Fyzika biopolymerů. Elektrostatické interakce makromolekul ve vodných roztocích. Vodné roztoky. Elektrostatická Poissonova rovnice.

Podobné dokumenty
Zkouškový test z fyzikální a koloidní chemie

1.3. Transport iontů v elektrickém poli

Energie elektrického pole

Korelační energie. Celkovou elektronovou energii molekuly lze experimentálně určit ze vztahu. E vib. = E at. = 39,856, E d

Tepelná kapacita = T. Ē = 1 2 hν + hν. 1 = 1 e x. ln dx. Einsteinův výpočet (1907): Soustava N nezávislých oscilátorů se stejnou vlastní frekvencí má

Kinetika spalovacích reakcí

Transport hmoty a tepla v mikrofluidních systémech

V xv x V V E x. V nv n V nv x. S x S x S R x x x x S E x. ln ln

MODELOVÁNÍ A SIMULACE

katedra technických zařízení budov, fakulta stavební ČVUT TZ 31: Vzduchotechnika, cvičení č.1: Větrání stájových objektů vypracoval: Adamovský Daniel

Nerovnovážná termodynamika

Jednosložkové soustavy

Československá společnost pro růst krystalů ČVUT FEL Praha, 30. března 2006, 13:30

Numerická matematika 1. t = D u. x 2 (1) tato rovnice určuje chování funkce u(t, x), která závisí na dvou proměnných. První

Iterační výpočty. Dokumentace k projektu pro předměty IZP a IUS. 22. listopadu projekt č. 2

Elektrické jevy na membránách

4EK211 Základy ekonometrie

3 Základní modely reaktorů

4EK211 Základy ekonometrie

12. Elektrochemie základní pojmy

test zápočet průměr známka

Lambertův-Beerův zákon

Matematika I A ukázkový test 1 pro 2018/2019

Odraz a lom rovinné monochromatické vlny na rovinném rozhraní dvou izotropních prostředí

11 Kvantová teorie molekul

POTENCIÁL ELEKTRICKÉHO POLE ELEKTRICKÉ NAPĚTÍ

REAKCE: 1) ACIDOBAZICKÉ Acidum = kyselina Baze = zásada. Využití: V analytické kvantitativní chemii v odměrné analýze

[ ] d[ Y] rychlost REAKČNÍ KINETIKA X Y

Věra Keselicová. květen 2013

Skupenské stavy. Kapalina Částečně neuspořádané Volný pohyb částic nebo skupin částic Částice blíže u sebe

9 PŘEDNÁŠKA 9: Heisenbergovy relace neurčitosti, důsledky. Tunelový jev. Shrnutí probrané látky, příprava na zkoušku.

Energie, její formy a měření

GAUSSŮV ZÁKON ELEKTROSTATIKY

Mechatronické systémy s elektronicky komutovanými motory

DUM č. 16 v sadě. 11. Fy-2 Učební materiály do fyziky pro 3. ročník gymnázia

PROTOLYTICKÉ ROVNOVÁHY

PODKLADY PRO PRAKTICKÝ SEMINÁŘ PRO UČITELE VOŠ. Logaritmické veličiny používané pro popis přenosových řetězců. Ing. Bc. Ivan Pravda, Ph.D.

Molekulová vibrace dvojatomové molekuly. Disociační křivka dvojatomové molekuly

ELEKTŘINA A MAGNETIZMUS Řešené úlohy a postupy: Gaussův zákon

Tento dokument je doplňkem opory pro studenty Přírodovědecké fakulty Univerzity Jana Evangelisty Purkyně.

Pro zředěné roztoky za konstantní teploty T je osmotický tlak úměrný molární koncentraci

ÚVOD DO KVANTOVÉ CHEMIE

u (x i ) U i 1 2U i +U i+1 h 2. Na hranicích oblasti jsou uzlové hodnoty dány okrajovými podmínkami bud přímo

2. Statistický popis plazmatu

Tok - relativní pohyb sousedních elementů materiálu.

