Polychromatická cytometrie - setup experimentu
|
|
- Dušan Zeman
- před 6 lety
- Počet zobrazení:
Transkript
1 Polychromatická cytometrie - setup experimentu
2 Polychromatická cytometrie - setup experimentu Cíl: Najít nejlepší kompromis Hladina exprese Intenzita fluorochromu Četnost subsetu buněk Kvalitativní x kvantitativní Kompenzační spread Dostupnost reagencií
3 Polychromatická cytometrie - setup experimentu Kostra definující znaky, méně časté fluo, i custom konjugace vhodná vyplatí se investovat do optimalizace Další znaky alterace podle experimentu, obvyklejší fluo ROZMYSLET SI GATING!!
4 7 -KOMBI Citlivost fluo: Spillover fluo: Pacific Blue FITC PE PerCP PE- D747 APC A700 CD14 CD3 16/56 CD45 CD4 CD19 CD8
5 7 KOMBI gating 1 FS Lin: FS 30K 20K 10K K 20K 30K SS Lin: SS FL 6 Log: CD14-Pacific Blue GRAN MONO 3.82 LYMFOcyty <FL 4 Log>: CD45-Per-CP
6 7 KOMBI gating 2 FS Lin: FS 30K 20K 10K FL 6 Log: CD14-Pacific Blue K 20K 30K SS Lin: SS <FL 4 Log>: CD45-Per-CP
7 7 KOMBI gating 3 Lymfo: Lymfo: CD3+: <FL 1 Log>: CD3-FITC <FL 1 Log>: CD3-FITC NK 17.3 <FL 5 Log>: CD4-PE-Dy <FL 8 Log>: CD19-APC <FL 2 Log>: CD16\CD56-PE <FL 9 Log>: CD8-Alexa 700
8 FMO příklad Test FMO (minus Alexa700) Gate podle FMO <FL 1 Log>: CD3-FITC <FL 1 Log>: CD3-FITC <FL 1 Log>: CD3-FITC <FL 9 Log>: CD8-Alexa <FL 9 Log>: NIC-Alexa <FL 9 Log>: CD8-Alexa 700
9 GRAN Multigraph 14+ MONO Overlay LYMFOcyty LYMFOcyty/3+ LYMFOcyty/3+/4+ LYMFOcyty/3+/4+8+ LYMFOcyty/3+/8+ LYMFOcyty/3+/DN LYMFOcyty/3+8+ LYMFOcyty/3-8+ LYMFOcyty/19+ LYMFOcyty/Boolean Gate LYMFOcyty/NK FS Lin: FS <FL 1 Log>: CD3-FITC <FL 8 Log>: CD19-APC SS Lin: SS <FL 2 Log>: CD16\CD56-PE <FL 2 Log>: CD16\CD56-PE <FL 5 Log>: CD4-PE-Dy747 <FL 4 Log>: CD45-Per-CP FL 6 Log: CD14-Pacific Blue <FL 9 Log>: CD8-Alexa 700 <FL 8 Log>: CD19-APC <FL 5 Log>: CD4-PE-Dy747
10 FMO kontroly Pacific Blue FITC PE PerCP PE- D747 APC A700 CD14 CD3 16/56 CD45 CD4 CD19 CD8 FMO / FMO 2 FMO 3 FMO 4 FMO 5 FMO 6 FMO /56 16/56 16/56 16/56 16/56 16/
11 FMO kontroly 2 Pacific Blue FITC PE PerCP PE- D747 APC A700 B2 CD14 CD3 16/56 CD45 CD4 CD19 CD8 FMO / FMO / FMO / FMO / FMO /
12 Zkreslení
13 Zkreslení vlivem kompenzací Nekomp, gate CD3+ lymfo CD8 Správně komp, gate lymfo Nature Medicine: Objev nové populace lymfocytů!!!!!!!!!!!! Nekomp, gate lymfo, single stain CD8
14 Zkreslení vlivem kompenzací
15 Zkreslení vlivem kompenzací
16 Zkreslení vlivem kompenzací FITC Přesvit (spilover, spectral overlap) z PE do FITC je malý = malá kompenzace MALÉ ZKRESLENÍ z PE do PE-TxRed je velký = velká komp. VELKÉ ZKRESLENÍ PRO GATING - FMO KONTROLY PE PE-TxRed PE PE-TxRed PE = 65%
17 Zkreslení vlivem kompenzací Je třeba promyslet odkud se dívat Obvyklé problémy: PE vs PE-TxRed, PE-Cy5 vs APC Nelze použít vždy histogram Nelze vždy použít čtverce či kvadranty Je třeba promyslet jak postavit gate (kontroly FMO) V silně komp. kanálech je menší rozlišení a horší kvantifikace
18 Design experimentu Na interpretaci dat myslet PŘEDEM Bez správných kontrol někdy interpretovat nelze Jak naložit se zkreslením komp. dat? Sestavit design experimentu tak, aby se předešlo potížím při analýze
19 Jak naložit se zkreslením? PE PE-TxRed donor akceptor Na donor pozitivních buňkách se akceptor pozitivní znak nevyskytuje/nehodnotí CD8 PE-TxRed CD4 PE u CD4 PE pos. buněk CD8 PE-TxRed není
20 10000 <FL 9 Log>: CD8-Alexa <FL 8 Log>: CD19-APC
21 Jak naložit se zkreslením? PE PE-TxRed donor akceptor PE-TxRed CD3 PE znak s nízkou int. do PE Nižší intenzita donoru = nižší rozptyl akceptoru
22 10000 <FL 9 Log>: CD8-Alexa <FL 8 Log>: CD19-APC
23 Jak naložit se zkreslením? PE PE-TxRed donor akceptor CD3 PE-TxRed CD4 PE Jen kvalitativní znak do PE-TxRed
24 Vizualizace digitálních dat
25 Vizualizace digitálních dat Dva ploty z téhot hož vzorku, CD3+ gate na lymfocyty Najdi rozdíly
