URâOVÁNÍ NEBALANCOVAN CH GENOV CH ZMùN METODOU ARRAY KOMPARATIVNÍ GENOMOVÉ HYBRIDIZACE (ARRAY CGH) U NÁDORÒ.
|
|
- Kristýna Vítková
- před 5 lety
- Počet zobrazení:
Transkript
1 URâOVÁNÍ NEBALANCOVAN CH GENOV CH ZMùN METODOU ARRAY KOMPARATIVNÍ GENOMOVÉ HYBRIDIZACE (ARRAY CGH) U NÁDORÒ. DETERMINATION OF GENOMIC IMBALANCES USING ARRAY COMPARATIVE GENOMIC HYBRIDIZATION (ARRAY CGH) IN CANCER GENOM. JARO OVÁ M 1., POSPÍ ILOVÁ H 1., PLACH R. 1, PAPAJÍK T. 1, KOPTÍKOVÁ J 2., INDRÁK K. 2 1 HEMATO-ONKOLOGICKÁ KLINIKA LF A FN OLOMOUC 2 CENTRUM BIOSTATISTIKY A ANAL Z, P F A LF MU BRNO Souhrn Nádory jsou onemocnûní charakterizovaná genomovou instabilitou. Zmûny v poãtu kopií DNA jsou jednou z mnoha abnormit, kter mi mûïe b t ovlivnûna exprese a funkce genû. Proto urãení nebalancovan ch zmûn, které pfiedstavují pfiedev ím amplifikace a delece chromosomov ch oblastí a genû v nich lokalizovan ch, dovoluje urãit kritické geny a signální dráhy zahrnuté do vzniku a v voje onemocnûní. Urãení takov ch nebalancovan ch zmûn dovoluje molekulárnû cytogenetická metoda komparativní genomová hybridizace (CGH). CGH se stala základem nedávno vyvinuté technologie, metody array komparativní genomové hybridizace (array CGH), která dovoluje detailní anal zu chromosomov ch oblastí, ve kter ch do lo ke zmûnû poãtu kopií sekvencí DNA. V souãasnosti mûïeme vyuïít fiady array CGH technologií, které v znamn m zpûsobem zvy ují rozli ovací schopnost metody CGH a umoïàují definovat v genomu oblasti, které mají vztah ke vzniku nádoru a dovolují rychle odhalit geny leïící v tûchto oblastech. Tato práce informuje o principu, v znamu a vyuïití metody array CGH pfii urãování nebalancovan ch zmûn v nádorovém genomu. Klíãová slova: CGH, DNA ãip, array CGH, nádorov genom, onkogen, tumor supresorov gen Summary Cancer is a disease characterized by genomic instability. One of the mechanisms that changes gene expression and gene function is DNA copy number changes. These changes mostly include gains and losses of chromosomal regions, which can be detected by molecular cytogenetic method: comparative genomic hybridization (CGH). On the basis of CGH a new method has been recently developed called array comparative genomic hybridization (array CGH). Array CGH improves the resolution of CGH and enables detailed analysis of chromosomal regions, detecting DNA sequence copy number changes. Modern array CGH technologies posses increased sensitivity and are able to define genomic regions related to cancer, and to identify genes lying within these regions. Such genes may be involved in critical signaling pathways and may play role in cancer development and progression. This work informs about the principle, significance and usage of array CGH method in detection of imbalanced aberrations of cancer genome. Key words: CGH, DNA chip, array CGH, tumor genom, oncogene, tumor suppressor gene Úvod Molekulárnû cytogenetické metody pfiedstavují revoluãní a dnes jiï potvrzen zpûsob urãování chromosomov ch zmûn. Jednou z takov ch technologií, která byla vyvinuta pfiedev ím pro vy etfiování nádorov ch bunûk, je metoda komparativní genomové hybridizace (CGH). CGH (obr. ã. 1) byla vyvinuta pro mûfiení zmûn poãtu kopií sekvencí DNA v celém genomu v jednom vy etfiení (1, 2). Principem metody je komparativní neboli pomûrná hybridizace dvou odli nû znaãen ch genomov ch DNA s normálními metafázov mi chromosomy. Genomové DNA jsou izolovány ze dvou bunûãn ch populací, normální a nádorové, a jsou znaãené rozdíln mi fluorochromy, obvykle ãerven m a zelen m. Po skonãení hybridizace jsou mûfieny intenzity obou fluorescencí podél kaïdého chromosomu a pomûr intenzit ãervené a zelené fluorescence pak urãuje relativní pomûr poãtu kopií ve vy etfiovaném genomu. Jedna z genomov ch DNA je vïdy normální, oznaãená jako referenãní, takïe pomûr pfiímo mapuje zmûny poãtu kopií v testovaném genomu. Je dûleïité si uvûdomit, Ïe CGH samotná urãuje pouze zmûny poãtu kopií, ale ne absolutní poãet kopií. Pfiesnû tetraploidní bunûãná populace bude tedy dávat konstantní pomûr v genomu a bude nerozli itelná od v sledku získaného z diploidní testované populace. Metoda CGH má své omezené rozli ovací schopnosti a dovoluje urãit nebalancované zmûny na chromosomech, které se pohybují od 3 megabází (Mb) pro ztráty genetického materiálu a 7 10 Mb pro urãení pfiítomnosti nadbyteãného genetického materiálu (3). Zv it citlivost metody, která v jediné hybridizaãní reakci dovoluje analyzovat cel nádorov genom, se podafiilo zavedením metody array komparativní genomové hybridizace (array CGH). Cíl hybridizace, metafázové chromosomy metody CGH, byly nahrazeny fragmenty klonované DNA rûzn ch genû. Tyto fragmenty byly speciální technikou umístûny ti tûny na povrch skla, kde k nim referenãní 342 KLINICKÁ ONKOLOGIE 19 SUPPLEMENT 2006
2 a zkoumaná DNA hybridizují. KaÏd fragment klonované genomové DNA zaujímá své pfiesnû urãené místo na povrchu skla. Takto pfiipravené speciální sklo bylo oznaãeno microarray neboli ãip (obr. 1). Obrázek ã. 1.: A. Komparativní genomová hybridizace (CGH). Princip metody CGH je zaloïen na hybridizaci dvou rozdílnû znaãen ch genomov ch DNA, které hybridizují s normálními chromosomy. Pomûr fluorescenãních intenzit urãuje oblasti na chromosomu, ve kter ch do lo ke ztrátám nebo zmnoïení genetického materiálu. B. Stejná hybridizace dvou rozdílnû znaãen ch genomov ch DNA s DNA ãipem. Poãty kopií klonû na ãipu jsou urãeny pomûrem namûfien ch intenzit fluorescence a jejich urãení závisí také na velikosti klonû a jejich lokalizaci na chromosomu. Princip metody array CGH Technologie array CGH, také oznaãována jako matrix CGH, byla zpoãátku pouïita pro urãení segmentálních zmûn tj. zmûn, které se t kaly chromosomov ch oblastí o velikosti nûkolika megabází, (Mb), a které byly lokalizované ve specifick ch chromosomov ch oblastech spojen ch s urãit m onemocnûním. Salinos-Toldo a spolupracovníci (4) pouïili microarray technologii k urãení nebalancovan ch chromosomov ch zmûn. V metodû CGH nahradili cíl hybridizace, metafázové chromosomy, microarray neboli ãipem, kter obsahoval klony s velk mi inzerty (large insert clones LIC) pokr vajícími chromosom 13q14 a dal í oblasti. Anal za fiady bunûãn ch linií a nádorového genomu v práci tûchto autorû ukázala, Ïe tento pfiístup dovoluje zv it citlivost metody CGH z 10 megabází (Mb) na kilobází (kb). Obrázek ã. 2.: Schematické znázornûní principu array komparativní genomové hybridizace (detailní popis v textu). Základním principem metody array CGH je hybridizace (Obr. ã. 2). Vzorky normální a nádorové genomové DNA jsou pomocí molekulárnû genetické metody random priming PCR oznaãeny rozdíln mi fluorochromy a takto rozdílnû znaãené DNA hybridizují s ãipem obsahujícím fragmenty genomové DNA vybran ch genû. V sledek hybridizace je hodnocen pomocí speciálního pfiístroje, umoïàující mûfiení intenzity fluorescence hybridizované normální a nádorové DNA. Rozdíl v pomûru intenzity ãervené a zelené fluorescence urãuje nebalancované zmûny v nádorovém genomu. Pro vyhodnocení v sledkû hybridizace se pouïívají speciální programy zabudované pfiímo v ãtecím zafiízení a statistické vyhodnocení je provádûno pomocí dal ích samostatn ch softwarov ch nástrojû. Array CGH slouïí ke zv ení pfiesnosti, rozli ení a rozsahu