Informaãní zázemí pro ãeská populaãní onkologická data INFORMATION SYSTEM FOR ANALYTICAL PROCESSING OF DATA OF CZECH NATIONAL CANCER REGISTRY.

Transkript

1 p fi e h l e d Informaãní zázemí pro ãeská populaãní onkologická data INFORMAâNÍ SYSTÉM PRO ANALYTICKÉ ZPRACOVÁNÍ DAT NÁRODNÍHO ONKOLOGICKÉHO REGISTRU - PROJEKT SVOD V ROCE 2006 INFORMATION SYSTEM FOR ANALYTICAL PROCESSING OF DATA OF CZECH NATIONAL CANCER REGISTRY. DU EK L. 1, ÎALOUDÍK J. 2, KOPTÍKOVÁ J. 1, MUÎÍK J. 1, BRABEC P. 1, PAVLI P. 1, ABRAHÁMOVÁ J. 3, VYZULA R. 2 1 LÉKA SKÁ FAKULTA MASARYKOVY UNIVERZITY, BRNO 2 MASARYKÒV ONKOLOGICK ÚSTAV, BRNO 3 FAKULTNÍ THOMAYEROVA NEMOCNICE, PRAHA Souhrn Práce shrnuje v voj analytického a informaãního systému SVOD zamûfieného na anal zy populaãních dat onkologick ch registrû, pfiedev ím Národního onkologického registru âeské republiky. Systém pracuje ve tfiech formách cílen ch na rûzné koncové uïivatele arûzná data: a) webov portál SVOD ( jako on-line software zpfiístupàující epidemiologická data o zhoubn ch nádorech, b) lokálnû instalovan informaãní systém SVOD umoïàující odborníkûm i anal zy klinick ch dat a c) v stupy ve formû zpravodajství SVOD pfiiná ející jiï interpretované komplexní anal zy vãetnû populaãních dat o pfieïití onkologick ch pacientû. Funkce a sluïby software SVOD jsou univerzální, vyuïitelné pro zpracování dat z jakéhokoli zdravotnického registru nebo obsáhlej í databáze. Klíãová slova: epidemiologie nádorû, populaãní registrace dat, informaãní systém. Summary This paper summarizes development of analytical and information system SVOD that is oriented on analyses of population-based cancer registries. Primary interest in focused on Czech National Cancer Registry with more 1.3 million of patients that have been reported since The system SVOD is functional in three forms optimized for different users and data: a) web portal SVOD ( as on-line working software making accessible namely standard epidemiological data, b) locally installed analytical system SVOD targeted for professionals analyzing also population-based clinical records and c) reporting system SVOD providing complex analyses of multiple data sources with associated comments and interpretations. Functionality of software SVOD is universal, usable for any health care registry or database. Key words: cancer epidemiology, population-based registry, information system. O projektu SVOD Analytick systém SVOD (software pro vizualizaci onkologick ch dat) je vyvíjen od roku 2000 jako univerzální nástroj pro zviditelnûní a anal zu dat populaãních onkologick ch registrû, pfiedev ím pak Národního onkologického registru âeské republiky (NOR). Software je koncipován jako analytick nástroj nad jiï existujícími databázemi a nenahrazuje jejich archivaãní funkci. V stupy nabízejí analytick a grafick servis, pfiípadnû interpretované prezentace v stupû. Funkce a sluïby software SVOD jsou univerzální, vyuïitelné pro zpracování dat z jakéhokoli zdravotnického registru nebo obsáhlej í databáze. V voj software SVOD je finanãnû podporován Ministerstvem zdravotnictví âr a je organizaãnû zaji Èován Masarykov m onkologick m ústavem, Institutem biostatistiky a anal z Lékafiské a Pfiírodovûdecké fakulty Masarykovy univerzity v Brnû a Univerzitním onkologick m centrem Lékafiské fakulty Masarykovy univerzity v Brnû. Projekt SVOD je primárnû zamûfien na epidemiologii zhoubn ch nádorû a pracuje tedy pfiedev ím s databází Národního onkologického registru. Pro kalkulaci a interpretaci epidemiologick ch parametrû systém vyuïívá podporu dal ích populaãních databází obsahujících demografická data âr a vûkovû specifické agregace z databáze zemfiel ch âr. Tato datová podpora je projektu poskytována âesk m statistick m úfiadem. Samostatná kapitola v voje je vûnována klinické ãásti hlá ení NOR a zamûfiuje se na populaãní pfiehledy aplikovan ch diagnostick ch a terapeutick ch metod, hodnocení strategie léãby rûzn ch malignit a v neposlední fiadû hodnocení celkového pfieïití onkologick ch pacientû. UÏivatel SVOD získává velmi hodnotná data, neboè souãasná verze obsahuje kompletní export NOR a k dispozici tak je 109 diagnóz novotvarû (C00-C97, D00-D09, D37- D48) a to za období (více neï 1,3 milionu záznamû). Pfiehled dat NOR dostupn ch v roce 2006 v systému SVOD je uveden v Tabulce 1. Hodnotu anal z lze spatfiovat pfiedev ím v následujících moïnostech a skuteãnostech: 1. Systém poskytuje reprezentativní obraz epidemiologie zhoubn ch nádorû v ãeské populaci. Data NOR pfiiná ejí jedineãnou moïnost hodnotit onkologická populaãní 96 KLINICKÁ ONKOLOGIE 20 SUPPLEMENT 1/2007