26 Kompenzace PMT a % kompenzace Median fluo intensity PMT 550 PMT 600 PMT 650 PMT 700 CD19 APC CD19 neg Ratio Vzájemný poměr r PMT (zde APC vs APC-Cy7) Cy7) - změní % kompenzace - NEZLEPŠÍ rozlišen ení APC channel Compensation PMT 550 PMT 600 PMT 650 PMT 700 APCCy7 - APC ,7 3,4 APC - APCCy7 8,1 15, APC spillover to APC-Cy7 APC-Cy7 spillover to APC
27 Herzenberg, L. A., J. Tung, et al. (2006). "Interpreting flow cytometry data: a guide for the perplexed." Nat Immunol 7(7): Vizualizace digitálních dat Další názvy: Log-lineární transformace Logicle display Biexponential (DiVa) VisiComp (Summit 4,3)
28 Post-akviziční (off-line) kompenzace Výhody: méně stresu, bez rizika neřešiteln itelné over-komp komp, umožní LOGICLE display (i na analogových systémech) Neýhody: Data nejsou kompenzovaná při i měřm ěření, nelze dobře e vizuáln lně kontrolovat Podmínky: Kompenzační kontroly Single stained tubes Vhodný analyzační software: DiVa,, Summit, FlowJo
29 Digital: FACS Aria, BD LSR2 FACS Canto Cyan ADP Změna kompenzace po akvizici Analog vs digital Analog vs digital Analog: FACS Sort FACS Calibur FACS Vantage Kompenzace je přišitá
30 Zpracování signálu je jiné Kompenzovaná data v analogových systémech nemají NULU ani záporné hodnoty digitálních systémech mohou jít i do záporných hodnot
Standardizace v průtokové cytometrii. Hana Glier, Martin Špryngar Konference Analytická cytometrie VII Mikulov, 2013
Standardizace v průtokové cytometrii Hana Glier, Martin Špryngar Konference Analytická cytometrie VII Mikulov, 2013 Osnova 1. Standardizace měření - co a proč standardizovat 2. Platforma BD CS&T modul
Principy a instrumentace
Průtoková cytometrie Principy a instrumentace Ing. Antonín Hlaváček Úvod Průtoková cytometrie je moderní laboratorní metoda měření a analýza fyzikálních -chemických vlastností buňky během průchodu laserovým
Nastavení metod pro imunofenotypizaci krevních. EXBIO Praha, a.s.
Nastavení metod pro imunofenotypizaci krevních buněk pomocí průtokové cytometrie Martin Špryngar EXBIO Praha, a.s. Obsah: Porovnání vícebarevné vs. dvoubarevné cytometrie Požadavky průtokové cytometrie
Imunofenotypizace leukemií z kostní dřeně, periferní krve, výpotku a mozkomíšního moku průtokovou cytometrií
Imunofenotypizace leukemií z kostní dřeně, periferní krve, výpotku a mozkomíšního moku průtokovou cytometrií 1) Použití validovaných kitů od výrobce značka CE/IVD 2) Home made metoda s vlastní (laboratoří
Polychromatická cytometrie v hemato-onkologii
Polychromatická cytometrie v hemato-onkologii Tomáš Kalina, Ester Mejstříková, Ondřej Hrušák Klinika dětské hematologie a onkologie Univerzita Karlova, 2. LF a FN Motol - cytometrie http://clip.lf2.cuni.cz
Vícebarevná průtoková cytometrie v klinice
Vícebarevná průtoková cytometrie v klinice EXBIO seminář 21.5.2014 Miroslav Benko EXBIO Praha a.s. Nad Safinou II Vestec Vícebarevná průtoková cytometrie v klinice EXBIO seminář 21.5.2014 Miroslav Benko
METODY VYŠETŘOVÁNÍ BUNĚČNÉ IMUNITY. Veřejné zdravotnictví
METODY VYŠETŘOVÁNÍ BUNĚČNÉ IMUNITY Veřejné zdravotnictví METODY VYŠETŘOVÁNÍ BUNĚČNÉ IMUNITY průtoková cytometrie metody stanovení funkční aktivity lymfocytů testy fagocytárních funkcí Průtoková cytometrie
HLA B27: molekulární marker Ankylozující spondylitidy. Peter Novota. 16.2.2016, Praha
HLA B27: molekulární marker Ankylozující spondylitidy Peter Novota 16.2.2016, Praha HLA B součást MHC komplexu HLA I. třídy (chromosom 6) úsek značně polymorfní antigeny se vyskytují na povrchu buněk podílí
Průtoková cytometrie
Průtoková cytometrie Princip průtokové cytometrie Použití více fluorescenčních barev - teorie kompenzace Možnosti analýzy dat Některé aplikace průtokové cytometrie Imunologické laboratorní metody 20.4.2009
DODATEČNÉ INFORMACE dle 49 zákona č. 137/2006 Sb., o veřejných zakázkách
DODATEČNÉ INFORMACE dle 49 zákona č. 137/2006 Sb., o veřejných zakázkách Zadavatel tímto poskytuje dodavatelům v souladu s 49 odst. 4 zákona o veřejných zakázkách dodatečné informace k veřejné zakázce