zmûn ve srovnání s klasickou metodou CGH a mûfiení mûïe b t porovnáno pfiímo k pozici na genomové sekvenci (5). âip pro array CGH je pfiipraven z mapovan ch BAC (Bacterial Artificial Chromosomes) a dal ích genomov ch klonû nebo jsou na hybridizaãním skle umístûny fragmenty komplementární DNA genû (cdna) a nebo oligonukleotidy. V pfiípadû pouïití BAC array, vyïaduje hybridizaãní reakce nûkolik stovek nanogramû genomové DNA, ale více jak jeden mikrogram DNA je potfiebn pro cdna array a nûkteré specifické BAC ãipy (6, 7). Jednotlivé typy ãipû mají své pfiednosti, ale i svá omezení. Napfiíklad, vy í rozli ení je dosaïeno pouïitím oligonukleotidov ch ãipû, které jsou pfiipraveny technikou spotování na sklo (8) nebo pfiímou syntézou na sklo nebo silikonové substráty (9), které obsahují více jak elementû. âipy pro urãení nukleotidového polymorfismu (Single nucleotide polymorfism array-snp) jsou vysoce citlivé ãipy dovolující urãit i ztrátu heterozygozity jednotliv ch nukleotidû i zmûny poãtu kopií (10). SNP ãipové sondy jsou sestavené z 25-merov ch oligonukleotidû a kaïd SNP má jak sense tak antisense fietûzec. Intenzita sondy tak odpovídá dvûma alelám a umoïàuje tak urãit celkem tfii genotypy AA, BB nebo AB. Na rozdíl od BAC ãipu hybridizuje k SNP ãipu pouze jedna genomová DNA a zmûny poãtu kopií jsou urãeny na základû srovnání s nezávislou pfiedchozí kontrolní hybridizací. Pomocí tohoto pfiístupu napfiíklad Raghavan a spol. (10) urãili velkou oblast vykazující uniparentální disomii u nemocn ch s leukémií, ktefií mûli normální karyotyp. Tento nález mûl velk vliv na pochopení genov ch zmûn u leukémií a ukázal, Ïe SNP ãipy budou mít v znamné místo také pfii urãování zmûn v nádorovém genomu. Dal í moïností je pouïití tzv. long oligonucleotide array. Metoda, která je oznaãena jako ROMA representational oligonucleotide microarray analysis, pfiedstavuje pfiístup, ve kterém je genomová DNA roz tûpena pomocí restrikãního enzymu, nejãastûji BglII, kter je následován linkermediated polymerázovou fietûzovou reakcí, a v sledkem jsou fragmenty o délce men í jak 1,2 kilobáze (kb). Tento pfiístup dovoluje urãení zmûn, které jsou men í jak jedna megabáze (8). Tiling array Pfiesto, Ïe je moïné konstruovat ãipy s rûzn m poãtem klonovan ch DNA v jednotliv ch chromosomov ch oblastech, je v bûr ãetnosti klonû velmi individuální. MÛÏe totiï vést k tomu, Ïe nûkteré oblasti zûstanou nepokryté. Pro úplné porozumûní v znamu nebalancovan ch zmûn v nádorovém genomu potfiebujeme takové ãipy, které skuteãnû pokr vají cel genom. Ishkanian a spol. (11) dosud jako jediní, sestavili ãip pro array CGH pokr vající skuteãnû cel genom (Obr. 3). Toto tzv. submegabázové rozli ení, sestavené ze sady pfiekr vajících se klonû, bylo oznaãeno SMRT (Submegabase resolution tiling set). Tento ãip je tvofien celkem pfiekr vajícími se BAC klony, které jsou naspotovány v triplikátech na celkem dvû hybridizaãní skla. V znamem tûchto citliv ch konstrukcí tkví v tom, Ïe takov m ãipem mohou b t detekovány mikrozmûny, které pfii pouïití jin ch ãipû zûstanou neodhaleny. Av ak takové vysoké rozli ení má svá úskalí. Tento ãip, na rozdíl od jin ch s men ím rozli ením, obsahuje i klony, které hybridi- KLINICKÁ ONKOLOGIE 19 SUPPLEMENT
3 zují s vysoce homologními sekvencemi v genomu, a proto je vyhodnocení takov ch ãipû velmi nároãné a vyïaduje znaãné znalosti a zku enosti. A B Obrázek ã. 3.: Znázornûní moïností volby klonû pro konstrukci ãipu. A Rozli ení ãipu je dáno poãtem a vzdáleností jednotliv ch vybran ch klonû v dan ch oblastech. B Pfiíklad volby klonû pro konstrukci tzv. tiling array, ve kterém se jednotlivé klony vzájemnû pfiekr vají. PoÏadavky na kvalitu a kvantitu DNA Pro získání kvalitních a validních v sledkû je pfii pouïití metody array CGH zapotfiebí dodrïet dnes jiï pfiesnû stanovené podmínky kaïdé hybridizace. V znamn m faktorem, ovlivàujícím jiï na poãátku v sledek hybridizace, je kvalita a kvantita vy etfiované DNA. Problémy se získáním potfiebného mnoïství DNA se mohou objevit pfiedev ím u materiálu získaného z mal ch biopsií, zatímco problém s kvalitou se mûïe objevit u formalinem fixovan ch tkání nebo u parafínov ch fiezû. Dnes jiï víme, Ïe tzv. large insert, klony s velikostí kolem 150 kb, jsou pomûrnû citlivé a hybridizace je úspû ná i pfii pouïití ménû kvalitní DNA. To v ak neplatí pro oligonukleotidové ãipy a ãipy tvofiené mal mi PCR fragmenty. Vût ina BAC ãipû vyïaduje pro hybridizaci ng DNA, zatím co oligonukleotidové a cdna ãipy vyïadují aï 1 mikrogram vysoce kvalitní DNA. Dal í limitací pro array CGH je heterogenita tkánû (12). Nenádorové buàky v nádorovém vzorku vedou k posunu v pomûru signálû spojen ch s genetick mi zmûnami v nádorov ch buàkách. Garnis a spol. (13) napodobili tento fenomén experimentálnû a potvrdili, stejnû jako Davies a spol (14), Ïe pravdûpodobnost urãení zmûn urãité velikosti není závislá jen na poãtu klonû pfiítomn ch na ãipu, ale také na jejich velikosti. Vût í klony jsou identifikovány s vût í pravdûpodobností neï klony malé. DÛleÏit je také vhodn v bûr referenãní DNA. PouÏívá se DNA jak od jedince opaãného pohlaví, tak stejného pohlaví. Referenãní DNA je smûsí DNA rûzn ch jedincû nebo jde o DNA pouze jednoho jedince. V bûr závisí také na zku enosti laboratofie. Anal zy dat získan ch metodou array CGH Rychl rozvoj metody array CGH vedl k vyvinutí fiady softwarov ch systémû pro statistické hodnocení a vizualizaci dat. Prvním krokem vizualizace je konverse obrazov ch dat získan ch z pfiíslu ného ãtecího zafiízení do ãíselného vyjádfiení lokus-specifického pomûru poãtu kopií. Program, kter to umoïàuje, je souãástí softwarového vybavení fiady skenerû. Druh m krokem je pfiifiazení elementû naspotovan ch na ãipu k jejich pozici v genomu. Speciální program dokáïe na základû informace o sekvenci jednotliv ch BAC klonû urãit jejich vztah k lidskému genomu. KaÏd klon zastoupen na ãipu je pak pfiesnû graficky lokalizován na své genomové místo (obr. 2). Urãení nebalancovan ch zmûn vyïaduje statistické vyhodnocení získan ch dat. Programy vhodné k tomuto úãelu jsou jak volnû dostupné, tak je moïné je zakoupit od specializovan ch softwarov ch firem. Av ak pouïití softwarov ch programû vyïaduje v praxi velmi dobrou znalost jejich principu. Neznalost by mohla vést k nesprávnému pouïití a interpretaci v sledkû. Pfiíkladem volnû dostupn ch programû, které jsou schopné hodnotit jednotlivé experimenty, jsou napfi. ArrayCyCHt (genomics.catholic.ac.kr/arraycgh), Caryoscope (caryoscope.stanford.edu/ a nebo SeeGH ( (15). Sofistikovanûj í programy, které dovolují vyhodnotit více experimentû, jsou napfi. CGHPro ( rop/molecular cytogenetics/arraycgh/cghpro) Nebo CGHAnalyser ( douwnloads.htm cgh/html/). Pro vlastní vyhodnocení v sledku hybridizace je nutné znát také aktuální informace o polymorfismech v lidském genomu a tyto informace vyuïít pfii hodnocení v sledkû (15). Urãování zmûn v nádorovém genomu metodou array CGH V posledních 5 letech byla publikována fiada studií vyuïívající metody array CGH pro urãování zmûn poãtu kopií zamûfien ch na specifické oblasti, o kter ch bylo známo, Ïe jsou ãasto zahrnuté do nebalancovan ch aberací. Napfiíklad byl zkonstruován ãip pro chromosom 3p tvofien 535 BAC klony a byl pouïit pro definování ãasto deletovan ch a