Spinový moment hybnosti /magnetický moment, interakce s magnetickým polem

Maticová exponenciála a jiné maticové funkce

Plazma. magnetosféra komety. zbytky po výbuchu supernovy. formování hvězdy. slunce

ELEKTROSTATIKA. Mgr. Jan Ptáčník - GJVJ - Fyzika - Elektřina a magnetismus - 2. ročník

VI. Disociace a iontové rovnováhy

ELEKTRICKÝ NÁBOJ A ELEKTRICKÉ POLE

Theory Česky (Czech Republic)

Fluktuace termodynamických veličin

MĚRENÍ V ELEKTROTECHNICE

ANALÝZA ROZPTYLU (Analysis of Variance ANOVA)

symetrická rovnice, model Redlich- Kister dvoukonstantové rovnice: Margules, van Laar model Hildebrandt - Scatchard mřížková teorie roztoků příklady

Farmakokinetika. matematický popis procesu podání, absorpce, distribuce, metabolismu a vyloučení léků z těla

SIMULACE. Numerické řešení obyčejných diferenciálních rovnic. Měřicí a řídicí technika magisterské studium FTOP - přednášky ZS 2009/10

Kyselost, bazicita, pka

Elektrický náboj a elektrické pole

ESR, spinový hamiltonián a spektra

Membránové potenciály

ELEKTŘINA A MAGNETIZMUS Řešené úlohy a postupy: Faradayův zákon

4.1.7 Rozložení náboje na vodiči

Skalární a vektorový popis silového pole

1. POLOVODIČOVÉ TEPLOMĚRY

OSTRAVSKÁ UNIVERZITA V OSTRAVĚ TERMODYNAMIKA A STATISTICKÁ FYZIKA DALIBOR DVOŘÁK

Fyzika IV. -ezv -e(z-zv) kov: valenční elektrony vodivostní elektrony. Elektronová struktura pevných látek model volných elektronů

Q N v místě r. Zobecnění Coulombova zákona Q 3 Q 4 Q 1 Q 2

Oxidace a redukce. Objev kyslíku nový prvek, vyvrácení flogistonové teorie. Hoření = slučování s kyslíkem = oxidace. 2 Mg + O 2 2 MgO S + O 2 SO 2

Farmakokinetika I. Letní semestr 2015 MVDr. PharmDr. R. Zavadilová, CSc.

Elektrostatické pole. Vznik a zobrazení elektrostatického pole

Katedra geotechniky a podzemního stavitelství

CHEMIE A CHEMICKÉ TECHNOLOGIE (N150013) 3.r.

Opakování: shrnutí základních poznatků o struktuře atomu

DUSÍK NITROGENIUM 14,0067 3,1. Doplňte:

Úvod do magnetizmu pevných látek

Numerická matematika A

III. STRUKTURA A VLASTNOSTI PLYNŮ

III/2 - Inovace a zkvalitnění výuky prostřednictvím ICT Inovace výuky na GSN prostřednictvím ICT

Difúze. 0 m n pu p m n pu kbt n. n u D n n m. Fickův zákon Po dosazení do rovnice kontinuity

6. Kinetické vlastnosti disperzních soustav

elektrony v pevné látce verze 1. prosince 2016

11 Tachogram jízdy kolejových vozidel

Elektrické pole vybuzené nábojem Q2 působí na náboj Q1 silou, která je stejně veliká a opačná: F 12 F 21

ATOMOVÉ JÁDRO. Nucleus Složení: Proton. Neutron 1 0 n částice bez náboje Proton + neutron = NUKLEON PROTONOVÉ číslo: celkový počet nukleonů v jádře

Elektromagnetické pole

ELEKTŘINA A MAGNETIZMUS Řešené úlohy a postupy: Posuvný proud a Poyntingův vektor

7 Hallůvjevvkovuapolovodiči

Matematické modelování ve stavební fyzice

Typy molekul, látek a jejich vazeb v organismech

Nerovnovážné systémy Onsagerova hypotéza, fluktuačně disipační teorém

Základní zákony a terminologie v elektrotechnice

PEM - rámcové příklady Elektrostatické pole a stacionární elektrický proud

ZÁPADOČESKÁ UNIVERZITA V PLZNI

Dopravní plánování a modelování (11 DOPM )