Intracelulární detekce Foxp3
Intracelulární detekce Foxp3 Ústav imunologie 2.LFUK a FN Motol Daniela Rožková, Jan Laštovička T regulační lymfocyty (Treg) Jsou definovány funkčně svou schopností potlačovat aktivaci a proliferaci CD4+
Ústav molekulární a translační medicíny LF UP - cytometry
ZADÁVACÍ DOKUMENTACE ve smyslu zákona č. 137/2006 Sb., ve znění pozdějších předpisů (dále jen zákon ) a v souladu s podmínkami pro zadávání veřejných zakázek v rámci Operačního programu Výzkum a vývoj
KAZUISTIKY V BUNĚČNÉ IMUNOLOGII. UŽIVATELSKÉ SETKÁNÍ PRŮTOKOVÉ CYTOMETRIE BECKMAN COULTER Ing. Pavla Plačková
KAZUISTIKY V BUNĚČNÉ IMUNOLOGII UŽIVATELSKÉ SETKÁNÍ PRŮTOKOVÉ CYTOMETRIE BECKMAN COULTER 13.-14. 5. 2018 Ing. Pavla Plačková IMUNITNÍ SYSTÉM udržování integrity organizmu obranyschopnost autotolerance
Aplikace průtokové cytometrie v klinické imunologii a hematologii
Aplikace průtokové cytometrie v klinické imunologii a hematologii Lukáš Kubala kubalal@ibp.cz Laboratoř patofyziologie volných radikálů BFÚ AV ČR Imunologie - Stanovení statusu imunitního systému Vrozené
Stanovení základních lymfocytárních populací -Příprava k akreditaci IVD metoda
Stanovení základních lymfocytárních populací -Příprava k akreditaci IVD metoda Mgr. Marcela Vlková, Ph.D; Mgr. Olga Tichá, Ph.D. Ústav klinické alergologie a imunologie, FNUSA, Brno RNDr. Veronika Kanderová,
laboratorní technologie
Průtoková cytometrie L. Roubalová Metoda průtokové cytometrie je v současné době považována za standardní metodu analýzy částic v suspenzi. Umožňuje kvalitativní a kvantitativní analýzu fyzikálních (optických)
FluoroSpheres Kód K0110
FluoroSpheres Kód K0110 6. vydání Kalibrační kuličky pro denní monitorování průtokového cytometru. Činidla obsažená v kitu lze použít pro 40 kalibrací. (108650-004) SSK0110CE_02/CZ/2015.12 p. 1/9 Obsah
Mnohobarevná cytometrie v klinické diagnostice
Mnohobarevná cytometrie v klinické diagnostice Mgr. Marcela Vlková, Ph.D. Ústav klinické imunologie a alergologie, FN u sv. Anny v Brně Průtoková cytometrie v klinické laboratoři Relativní a absolutní
Základy princip pr tokové cytometrie
Základy princip pr tokové cytometrie Flow Cytometry Flow cytometrie je technologický proces, který umož uje individuální stanovení fluorescence jednotlivých bun k. Tento proces umož uje stanovit tisíce
Flowcytometrie u MG. - zasedání pracovní skupiny. Lucie Kovářová a kol. OKH, FN Brno
Flowcytometrie u MG - zasedání pracovní skupiny Lucie Kovářová a kol. OKH, FN Brno 2/26 Program setkání Program setkání 1) Využití flow cytometrie u MG 2) Zkušenosti jednotlivých center - zhodnocení dotazníku
Ing. Martina Almáši, Ph.D. OKH-LEHABI FN Brno, Babákova myelomová skupina při Ústavu patologické fyziologie, LF MU, Brno
Zpracování a využití biologického materiálu pro výzkumné účely od nemocných s monoklonální gamapatií Ing. Martina Almáši, Ph.D. OKH-LEHABI FN Brno, Babákova myelomová skupina při Ústavu patologické fyziologie,
Principles of Flow Cytometry. Tomáš Kalina MOTOLSKÝ MINIKURZ CYTOMETRIE
Principles of Flow Cytometry Tomáš Kalina MOTOLSKÝ MINIKURZ CYTOMETRIE Basics of Flow Cytometry Fluidics Optics Electronics Cells in suspension flow in single-file through an illuminated volume where they
Jana Nechvátalová Fakultní nemocnice u sv. Anny v Brně
Průtoková cytometrie a stanovení lymfocytárních subpopulací Jana Nechvátalová Fakultní nemocnice u sv. Anny v Brně Cluster Designation (Cluster of Differentiation) buňky exprimují ( vystavují) na svém
Stanovení PNH klonů průtokovou cytometrií
Stanovení PNH klonů průtokovou cytometrií Iuri Marinov, ÚHKT, Praha Motolský minikurz - Praha, 2015 Přežití (%) Paroxysmální noční hemoglobinurie (PNH)- vzácné onemocnění s život ohrožujícími komplikacemi
Využití mnohobarevné průtokové cytometrie pro vyšetření lymfocytárních subpopulací Jana Nechvátalová