amplifikovan ch oblastí u nádorû dutiny ústní (16) a nádorû plic (17) nebo 5p ãip s 491 BAC klony pokr vajícími 50 Mb na chromosomu 5p (18) a ãip pro chromosom 1p s celkem 642 BAC klony pokr vající 120 Mb, zase pomohl pfii objevu genû podílejících se na tumorogenezi plic (19). V znam pouïití ãipû s vysok m rozli ením byl potvrzen na studiích proveden ch u lymfomu plá Èové zóny (MCL), kter je charakterizován translokací t(11;14)(q13;q32). Tato zmûna je pfiíãinou zv ené exprese cyklinu D1. Pro maligní transformaci jsou nutné pfiídatné genetické zmûny. Tyto zmûny a jejich frekvence byly studovány metodou array CGH s rûzn mi typy ãipû. Kohlhammer a spol. (20) pouïili ãip s rozli ením 15 Mb a detekovali prûmûrnû 6,7 zmûn na jeden vy etfien pfiípad MCL. Urãili tak o 50 % více zmûn, neï bylo urãeno klasickou metodou CGH. V této práci bylo urãeno celkem 6 oblastí s kandidátními geny, které jsou cílem dal ích v zkumû. Ve studii Schraderse a spol. (21) byl u MCL pouïit ãip s rozli ením 800 kb a bylo urãeno 15,4 zmûn na jeden pfiípad a celkem 15 oblastí s kandidátními geny. Dal í v znamná data byla získána ze studie de Leeuw a spol. (22). Anal za bunûãné linie MCL s pouïitím SMRT ãipu dovolila urãit v prûmûru 35 zmûn v genomu se stejn m mnoïstvím jak ztrát genetického materiálu, tak zmnoïení, a potvrdila opakující se zmûny men í jak 130 kb (22). Aãkoliv byla tato studie provedena na bunûãné linii, kde nûkteré zmûny mohou souviset s kultivaãními artefakty, detekci celkem 35 zmûn je moïné povaïovat za velmi v znamnou. Navíc byly nûkteré zmûny submegabázové velikosti a zahrnovaly pouze 1 2 kandidátní geny. PouÏitím tohoto velmi citlivého ãipu se ukázalo, Ïe delece na chromosomu 8p21, u které urãili Kohlhmmer a spol. (20) velikost 2,4 Mb, je ve skuteãnosti delece o velikosti 730 kb a zahrnuje tfii kandidátní tumor supresorové geny, jako napfi. TNFRSF10B gen tumor necrosis factor. PouÏití metody array CGH s ãipy s vysok m rozli ením pfiiná í v znamné informace o kandidátních genech, které jsou zahrnuty do patogeneze onemocnûní. Právû pouïití citliv ch ãipû dává moïnost odhalit a následnû analyzovat malé oblasti v genomu. Pfiíkladem je trisomie chromosomu 12 u MCL. Ve studii de Leeuw a spol. (22) se ukázalo, Ïe nejde o kompletní trisomii chromosomu 12, ale bylo objeveno 6 oblastí na chromosomu 12, které byly duplikované na krátkém i dlouhém rameni chromosomu 12, pfiiãemï jedna duplikace z nich byla men í jak 370 kb a obsahovala pouze 2 geny. To je dûkaz, Ïe se vzrûstající rozli ovací schopností array CGH technologií vzrûstá také pravdûpodobnost snadnûj ího odhalení dosud neznám ch nádorov ch genû. 344 KLINICKÁ ONKOLOGIE 19 SUPPLEMENT 2006
4 Genetické zmûny spojené s progresí nádorû PouÏití array CGH technologií pfiispûlo také k porozumûní nûkter m zmûnám, které pozorujeme v dobû progrese onemocnûní. Martinez-Climent a spol. (23) pouïili ãip s 2400 klony s rozli ením 1,4 Mb pro studium zmûn bunûãné linie folikulárního lymfomu (FL) a nûkolika pacientû s transformací FL do velkobunûãného B lymfomu (DLBCL). Genomov profil byl porovnán s jejich expresním profilem a bylo potvrzeno, Ïe transformace je provázena vznikem dal ích genomov ch zmûn a zmûna exprese fiady genû odpovídala jejich genomov m zmûnám. Jiná studie byla zamûfiena na urãení genetick ch zmûn v souvislosti s progresí premaligního stádia nádoru do plnû maligní formy. Weiss a spol. (24) studovali metodou array CGH hyperplastické polypy Ïaludku a Ïaludeãní adenomy a v sledkem srovnání bylo zji tûní, Ïe existují pravdûpodobnû dvû rozdílné patogenetické cesty vzniku nádorû Ïaludku. V sledky práce Nyante a spol. (25) u nádorû prsu ukázaly, Ïe na základû nebalancovan ch zmûn mûïeme odli it podtypy nádorû prsních s odli n m klinick m prûbûhem. V echny tyto studie ukázaly, Ïe pozdûj í nádorová stádia jsou charakterizována vy ím v skytem zmûn ve srovnání s jejich pfiedchozími stádii. Pfiedpokládá se, Ïe právû tyto pfiídatné zmûny jsou odpovûdné za progresi onemocnûní. Tyto nálezy mohou také pfiinést dûleïité prognostické informace o budoucím klinickém chování onemocnûní. Napfiíklad, korelace array CGH v sledkû s klinick m prûbûhem onemocnûní u lymfomu plá Èové zóny (MCL) ukázala, Ïe delece na chromosomech 8p a 13q14 je vïdy spojena se patnou prognózou onemocnûní (20). âipová technologie pro urãení translokací Metoda array CGH dovoluje urãit zmûny poãtu kopií sekvencí DNA. Nedovoluje urãit chromosomové zmûny typu inverse a balancované translokace, ve kter ch nedochází ke zmûnû poãtu kopií. Pro urãení balancovan ch zmûn byla vyvinuta modifikace metody array CGH a byla oznaãena array painting (26). Array painting vyuïívá prûtokové cytometrie k sortování a separaci abnormálních chromosomû, které jsou v sledkem translokace nebo inverse, pomocí zmûny velikosti a pomûru párû bází. Následuje izolace DNA z tûchto abnormálních chromosomû. DNA obou aberantních chromosomû jsou oznaãeny rozdíln mi fluorochromy a hybridizují s ãipem. V pfiípadû balancované translokace rozdílnû znaãené DNA dvou derivovan ch chromosomû ukazují sekvence, které jsou proximálnû vzhledem ke zlomu znaãené jednou barvou, zatímco sekvence, které jsou distálnû ke zlomu, jsou znaãeny jinou barvou (Obr. 4). Kombinací metod array CGH a array painting je moïné stanovit jak zmûny poãtu kopií DNA, tak balancované translokace. Obrázek ã. 4.: Schematické znázornûní principu metody paintig array (detailní popis v textu). Závûr V této práci jsme se zamûfiili na molekulárnû cytogenetickou metodu array CGH dovolující urãení zmûn poãtu kopií sekvencí DNA, na její princip a v znam u nádorû. Zmûny poãtu kopií DNA jsou jedním z mnoha mechanismû, které se mohou podílet na zmûnû exprese genû, která vede ke vzniku nádoru. Vyu- Ïití této technologie pro studium zmûn nádorového genomu je pfiíslibem v znamného pokroku v urãení nádorov ch genû. Jejich následné anal za pfiinese nové informace o jejich roli a podílu na vzniku a v voji nádorû a jejich moïné cílené léãbû. Práce je podporována grantem M M Literatura: 1. Kallioniemi A., Kallioniemi OP., Sidar D. et al.: Comparative genomic hybridization for molecular cytogenetic analysis of solid tumors. Science 258, 1992, Du Manoir S., Speicher MR., Joos S. et al.: Detection of complete and partial chromosome gains and losses by comparative genomic hybridization. Human Genet 90, 1993, Lichter P., Joos S., Bentz M. et al.: Comparative genomic hybridization: uses and limitations. Semin Hematol 37, 2000, Solinas-Toldo S., Lampel S., Stilgenbauer S. et al.: Matrix-based comparative genomic hybridization biochips to screen for genomic imbalances. Genes Chromosomes Cancer 20, 1997, Pinkel D, Segraves R., Sudar D. et al.: High resolution analysis of DNA copy number variation using comparative genomic hybridization to microarrays. Nat Genet 20, 1998, Pollack JR., Perou CM., Elizadeh AA. et al.: Genome-wide analysis of DNA copy number changes using cdna microarrays. Nat Genet 23, 1999, Carvalho B., Ouwerkert E., Meijer GA., Ylstra B.: High resolution microarray comparative genomic hybridization analysis using spotted oligonucleotides. J Clin Pathol 57, 2004, Lucito R., Healy J., Alexander J. et a.l: Representational oligonucleotide microarray analysis: a high-resolution method to detect genome copy number variation. Genome