2 Tabulka 1. Pfiehled dat NOR dostupn ch v nové verzi systému SVOD Diagnóza Poãet záznamû C00 - ZN rtu C01 - ZN kofiene jazyka C02 - ZN jin ch a neurãen ch ãástí jazyka C03 - ZN dásnû - gingivy C04 - ZN ústní spodiny C05 - ZN patra C06 - ZN jin ch a neurãen ch ãástí úst C07 - ZN pfiíu ní (parotické) Ïlázy C08 - ZN jin ch a neurãen ch slinn ch Ïláz C09 - ZN mandle - tonzily C10 - ZN ústní ãásti hltanu - orofaryngu C11 - ZN nosohltanu - nazofaryngu C12 - ZN pyriformního sinu C13 - ZN hypofaryngu C14 - ZN jin ch a nepfiesnû urãen ch lokalizací rtu, ústní dutiny a hltanu C15 - ZN jícnu C16 - ZN Ïaludku C17 - ZN tenkého stfieva C18 - ZN tlustého stfieva C19 - ZN rektosigmoideálního spojení C20 - ZN koneãníku - recta C21 - ZN fiiti a fiitního kanálu C22 - ZN jater a intrahepatálních Ïluãov ch cest C23 - ZN Ïluãníku C24 - ZN jin ch a neurãen ch ãástí Ïluãov ch cest C25 - ZN slinivky bfii ní C26 - ZN jin ch a nepfiesnû urãen ch trávicích orgánû C30 - ZN nosní dutiny a stfiedního ucha C31 - ZN vedlej ích dutin C32 - ZN hrtanu C33 - ZN prûdu nice - trachey C34 - ZN prûdu ky - bronchu a plíce C37 - ZN brzlíku - thymu C38 - ZN srdce, mezihrudí - mediastina a pohrudnice - pleury C39 - ZN jin ch a nepfiesnû urãen ch lokalizací v d ch.soustavû a nitrohrud.orgánech C40 - ZN kosti a kloubní chrupavky konãetin C41 - ZN kosti a kloubní chrupavky jin ch a neurãen ch lokalizací C43 - Zhoubn melanom kûïe C44 - Jin ZN kûïe C45 - Mezoteliom - mesothelioma C46 - Kaposiho sarkom C47 - ZN periferních nervû a autonomní nervové soustavy C48 - ZN retroperitonea a peritonea C49 - ZN jiné pojivové a mûkké tkánû C50 - ZN prsu C51 - ZN vulvy C52 - ZN pochvy - vaginy C53 - ZN hrdla dûloïního - cervicis uteri C54 - ZN tûla dûloïního C55 - ZN dûlohy, ãást NS C56 - ZN vajeãníku C57 - ZN jin ch a neurãen ch Ïensk ch pohlavních orgánû C58 - ZN placenty KLINICKÁ ONKOLOGIE 20 SUPPLEMENT 1/

3 C60 - ZN pyje C61 - ZN pfiedstojné Ïlázy - prostaty C62 - ZN varlete C63 - ZN jin ch a neurãen ch muïsk ch pohlavních orgánû C64 - ZN ledviny mimo pánviãku C65 - ZN ledvinné pánviãky C66 - ZN moãovodu - ureteru C67 - ZN moãového mûch fie - vesicae urinariae C68 - ZN jin ch a neurãen ch moãov ch orgánû C69 - ZN oka a oãních adnex C70 - ZN mozkomí ních plen C71 - ZN mozku C72 - ZN míchy, mozkov ch nervû a jin ch ãástí centrální nervové soustavy C73 - ZN títné Ïlázy C74 - ZN nadledviny C75 - ZN jin ch Ïláz s vnitfiní sekrecí a pfiíbuzn ch struktur C76 - ZN jin ch a nepfiesnû urãen ch lokalizací C77 - Sekundární a neurãen ZN mízních uzlin C78 - Sekundární ZN d chací a trávicí soustavy C79 - Sekundární ZN jin ch lokalizací C80 - ZN bez urãení lokalizace C81 - Hodgkinova nemoc C82 - Ne-HodgkinÛv folikulární (nodulární) lymfom C83 - Ne-HodgkinÛv (difúzní) lymfom C84 - Periferní a koïní T-bunûãné lymfomy C85 - Ne-HodgkinÛv lymfom, jin ch a neurãen ch typû C88 - Zhoubné imunoproliferativní nemoci C90 - Mnohoãetn myelom a plasmocytární novotvary C91 - Lymfoidní leukémie C92 - Myeloidní leukémie C93 - Monocytární leukémie C94 - Jiné leukémie urãen ch bunûãn ch typû C95 - Leukémie neurãeného bunûãného typu C96 - Jiné zhoubné novotvary mízní, krvetvorné a pfiíbuzné tkánû C97 - Zhoubné novotvary mnohoãetn ch samostatn ch (primárních) lokalizací D00 - Carcinoma in situ dutiny ústní, jícnu a Ïaludku D01 - Carcinoma in situ jin ch a neurãen ch trávicích orgánû D02 - Carcinoma in situ stfiedního ucha a d chací soustavy D03 - Melanoma in situ D04 - Carcinoma in situ kûïe D05 - Carcinoma in situ prsu D06 - Carcinoma in situ - hrdla dûloïního - cervicis uteri D07 - Carcinoma in situ jin ch a neurãen ch pohlavních orgánû D09 - Carcinoma in situ jin ch a neurãen ch lokalizací D37 - Novotvar nejistého nebo neznámého chování dutiny ústní a trávicích orgánû D38 - Novotvary nejistého nebo nezn. chování stfi.ucha a d chacích a nitrohrudních orgánû D39 - Novotvary nejistého nebo neznámého chování Ïensk ch pohlavních orgánû D40 - Novotvar nejistého nebo neznámého chování muïsk ch pohlavních orgánû D41 - Novotvar nejistého nebo neznámého chování moãov ch orgánû D42 - Novotvar nejistého nebo neznámého chování mozkomí ních plen D43 - Novotvar nejistého nebo neznámého chování mozku a centrální nervové soustavy D44 - Novotvary nejistého nebo neznámého chování Ïláz s vnitfiní sekrecí D45 - Polycythaemia vera D46 - Myelodysplastické syndromy D47 - Jiné novotvary nejistého nebo neznámého chování mízní, krvetvorné a pfiíbuzné tkánû D48 - Novotvary nejistého nebo neznámého chování jin ch a neurãen ch lokalizací Celkem KLINICKÁ ONKOLOGIE 20 SUPPLEMENT 1/2007