Využití mnohobarevné průtokové cytometrie pro vyšetření lymfocytárních subpopulací Jana Nechvátalová Ústav klinické imunologie a alergologie Fakultní nemocnice u sv. Anny v Brně PRIMÁRNÍ IMUNODEFICIENCE
Dodávka průtokového cytometru
ODŮVODNĚNÍ VEŘEJNÉ ZAKÁZKY DLE 156 ZÁKONA Č. 137/2006 SB., O VEŘEJNÝCH ZAKÁZKÁCH V SOULADU S VYHL. Č. 232/2012 SB., O PODROBNOSTECH ROZSAHU ODŮVODNĚNÍ ÚČELNOSTI VEŘEJNÉ ZAKÁZKY A ODŮVODNĚNÍ VEŘEJNÉ ZAKÁZKY
Marcela Vlková Jana Nechvátalová. FN u sv. Anny v Brně LF MU Brno
Marcela Vlková Jana Nechvátalová FN u sv. Anny v Brně LF MU Brno Leukocytární subpopulace CD45 CD45 Lymfocytární subpopulace Fenotypizace základní subpopulace T a B lymfocytů a NK buněk subpopulace základních
Průtoková cytometrie Flow Cytometry
Průtoková cytometrie Flow Cytometry PRŮTOKOVÁ CYTOMETRIE (fluorescenční metoda) Měření fyzikálně-chemických vlastností buněk během jejich průchodu laserovým paprskem Nejčastěji imunofenotypizace krevních
Nové metody v průtokové cytometrii. Vlas T., Holubová M., Lysák D., Panzner P.
Nové metody v průtokové cytometrii Vlas T., Holubová M., Lysák D., Panzner P. Průtoková cytometrie Analytická metoda využívající interakce částic a záření. Technika se vyvinula z počítačů částic Počítače
Aktivace lymfocytů v klinické laboratoři
Aktivace lymfocytů v klinické laboratoři Veronika Kanderová CLIP (Childhood Leukaemia Investigation Prague) - Cytometrie Klinika dětské hematologie a onkologie 2. LF UK a FN v Motole Disclaimer Přednáška
Intracelulární detekce cytokinů. http://www.biosite.se/viewglossary.aspx?id=93 Markéta Rodová Analytická cytometrie 2011 Cytokiny molekuly zapojené do procesu buněčné signalizace základní regulátory IS
Kupní smlouva. uzavřená dle ustanovení 2079 a násl. zákona č. 89/2012 Sb., občanského zákoníku, v platném znění
Kupní smlouva uzavřená dle ustanovení 2079 a násl. zákona č. 89/2012 Sb., občanského zákoníku, v platném znění Níže uvedeného dne, měsíce a roku uzavřeli: 1. Ústav molekulární genetiky AV ČR, v.v.i. se
Helena Langhansová. 30. listopadu 2011
VYUŽIT ITÍ PRŮTOKOV TOKOVÉ CYTOMETRIE V IMUNOLOGII Helena Langhansová 30. listopadu 2011 Projekt Vytvoření a rozvoj týmu zaměřeného na výzkum a výuku v oblasti medicínské biologie, reg. č. CZ.1.07/2.2.00/15.0361,
Pokročilé biofyzikální metody v experimentální biologii
Pokročilé biofyzikální metody v experimentální biologii Ctirad Hofr 1/1 Proč biofyzikální metody? Biofyzikální metody využívají fyzikální principy ke studiu biologických systémů Poskytují kvantitativní
Verze: 1.2 Datum poslední revize: 24.9.2014. Nastavení real-time PCR cykleru. Light Cycler 480 Instrument. (Roche) generi biotech
Verze: 1.2 Datum poslední revize: 24.9.2014 Nastavení real-time PCR cykleru Light Cycler 480 Instrument (Roche) generi biotech OBSAH 1. Nastavení teplotního profilu...3 1.1. Nastavení nového teplotního
Zajímavé kazuistiky z laboratoře
Zajímavé kazuistiky z laboratoře Kamila Kutějová a kol. Spadia Lab Setkání uživatelů Průtokové cytometrie Beckman Coulter květen 2016, Mikulov Myelom biklonální Pacientka 80 let, hematoonkol.ambulance
Funkční testy: BasoFlowEx Kit FagoFlowEx Kit
Mgr. Martin Čonka EXBIO Praha, a.s. Funkční testy: BasoFlowEx Kit FagoFlowEx Kit Funkční testy napodobení biologický procesů in vitro nehrozí nebezpečí ohrožení pacienta v průběhu testování možná analýza
Toolboxy analýzy a modelování stochastických systémů
Toolboxy analýzy a modelování stochastických systémů Ústav teorie informace a automatizace, AVČR Oddělen lení stochastické informatiky Petr Salaba Toolboxy analýzy a modelování stochastických systémů Projekt:
Proč a jak analyzovat minimální reziduální nemoc (MRN) u mnohočetného myelomu
Setkání uživatelů Průtokové cytometrie Beckman Coulter v Mikulově, 8.-10.5.2016 Proč a jak analyzovat minimální reziduální nemoc (MRN) u mnohočetného myelomu Říhová L, Všianská P, Bezděková R Oddělení