Res 13, 2003, Zhou X., Cheng Li J., Paez G., et al.: An integrated view of copy number and allelic alterations in the cancer genome using single nucleotide polymorphism array. Cancer Res 64, 2004, Raghavan M., Lillington DM., Skoulakis S. et al: Genome-wide single nucleotide polymorphism analysis reveals frequent partial uniparental disomy due to somatic recombination in acute myeloid leukemias. Cancer Res 65, 2005, Ishkaniana. S., Malloff CA., Watson SK. et al.: A tiling resolution DNA microarray with complete coverage of human genome. Nat Genet 36, 2004, Pettus JA., Cowley BC., Maxwell T. et al.: Multiple abnormalities detected by dye reversal genomic microarrays in prostate cancer: a much greater sensitivity than conventional cytogenetics. Cancer Genet Cytogenet 154, 2004, Garnis C., Rosin MP., Zhang L., Lam WL.: Comparing canonical non-small cell lung squamous and adenocarcinoma model genomes. Int J Cancer 116(5), 2005, Davies JJ., Wilson IM., Lam WL.: Array CGH technologies and their applications to cancer genom. Chromosome Research, 13, 2005, Lockwood WW., Chari R., Chi B., Lam WL.: Recent advances in array comparative genomic hybridization technologies and their applications in human genetics. E J Human Genetics, 14, 2005, Garnis C., Baldwin C., Zhang L. et al.: Use of complete coverage array KLINICKÁ ONKOLOGIE 19 SUPPLEMENT
5 comparative genomic hybridization to define copy number alteration on chromosome 3p in oral squamous cell carcinoma. Cancer Res, 63, 2003, Garnis C., Campbell J., Davies JJ. et al.: Involvement of multiple developmental genes on chromosome 1p in lung tumourigenesis. Hum Mol Genet, 14, 2005, Coe BP., Henderson LJ., Garnis C. et al.: High-resolution chromosome arm 5p array CGH analysis of small cell lung carcinoma cell lines. Genes Chromosomes Cancer 42, 2005, Henderson LJ, Coe BP., Lee EH. et al.: Genomic and gene expression profiling of minute alteration of chromosome arm 1p in small cell lung carcinoma cell. Br J Cancer 92, 2005, Kohlhammer H., Schaenen C., Wessendorf S. et al.: Genomic DNA-chip hybridization in t(11;14)-positive mantle cell lymphomas shows a high frequency of aberrations and allows a refined characterization of consensus regions. Blood, 104, 2004, Schraders M., Pfund R., Straatman HM. et al.: Novel chromosomal imbalances in mantle cell lymphoma detected by genome-wide arraybased comparative genomic hybridization. Blood, 105, 2004, de Leeuw RJ., Davies JJ., Rosenwald A. et al.: Comprehensive whole genome array CGH profiling of mantle cell lymphoma model genomes. Hum Mol Genet 13, 2004, Martinez-ClimentJA., Alizadeh AA., Segraves R. et al.: Transformation of follicular lymphoma to diffuse large cell lymphoma is associated with a heterogeneous set of DNA copy number and gene expression alterations. Blood 101, 2003, Weiss MM., Kuipers EJ., Postma C. et al.: Genome wide comparative genomic hybridization analysis of premalignant lesions of the stomach. Mol Pathol 56, 2003, Nyante SJ., Devries S., Chen YY. et al.: Array-based comparative genomic hybridization of ductal carcinoma in situ and synchronous invasive lobular cancer. Hum Pathol. 35, 2004, Fiegler H, Gribble SM., Burford DC. et al.: Array painting: a method for a rapid analysis of aberrant chromosomes using DNA microarrays. J Med Genet 40, 2003,
Manuál k uïití ochranné známky âeské televize a pfiedpisy související
Manuál k uïití ochranné známky âeské televize a pfiedpisy související I/1 Základní podoba logotypu, síèová konstrukce a ochrann prostor ; y ; y Ochrannou známkou âeské televize je logotyp tvofien grafick
Referenční lidský genom. Rozdíly v genomové DNA v lidské populaci. Odchylky od referenčního genomu. Referenční lidský genom.
Referenční lidský genom Rozdíly v genomové DNA v lidské populaci Zdroj DNA: 60% sekvencí pochází ze sekvenování DNA od jednoho dárce (sekvenování a sestavování BAC klonů) některá místa genomu se nepodařilo
Metody detekce poškození DNA
STABILITA GENOMU II. Metody detekce poškození DNA Metody detekce poškození DNA Možnosti stanovení: 1. poškození DNA per se nebo 2. jeho následky mutace genů a mutace chromosomů 1. Detekce poškození DNA
OBSAH. Principy. Úvod Definice událostí po datu úãetní závûrky Úãel
23 POSOUZENÍ NÁSLEDN CH UDÁLOSTÍ OBSAH Principy Úvod Definice událostí po datu úãetní závûrky Úãel âinnosti Identifikace událostí do data vyhotovení zprávy auditora Identifikace událostí po datu vyhotovení
Cytogenetické vyšetřovací metody v onkohematologii Zuzana Zemanová
Cytogenetické vyšetřovací metody v onkohematologii Zuzana Zemanová Centrum nádorové cytogenetiky Ústav klinické biochemie a laboratorní diagnostiky VFN a 1. LF UK v Praze Klinický význam cytogenetických
PRÒMYSLOVÉ ZMùKâOVAâE VODY: V BùR
PRÒMYSLOVÉ ZMùKâOVAâE VODY: V BùR VHODNÉHO TYPU S ocelov mi nádobami PrÛmyslové zmûkãovaãe vody mohou b t rozdûleny do dvou skupin: A) PRÒMYSLOV DECAL (tabulka A), kter nedodává zmûkãenou vodu bûhem B)
Proteinové znaky dětské leukémie identifikované pomocí genových expresních profilů
Proteinové znaky dětské leukémie identifikované pomocí genových expresních profilů M.Vášková a spol. Klinika dětské hematologie a onkologie 2.LF UK a FN Motol Childhood Leukemia Investigation Prague Průtoková
Můj život s genetikou
Můj život s genetikou Aneta Mikulášová Molekulární biologie a genetika Přírodovědecká fakulta Masarykova univerzita Univerzitní vzdělávání genetiky 150 roků po Mendelovi Brno, 29. 5. 2015 Studium Molekulární
S 002~ Sirius Zpracování formuláfiû a vytûïování dat
S 002~ 2002 Sirius Zpracování formuláfiû a vytûïování dat Zpracování formulářů a vytěžování dat Zrychlení práce, sníïení poãtu chyb, úspora pracovníkû, to jsou v hody pouïití systému pro zpracování formuláfiû
Cytogenetika. chromosom jádro. telomera. centomera. telomera. buňka. histony. páry bazí. dvoušroubovice DNA
Cytogenetika telomera chromosom jádro centomera telomera buňka histony páry bazí dvoušroubovice DNA Typy chromosomů Karyotyp člověka 46 chromosomů 22 párů autosomů (1-22 od největšího po nejmenší) 1 pár
AURATON 30 AURATON TH-3
AURATON 30 AURATON TH-3 (s externím ãidlem 2,5 m) ELEKTRONICK TERMOSTAT NÁVOD K OBSLUZE Termostaty fiady AURATON 30 (TH-3) jsou urãeny pro teplotní kontrolu vytápûcího systému. Termostat má na v bûr ze
Využití průtokové cytometrie v analýze savčích chromozomů
Využití průtokové cytometrie v analýze savčích chromozomů Jan Fröhlich frohlich@vri.cz Brno 17.-18.5.2015 Flowcytometrické karyotypování a sorting chromozomů - Historie Užívána od pol. 70. let 20.stol
KLASICKÉ A MOLEKULÁRN RNÍ METODY V KLINICKÉ A ONKOLOGICKÉ CYTOGENETICE. Zuzana Zemanová CENTRUM NÁDOROVN DOROVÉ CYTOGENETIKY Ústav klinické biochemie a laboratorní diagnostiky VFN a 1. LF UK PRAHA CYTOGENETIKA
12. NepfietrÏit odpoãinek v t dnu
12. NepfietrÏit odpoãinek v t dnu 12.1 Právní úprava 92 (1) Zamûstnavatel je povinen rozvrhnout pracovní dobu tak, aby zamûstnanec mûl nepfietrïit odpoãinek v t dnu bûhem kaïdého období 7 po sobû jdoucích
STEJSKALOVÁ E., ECKSCHLAGER T. KLINIKA DùTSKÉ ONKOLOGIE, UNIVERZITA KARLOVA, 2. LF A FN MOTOL, PRAHA
MÒÎE CYTOGENETIK A MOLEKULÁRNÍ GENETIK POMOCI DÍTùTI NEMOCNÉMU NÁDOREM? MAY CYTOGENETICIST AND MOLECULAR GENETICIST BRING HELP TO CHILDREN SUFFERING FROM MALIGNANT TUMOR? STEJSKALOVÁ E., ECKSCHLAGER T.