4 rizika ãeské populace. Îádn jin datov zdroj v podobném rozsahu není k dispozici. 2. Studium kompletních ãasov ch trendû. Data NOR, a tedy i systém SVOD nabízejí kompletní datové fiady v voje epidemiologick ch parametrû od roku MoÏnost srovnání rûzn ch ãasov ch období. Databáze nabízí reprezentativní pohled do epidemiologie malignit ve dvou odli n ch spoleãensk ch systémech, pfied i po roce Zmûny, kter mi ãeská populace pro la po pádu komunismu, se v raznû odrazily i v úrovni rizika onkologick ch onemocnûní. Systém nabízí z tohoto pohledu unikátní materiál pro v zkum. 4. Srovnávací studium rûzn ch diagnostick ch skupin, regionû, zdravotnick ch zafiízení apod. NOR je reprezentativní populaãní databází malignit a umoïàuje plnohodnotné srovnání v ech zmiàovan ch jednotek. 5. Aktuální anal zy zpfiehledàující terén zdravotnick ch zafiízení zapojen ch do onkologie, jejich zátûï rûznû pokroãil mi onemocnûními, pouïívané léãebné postupy i celkové v sledky. Budeme-li uvaïovat období , které odpovídá i zavedení nové verze klasifikace nádorû, pak máme k dispozici aktuální záznamy od pfiibliïnû 440 tisíc pacientû s více neï 520 tisíci hlá- eními o novû diagnostikovaném maligním onemocnûní. Jde o nenahraditeln zdroj informací, plnû vyuïiteln i v souãasném zdravotnickém systému. 6. V voj a práce s populaãními referenãními standardy. Ze v ech v e uveden ch dûvodû vypl vá, Ïe NOR umoï- Àuje nastavení referenãních hranic pro hodnocení epidemiologické zátûïe, v konu diagnostiky a léãby i celkov ch léãebn ch v sledkû. V e na úrovni státu, vybran ch regionû nebo urãitého typu zdravotnick ch zafiízení. RÛznorodost uïivatelû diktuje rûznorodost analytick ch fie ení V voj systému nebyl v minulosti vïdy pfiímoãar, zmínit mûïeme problémy s velk mi objemy dat NOR, problematickou agregací rûzn ch zdrojû populaãních dat nebo neexistující metodické postupy pro zpracování jak epidemiologické, tak i klinické ãásti hlá ení NOR. Cílem projektu pfiitom vïdy bylo nejen data shromáïdit a nûjak zviditelnit, ale dostat je k uïivateli ve formû automatizovaného zpracování v koneãné a pfiímo vyuïitelné podobû. Nejde tedy jen o v voj software, ale i o zaji tûní jeho reálného vyuïívání onkology, vedoucími pracovníky ve zdravotnictví, vûdci. Data NOR a systém SVOD nabízejí tfii základní typy v stupû, kaïd s jin m stupnûm zpfiístupnûní: 1. Obecná epidemiologická data. Trendy incidence a mortality, základní diagnostick popis novû diagnostikovan ch zhoubn ch nádorû. Tato data mohou b t plo nû dostupná, nejlépe v laicky srozumiteln ch epidemiologick ch pfiehledech. 2. Anal za záznamû o diagnostice a léãbû zhoubn ch nádorû. Popisy metod diagnostiky, jejich v sledku, modality protinádorové terapie, typologie rûznû léãen ch pacientû. Jde o data vyïadující odborné zpracování a mûla by b t zpfiístupnûna odborn m managerûm zdravotnick ch zafiízení, plátcûm zdravotní péãe a odborné vefiejnosti. 3. Anal za celkového pfieïití onkologick ch pacientû. Nejcitlivûj í komponenta, vyïadující vysoce odborné zpracování zohledàující v echny moïnosti zkreslení a dezinterpretace. Tato data by mûla b t zpfiístupnûna pouze odborné onkologické vefiejnosti a kaïd jednotliv v stup by mûl b t pfied zvefiejnûním konzultován nejen lékafii, ale i analytiky dat a epidemiology. V voj systému SVOD byl donucen respektovat v echny tfii v e uvedené typy dat a v souãasnosti tedy systém pracuje ve tfiech rozdíln ch formách: 1. Webov portál SVOD. Vefiejnû dostupná platforma funkãní od roku 2005 umoïàuje analyzovat epidemiologická data âr jakémukoli uïivateli, v ãeském nebo anglickém jazyce. Portál plo nû zpfiístupàuje kompletní epidemiologická data a umoïàuje jejich on-line anal zu dle volby uïivatele, vãetnû srovnávání ãesk ch dat s mezinárodními zdroji: 2. Lokální analytick systém SVOD. Rozsáhl systém obsahující prohlíïeã dat NOR a analytické nástroje umoïàující analyzovat i klinické záznamy NOR. Systém urãen k lokální instalaci pro odborné pracovníky. 