Praktický kurz Praktický kurz monitorování apoptózy a autofágie u nádorových prostatických buněk pomocí průtokové cytometrie
Laboratoř Metalomiky a Nanotechnologií Praktický kurz Praktický kurz monitorování apoptózy a autofágie u nádorových prostatických buněk pomocí průtokové cytometrie Nastavení průtokového cytometru a jeho
ONLINE BIOSENZORY PŘI HLEDÁNÍ KONTAMINACE PITNÉ VODY
ONLINE BIOSENZORY PŘI HLEDÁNÍ KONTAMINACE PITNÉ VODY Ing. Jana Zuzáková Ing. Jana Zuzáková, Doc. RNDr. Jana Říhová Ambrožová, PhD., Ing. Dana Vejmelková, PhD., Ing. Roman Effenberg, RNDr. Miroslav Ledvina
SIGRIST BactoSense Unikátní přenosný průtokový cytometr pro monitoring mikrobiologické kvality vody
SIGRIST BactoSense 1 Unikátní přenosný průtokový cytometr pro monitoring mikrobiologické kvality vody Revoluce v mikrobiologii 2 HPC (Heterotrophic plate count) KTJ (kultivovatelné mikroorganismy) FCM
Pavlína Tinavská Laboratoř imunologie, Nemocnice České Budějovice
Pavlína Tinavská Laboratoř imunologie, Nemocnice České Budějovice nízce agresivní lymfoproliferativní onemocnění základem je proliferace a akumulace klonálních maligně transformovaných vyzrálých B lymfocytů
Proč jsme zavedli cytometrické vyšetření uzlin. Tomáš Zajíc Oddělení klinické mikrobiologie a imunologie KNL a.s.
Proč jsme zavedli cytometrické vyšetření uzlin Tomáš Zajíc Oddělení klinické mikrobiologie a imunologie KNL a.s. Proč jsme zavedli cytometrické vyšetření uzlin? Protože nás o to požádali patologové Limitace
PRŮTOKOVÁ CYTOMETRIE. Princip a využití. Lucie Říhová OKH, FN Brno
PRŮTOKOVÁ CYTOMETRIE Princip a využití Lucie Říhová OKH, FN Brno Průtokový cytometr flow cytometrie (flow+cyto+metrie) specializovanější varianta fluorescenčního mikroskopu v kombinaci s krevním analyzátorem
ď ď ď š Ý š š É Ý šš š š š šš š š š š Ě š Ó ď šš š šš ď Ě šš š šš Ě š Ě Ě Ú š š š Ě š š ď Ě š š Ž š Ě š Č š Ý ď š š ď š Ý Ť š š š š š Ý š ď ď š š Á Á É š š š Ž šš ď ř ň ř ř š Ý ď š š š š š š Ť Ě š Ť š
Ý š é š ó š ž š žé ó Š é ď Ý é é ž é ž š ž Ť é š é é Ř š é ď é ž é ž é é ž Ť é ď é šš é ž é ž é ž ů ž ž é Ť Ť Ř š é ž ž ď Ú š é ž š š ž š é ž š é é š ž é ž é ž ů é ž é ž é Č é é ž š š é é Ř š ž Ž š é é
š Ý š š Ú ž ž š ž š š ž š Í š š ž š Ú ž ž ž šš ž ž ž šš ž ž š ž ž š š ž ž ž šš ž ň Č ž ž ž ž šš ž ž ž š š š ó š š ž š ž š ž Ú ž š ž š š Ú ň š š ó š ž š ž š Ž ň š š š š š š š ž š š ž š š š š š š š š š š
Metody zvýrazňování obrazu III. Vícepásmová zvýraznění. Spektrální příznaky. Příznakový prostor. Podstata vícepásmových zvýraznění
Podstata vícepásmových zvýraznění Metody zvýrazňování obrazu III Vícepásmová zvýraznění DN hodnoty jako příznaky a, tzv. příznakový prostor. Vytváření nových pásem s cílem zvýšit odlišení různých objektů
Cytometrické metody pro stanovení proliferace lymfocytů. RNDr. Jan Lašťovička, CSc. Ústav imunologie 2.LF UK a FN Motol
Cytometrické metody pro stanovení proliferace lymfocytů RNDr. Jan Lašťovička, CSc. Ústav imunologie 2.LF UK a FN Motol Funkční testy lymfocytů Stanovení proliferace lymfocytů Schopnost lymfocytů reagovat
3.cvičen. ení. Ing. Bc. Ivan Pravda
3.cvičen ení Úvod do laboratorních měřm ěření Základní měření PCM 1.řádu - měření zkreslení Ing. Bc. Ivan Pravda Měření útlumového zkreslení - Útlumové zkreslení vyjadřuje frekvenční závislost útlumu telefonního
Rozhodnutí o námitkách
K ćj.:441-5/2013/dp - ÚVN V Praze dne 25.10.2013 Rozhodnutí o námitkách Zadavatel obdržel dne 24. 10. 2013 námitky stěžovatele ze dne 22. 10. 2013, směřující proti zadávacím podmínkám (dále jen námitky
Optická konfokální mikroskopie a mikrospektroskopie. Pavel Matějka
Optická konfokální mikroskopie a Pavel Matějka 1. Konfokální mikroskopie 1. Princip metody - konfokalita 2. Instrumentace metody zobrazování 3. Analýza obrazu 2. Konfokální 1. Luminiscenční 2. Ramanova
Zobrazovací systémy v transmisní radiografii a kvalita obrazu. Kateřina Boušková Nemocnice Na Františku