Centrum aplikované genomiky, Ústav dědičných metabolických poruch, 1.LFUK
ové technologie v analýze D A, R A a proteinů Stanislav Kmoch Centrum aplikované genomiky, Ústav dědičných metabolických poruch, 1.LFUK Motto : "The optimal health results from ensuring that the right
Termostat TH-3. Návod k obsluze
Termostat TH-3 Návod k obsluze Termostaty fiady TH-2 jsou urãeny pro teplotní kontrolu vytápûcího systému. Termostat má na v bûr ze dvou funkcí, a to b t v provozu (vytápût) nebo b t vypnut. Termostat
Atestace z lékařské genetiky inovované otázky pro rok A) Molekulární genetika
Atestace z lékařské genetiky inovované otázky pro rok 2017 A) Molekulární genetika 1. Struktura lidského genu, nomenklatura genů, databáze týkající se klinického dopadu variace v jednotlivých genech. 2.
SGH-S300 ProhlíÏeã WAP Návod k pouïití
* Obsah uveden v tomto návodu nemusí pfiesnû souhlasit s va ím telefonem, v závislosti na nainstalovaném softwaru nebo na va em poskytovali sluïeb. SGH-S300 ProhlíÏeã WAP Návod k pouïití ELECTRONICS World
Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/
Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/07.0354 Genomika (KBB/GENOM) Analýza transkriptomu Ing. Hana Šimková, CSc. Cíl přednášky - seznámení s moderními metodami komplexní
11 TRH PÒDY, TRH KAPITÁLU
11 TRH PÒDY, TRH KAPITÁLU 11.1 Trh pûdy a pozemková renta 11.2 Kapitál jako v robní faktor 11.2.1 Pojetí kapitálu 11.2.2 Kapitálov trh, cena kapitálu Anal za trhu pûdy ukazuje, jak je v ekonomickém systému
Inovace studia molekulární a buněčné biologie
Investice do rozvoje vzdělávání Inovace studia molekulární a buněčné biologie Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem České republiky. Investice do rozvoje vzdělávání
NGS analýza dat. kroužek, Alena Musilová
NGS analýza dat kroužek, 16.12.2016 Alena Musilová Typy NGS experimentů Název Materiál Cílí na..? Cíl experimentu? amplikon DNA malý počet vybraných genů hledání variant exom DNA všechny geny hledání
Lekce z analýz genových expresních profilů u MM a návrh panelu genů pro ČR. Mgr. Silvie Dudová
Lekce z analýz genových expresních profilů u MM a návrh panelu genů pro ČR Mgr. Silvie Dudová Centrum základního výzkumu pro monoklonální gamapatie a mnohočetný myelom, ILBIT LF MU Brno Laboratoř experimentální
9/2 Intraorální snímkování
Praktick rádce zubního lékafie str. 1 9/2 Intraorální snímkování Úvod do intraorálního snímkování MUDr. Martin Záhofiík Základní principy rentgenologie Rentgenové záfiení Rentgenové záfiení (záfiení X)
Grafick manuál znaãky. Odkaz na zfiizovatele
Grafick manuál znaãky Odkaz na zfiizovatele Obsah Úvod 1 Znaãka 2 Základní barevná varianta 2.1 Inverzní barevná varianta 2.2 âernobílá pozitivní varianta 2.3 âernobílá inverzní varianta 2.4 Grafická definice
Informaãní zázemí pro ãeská populaãní onkologická data
p fi e h l e d Informaãní zázemí pro ãeská populaãní onkologická data EPIDEMIOLOGIE ZHOUBN CH NÁDORÒ âr ON-LINE NA WEBOVÉM PORTÁLU PROJEKTU SVOD CANCER EPIDEMIOLOGY IN THE CZECH REPUBLIC ON-LINE MUÎÍK
Vytvořilo Oddělení lékařské genetiky FN Brno
GONOSOMY GONOSOMY CHROMOSOMY X, Y Obr. 1 (Nussbaum, 2004) autosomy v chromosomovém páru homologní po celé délce chromosomů crossingover MEIÓZA Obr. 2 (Nussbaum, 2004) GONOSOMY CHROMOSOMY X, Y ODLIŠNOSTI
Znaãka, barvy a písmo
Znaãka, barvy a písmo kliknûte zde nápovûda pouïitím tlaãítek se pohybujte v pfiíslu né sekci jednotlivá loga najdete uloïena na CDromu znaãky âeského TELECOMU z manuálu lze tisknout, je v ak tfieba pfiihlédnout
FUNKČNÍ VARIANTA GENU ANXA11 SNIŽUJE RIZIKO ONEMOCNĚNÍ
FUNKČNÍ VARIANTA GENU ANXA11 SNIŽUJE RIZIKO ONEMOCNĚNÍ SARKOIDÓZOU: POTVRZENÍ VÝSLEDKŮ CELOGENOMOVÉ ASOCIAČNÍ STUDIE. Sťahelová A. 1, Mrázek F. 1, Kriegová E. 1, Hutyrová B. 2, Kubištová Z. 1, Kolek V.
DNA microarrays Josef Srovnal, Michaela Špenerová, Lenka Radová, Marián Hajdúch, Vladimír Mihál
DNA microarrays Josef Srovnal, Michaela Špenerová, Lenka Radová, Marián Hajdúch, Vladimír Mihál Laboratoř experimentální medicíny při Dětské klinice LF UP a FN Olomouc Cíle Seznámit posluchače s: 1. Technologií
LABORATO EXPERIMENTÁLNÍ MEDICÍNY P I DùTSKÉ KLINICE LÉKA SKÉ FAKULTY UNIVERZITY PALACKÉHO A FAKULTNÍ NEMOCNICE V OLOMOUCI 2
VYUÎITÍ LASEROVÉ MIKRODISEKCE PRO P ÍPRAVU KOMPLEXNÍCH VZORKÒ Z NÁDOROVÉ TKÁNù PRO ÚâELY MIKROGENOMICK CH ANAL Z THE UTILIZATION OF LASER CAPTURE MICRODISSECTION FOR CONSTRUCTION OF SPECIFIC SAMPLES FROM
Epidemiologie zhoubného novotvaru prûdu ky a plíce (C34) v âr
Epidemiologie zhoubného novotvaru prûdu ky a plíce (C34) v âr 19 6 2009 Prof. MUDr. Jitka Abrahámová, DrSc. 1 ; MUDr. Markéta Černovská 1,2 ; doc. RNDr. Ladislav Dušek, Ph.D. 3 ; RNDr. Jan Mužík 3 ; RNDr.