3. Regionální zpravodajství SVOD. Specifick analytick v stup systému urãen pro v znamná zdravotnická zafiízení, regionální management apod. Zpravodajství má podobu prezentace s jiï zpracovan mi a interpretovan mi daty. Zpravodajství etfií ãas na stranû uïivatele, pfiiná í komplexní interpretaci sloïit ch situací a pfiedev ím umoïàuje bezpeãnou anal zu i nejcitlivûj ích dat vãetnû anal zy pfieïití. Bezpeãnou anal zou je my leno cílené zpracování dat pro odborného uïivatele, kterému je umoïnûno porovnávat data z jeho regionu nebo zdravotnického zafiízení s populaãními hodnotami. Data NOR a pfiedev ím populaãní odhady pfieïití pacientû nejsou vyuïívány k vzájemnému srovnání zdravotnick ch zafiízení. Webov portál SVOD plní roli celonárodního informaãního zdroje, zatímco software SVOD a systém regionálních zpravodajství jsou urãeny pfiedev ím pro odbornou vefiejnost a management zdravotnictví. JelikoÏ portál SVOD bude samostatnû pfiedstaven v jiném ãlánku tohoto vydání ãasopisu Klinická onkologie, v dal ích ãástech této práce pfiedstavíme pfiedev ím funkãnost nové verze analytického software SVOD. Kdo a jak jej mûïe získat analytick systém SVOD Na úvod této kapitoly je nutné zdûraznit, Ïe software SVOD i jeho analytické v stupy jsou neprodejné. V echna autorská a distribuãní práva vztahující se k tomuto systému jsou drïena Masarykovou univerzitou a níïe uvedená omezení pro zvefiejàování urãit ch v stupû jsou v sledkem shody autorského kolektivu, odborníkû ministerstva zdravotnictví âr (ÚZIS) a V boru âeské onkologické spoleãnosti JEP. Dostupnost komponent a v stupû systému SVOD je moïné shrnout v následujících bodech: 1. Web portál SVOD je volnû dostupn na adrese Zde je moïno získat pfiehled o v ech epidemiologick ch charakteristikách v ech maligních diagnóz v âr za období , detailní diagnostickou charakteristiku novû hlá en ch zhoubn ch nádorû, KLINICKÁ ONKOLOGIE 20 SUPPLEMENT 1/

5 stratifikaci epidemiologick ch dat dle regionû âr a dle základních charakteristik pacienta a nemoci. UÏivatel mûïe diskutovat s odborn mi správci portálu, mûïe zadávat podnûty i autorské návrhy na vylep ení v stupû nebo navrhovat v stupy nové. Systém je z tohoto pohledu zcela otevfien. Web portál bude dále aktualizován tak, jak budou k dispozici nová populaãní data. 2. Lokální analytick systém SVOD obsahuje v epidemiologické ãásti stejné anal zy a nástroje jako web portál SVOD, pfiidanou hodnotou zde tedy je moïnost pracovat i s klinick mi záznamy NOR. Tento software není volnû distribuován a je k dispozici pouze odborné vefiejnosti: UÏivatel musí zaïádat o poskytnutí akademické licence k uïívání software SVOD. Îádost je moïné smûfiovat buì na adresu hlavního koordinátora projektu (dusek@iba.muni.cz) nebo se pfiihlásit pfies webové stránky (sekce software SVOD ). Îádost musí obsahovat struãné zdûvodnûní jaká data a k jakému úãelu budou analyzována. K Ïádostem se vyjadfiuje oficiálnû jmenovaná odborná rada projektu SVOD. Po podpisu licenãní smlouvy s Masarykovou univerzitou, kde se uïivatel zaváïe k respektování autorsk ch práv a odsouhlasí pfiedepsan reïim práce s daty, bude uïivateli pfiipravena kopie SW SVOD i s poïadovan m exportem ãásti anonymizované databáze NOR. Seznam licenãních smluv i se zdûvodnûním jejich poskytnutí schvaluje odborná rada projektu SVOD, ve které je zapojeno více neï 20 pfiedních onkologû a odborníkû na populaãní anal zy. Doba trvání licenãní smlouvy mûïe b t upravena podle konkrétních poïadavkû a projektû. Takto se SW SVOD stává dostupn m i pro v zkumné projekty. Licence na uïívání SW a rovnûï i poïadovaná data a v stupy jsou poskytovány zdarma, uïivatel hradí pouze manipulaãní poplatek Masarykovû univerzitû. Lokální instalace SVOD touto cestou nemá smysl, pokud je zamûfiena pouze na anal zu epidemiologick ch dat tato jsou plnû dostupná na portálu Touto formou mohou b t zpfiístupnûna jakákoli data NOR kromû: - osobních údajû pacientû (nejsou v systému SVOD zahrnuty), - dat a kódû identifikujících zdravotnická zafiízení âr není tedy zpfiístupnûna srovnávací anal za konkrétních zdravotnick ch zafiízení; uïivatel, kter poïádal o odtajnûní kódu svého zdravotnického zafiízení nicménû mûïe srovnávat svá data proti populaãním v stupûm, - dat o pfieïití pacientû ve vazbû na konkrétní zdravotnická zafiízení. 