Zobrazovací systémy v transmisní radiografii a kvalita obrazu Kateřina Boušková Nemocnice Na Františku Rentgenové záření Elektromagnetické záření o λ= 10-8 10-13 m V lékařství obvykle zdrojem rentgenová
Verze 07 Příloha č. 1
Hematologicko-transfuzní dělení ABECEDNÍ SEZNAM VYŠETŘENÍ S REFERENČNÍMI HODNOTAMI AB0 Hemolytické omocnění novorozence : Imunohematologická Srážlivá žilní bo pupečníková krev 1x zkumavka 4-6 ml plast
Statistika. Diskrétní data. Spojitá data. Charakteristiky polohy. Charakteristiky variability
I Přednáška Statistika Diskrétní data Spojitá data Charakteristiky polohy Charakteristiky variability Statistika deskriptivní statistika ˆ induktivní statistika populace (základní soubor) ˆ výběr parametry
TECHNICKÁ UNIVERZITA V LIBERCI SEMESTRÁLNÍ PRÁCE
TECHNICKÁ UNIVERZITA V LIBERCI Ekonomická fakulta Studentská 2 461 17 Liberec 1 SEMESTRÁLNÍ PRÁCE STATISTICKÝ ROZBOR DAT Z DOTAZNÍKOVÝCH ŠETŘENÍ Gabriela Dlasková, Veronika Bukovinská Sára Kroupová, Dagmar
1.6 Operační zesilovače II.
1.6 Operační zesilovače II. 1.6.1 Úkol: 1. Ověřte funkci operačního zesilovače ve funkci integrátoru 2. Ověřte funkci operačního zesilovače ve funkci derivátoru 3. Ověřte funkci operačního zesilovače ve
Proteinové znaky dětské leukémie identifikované pomocí genových expresních profilů
Proteinové znaky dětské leukémie identifikované pomocí genových expresních profilů M.Vášková a spol. Klinika dětské hematologie a onkologie 2.LF UK a FN Motol Childhood Leukemia Investigation Prague Průtoková
Přínos vyšetření klonality plazmocytů u monoklonálních gamapatií pomocí polychromatické průtokové cytometrie
Přínos vyšetření klonality plazmocytů u monoklonálních gamapatií pomocí polychromatické průtokové cytometrie Autor: 1 Mgr. Lucie Říhová, Ph.D. Recenzent: 2 prof. MUDr. Roman Hájek, CSc. 1 Oddělení klinické
ZPS CR systémů. Tomáš. Pokorný
ZPS CR systémů (systém m AUTO QC 2 ) Tomáš Pokorný ZPS obecné zásady Kontrola každého prvku řetězce: RTG přístroj p (generování RTG zářenz ení) Detektor Zpracování latentního obrazu Zobrazování obrazové
Progrese HIV infekce z pohledu laboratorní imunologie
Progrese HIV infekce z pohledu laboratorní imunologie 1 Lochmanová A., 2 Olbrechtová L., 2 Kolčáková J., 2 Zjevíková A. 1 OIA ZÚ Ostrava 2 klinika infekčních nemocí, FN Ostrava HIV infekce onemocnění s
Analýza obrazu. Gabriela Lochmanová. Studijní materiály
Analýza obrazu Gabriela Lochmanová 1 Stanovení cíle experimentu Způsob detekce? Postup zpracování vzorku, kontrolní vzorky, standard Definice jasně stanovených otázek cílů potvrzení hypotézy soustředění
Statistika pro geografy
Statistika pro geografy 2. Popisná statistika Mgr. David Fiedor 23. února 2015 Osnova 1 2 3 Pojmy - Bodové rozdělení četností Absolutní četnost Absolutní četností hodnoty x j znaku x rozumíme počet statistických
strojů umožň lní vstupní infiltraci Mgr. Silvie Dudová, RNDr. Iva Burešová, Drahomíra Kyjovská
Možnosti a změny při p i zpracování vzorků kostní dřeně po aktivaci přístrojp strojů umožň žňujících ch selekci MM buněk k ve vysoké čistotě i při p i minimáln lní vstupní infiltraci Mgr. Silvie Dudová,
CMV specifické T- lymfocyty po alogenní transplantaci hemopoetických progenitorových buněk
CMV specifické T- lymfocyty po alogenní transplantaci hemopoetických progenitorových buněk Hematologicko-onkologické oddělení FN Plzeň Daniel Lysák Motolský minikurz cytometrie 2007 1. CMV u pacientů po
Odůvodnění veřejné zakázky
Odůvodnění veřejné zakázky podle 156 zákona č. 137/2006 Sb., o veřejných zakázkách, ve znění pozdějších předpisů (dále jen ZVZ ) Název veřejné zakázky:,,flow cytometrový analyzátor CEITEC II Evidenční
Statistické metody - nástroj poznání a rozhodování anebo zdroj omylů a lží
Statistické metody - nástroj poznání a rozhodování anebo zdroj omylů a lží Zdeněk Karpíšek Jsou tři druhy lží: lži, odsouzeníhodné lži a statistiky. Statistika je logická a přesná metoda, jak nepřesně
Analýza dat na PC I.