MontáÏní a provozní návod - Kódov spínaã CTV 1 / CTV 3
CZ MontáÏní a provozní návod - Kódov spínaã CTV 1 / CTV 3 âesky Obrázek 1 MontáÏ klávesnice Obrázek 2 MontáÏ - vyhodnocovací pfiístroj Obrázek 3 Pfiipojení CTV 1 (ovládání impulzû) Obrázek 4 "2-bránov
Genové knihovny a analýza genomu
Genové knihovny a analýza genomu Klonování genů Problém: genom organismů je komplexní a je proto obtížné v něm najít a klonovat specifický gen Klonování genů Po restrikčním štěpení genomové DNA pocházející
Inovace studia molekulární a buněčné biologie
Investice do rozvoje vzdělávání Inovace studia molekulární a buněčné biologie Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem České republiky. Investice do rozvoje vzdělávání
Genetické mapování. v přírodních populacích i v laboratoři
Genetické mapování v přírodních populacích i v laboratoři Funkční genetika Cílem je propojit konkrétní mutace/geny s fenotypem Vzniklý v laboratoři pomocí mutageneze či vyskytující se v přírodě. Forward
HAJDÚCH M. 1,3, JARO OVÁ M. 2, TROJANEC R. 1, INDRÁK K. 2, PAâKOVÁ K. 1, PAPAJÍK T. 2, CWIERTKA K. 3
CYTOGENETICKÉ A MOLEKULÁRNù BIOLOGICKÉ MARKERY V ONKOLOGII SOLIDNÍCH NÁDORÒ A HEMATOLOGICK CH MALIGNIT CYTOGENETICS AND MOLECULAR BIOLOGICAL MARKERS IN ONCOLOGY AND HEMATOONCOLOGY HAJDÚCH M. 1,3, JARO
Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/
Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/07.0354 Genomika (KBB/GENOM) Poziční klonování Ing. Hana Šimková, CSc. Cíl přednášky - seznámení s metodou pozičního klonování genů
Co je dobré vûdût pfii zateplování podkroví
Co je dobré vûdût pfii zateplování podkroví Jaká bude pouïita podstfie ní difúzní (paropropustná) fólie Jaké vlastnosti má pouïitá tepelná izolace Jaká a jak bude namontována parozábrana (fólie pod vnitfiním
VEDOUCÍ REDAKTOR: ZÁSTUPCE VEDOUCÍHO REDAKTORA: V KONN REDAKTOR: REDAKTO I: âoupek PETR HÁJEK ROMAN KOCÁK IVO. REDAKâNÍ RADA:
âipové technologie v onkologickém v zkumu a praxi Microarray technologies in oncologic research and clinical practice REDAKâNù ZPRACOVAL: SVOBODA Marek, HAJDÚCH Marián klinická onkologie Supplement 2006
Vítejte v TESLE Jihlava
KONTAKTY HYPCON Vítejte v TESLE Jihlava Praha D1 Rozvadov (Műnchen) Jihlava Znojmo (Wien) Brno PROFIL SPOLEâNOSTI Akciová spoleãnost TESLA Jihlava se zamûfiuje na konektory a spínací prvky. Od roku 1958
pfiehled p fi e h l e d
pfiehled p fi e h l e d VYUÎITÍ LASEROVÉ MIKRODISEKCE PRO P ÍPRAVU KOMPLEXNÍCH VZORKÒ Z NÁDOROVÉ TKÁNù PRO ÚâELY MIKROGENOMICK CH ANAL Z APPLICATION OF LASER CAPTURE MICRODISSECTION IN PREPARATION OF COMPLEX
NEâESALOVÁ E.*, KUGLÍK P.**, CEJPEK P.***, VESELSKÁ R.*, VRANOVÁ R.**, PE ÁKOVÁ M.****, RELICHOVÁ J.**
pûvodní práce STUDIUM POLYZOMIE CHROMOZOMU 7, MONOZOMIE CHROMOZOMU 10, AMPLIFIKACE GENU EGFR A DELECE GENU P53 U MULTIFORMNÍHO GLIOBLASTOMU POMOCÍ METODY FLUORESCENâNÍ IN SITU HYBRIDIZACE (FISH) STUDY
Laboratoř molekulární patologie
Laboratoř molekulární patologie Ústav patologie FN Brno Prof. RNDr. Jana Šmardová, CSc. 19.11.2014 Složení laboratoře stálí členové Prof. RNDr. Jana Šmardová, CSc. Mgr. Květa Lišková Mgr. Lenka Pitrová
Matematicko-fyzikální fakulta UK
Matematicko-fyzikální fakulta UK Adresa: Ke Karlovu 3, 2 6 Praha 2 Telefon: 02/29 (ústfiedna), 02/29 262, 02/29 254 Fax: 02/29 292 www adresa: http://www.mff.cuni.cz Den otevfien ch dvefií: 23.. 2000 Termín
Stfiední odborné uãili tû Jifiice. Jifiice, Ruská cesta 404, 289 22 Lysá nad Labem PLÁN DVPP. na kolní rok 2013/2014
Stfiední odborné uãili tû Jifiice Jifiice, Ruská cesta 404, 289 22 Lysá nad Labem PLÁN DVPP na kolní rok 2013/2014 Vypracoval: Ing. Pavel Gogela, metodik DVPP Schválil: Mgr. Bc. Jan Beer, fieditel koly
Mgr. Veronika Peňásová vpenasova@fnbrno.cz Laboratoř molekulární diagnostiky, OLG FN Brno Klinika dětské onkologie, FN Brno
Retinoblastom Mgr. Veronika Peňásová vpenasova@fnbrno.cz Laboratoř molekulární diagnostiky, OLG FN Brno Klinika dětské onkologie, FN Brno Retinoblastom (RBL) zhoubný nádor oka, pocházející z primitivních
OBSAH. Principy. Úvod Úãel Typy detailních testû
18 PROVÁDùNÍ DETAILNÍCH TESTÒ OBSAH Principy Úvod Úãel Typy detailních testû âinnosti Identifikovat ãástku a potenciální chyby Identifikovat soubor ZváÏit nutnost disagregace Test v ech poloïek Test vybran
Zuzana Zemanová 1, Filip Kramář 2
CHROMOSOMOVÉ ABERACE V BUŇKÁCH MALIGNÍCH MOZKOVÝCH NÁDORŮ. Zuzana Zemanová 1, Filip Kramář 2 1 Centrum nádorové cytogenetiky, Ústav klinické biochemie a laboratorní diagnostiky, Všeobecná fakultní nemocnice
ZÍSKANÉ CHROMOSOMOVÉ ABERACE. Vytvořilo Oddělení lékařské genetiky FN Brno
ZÍSKANÉ CHROMOSOMOVÉ ABERACE CHROMOSOMOVÉ ABERACE (CHA) Cílem cytogenetického vyšetření je zjištění přítomnosti / nepřítomnosti chromosomových aberací (patologických chromosomových změn) TYPY ZÍSKANÝCH
Roman Hájek. Zbytkové nádorové onemocnění. Mikulov 5.září, 2015
Roman Hájek Zbytkové nádorové onemocnění Mikulov 5.září, 2015 Zbytkové nádorové onemocnění 1. Minimal residual disease (MRD) Proč lékaře zbytkové nádorové onemocnění stále více zajímá? Protože se zásadně
Sekreční karcinom slinných žláz: využití genomového profilování v personalizaci onkologické léčby: analýza 49 případů sekvenováním nové generace (NGS)
Sekreční karcinom slinných žláz: využití genomového profilování v personalizaci onkologické léčby: analýza 49 případů sekvenováním nové generace (NGS) Skálová A, Santana T, Baněčková M, Vaněček T, Michal
Ocel v architektufie JANISOL SYSTÉMY SYSTÉMY OCELOV CH PROFILÒ PRO DVE NÍ A OKENNÍ KONSTRUKCE S P ERU EN M TEPELN M MOSTEM
SYSTÉMY SYSTÉMY OCELOV CH PROFILÒ PRO DVE NÍ A OKENNÍ KONSTRUKCE S P ERU EN M TEPELN M MOSTEM Tímto systémem profilû (stavební hloubka 60 mm) lze velmi rychle a hospodárnû zhotovit jedno- a dvoukfiídlé
pfiehled DETEKCE A V SKYT CHROMOZOMÁLNÍCH ABERACÍ U ZHOUBN CH NÁDORÒ DùLOÎNÍHO HRDLA A VAJEâNÍKU
pfiehled DETEKCE A V SKYT CHROMOZOMÁLNÍCH ABERACÍ U ZHOUBN CH NÁDORÒ DùLOÎNÍHO HRDLA A VAJEâNÍKU DETECTION AND OCCURENCE OF THE CHROMOSOMAL ABERRATIONS IN MALIGNANT TUMOURS OF CERVIX AND OVARY. KRKAVCOVÁ
OBSAH. Úvod... 11 Seznam zkratek uïit ch právních pfiedpisû... 15 Seznam jin ch zkratek... 16. Díl 1 Obecné principy poznávání dítûte...
Diagnostika_zlom(4) 13.3.2012 14:49 Stránka 5 Úvod........................................................ 11 Seznam zkratek uïit ch právních pfiedpisû........................ 15 Seznam jin ch zkratek..........................................