3. Zpravodajství systému SVOD je vyvíjeno pfiedev ím pro vedoucí a odborné garanty komplexních onkologick ch center âr. Podle jejich rozhodnutí budou vybrané kapitoly zvefiejnûny na portálu UÏivatelé systému SVOD mohou nicménû podávat podnûty a poïadavky ke zpracování urãit ch populaãních v stupû: Specifikovan podnût nebo námût na jednání lze podat buì pfiímo na adresu hlavního koordinátora projektu (dusek@iba.muni.cz) nebo pfies webov portál SVOD ( Pfiednost ve zpracování dat mají poïadavky komplexních onkologick ch center a obecnû poïadavky ãlenû âeské onkologické spoleãnosti JEP. V pfiípadû kumulace velkého mnoïství poïadavkû rozhoduje o pofiadí a prioritách hlavní koordinátor projektu po poradû s odbornou radou projektu SVOD. Touto formou lze poïadovat i zpracování populaãních dat o celkovém pfieïití pacientû, vïdy v ak pouze pro danou jednotku (region, zdravotnické zafiízení) ve srovnání s populaãní referencí. Vzájemná srovnání konkrétních zdravotnick ch zafiízení nejsou moïná. Zvlá tní pozornost je vûnována anal zám poïadovan m vedením zdravotnick ch zafiízení a odborn mi zdravotnick mi pracovníky státní správy (krajské úfiady, ministerstvo, apod.). Funkãnost analytického systému SVOD v nové verzi Analytick systém SVOD je sloïen z nûkolika analytick ch a prezentaãních modulû, které uïivatel ovládá pfies jediné pracovní okno. Souãástí systému je i originální reportovací systém umoïàující automatizovanou tvorbu tematicky zamûfien ch anal z. Demo verzi a detailní popis systému je moïné rovnûï nalézt na adrese (sekce Software SVOD ). Základní popis komponent systému obsahuje Tabulka 2. Technologické zázemí analytického systému SVOD PouÏit programovací jazyk. Program SVOD je napsán v programovacím prostfiedí Microsoft Visual C++. Jako základ programu je pouïita objektová knihovna WTL (Windows Template Library). Komunikaãní protokoly. Program SVOD pouïívá ke komunikaci s databázov m strojem univerzální rozhraní SQL (Standardní dotazovací jazyk). Tento jazyk vyuïívá vût ina souãasn ch databázov ch strojû. To umoïàuje pouïít program SVOD jako univerzálního klienta, kter se mûïe napojit jak k lokálním datûm na pevném disku tak i ke vzdálené databázi na centrálním serveru. NiÏ í vrstva, na které jazyk SQL komunikuje z databázov m strojem, je OLEDB. Technologie OLEDB umoïàuje vyuïívat komunikaãního protokolu TCP/IP, coï zaji Èuje otevfienost celého systému. PouÏité databázové prostfiedí. Lokální databáze systému SVOD je umístûna v databázovém souboru typu Microsoft Access verze 97. K tomuto souboru pfiistupuje program SVOD pfies technologii OLEDB pomocí dotazû v SQL jazyce. Databáze typu Microsoft Access byla vybrána z dûvodu dostateãnû vysokého v konu a jednoduchosti pfiístupu ke zdrojov m datûm. Systémové poïadavky: - osobní poãítaã s my í, procesor minimálnû Pentium (doporuãujeme Pentium III) - minimálnû 32 MB RAM (doporuãujeme 128 MB) MB na pevném disku pro program, archiv datov ch souborû diagnóz a pracovní prostor pro provedení anal z - rozli ení obrazovky minimálnû 800x600/16 tis. barev (optimalizováno na 1024x768/16 tis. barev) - operaãní systém MS Windows 95, 98, NT, 2000 nebo XP 100 KLINICKÁ ONKOLOGIE 20 SUPPLEMENT 1/2007

6 Tabulka 2. Základní komponenty analytického systému SVOD a jejich funkce Komponenta (modul) Struãn popis Tfiídící panel diagnóz Analytick systém COBRA COBRA: ProhlíÏeã dat COBRA: Analytick modul COBRA: Prezentaãní modul Editor mapov ch v stupû NejuÏívanûj í anal zy Editor grafick ch v stupû Vstup na web portál SVOD Vstupní panel obsahující kompletní pfiehled diagnóz zhoubn ch nádorû vãetnû moïného tfiídûní dle lokalizace. Panel umoïàuje pfiepínat diagnostické skupiny v prûbûhu práce se systémem. COBRA ( Comprehensive data browser ) je integrovan analytick software sdruïující prohlíïeã dat, analytick modul a prezentaãní modul. Tyto nástroje umoïàují uïivateli anal zu i velmi rozsáhl ch dat bez poïadavkû na analytické nebo statistické vzdûlání. COBRA je originálním produktem projektu SVOD. Samostatn modul umoïàující pfiím pfiístup ke v em parametrûm analyzovaného úseku databáze (databází). Modul nabízí voln v bûr kohorty pacientû, základní statistické sumarizace a jejich realizaci ve formû tabulek nebo grafû. UÏivatel