INOVACE ODBORNÉHO VZDĚLÁVÁNÍ NA STŘEDNÍCH ŠKOLÁCH ZAMĚŘENÉ NA VYUŽÍVÁNÍ ENERGETICKÝCH ZDROJŮ PRO 21. STOLETÍ A NA JEJICH DOPAD NA ŽIVOTNÍ PROSTŘEDÍ

Oxidace a redukce. Hoření = slučování s kyslíkem = oxidace. 2 Mg + O 2 2 MgO S + O 2 SO 2. Redukce = odebrání kyslíku

Transkript:

Fyzka bopolymerů Elektrostatcké nterakce makromolekul ve vodných roztocích Robert Vácha Kamence 5, A4 2.13 robert.vacha@mal.mun.cz Vodné roztoky ldské tělo se skládá z 55-75 % z vody (roztoků) většna roztoků je elektro neutrální Ion Intracelular [mm] Extracelular [mm] Na+ 5-15 145 K+ 140 5 Cl- 5-15 110 by Krtka Jan Cell 2 Elektrostatcká Possonova rovnce Coulomb Síla: FC = Potencál: 1 Q1 Q2 4 r2 VC = 1 = 10 4 0 1 Q1 Q2 4 r 7 2 c m/f platí prncp superpozce Maxwelovy rovnce (E je elektrcké pole a B je magnetcké pole) bez pohybu nábojů B=0 => statcké řešení jelkož rotace elektrckeho pole je nulová, E = r E =r ( r )= => Possonova rovnce r = je Laplacův operator 3

Posson-Boltzmannova rovnce k řešení Possonovy rovnce = potřebujeme znát nábojovou hustotu v rovnováze µ = q + ln( ) = const. nábojová hustota - dána Boltzmanovým rozdělením: = X q 0 exp 0 je nábojová hustota -té složky systému v místě nulového potencálu kombnací Possonovy rovnce a Boltzmannova rozdělení dostaneme Posson- Boltzmannovu (PB) rovnc e je elementární náboj 4 = X 0 exp ez z je multplcta řešení je dáno okrajovým podmínkym, obvykle: - elektroneutralta systému - znalost místa s nulovým potencálem (např. v nekonečnu) - znalost nábojové hustoty v místě nulového potencálu 4 Lnearzace Posson-Boltzmannovy rovnce nejběžnější aproxmace PB rovnce je lnearzace ( pro malé x platí e x 1 + x) pokud platí q << dostaneme Debye-Hückelovu aproxmac 4 = X 0 exp q = X 0 + X 0 q X pokud je systém elektroneutrální 0 =0 získáme lneární dferencální rovnc potencál okolo nabté koule (r) =A e appler = q apple(r R) e r 4 r(appler + 1) 4 = X 0 q = apple2 potencál u stěny (x) = (0)e applex = (0) exp x kde = 1 apple je Debyeova stínící délka 5 Stínící délka Debyeova stínící délka = charakterstcká délka, ve které se vyskytuje většna prot-ontů s s = 1 r apple = P q = P 0 e2 z 2 = 0N e 2 N a I kde I je ontová síla = 0.304 p c1:1salt nm 0.176 p c1:2salt nm I = 1 X c z 2 2 a Na Avogarova konstanta pro sůl z jednomocných ontů např. NaCl 0.3 nm pro 1 M roztok 1.0 nm pro 0.1 M roztok 10 nm pro 1 mm roztok pro sůl z jedno a dvoumocných ontů např. K2SO4, CaCl2 0.152 p c2:2salt nm pro sůl z dvoumocných ontů např. MgCO3 0.15 nm pro 1 M roztok 0.50 nm pro 0.1 M roztok 5.00 nm pro 1 mm roztok 1 nm za fyzologckých podmínek Bjerrumova délka = dva elementární náboje nteragují slou teplotní energe () b = e2 56 nm ve vakuu, 0.71 nm ve vodě 4 6