III. Kontroly dodrïování reïimu práce neschopn ch zamûstnancû. 14. Co je reïim doãasnû práce neschopného poji tûnce
nahrada_mzdy_zlom(3) 22.12.2010 15:21 Stránka 84 III. Kontroly dodrïování reïimu práce neschopn ch zamûstnancû 14. Co je reïim doãasnû práce neschopného poji tûnce ReÏim doãasnû práce neschopného poji
Proč je dobré studovat genetické procesy na úrovni buňky? Například proto, že odchylky počtu nebo struktury chromozomů mohou způsobit:
Cytogenetika Proč je dobré studovat genetické procesy na úrovni buňky? Například proto, že odchylky počtu nebo struktury chromozomů mohou způsobit: mentální nebo psychomotorickou retardaci, poruchy vývoje
HTA v onkologii: datové zdroje a parametrické záznamy
HTA v onkologii: datové zdroje a parametrické záznamy REGISTRACE EPIDEMIOLOGICK CH DAT V ONKOLOGII A JEJÍ V ZNAM PRO HODNOCENÍ LÉâEBNÉ PÉâE CANCER EPIDEMIOLOGY REGISTRATION AND ITS ROLE IN HEALTH TECHNOLOGY
P ÍRUâKA PRO PROVÁDùNÍ AUDITU
P ÍRUâKA PRO PROVÁDùNÍ AUDITU 2012 P ÍRUâKA PRO PROVÁDùNÍ AUDITU Tato Pfiíruãka byla pro Komoru auditorû âeské republiky pfiipravena auditorskou spoleãností Deloitte Audit s.r.o. Karolinská 654/2, 186
Ponofite se s námi pro perly do Va eho oddûlení barev! Kompletní sortiment. pro obchodníky
Ponofite se s námi pro perly do Va eho oddûlení barev! Kompletní sortiment pro obchodníky Platnost od: 01. 02. 2008 VáÏen zákazníku, právû jste otevfiel nové vydání na eho katalogu urãeného pro maloobchod
Vûstník. právních pfiedpisû Pardubického kraje. âástka 8 Rozesláno dne 30. prosince 2006
Strana 301 Vûstník právních pfiedpisû PlzeÀského kraje âástka 1/2001 Roãník 2006 Vûstník právních pfiedpisû Pardubického kraje âástka 8 Rozesláno dne 30. prosince 2006 O B S A H Nafiízení hejtmana Pardubického
Implementace laboratorní medicíny do systému vzdělávání na Univerzitě Palackého v Olomouci. reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/
Implementace laboratorní medicíny do systému vzdělávání na Univerzitě Palackého v Olomouci reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/28.0088 Hybridizační metody v diagnostice Mgr. Gabriela Kořínková, Ph.D. Laboratoř molekulární
1. Stykaãe 1.3 Stykaãe fiady C
1.3 Stykaãe fiady C 1.3.1 Tabulka ã. 8 technická data Technická data stykaãû fiady C Hlavní kontakty Jmenovité izolaãní napûtí U i [V] Impulzní v drïné napûtí U imp [kv] Jmenovit tepeln proud I th [A]
TS-101 PROGRAMOVATELN REGULÁTOR TEPLOTY S T DENNÍM PROGRAMEM NÁVOD K OBSLUZE DODÁVÁ:
TS-101 PROGRAMOVATELN REGULÁTOR TEPLOTY S T DENNÍM PROGRAMEM NÁVOD K OBSLUZE DODÁVÁ: Strana: 1 Programovateln termostat TS-101 âásti balení: 1. Programovateln termostat 2. roubky 3. HmoÏdinky 4. Vrtání
PRÒMYSLOV DEFERR. PrÛmyslov sloupcov filtr k odstranûní Ïeleza a hofiãíku. FILTRAâNÍ KOLONY
PRÒMYSLOV DEFERR PrÛmyslov sloupcov filtr k odstranûní Ïeleza a hofiãíku Pitná voda nesmí obsahovat více neï 0, mg/l Ïeleza a 0,05 mg/l hofiãíku. Pro technologické vyuïití vody mohou b t tyto limity dokonce
HODNOCENÍ CYTOGENETICKÝCH A FISH NÁLEZŮ U NEMOCNÝCH S MNOHOČETNÝM MYELOMEM VE STUDII CMG ORGANIZACE VÝZKUMNÉHO GRANTU NR/
HODNOCENÍ CYTOGENETICKÝCH A FISH NÁLEZŮ U NEMOCNÝCH S MNOHOČETNÝM MYELOMEM VE STUDII CMG 22. ORGANIZACE VÝZKUMNÉHO GRANTU NR/8183-4. KLONÁLNÍ CHROMOSOMOVÉ ABERACE U MNOHOČETNÉHO MYELOMU (MM). Klasické
Pájen v mûník tepla, XB
Pájen v mûník tepla, XB Popis / aplikace XB je deskov v mûník tepla pájen natvrdo, vyvinut k pouïití v systémech dálkového vytápûní (tedy pro klimatizaci, vytápûní nebo ohfiev teplé uïitkové vody) Pájené
Inovace studia molekulární a buněčné biologie
Investice do rozvoje vzdělávání Inovace studia molekulární a buněčné biologie Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem České republiky. Investice do rozvoje vzdělávání
8 Obouruãní ovládací pulty
Obsah Obouruãní ovládací pulty b V eobecnû.................................................... strana /2 b Popis......................................................... strana / b Technické údaje................................................
Metody studia exprese mrna. jádro a genová exprese 2007
Metody studia exprese mrna Buněčné jádro a genová exprese 2007 Aktivita genu je primárn ě vyjád ř ena jeho transkripcí-prvním krokem vedoucím k syntéze kódovaného proteinu. Cíle metod Ur č ení mno ž ství
Metody studia historie populací. Metody studia historie populací
1) Metody studia genetické rozmanitosti komplexní fenotypové znaky, molekulární znaky. 2) Mechanizmy evoluce mutace, přírodní výběr, genový posun a genový tok 3) Anageneze x kladogeneze - co je vlastně
Varianty lidského chromosomu 9 z klinického i evolučního hlediska
Varianty lidského chromosomu 9 z klinického i evolučního hlediska Antonín Šípek jr., Aleš Panczak, Romana Mihalová, Lenka Hrčková, Eva Suttrová, Mimoza Janashia a Milada Kohoutová Ústav biologie a lékařské
WC a koupelna kdekoli... a nyní i bezbariérovû. Katalog novinek
WC a koupelna kdekoli... a nyní i bezbariérovû Katalog novinek SANIBROY sanitární kalová čerpadla 2011 WC a koupelna bez bariér kdekoli SANICONDENS Best sanitární čerpadlo SANICONDENS Best je ãerpadlo
Charakterizace hybridních trav pomocí cytogenetických a molekulárních metod
Molekulární přístupy ve šlechtění rostlin Olomouc 14. února, 2017 Charakterizace hybridních trav pomocí cytogenetických a molekulárních metod Jan Bartoš Ústav experimentální botaniky Olomouc, Czech Republic
Buněčné kultury Primární kultury
Buněčné kultury Primární kultury - odvozené přímo z excise tkáně buněčné linie z různých organizmů, tkání explantované kultury jednobuněčné suspense lze je udržovat jen po omezenou dobu během kultivace
Majetek nebo sluïby pfiijaty, nákup nezaúãtován Zaúãtování
CÍLE Pfiedmûtem této kapitoly jsou závazky z obchodních vztahû, závazky vûãi propojen m osobám, závazky k zamûstnancûm a související závazky z titulu sociálního a zdravotního poji tûní, pfiijaté zálohy,
NÁVAZNOST METOD KLASICKÉ A MOLEKULÁRNÍ CYTOGENETIKY. Vytvořilo Oddělení lékařské genetiky FN Brno
NÁVAZNOST METOD KLASICKÉ A MOLEKULÁRNÍ CYTOGENETIKY TYPY CHROMOSOMOVÝCH ABERACÍ, kterých se týká vyšetření metodami klasické i molekulární cytogenetiky - VYŠETŘENÍ VROZENÝCH CHROMOSOMOVÝCH ABERACÍ prenatální
Pokročilé biofyzikální metody v experimentální biologii
Pokročilé biofyzikální metody v experimentální biologii Ctirad Hofr 1/1 Proč biofyzikální metody? Biofyzikální metody využívají fyzikální principy ke studiu biologických systémů Poskytují kvantitativní
Možnosti využití technologie DNA microarrays v predikci odpovědi na neoadjuvantní terapii u pacientů s karcinomem jícnu
Možnosti využití technologie DNA microarrays v predikci odpovědi na neoadjuvantní terapii u pacientů s karcinomem jícnu Srovnal J. 1, Cincibuch J. 2, Cwierkta K. 2, Melichar B. 2, Aujeský R. 3, Vrba R.