mûïe rovnûï zvolen parametr tfiídit podle vybran ch kritérií. Systém automaticky rozli uje typ zvolené promûnné a poãítá adekvátní sumární statistiky. Ukázky v stupû z tohoto modulu jsou na Obrázku 1. Systém tématicky tfiídûn ch anal z, ve kter ch uïivatel pomocí jediného ovládacího okna vybírá kohortu pacientû a tfiídící faktory. Jednodu e získává v stupy ve formû grafu nebo tabulky. Seznam tûchto anal z není koneãn a mûïe b t roz ifiován. Ovládací panel a pfiíklady v stupû jsou na Obrázku 2. Seznam jiï vytvofien ch anal z je struãnû popsán v Tabulce 3. Nejkomplexnûj í nástroj systému COBRA slouïící k vytváfiení souvisl ch prezentací z dat analyzovan ch databází. V stupem je prezentace sloïená z mnoha grafû a tabulek, které lze pfiímo promítat. V hodou ov em je, Ïe jde o automatizovanû generovan v stup a celá prezentace je tak automaticky aktualizována pfii zmûnû primárních dat. Tento nástroj je rovnûï moïné vyuïívat k edukaci. Ukázky z v stupû tohoto modulu jsou na Obrázku 3. Grafick a datov prvek umoïàující práci s mapou âeské republiky a v stupy anal z v regionálním tfiídûní. Tyto nástroje jsou jednak implementovány ve v bûru kohorty pacientû a dále v grafick ch v stupech. Ukázky tûchto nástrojû jsou na Obrázku 4. UÏivatel mûïe definovat nejãastûj í anal zy a umístit je na hlavní pracovní plo e software. V echny grafické v stupy jsou plnû editovatelné a exportovatelné v bûïn ch formátech. UÏivatel má moïnost generovat z grafického v stupu primární data v podobû tabulky. Software SVOD je pfiímo propojen s webov m portálem SVOD ( UÏivatel tak mûïe kombinovat anal zy z obou zdrojû nebo pfiípadnû ovûfiovat své v stupy v komunikaci se správcem systému. Tabulka 3. Komentovan pfiehled automatizovan ch anal z v systému SVOD (viz téï Obr. 3) EPIDEMIOLOGIE Epidemiologie: incidence a mortalita v voj incidence a mortality v ãase (absolutní poãty, hrubá incidence nebo mortalita (pfiepoãet na osob), ASR(W) vûkovû standardizovaná incidence nebo mortalita svûtov standard, ASR(E) vûkovû standardizovaná incidence nebo mortalita evropsk standard) Epidemiologie: zmûny v ãase zmûny ve v voji incidence a mortality v ãase (index rûstu ke zvolenému roku, meziroãní zmûny absolutní hodnoty nebo %) Vûková struktura populace pacientû vûková struktura pacientû nebo zemfiel ch na diagnózu (absolutní poãty, podíl (%) 5let ch vûkov ch kategorií, vûkovû specifická incidence nebo mortalita pfiepoãet na osob ve vûkov ch kategoriích) Vûkovû specifické anal zy v ãase v voj vûkovû specifické incidence nebo mortality (poãet pfiípadû na osob ve vûkové kategorii) v ãase Zastoupení klinick ch stadií zastoupení klinick ch stadií v ãase (absolutní poãty, pfiepoãet na osob, zastoupení stadií (%)) Demografické údaje prohlíïení databáze demografick ch údajû (ãasov v voj poãtu obyvatel, vûková struktura populace s moïností srovnání s vûkovou strukturou pacientû) Data okresû tabulka incidence zhoubn ch novotvarû pro vybran okres po jednotliv ch letech (poãet obyvatel, absolutní poãet pfiípadû, poãet pfiípadû na osob, ASR(E) a 95% interval spolehlivosti, ASR(W) a 95% interval spolehlivosti, SIR a 95% interval spolehlivosti) KLINICKÁ ONKOLOGIE 20 SUPPLEMENT 1/

7 SROVNÁVACÍ ANAL ZY srovnání epidemiologick ch parametrû kraje s referenãním standardem tvofien m uïivatelem zvolenou skupinou krajû (v echny nebo pouze vybrané kraje); hodnota kraje je srovnávána se stfiední hodnotou a s hraniãními hodnotami zvoleného standardu Srovnávací anal za - epidemiologie Srovnávací anal za - vûková struktura Srovnávací anal za - pfieïití Srovnání krajû v mapách srovnání formou ãasové fiady nebo sumárnû za urãité ãasové období (hrubá incidence nebo mortalita, ASR(W), ASR(E)) vûková struktura pacientû v kraji ve srovnání s vûkovou strukturou srovnávacího standardu (vûkovû specifická incidence nebo mortalita, vûková struktura - podíl (%) 5let ch vûkov ch kategorií) kfiivky pfieïití dle Kaplana a Meiera srovnání kfiivky pfieïití vybraného kraje proti kfiivce pfieïití za celou âr; srovnání kfiivky pfieïití vybraného kraje proti kfiivkám pfie- Ïití srovnávacího standardu (nevût í a nejmen í medián pfieïití) srovnání krajû nebo okresû v mapû nebo sloupcovém grafu (hrubá incidence nebo mortalita, ASR(W), ASR(E)) ZDRAVOTNICK MANAGEMENT Diagnostika - aplikace v ãase Léãba - aplikace v ãase Diagnostika - vûkovû spec. v voj Léãba - vûkovû spec. v voj Diagnostika - kombinace metod Léãba - kombinace metod Diagnostika - kombinace metod (graf) Léãba - kombinace metod (graf) v voj aplikace diagnostick ch metod v ãase (absolutní poãty pacientû, podíl pacientû, u nichï byla aplikována daná diagnostická metoda nebo kombinace metod) v voj aplikace léãebn ch metody v ãase (absolutní poãty pacientû, podíl pacientû, u nichï byla aplikována daná léãebná metoda nebo kombinace metod) aplikace diagnostick ch metod dle vûku pacientû (absolutní poãty pacientû 5let ch vûkov ch kategoriích, vûková struktura pacientû diagnostikovan ch danou metodou, podíl pacientû ve vûkové kategorii, ktefií byli diagnostikováni danou metodou) aplikace léãebn ch metod dle vûku pacientû (absolutní poãty pacientû v 5let ch vûkov ch kategoriích, vûková struktura pacientû léãen ch danou metodou, podíl pacientû ve vûkové kategorii, ktefií byli léãeni danou metodou) kombinace diagnostick ch metod, které byly aplikovány u pacientû tabulka hodnot (poãet a % pacientû s jednotliv mi kombinacemi) kombinace léãebn ch metod, které byly aplikovány u pacientû tabulka hodnot (poãet a % pacientû s jednotliv mi kombinacemi) zastoupení pacientû se zvolenou kombinací diagnostick ch metod (% pacientû diagnostikovan ch vybranou kombinací metod, % pacientû diagnostikovan ch pouze nûkter mi metodami z vybrané kombinace, % diagnostikovan ch jin mi metodami) zastoupení pacientû se zvolenou kombinací léãebn ch metod (% pacientû léãen ch vybranou kombinací metod, % pacientû léãen ch pouze nûkter mi metodami z vybrané kombinace, % léãen ch jin mi metodami) Tabulka 4. Obsah regionálního zpravodajství epidemiologie zhoubn ch nádorû Základní ãást zpravodajství: I. Demografická charakteristika regionu Velikost populace poãty osob v kraji a v âr v roce 2003, zastoupení muïû a Ïen Vûková struktura populace poãty osob ve vûkov ch kategoriích v roce 2003, srovnání vûkové struktury muïû a Ïen v kraji a v âr Trendy v voje populace v voj poãtu obyvatel v kraji a v âr v období , v voj podílu kraje na celkové populaci âr, v voj vûkové struktury populace kraje a âr II. Mortalita v regionu Poãty zemfiel ch úmrtí muïû a Ïen v roce 2003 poãty a pfiepoãet na osob v kraji a v âr, podíl kraje na celkové mortalitû v âr Vûková struktura zemfiel ch poãty zemfiel ch muïû a Ïen a pfiepoãet na osob ve vûkov ch kategoriích v kraji a v âr v roce 2003 Trendy v voje v voj poãtu zemfiel ch na osob u muïû a Ïen v kraji a v âr od roku 1991, v voj poãtu zemfiel ch na osob ve vûkov ch kategoriích v kraji a v âr 102 KLINICKÁ ONKOLOGIE 20 SUPPLEMENT 1/2007

8 Pfiíãiny úmrtí podíl (%) pfiíãin úmrtí na celkové mortalitû v kraji a v âr v roce 2003, podíl pfiíãin úmrtí ve vûkov ch kategoriích v kraji a v âr Mortalita nádorov ch onemocnûní mortalita diagnóz nádorov ch onemocnûní v kraji a v âr v období poãty, pfiepoãet na osob, podíl (%) diagnóz v rámci nádorov ch onemocnûní; poãet zemfiel ch na diagnózy na osob u muïû a Ïen v období v kraji a v âr Trendy mortality zhoubn ch novotvarû v voj mortality diagnóz v období poãty, pfiepoãet na osob a vûkovû standardizovan poãet (svûtov standard); srovnání v voje v kraji a v âr; srovnání krajû za období mapa a graf zpracováno pro diagnózy C00 D48, C18 C21, C33+C34, C16, C25, C23+C24, C64 C66+C68, C50, C61 III. IV. Epidemiologie zhoubn ch nádorû v regionu Incidence diagnóz nádorov ch onemocnûní incidence diagnóz nádorov ch onemocnûní v kraji a v âr v období poãty, pfiepoãet na osob, podíl (%) diagnóz v rámci nádorov ch onemocnûní; poãet na osob u muïû a Ïen v období v kraji a v âr Trendy incidence diagnóz nádorov ch onemocnûní v voj incidence diagnóz v období poãty, pfiepoãet na osob a vûkovû standardizovan poãet (svûtov standard); srovnání v voje v kraji a v âr; srovnání krajû za období mapa a graf zpracováno pro diagnózy C00 C97 bez C44, C18 C21, C33+C34, C43, C50, C54+C55, C56, C61, C62, C64 C66+C68 Srovnání s mezinárodními daty srovnání incidence C00 C97 bez C44 u muïû a Ïen v kraji, âr a zemích Evropy (vûkovû standardizovan poãet svûtov standard) stav k roku 2002 Vûková struktura pacientû s nádorov m onemocnûním poãty ve vûkov ch kategoriích, pfiepoãet na osob ve vûkov ch kategoriích a zastoupení (%) vûkov ch kategorií v období zpracováno pro diagnózy C00 C97 bez C44, C18 C21, C33+C34, C43, C50, C54+C55, C56, C61, C62, C64 