s variabilní expresivitou hodnocení a interpretace. 3 rd Central-Eastern European Symposium on Free Nucleic Acids in Non-Invasive Prenatal Diagnosis, Martin, SK Maresova, I. Horackova, S. Putzova, M. Zembol, F. Stejskal D.: Our experience with non-invasive aneuploidy testing using NGS method 47. celostátní sjezd biochemických laborantů, Ostrava Marešová, I. Horáčková, S. Vávrová, J. Zembol, F. Stejskal, D. Putzová, M.: Prenascan v Gennetu, neinvazivní prenatální test trizomie 47. cytogenetická konference, Praha Bečvářová, V. Curtisová, V. Hůrková, V. Magner, M. Mihalová, R. Panczak, A. Hnyková, L. Hroncová, H. Filipová, M. Horáček, J. Trková, M.: Přínos SNP array u cytogeneticky detekovatelných duplikací na chromosomu 14. Trková, M. Bečvářová, V. Seeman, P. Šafka Brožková, D. Diblík, J. Veselá, K. Horáček, J. Hnyková, L. Hroncová, H. Stejskal, D.: Ztráta heterozygosity jako příčina geneticky podmíněných onemocnění. Putzová, M. Krautová, L. Zembol, F. Míka, J. Křen, R. Weber, V. Vykysalá, L. Stejskal, D.: Potential NGS in preimplantation diagnosis (GENNET) IonWorld Tour, Budapešť Putzová, M.: Potential of NGS in preimplantation testing Marešová, I. Zembol, F. Horáčková, S. Putzová, M.: Aneuploidy analysis using the Ion Proton System 18. celostátní konference DNA diagnostiky, Brno: Putzová, M. Krautová, L. Soldátová, I. Marešová, I. Horáčková, S. Zembol, F.: NGS v preimplantační diagnostice Horáčková, S. Zembol, F. Marešová, I. Vávrová, J. Stejskal, D. Putzová, M.: Screening distribuce volné DNA v maternální plazmě- -cfdna test Černá, L. Horáčková, S. Honysová, B. Krutílková, V. Putzová, M. Stejskal, D.: NGS sekvenování predispozičních nádorových mutací v Gennetu Liška, F.1 Hirschfeldová, K.1 Chylíková, B.1 Putzová, M.2 Laštůvková, J. 3 Šilhánová, E.4 Baxová, A.1 (1 Ústav biologie a lékařské genetiky, 1. LF UK a VFN, 2 Gennet, 3 Ústí nad Labem, 4 Ostrava): Trombocytopénie s chybějící vřetenní kostí syndrom s neobvyklým mechanizmem dědičnosti Vyzvaná přednáška Brandejská, M. Hrochová, V. Jarošová, R. Langerová, A. Vykysalá, L. Smetanová, D. Stejskal, D. Stejskal, M.: Čtyři úhly pohledu na reprodukci v současnosti. Konference Genetické společnosti Gregora Mendela 2014 Putzová, M.: Využití NGS v preimplantační a prenatální diagnostice Lunch table discussion Chairman: Brandejská, M., Co-Chairman: Hajči, J.: Patří léčba reprodukce do ambulancí registrujících gynekologů? Výroční zpráva 2014 stránka 13

14 VIII. Personální obsazení GENNET (stav k ) Vedoucí lékař prim. MUDr. David Stejskal Vedoucí lékař oddělení fetální medicíny prim. MUDr. Dagmar Smetanová, CSc. Vedoucí IVF programu a GENNET Scientific Board prim. MUDr. Milada Brandejská PRAHA LETNÁ Lékařská genetika prim. MUDr. Eva Hlavová MUDr. Jan Diblík, Ph.D. MUDr. Michaela Hejtmánková MUDr. Věra Krutílková MUDr. Dagmar Rašková MUDr. David Stejskal Fetální medicína prim. MUDr. Dagmar Smetanová, CSc. MUDr. Sabina Březinová MUDr. Martin Doležal MUDr. Martin Hynek MUDr. Dita Kilijánová MUDr. Eduard Kulovaný, CSc. Centrum asistované reprodukce prim. MUDr. Milada Brandejská MUDr. Veronika Hrochová MUDr. Radka Jarošová MUDr. Alena Langerová MUDr. Kateřina Rožníčková MUDr. Lenka Vykysalá Laboratoř IVF vedoucí laboratoře Ing. Josef Míka, Csc. Laboratoř molekulárně genetická vedoucí laboratoře RNDr. Martina Putzová, Ph.D. Laboratoř cytogenetická vedoucí laboratoře RNDr. Jiří Horáček Fetální kardiologie (privátní) Prof. MUDr. Jan Marek, Ph.D. MUDr. Viktor Tomek Dětská kardiologie MUDr. Jiří Gilík Neurologie (privátní) MUDr. Jana Zárubová Andrologie MUDr. Viktor Vik Vrchní sestra Ivana Hrodějová PRAHA ARCHA Centrum asistované reprodukce Lékařská genetika MUDr. Milan Daněk Doc. MUDr. Alice Baxová, CSc. MUDr. Michaela Bartošová MUDr. Jan Diblík, Ph.D. MUDr. Simona Bukvová Urologie a andrologie MUDr. Tereza Kosová MUDr. Viktor Vik MUDr. Miroslav Landfeld Vrchní sestra MUDr. Martin Valachovič Pavla Vlková MUDr. Jiří Vokroj Laboratoř IVF vedoucí laboratoře Ing. Vlastimil Weber GENNET CITY FERTILITY Centrum asistované reprodukce Laboratoř IVF Dr. Martin Hrehorčák vedoucí laboratoře Dr. Vivienne Hall Shaun Rogers Vrchní sestra Jane Holman LIBEREC Lékařská genetika prim. MUDr. David Stejskal MUDr. Jan Diblík, Ph.D. MUDr. Gabriela Křečková Fetální medicína MUDr. Vendula Johannová MUDr. Jaroslav Soukeník Centrum asistované reprodukce MUDr. Veronika Mokrá Laboratoř IVF vedoucí laboratoře Ing. Dagmar Milická Laboratoř cytogenetická vedoucí laboratoře Ing. Jitka Zatloukalová Vrchní sestra Jana Vacková Výroční zpráva 2014 stránka 14

15

16 CENTRUM LÉKAŘSKÉ GENETIKY A REPRODUKČNÍ MEDICÍNY GENNET Na Poříčí 26, Praha 1 CENTRUM LÉKAŘSKÉ GENETIKY A REPRODUKČNÍ MEDICÍNY GENNET Kostelní 9, Praha 7 CENTRUM LÉKAŘSKÉ GENETIKY A REPRODUKČNÍ MEDICÍNY GENNET Liliová 1, Liberec GENNET CITY FERTILITY 16 St John Street, London EC1M 4NT info@gennet.cz