DIAGNOSTICKÝ KIT PRO DETEKCI MINIMÁLNÍ REZIDUÁLNÍ CHOROBY U KOLOREKTÁLNÍHO KARCINOMU
Úvod IntellMed, s.r.o., Václavské náměstí 820/41, 110 00 Praha 1 DIAGNOSTICKÝ KIT PRO DETEKCI MINIMÁLNÍ REZIDUÁLNÍ CHOROBY U KOLOREKTÁLNÍHO KARCINOMU Jednou z nejvhodnějších metod pro detekci minimální
DS-75 JE TO TAK SNADNÉ. kombinace produktivity v estrannosti a pohodlí
DS-75 JE TO TAK SNADNÉ kombinace produktivity v estrannosti a pohodlí DS-75 OBÁLKOVÁNÍ JE TAK SNADNÉ Pracujete v prostfiedí, kde je zpracování zásilek klíãová otázka? Kompaktní obálkovací stroj má mnoho
Metody studia historie populací. Metody studia historie populací. 1) Metody studiagenetickérozmanitosti komplexní fenotypové znaky, molekulární znaky.
1) Metody studiagenetickérozmanitosti komplexní fenotypové znaky, molekulární znaky. 2)Mechanizmy evoluce mutace, p írodnívýb r, genový posun a genový tok 3) Anagenezex kladogeneze-co je vlastn druh 4)Dva
P ehled výsledk z Referen ní laborato e
P ehled výsledk z Referen ní laborato e 1,3 Hajdúch M, 1,3 Trojanec R, 2,3 Kolá Z, 1,3 Bouchalová K, 2,3 Sedláková E. 1 Laborato experimentální medicíny p i D tské klinice LF UP a FN Olomouc 2 Laborato
K ÍÎOVKA, KTERÁ NIKDY NEKONâÍ NÁVOD
K ÍÎOVKA, KTERÁ NIKDY NEKONâÍ NÁVOD CZ CZ Hra pro: 2-4 hráãe Délka hry: 45 minut Hra obsahuje: 1 herní plán 101 písmeno ze silného kartonu 4 plastové stojánky 32 záznamové tabulky 1 látkov sáãek 1 návod
OD GENOMU K PROTEOMU VYUÎITÍ PROTEINOV CH âipò V ONKOLOGII FROM GENOME TO PROTEOME USING OF PROTEIN MICROARRAYS IN ONCOLOGY
OD GENOMU K PROTEOMU VYUÎITÍ PROTEINOV CH âipò V ONKOLOGII FROM GENOME TO PROTEOME USING OF PROTEIN MICROARRAYS IN ONCOLOGY MALâÍKOVÁ J., TICH B., KOTA KOVÁ J., MAYER J., POSPÍ ILOVÁ. CENTRUM MOLEKULÁRNÍ
MCS. Komplexní fie ení pro mûnící se potfieby rozvodu elektrické energie, fiízení a automatizace. Modulární skfiíàov systém
Komplexní fie ení pro mûnící se potfieby rozvodu elektrické energie, fiízení a automatizace MCS Modulární skfiíàov systém Mnohostranný, dobře navržený, rychlý systém - pro lokální i celosvětové použití
DIAGNOSTICKÝ KIT PRO DETEKCI MINIMÁLNÍ REZIDUÁLNÍ CHOROBY U KARCINOMU PANKREATU
Úvod IntellMed, s.r.o., Václavské náměstí 820/41, 110 00 Praha 1 DIAGNOSTICKÝ KIT PRO DETEKCI MINIMÁLNÍ REZIDUÁLNÍ CHOROBY U KARCINOMU PANKREATU Jednou z nejvhodnějších metod pro detekci minimální reziduální
zastávkové pfiístfie ky sportovní pfiístfie ky
zastávkové pfiístfie ky sportovní pfiístfie ky classic Klasicky tvarovan pfiístfie ek dokonal ch proporcí a vysoké stability. Promy len systém podpûr nese pfiekvapivû rozmûrnou stfiechu s dvûma moïnostmi
PCR IN DETECTION OF FUNGAL CONTAMINATIONS IN POWDERED PEPPER
PCR IN DETECTION OF FUNGAL CONTAMINATIONS IN POWDERED PEPPER Trojan V., Hanáček P., Havel L. Department of Plant Biology, Faculty of Agronomy, Mendel University of Agriculture and Forestry in Brno, Zemedelska
YY-JZ/-OZ (YSLY) Flexibilní ovládací kabely, ãíslované Ïíly. Konstrukce. Technická data. PouÏití
YY-JZ/-OZ (YSLY) Flexibilní ovládací kabely, vané Ïíly - Lanûné mûdûné jádro dle normy DIN VDE 0295, IEC 60228 tfi.5 - Izolace jádra ze speciální smûsi PVC - âerné Ïíly s opakujícím se bíl m váním dle
6. DLOUHODOBÝ FINANČNÍ MAJETEK
6. DLOUHODOBÝ FINANČNÍ MAJETEK POSTUPY YHODNOCENÍ RIZIK Obecné principy Pfiedmûtem této kapitoly je dlouhodob finanãní majetek, tedy akcie a kapitálové úãasti, dluhopisy, dlouhodobé vklady, pûjãky propojen
H O D N O C E N Í E F E K T U O N K O L O G I C K É L É
50 Anal za pfieïití v hodnocení v sledkû onkologické péãe: moïnosti a limity. Du ek L, Pavlík T., Koptíková J., MuÏík J., Gelnarová E., Vyzula R., Îaloudík J. Institut biostatistiky a anal z, Masarykova
Bioptická laboratoř s.r.o. a Šiklův ústav patologie Lékařské fakulty UK v Plzni
Genové fúze NCOA4-RET a TRIM27- RETdiferencují intraduktální karcinom slinných žláz na duktální a apokrinní podtyp: analýza 18 případů pomocí sekvenování nové generace (NGS) Skálová A, Baněčková M, Martínek
II. ročník, zimní semestr 1. týden OPAKOVÁNÍ. Úvod do POPULAČNÍ GENETIKY
II. ročník, zimní semestr 1. týden 6.10. - 10.10.2008 OPAKOVÁNÍ Úvod do POPULAČNÍ GENETIKY 1 Informace o výuce (vývěska) 2 - nahrazování (zcela výjimečně) - podmínky udělení zápočtu (docházka, prospěch
Informaãní zázemí pro ãeská populaãní onkologická data INFORMATION SYSTEM FOR ANALYTICAL PROCESSING OF DATA OF CZECH NATIONAL CANCER REGISTRY.
p fi e h l e d Informaãní zázemí pro ãeská populaãní onkologická data INFORMAâNÍ SYSTÉM PRO ANALYTICKÉ ZPRACOVÁNÍ DAT NÁRODNÍHO ONKOLOGICKÉHO REGISTRU - PROJEKT SVOD V ROCE 2006 INFORMATION SYSTEM FOR
VYUŽITÍ MLPA TECHNIKY K PRŮKAZU GENETICKÝCH ZMĚN U NEUROBLASTOMU UTILIZATION OF MLPA TO DETECTION OF GENETIC CHANGES IN NEUROBLASTOMA
přehled VYUŽITÍ MLPA TECHNIKY K PRŮKAZU GENETICKÝCH ZMĚN U NEUROBLASTOMU UTILIZATION OF MLPA TO DETECTION OF GENETIC CHANGES IN NEUROBLASTOMA VÍCHA A., ECKSCHLAGER T. KLINIKA DĚTSKÉ HEMATOLOGIE A ONKOLOGIE
PGT- A a mosaicismus. RNDr. Martina Hrubá, Ph.D.
PGT- A a mosaicismus RNDr. Martina Hrubá, Ph.D. KAZUISTIKA (A.CH.,*1987) VSTUPNÍ ANAMNÉZA 2010 2015: 3 opakované spontánní potraty v prvním trimestru, asthenozoospermie u manžela (bez trombofilních mutací,
právních pfiedpisû PlzeÀského kraje
Strana 137 Vûstník právních pfiedpisû PlzeÀského kraje âástka 1/2001 Roãník 2006 VùSTNÍK právních pfiedpisû PlzeÀského kraje âástka 3 Rozesláno dne 18. kvûtna 2006 O B S A H 2. Nafiízení PlzeÀského kraje
Laboratoř na čipu. Lab-on-a-chip. Pavel Matějka
Laboratoř na čipu Lab-on-a-chip Pavel Matějka Typy analytických čipů 1. Chemické čipy 1. Princip chemického čipu 2. Příklady chemických čipů 3. Příklady analytického použití 2. Biočipy 1. Princip biočipu