C66+C68 Prevalence nádorov ch onemocnûní poãty Ïijících pacientû s diagnózami nádorov ch onemocnûním v kraji a v âr, pfiepoãet na osob a podíl (%) jednotliv ch diagnóz v roce 2003; poãet Ïijících pacientû s diagnózami na osob u muïû a Ïen v roce 2003 v kraji a v âr; vûková struktura Ïijících pacientû s diagnózou C00 C97 bez C44 Diagnostika zhoubn ch nádorû a celková léãebná zátûï regionu Diagnostika pacientû v regionu podíl pacientû se stanovenou TNM klasifikací a klinick m stadiem, podíl neuveden ch stadií v kategoriích dle dûvodu neuvedení TNM klasifikace - srovnání kraje a âr v obdobích , , Stanovení klinického stadia pacientû v období klinická stadia diagnóz poãet a podíl (%) v kraji a v âr; srovnání kraje s celkovou situací v âr u diagnóz C18 C21, C33+C34, C43, C50, C54+C55, C56, C61, C62, C64-C66+C68 Trendy stanovení klinick ch stadií v voj zastoupení klinick ch stadií v období podíl (%) a poãet na osob zpracováno pro diagnózy C18 C21, C33+C34, C43, C50, C54+C55, C56, C61, C62, C64 C66+C68 Léãebná zátûï regionu zastoupení pacientû s protinádorovou léãbou a bez protinádorové léãby v kraji a v âr v období V. Pozice komplexního onkologického centra v regionu Pozice KOC v regionu struktura KOC/KOS Pacienti KOC poãty a podíl (%) diagnóz, zastoupení muïû a Ïen, vûková struktura, okres trvalého bydli tû pacientû Pacienti mimo KOC pacienti kraje léãení mimo KOC/KOS poãty a podíl (%) diagnóz, zastoupení muïû a Ïen, vûková struktura, okres trvalého bydli tû pacientû VI. V znamné trendy v epidemiologii nádorû âr a v regionu vybrané trendy: v voj záchytu ãasn ch a pokroãil ch klinick ch stadií nádoru prsu (C50), v voj incidence nádorû plic (C33+C34) u muïû a Ïen, v voj incidence nádorû Ïaludku (C16) u muïû a Ïen, v voj podílu pacientû s protinádorovou léãbou srovnání kraje a âr Speciální ãást zpravodajství: DoplÀující anal zy dle individuálních potfieb uïivatelû. KLINICKÁ ONKOLOGIE 20 SUPPLEMENT 1/

9 Obrázek 1. Ukázka v stupû ProhlíÏeãe dat v systému SVOD 104 KLINICKÁ ONKOLOGIE 20 SUPPLEMENT 1/2007

10 Obrázek 2. Ukázka v stupû Analytického modulu v systému SVOD KLINICKÁ ONKOLOGIE 20 SUPPLEMENT 1/

11 Obrázek 3. Ukázka v stupu Prezentaãního modulu v systému SVOD 106 KLINICKÁ ONKOLOGIE 20 SUPPLEMENT 1/2007

12 Obrázek 4. Ukázka mapov ch v stupû v systému SVOD Obrázek 5. Ukázka z regionálního zpravodajství epidemiologie zhoubn ch nádorû srovnání kraje a âeské republiky KLINICKÁ ONKOLOGIE 20 SUPPLEMENT 1/

13 Zpravodajství systému SVOD poskytuje anal zy na míru Autorsk t m projektu SVOD nabízí i pfiímé provedení anal z pro koncového uïivatele. Takto vzniklo tzv. regionální zpravodajství SVOD jako sumarizace populaãních epidemiologick ch i klinick ch dat NOR pro potfieby regionû a komplexních onkologick ch center. Tyto anal zy kombinují v znamné zdroje populaãních dat s cílem zmapovat epidemiologickou situaci v regionech âr a její dopad na chod zdravotnick ch zafiízení. VyuÏíván je pfiedev ím Národní onkologick registr, dále pak databáze zemfiel ch âr a demografická data o populaci âr. Pro dal í verze tûchto anal z je plánováno vyuïití i environmentálních databází a informaãních systémû z biomonitorngu Ïivotního prostfiedí. Obsah regionálního zpravodajství je uveden v pfiehledové Tabulce 4 a ukázka v stupû vztahujících urãit region k referenãním datûm âr je uvedena na Obrázku 5. Budoucnost systému SVOD Dosavadní v voj systému jasnû ukazuje perspektivy online pracujícího software. Z tohoto dûvodu bude analyticky v znamnû posilován pfiedev ím webov portál SVOD ( a lokální analytick software zûstane jako nástroj pro podrobné anal zy odborné vefiejnosti. V dal ích verzích webového portálu SVOD tak uïivatelé najdou i rozsáhlej í analytické v stupy pfiipravené formou automaticky generovan ch prezentací. Vysokou prioritou bude rovnûï pfiíprava zahraniãních v stupû, které by mûly zv it prestiï projektu a Národního onkologického registru âr. Literatura Du ek L., Pavli P., Îaloudík J., Koptíková J., MuÏík J., Vyzula R. SVOD - systém pro vizualizaci onkologick ch dat: verze 6.0. [Poãítaãov software]. Masarykova univerzita Du ek L., MuÏík J., Kubásek M., Koptíková J., Îaloudík J., Vyzula R. âesk národní webov portál epidemiologie nádorû [online]. Masarykova univerzita, [2005], [cit ]. Dostupn z WWW: KLINICKÁ ONKOLOGIE 20 SUPPLEMENT 1/2007