CENTRUM BIOSTATISTIKY A ANALÝZ Lékařská a Přírodovědecká fakulta, Masarykova univerzita Analýza dat na PC I. Popisná analýza v programu Statistica IBA výuka Základní popisná statistika Popisná statistika
Zuzana ŠINKOROVÁ, Lenka ZÁRYBNICKÁ Univerzita obrany, katedra radiobiologie Fakulty vojenského zdravotnictví, Hradec Králové
98 VOJENSKÉ ZDRAVOTNICKÉ LISTY ROČNÍK LXXVII, 2008, č. 3 PRŮTOKOVÁ CYTOMETRIE JAKO ANALYTICKÁ A SELEKČNÍ METODA I. ČÁST Zuzana ŠINKOROVÁ, Lenka ZÁRYBNICKÁ Univerzita obrany, katedra radiobiologie Fakulty
Tematické okruhy k SZZ v bakalářském studijním oboru Zdravotní laborant bakalářského studijního programu B5345 Specializace ve zdravotnictví
Tematické okruhy k SZZ v bakalářském studijním oboru Zdravotní laborant bakalářského studijního programu B5345 Specializace ve zdravotnictví Dle čl. 7 odst. 2 Směrnice děkana pro realizaci bakalářských
Základy biostatistiky II. Veřejné zdravotnictví 3.LF UK - II
Základy biostatistiky II Veřejné zdravotnictví 3.LF UK - II Teoretické rozložení-matematické modely rozložení Naměřená data Výběrové rozložení Teoretické rozložení 1 e 2 x 2 Teoretické rozložení-matematické
Š Ě É ě ě ů ď č ě ě Č Á č ě ě ě é ě é ř ů č ě ý ř ů ě é ř é é ř ú č é ý é ů é č ř ě Ť ů ý ý ů č ě ď é ě ý é é é ř ď ý ř ť ř é ě ň ť č ďě č ě ý é č ě ř ň ů ě ř ě ě ě é ů é é č ě ů é č ě é ě ď č ý ě ů ů
Á Š Á Ž Ě Ý Ě Á Á ť č ň Ť é č ě ě ž č č ě č Ť č č š č ě Ť ě č ě Ť Ť š Á Š Á Ž Ě Ý Ř Á Á ť Ú ě é č Š č ě Ť š ě Ť Š Á Š Á Ž Ě Ý Ě Á Á ť ě Ú Ý ň ě Ť ě ě ň ž č č č Ý ě É ě ě ďú É Ú ď Á Š Á Ž Ě Ý Ě Á Á ť ě
Náhodné signály. Honza Černocký, ÚPGM
Náhodné signály Honza Černocký, ÚPGM Signály ve škole a v reálném světě Deterministické Rovnice Obrázek Algoritmus Kus kódu } Můžeme vypočítat Málo informace! Náhodné Nevíme přesně Pokaždé jiné Především
Minimální hodnota. Tabulka 11
PŘÍLOHA č.1 Výsledné hodnoty Výsledky - ženy (SOŠ i SOU, maturitní i učební obory) Aritmetický průměr Maximální hodnota Minimální hodnota Medián Modus Rozptyl Směrodatná odchylka SOM 0,49 2,00 0,00 0,33
4ST201 STATISTIKA CVIČENÍ Č. 8
4ST201 STATISTIKA CVIČENÍ Č. 8 analýza závislostí kontingenční tabulky test závislosti v kontingenční tabulce analýza rozptylu regresní analýza lineární regrese Analýza závislostí Budeme ověřovat existenci
Bioscience Imaging Centre
Bioscience Imaging Centre (Středisko mikroskopie) zajišťujeme moderní mikroskopické zařízení a softwary pro analýzu obrazu poradíme s plánováním experimentů (histologie, detekce proteinů a mrna) pomůžeme
Záchyt pozitronů v precipitátech
Záchyt pozitronů v precipitátech koherentní precipitát materiál ve vakuu E elektrony pozitrony vakuum E F E, valenční č pás vakuum výstupní práce: povrchový potenciál: chemický potenciál: Záchyt pozitronů
Multimediální systémy
Multimediální systémy Jan Outrata KATEDRA INFORMATIKY UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI přednášky Literatura Havaldar P., Medioni G.: Multimedia Systems: Algorithms, Standards, and Industry Practices. Course
David Buchtela. Monitory 20.10.2009. Monitory. David Buchtela. enýrství lská univerzita v Praze
1 20.10.2009 Monitory Monitory David Buchtela Katedra informačního inženýrstv enýrství Provozně ekonomická fakulta, Česká zemědělsk lská univerzita v Praze Kamýcká 129, Praha 6 - Suchdol 2 Monitory Monitor
Výzva k podání nabídky na veřejnou zakázku malého rozsahu
Výzva k podání nabídky na veřejnou zakázku malého rozsahu Veřejná zakázka malého rozsahu podle 12 odst. 3 zákona č. 137/2006 Sb., o veřejných zakázkách, ve znění pozdějších předpisů (dále jen zákon ).