Gouy-Chapmanova teore máme-l nabtý proten, prot-onty okolo vytváří dfuzní obal s opačným nábojem - z větší vzdálenost elektrcká dvouvrstva nterakce použtím aproxmace elektrostatcké dvouvrstvy: dvě malé molekuly R (poloměr) << d (vzdálenost) dvě koule (proteny) R >> d Z 1 Z 2 e 2 4 R 1 R 2 R 1 + R 2 Z exp( exp( appled +2appleR) d(1 + 2appleR) appled) koule a povrch RZ exp( appled) dva povrchy (na jednot. plochu) apple 2 Z exp( appled) Z je defnováno povrchovým potencálem hustotou na povrchu = apple 0 Z = 64 0 na částc, který souvsí s nábojovou 2 ze tanh 2 0 4 e hyperbolcký tangens se často značí = tanh(ze 0 /4) 7 pro malé povrchové potencály ( 0 << 25 mv) jsou nterakce: dvě koule koule a povrch dva povrchy 2 2 R 1 R 2 apple 2 exp( appled) R 1 + R 2 2 2 R apple 2 exp( appled) 2 2 apple exp( appled) Delektrcká konstanta onty lze zahrnou mplctně - změna delektrcké konstanty Lev A. et al. PRL 2012, 108, 227801 8 Příklad 1 Spočítejte elektrostatckou nterakc dvou Lysozymů v krv, kde ph = 7.4 Předpokládejte náboj lysozymu +7 a jeho poloměr R = 20 nm Řešení 9

Hustota z elektrostatckého pole pokud známe elektrostatcké pole - lokalní nábojová hustota je: = 0 + q 2 E2 odvození v 1D: početní hustota na náboj je dána vztahem N = X 0 q exp q d N dx = X q 0 q d exp q dx = d dx = 2 d d 2 dx dx N = 0N + 2 d 2 dx X = X 0 + d q q 2 dx 2 = X 0 q + q 2q E 2 10 Aproxmace 1) PB je teore středního pole 2) všechny onty mají stejnou nulovou velkost, lší se jen nábojem - PB selže př vzdálenostech o velkost ontu a nemusí správně popsat ontové korelace - neobsahuje/nepopsuje fluktuace hustoty => dodatečná přtažlvá nterakce ndukovaný dpól - ndukovaný dpól - neposthuje ontově specfcké efekty např. bologcky velm rozdílné Na + a K + 11 Fluktující náboje náboj protenů může fluktuovat okolo střední hodnoty => dodatečná nterakce schopnost měnt náboj v závslost na potencálu posthuje kapactance C C = @ <q> @ = <q2 > <q> 2 e 2 nterakce dvou molekul může být potom popsána multpólovým rozvojem e 2 2(4 ) 2 C 1 C 2 R 2 1 2(4 ) 2 Q 2 2C 1 + Q 2 1C 2 R 2... kde Q je střední hodnota náboje na molekule pro samostatnou amnokyselnu C = 1 @ <q> ln 10 @ ph největší kapactanc má molekula v blzkost svého pka př neutrálním ph tak největší kapactanc má Hstdn 12

Příklad 2 Spočítejte jak se změní rovnovážná konstanta Hstdnu na povrchu Lysozymu Předpokládejte, že standartní pka Hstdnu je 6.0 Přpomeňte s defnc chemckého potencálu, který je v rovnováze stejný v celém systému @G µ = = µ o + RT ln a = µ o + RT ln x @N T,P,N6=j v přítomnst elektrostatckého potencálu +q Defnce pka: záporně vzatý dekadcký logartmus rovnovážné konstanty pk a = log [X ][H+ ] HX H + + X [HX] 13 Příklad 3 Spočítejte jak se změní koncentrace a zdánlvá rovnovážná konstanta Hstdnu na povrchu Lysozymu. Zdánlvá rovnovážná konstanta je defnovaná vůč koncentrac protonů v bulku. Řešení 14 Příklad 4 Ukažte, že analytcké řešení pro PB rovnc pro nabtou stěnu v rozoku 1:1 mocné sol je (x) = 2 e ln 1+ exp( applex) 1 exp( applex) a pro malé potencály to konverguje k řešení Debye-Hückela Nápověda: dosazením sol do PB rovnce zkontrolujte že dostanete d 2 U (x) dx 2 = 1 2 použíjte k řešení substtuc z = e x/ U e e U U = ev kde s = 2e 2 0N 15

Řešení 16