Obsah. Statistika Zpracování informací ze statistického šetření Charakteristiky úrovně, variability a koncentrace kvantitativního znaku
Obsah Statistika Zpracování informací ze statistického šetření Charakteristiky úrovně, variability a koncentrace kvantitativního znaku Roman Biskup (zapálený) statistik ve výslužbě, aktuálně analytik v
diagnostika in vitro CARES iniciativa společnosti Beckman Coulter v boji proti HIV Movember s Beckman Coulter již potřetí!
in vitro diagnostika CARES iniciativa společnosti Beckman Coulter v boji proti HIV Movember s Beckman Coulter již potřetí! Přístroje MicroScan WalkAway PLUS automatické řešení pro testování citlivosti
Dekapling, koherentní transfer polarizace, nukleární Overhauserův jev
Dekapling Dekapling, koherentní transfer polarizace, nukleární Overhauserův jev Dekaplingem rozumíme odstranění vlivu J-vazby XA na na spektra jader A působením dalšího radiofrekvenčního pole ( ω X )na
ON-LINE KVANTIFIKACE SINIC V SUROVÉ VODĚ
ON-LINE KVANTIFIKACE SINIC V SUROVÉ VODĚ Mgr. ZLATICA NOVOTNÁ Doc. Ing. BLAHOSLAV MARŠÁLEK, CSc. Ing. MARTIN TRTÍLEK Ing. TOMÁŠ RATAJ CENTRUM PRO CYANOBAKTERIE A JEJICH TOXINY, BÚ AVČR Photon System Instrument,
Grafika na počítači. Bc. Veronika Tomsová
Grafika na počítači Bc. Veronika Tomsová Proces zpracování obrazu Proces zpracování obrazu 1. Snímání obrazu 2. Digitalizace obrazu převod spojitého signálu na matici čísel reprezentující obraz 3. Předzpracování
Mann-Whitney U-test. Znaménkový test. Vytvořil Institut biostatistiky a analýz, Masarykova univerzita J. Jarkovský, L. Dušek
10. Neparametrické y Mann-Whitney U- Wilcoxonův Znaménkový Shrnutí statistických ů Typ srovnání Nulová hypotéza Parametrický Neparametrický 1 skupina dat vs. etalon Střední hodnota je rovna hodnotě etalonu.
Jana Vránová, 3. lékařská fakulta UK
Jana Vránová, 3. lékařská fakulta UK Vznikají při zkoumání vztahů kvalitativních resp. diskrétních znaků Jedná se o analogii s korelační analýzou spojitých znaků Přitom předpokládáme, že každý prvek populace
Kategorická data METODOLOGICKÝ PROSEMINÁŘ II TÝDEN 7 4. DUBNA dubna 2018 Lukáš Hájek, Karel Höfer Metodologický proseminář II 1
Kategorická data METODOLOGICKÝ PROSEMINÁŘ II TÝDEN 7 4. DUBNA 2018 4. dubna 2018 Lukáš Hájek, Karel Höfer Metodologický proseminář II 1 Typy proměnných nominální (nominal) o dvou hodnotách lze říci pouze
Základy popisné statistiky
Základy popisné statistiky Michal Fusek Ústav matematiky FEKT VUT, fusekmi@feec.vutbr.cz 8. přednáška z ESMAT Michal Fusek (fusekmi@feec.vutbr.cz) 1 / 26 Obsah 1 Základy statistického zpracování dat 2
KGG/STG Statistika pro geografy
KGG/STG Statistika pro geografy 1. Úvod, základní pojmy Mgr. David Fiedor 16. února 2015 Osnova 1 Úvod - organizace výuky 2 3 Struktura přednášek Úvod, základní pojmy Popisná statistika Teoretická rozdělení
Realita versus data GIS
http://www.indiana.edu/ Realita versus data GIS Data v GIS Typy dat prostorová (poloha a vzájemné vztahy) popisná (atributy) Reprezentace prostorových dat (formát) rastrová Spojitý konceptuální model vektorová
Navrhování experimentů a jejich analýza. Eva Jarošová
Navrhování experimentů a jejich analýza Eva Jarošová Obsah Základní techniky Vyhodnocení výsledků Experimenty s jedním zkoumaným faktorem Faktoriální experimenty úplné 2 N dílčí 2 N-p Experimenty pro studium
Výkon komunik. systémů
Výkon komunik. systémů Tyto slajdy vznikly jako podklady k přednáškám v průběhu mého aktivního působení na Katedře radioelektroniky Českého vysokého učení technického v Praze. Souvisí s problematikou radiotechniky
Krevní buňky budeme měřit spektrálně
Publikováno z 2. lékařská fakulta Univerzity Karlovy (https://www.lf2.cuni.cz) LF2 > Krevní buňky budeme měřit spektrálně Krevní buňky budeme měřit spektrálně Hyperspektrální cytometr, který na pohled
STATISTIKA A INFORMATIKA - bc studium OZW, 1.roč. (zkušební otázky)
STATISTIKA A INFORMATIKA - bc studium OZW, 1.roč. (zkušební otázky) 1) Význam a využití statistiky v biologických vědách a veterinárním lékařství ) Rozdělení znaků (veličin) ve statistice 3) Základní a
Základy navrhování průmyslových experimentů DOE
Základy navrhování průmyslových experimentů DOE cílová hodnota V. Vícefaktoriální experimenty Gejza Dohnal střední hodnota cílová hodnota Vícefaktoriální návrhy experimentů počet faktorů: počet úrovní: