Where Excellence Meets Hope VÝROČNÍ ZPRÁVA 2015

Transkript

1 Where Excellence Meets Hope VÝROČNÍ ZPRÁVA 2015

2 OBSAH Úvodní slovo vedoucího lékaře...2 I. Úvod... 3 II. Výsledky prenatální diagnostiky... 3 III. Výsledky centra asistované reprodukce...5 IV. Preimplantační diagnostika (PGD)...5 V. Postnatální laboratorní diagnostika...12 VI. Kontrola kvality...13 VII. Publikační činnost VIII. Personální obsazení GENNET (stav k ) 20

3 Vážení klienti, kolegové a spolupracovníci, dostává se Vám do rukou výroční zpráva společnosti GENNET, ve které bych si Vás dovolil seznámit s výsledky za rok Úvodem bych Vás rád upozornil na některé podle mého názoru významné oblasti naší činnosti v uplynulém roce. Získali jsme první zkušenosti z práce ve skupině FutureLife, která sdružuje celkem 15 zdravotnických zařízení. Společné ekonomické, personální i metodické postupy mají velký rozvojový potenciál. Genetická laboratoř GENNET se stala centrální laboratoří skupiny. Nedílnou součástí péče o páry s poruchami plodnosti je také pečlivé vyšetření imunitního systému. Proto jsme se v loňském roce nově rozšířili o akreditovanou imunologickou laboratoř. K dalším, neméně důležitým vyšetřením, které GENNET nově nabízí, patří Vyšetření DNA fragmentace spermií na naší klinice v Liberci. Připravili jsme technické podmínky pro preimplantační screening aneuploidií (PGS), který provádíme i pro další centra skupiny. Metodami PCR a karyomappingu můžeme preimplantačně vyšetřovat téměř všechny monogenní choroby s prokázanou kauzální mutací. Se zvyšujícím se počtem cyklů s preimplantační diagnózou a podporou transferu jednoho embrya se zvýšil o třetinu počet cyklů s kryoembryotransferem. V prenatálním programu jsme zavedli vlastní metodu neinvazivní prenatální diagnostiky pomocí volné DNA v krvi matky (cfdna test), kterou doporučujeme kontingentu matek s hraničním rizikem v kombinovaném nebo integrovaném screeningovém testu. V programu lékařské genetiky jsme zavedli test CZECANCA (Czech Cancer Panel for Clinical Analysis) vyvinutý skupinou Doc. MUDr. Kleibla z 1. lékařské fakulty UK. Pomocí metody sekvenování nové generace CZECANCA vyšetřuje vrozené mutace skupiny 219 genů spojených s nádorovým bujením. Hodnocení výsledků testu se zaměřuje v první řadě na 44 známých genů, jejichž vrozené mutace se u lidí prokazatelně podílejí na nejčastějších dědičných nádorových onemocněních, jako jsou dědičné nádory prsu a vaječníků, nádory trávicího ústrojí, ale i řady dalších orgánů. Naším cílem je poskytovat klientům i nadále excelentní péči, a proto jsme také v uplynulém roce kladli nejvyšší důraz na odbornou kvalitu poskytovaných služeb a prováděných vyšetření. Po splnění podmínek kontrolního auditu jsou naše genetické a IVF laboratoře akreditovány dle normy ČSN EN ISO 15189:2013, a to až do dubna roku Náš tým posílili další zkušení kolegové, a proto věříme, že i rok 2016 bude alespoň tak úspěšný jako ten uplynulý. Děkujeme Vám za důvěru. MUDr. David Stejskal vedoucí lékař 1

4 I. ÚVOD Na klinikách v Praze a Liberci poskytujeme našim pacientům komplexní péči v oblasti lékařské genetiky, fetální medicíny a asistované reprodukce. V roce 2015 jsme vyšetřili pacientů a rodin. II. VÝSLEDKY PRENATÁLNÍ DIAGNOSTIKY Výsledky screeningu vrozených vad v I. a II. trimestru. Celkem bylo hodnoceno prenatálních screeningových testů ve screeningových centrech Praha a Liberec kombinovaných testů v I. trimestru (průměrný věk testovaných osob 33 let; 3,15 % pozitivních s rizikem trizomie chromozomu č. 21 1/100 a vyšším) 9442 integrovaných testů v I. a II. trimestru (průměrný věk testovaných 32 let; 1,94 % pozitivních s rizikem trizomie chromozomu č. 21 1/150 a vyšším) 3983 triple testů ve II. trimestru (průměrný věk testovaných osob 32 let; 5,02 % pozitivních s rizikem trizomie chromozomu č. 21 1/250 a vyšším) Ultrazvukem bylo primárně zjištěno nebo následně potvrzeno 275 vrozených vad plodu. Celkem bylo provedeno: ultrazvukových vyšetření v I. trimestru ultrazvukových vyšetření ve II. a III. trimestru Invazivní výkony Bylo vyšetřeno: 207 odběrů choria CVS s 74 (36,3 %) nálezy chromozomálních vad amniocentéz AMC s 45 (4,0 %) nálezy chromozomálních vad U všech vyšetření choriových klků a 85 % vyšetření plodových vod byla provedena rychlá diagnostika nejčastějších chromozomálních vad technikou QF-PCR. Prenatální vyšetření metodou SNP array bylo provedeno u 320 plodů, metodou array CGH u 84 plodů. U 29 (7 %) byl zjištěn nález. Neinvazivní prenatální testy (NIPT) Zpracování neinvazivního prenatálního testu na trizomie chromozomů 21, 18 a 13 probíhá v partnerské laboratoři společnosti BGI. V rámci projektu Prenascan bylo za rok 2015 vyšetřeno celkem 1773 vzorků z České a Slovenské republiky. Bylo diagnostikováno a přímým vyšetřením plodu potvrzeno 16 trizomií chromozomu č. 21 a 7 trizomie chromozomu č. 18 a 2 trizomie chromozomu č. 13. Z celkového počtu 1773 vzorků bylo nutné u 15 vzorků (0,8 %) odběr krve opakovat vzhledem k nedostatečné koncentraci DNA plodu v krvi matky. Celkové výsledky prenatální diagnostiky Bylo zjištěno celkem 275 prenatálních vrozených vad: 121 nálezů chromozomálních vrozených vad (105 závažných) 203 morfologických vad (49 s chromozomální aberací) 177 těhotných požádalo o přerušení těhotenství z genetické indikace Chromozomální VVV Chromozomální VVV 54 Downův syndrom (trizomie 21) 16 Edwardsův syndrom (trizomie 18) 4 Patauův syndrom (trizomie 13) 7 Aneuploidie pohlavních chromozomů 6 Triploidie 3 Strukturální aberace 15 Všechny závažné aberace 105 Morfologické VVV (mnohočetné vvv uváděny opakovaně) Defekty neurální trubice (rozštěpy páteře) 22 Vady CNS 14 Orofaciální vady (rozštěpy rtu) 17 Defekty přední stěny břišní 11 Srdeční vady 23 Vady hrudníku a nitrohrudních orgánů 7 Vady trávicího ústrojí 8 Jiné 14 Vady močopohlavního ústrojí 35 Vady končetin 30 Vyšetření produktů koncepce (spontánní potraty v I. trimestru) Molekulárně genetickými technikami bylo vyšetřeno celkem 81 produktů koncepce na nejčastěji se vyskytující aneuploidie (chromozomů č. 2, 7, 13, 14, 15, 16, 18, 21, 22 a chromozomů X, Y), triploidie a uniparentální disomie (kompletní mola) a trombofilní mutace (FVL Leidenská). U 34 % produktů koncepce byla zjištěna chromozomální etiologie potratu. 2

5 III. VÝSLEDKY CENTRA ASISTOVANÉ REPRODUKCE Úspěšnost metod, které pacientům nabízíme, se stále pohybuje na skvělé úrovni. Stále více pacientů dnes využívá možnosti preimplantační diagnostiky a následného kryoembryotransferu a klesá tedy počet transferů v jednom cyklu. Stoupá také počet single embryo transferů. Díky individuální péči, při níž má každý pacient svého lékaře, jsme dosáhli maximální spokojenosti našich pacientů. Všechna centra GENNET jsou vybavena Time lapse systémem EmbryoScope. Výsledky klinik GENNET v roce 2015 ve vybraných metodách IVF/ICSI OPU ET Těhotenství Těhotenství 33 % 37 % 44 % 43 % 40 % 46 % 43 % 41% 44% na ET v % KET ET Těhotenství Těhotenství 26 % 22 % 36 % 33 % 39 % 39 % 36 % 39 % 40 % na ET v % ED ET Těhotenství Těhotenství 51 % 54 % 53 % 61 % 69 % 68 % 67% 69% na ET v % IVF/ICSI KET OPU ET Těhotenství ED 700 ET Těhotenství ET Těhotenství 3

6 IV. PREIMPLANTAČNÍ DIAGNOSTIKA (PGD) Naše akreditované laboratoře provádějí PGD pro ostatní IVF centra v Čechách i v zahraničí. V současnosti jsou dostupné tyto metody: PGS screening aneuploidií metodou array CGH (GenetiSure 8x60K Agilent, 24sure Illumina) PGD (u nosičů translokací) metodou array CGH (GenetiSure 8x60K Agilent, 24sure+ Illumina) PGS screening aneuploidií metodou FISH PGD (u nosičů translokací) metodou FISH PGD monogenních chrorob metodou PCR PGD monogenních chorob metodou Karyomapping (Illumina) Pro optimální výsledek doporučujeme metodu tzv. PGD dislokace, kdy k transferu dochází v následujícím cyklu po vitrifikaci embryí a jejich vyšetření. PGS/PGD metodou array CGH byl proveden v 252 cyklech. Výsledky potvrzují, že pouze 51 % vyšetřených embryí je euploidních (tzn. že mají normální počet chromozomů). Ve 171 cyklech bylo doporučeno alespoň jedno embryo k embryotransferu. Dle dostupných dat z provedených kryoembryotransferů (KET) za rok 2015 dosahuje úspěšnost otěhotnění po PGS/PGD metodou array 40%. PGS metodou FISH byl proveden v 11 případech, PGD (nosiči translokací) metodou FISH v 6 případech. PGS/PGD array výsledky 2015 PGS/PGD metodou array Počet cyklů 252 Bioptovaná embrya 822 Úspěšná amplifikace DNA 734 (90 %) Úspěšná array CGH 683 (93 %) Euploidní embrya 346 (51 %) Počet cyklů s ET 171 (68 %) (68%) PGD metodou PCR byla v roce 2015 provedena ve 74 cyklech, celkem bylo provedeno již 525 cyklů. Pro vyšetření monogenních chorob používáme nepřímou metodu užívající výsledky haplotypové rodinné analýzy. Tuto metodu lze použít prakticky u všech monogenních chorob. Pracujeme na kombinaci haplotypové analýzy s PGS založené na NGS (sekvenování nové generace). Tato možnost bude pro naše pacienty dostupná v první polovině příštího roku. PGD monogenních onemocnění Provedené cykly Rok Dokončené přípravy (nové geny) Celkem Výsledky Počet cyklů (SC) 525 Embryotransfer (ET) 369 Klinické těhotenství (CP) 138 CP/ET 38,10% 38,10 % 4

7 Seznam monogenních chorob připravených pro preimplantační diagnostiku Název onemocnění Zkratka Typ dědičnosti Charcot-Marie-Tooth typu 1A CMT 1A AD PMP22 17p12 Cystická fibróza CF AR CFTR 7q31.2 Marfanův syndrom MS AD FBN1 15q21.1 Huntingtonova chorea HCH AD IT15 4p16.3 RhD aloimunizace RhD AD RHD 1p36.11 Myotonická dystrofie typu 1 MD1 AD DMPK 9q q12 Syndrom fragilního X FRAXA XD FMR1 Xq27.3 X-vázaná těžká SCID XR IL2RG Xq13.1 kombinovaná imunodeficience Hemofilie A XR Factor VIII Xq28 Polycystické ledviny autozomálně recesivní forma ARPKD AR PKHD1 6p12.2 AR dědičná hluchota 13q12.11 AR GJB2 (Connexin26) Hereditární sensorická 1 neuropatie HSN1 AD SPTLC1 9q22.31 Morbus Crouzon AD FGFR2 10q26.13 BRCA1 BRCA1 AD BRCA1 17q21.31 Duchennova svalová dystrofie DMD XR dystrofin Xp21.1 Neurofibromatóza 1 NF1 AD NF1 17q11.2 Spinální muskulární atrofie SMA AR SMN1 5q Currarino syndrom CS AD HLXB9 7q36.3 Camurati Engelmannova dysplazie CED AD TGFB1 19q13.2 Treacher Collins syndrom TCS AD TCOF1 5q33.1 Erytropoetická protoporfýrie EPP AD FECH 18q21.3 IPEX syndrom IPEX XR FOXP3 Xp11.23 Propionová acidémie PA AR PCCB 3q21-3q22.3 Alagillův syndrom AS AD JAG-1 20p12 Epidermolysis bullosa EB AD keratin 14 17q21.2 (KRT14) Lynchův syndrom HNPCC AD MLH1 3p22.2 Pelizaeus-Merzbacher syndrom PMD XR PLP1 Xq22.2 Charcot-Marie-Tooth CMTX1 XD GJB1, Xq13.1 gonozomálně dominantní typ Cx32 Leidenská mutace, faktor V FV AR Factor V 1q24.2 Fabryho choroba FD XD GLA Xq22.1 Polycystické ledviny autozomálně dominantní forma ADPKD AD PKD1 16p13.3 phosphorylation deficiency 6) Hemofilie B XR Factor IX Xq27.1 Junkční epidermolysis bullosa JEB AR LAMB3 1q32.2 BRCA2 BRCA2 AD BRCA2 13q13.1 Porucha mitochondriální beta-oxidace MK, LCHAD AR HADHA 2p23.3 deficit LCHAD Alportův syndom AS XR COL4A5 Xq22.3 Deficit adenylosukcinátlyázy AR ADSL 22q13.1-q13.2 Von Hippel-Lindaův syndrom VHL AD VHL 3p25-p26 Deficit adenosindeaminázy AR ADA 20q13.12 Mukopolysacharidóza I MPS1 AR IDUA 4p16.3 Incontinentia pigmenti IP XD NEMO Xq28 MYH9 related disorders (e.g. Epstain syndrome) AD MYH9 22q12.3 Facioscapulohumerální muskulární dystrofie FSHD AD FRG1 4q35 Smith-Lemli-Opitz syndrom SLOS AR DHCR7 11q13.4 Kongenitální adrenální hyperplazie CAH AR CYP21 6p2.1-3 Mukopolysacharidóza III, typ A MPS3 AR SGSH 17q25.3 (Sanfilipův syndrom) Deficit alfa1-antitrypsinu A1AT AR SERPINA1 14q32.1 Mnohočetná endokrinní neoplázie 2A MEN2A AD RET 10q11.2 Zadní polymorfní dystrofie rohovky PCCD1 AD celý lokus 20p11.2 Waardenburgův syndrom WS AD PAX3 2q35-2q37 Ichthyosis vulgarit IV AD FLG1 1q21.3 Hypofosfatázie AR ALPL 1p36.12 Okulocerebrorenální syndrom (Loweho syndrom) OCRL XR OCRL Xq Lynchův syndrom AD MSH2 2p21 Gen Chromozom Název onemocnění Zkratka OTC deficit (porucha ornitintranskarbamylázy) OTC XR Delece OTC (okolních genů RPGR+TSPAN7) Xp21.1-Xp11.4 Fenylketonurie PKU AR PAH 12q23.2 Hypertrofická myopatie HKMP AD MYH7 14q12 Hypertrofická myopatie HKMP AD MYH7 14q12 Myotonická dystrofie typu 2 MD2 AD ZNF9 3q21.3 Epidermolysis bullosa dystrophica DEB AD COL7A1 3p21.3 Lamelární ichtyosa AR TGM1 14q12 Borjeson-Forssmann- Lehmanův syndrom BFLS GR PHF Xq26.2 Meckel Gruberův syndrom AR CC2D2A 4p15.32 X-vázaná adrenoleukodystrofie XALD GR ABCD1 Xq28 Brachydaktylie - E BDE AD PTHLH 12p Familiární juvenilní hyperurikémická nefropatie FJHN AD UMOD 16p12.3 (FJHN) Deficit mitochondriální alanyl-trna syntetázy AR AARS2 6p21.1 X-vázaná myotubulární myopatie yp 1 MTM1 MTM1 XR MTM1 Xq28 L1CAM syndrome (L1 cell adhesion molecule) L1CAM XR L1CAM Xq28 Duplikace 8,3Mb (15q11.1 q oblast PW/AS) 15q11-q13 MHBD- X-vázaná (deficit 2-methyl-3-hydroxybutyryl MHBD XD HADH2 Xp11.2 CoA dehydrogenázy) Spinocerebellar ataxia typ 2SCA2 AD ATXN2 12q24.12 X-linked retinoschisis RSI GD RSI Xp22.13 Camurati Engelmannova dysplazie CED AD TGFB1 19q13.2 Charcot-Marie Tooth typ1 CMT1 AD FBLN5 14q32.12 Medulární cystické onemocnění ledvin MCKD1 AD MUC1 1q22 Pontocerebellarní hyperplasie PCH1 AR EXOSC3 9p13.2 Polycystická choroba ledvin ADPKD AD PKD2 4q22.1 ADPKD gen PKD2 Mukolipidóza III.A ML IIIA AR GNPTAB 12q23.2 Cerebalangiopathy autosomal dominant with subcortical infatrs CADASIL AD NOTCH3 19p13.12 and leukoencephalopathy X-vázaný syndrom insenzitivity k androgenům XR AR gen Xq12 Charcot-Marie-Tooth neuropathy 1B CMT1B AD MPZ 1q23.3 Léri-Weill dyschondrosteosis (delece 609kb Xp ,371-1,212,518) (včetně genu SHOX) AD Typ dědičnosti Gen SHOX+PAR1 oblast Chromozom Del 609kb Xp22.33 Translokace - 6 AD 6q25-q27 Osteogenesis imperfecta types I AD COL1A1 17q21.33 COXPD6 (combined oxidative phosphorylation deficiency 6) XR AFM1 Xq26.1 Li-Fraumeni syndrom AD TP53 17p13.1 Severe Combined Immunodeficiency Disease AR RAG2 11p13 Thrombocytopenia-absent radius syndrome AR RBM8A 1q21.1 Paroxysmal dyskinesia AD PRRT2 16p11.2 FAP familiální adenomatózní polypóza AD APC 5q22.2 Blepharophimosis, epicanthus inversus, and ptosis (BPES) AD FOXL2 3q22.3 Spastická paraplegie typ 4(SPG4) SPG4 AD SPAST 2p22.3 Charcot-Marie-Tooth typu 1A CMT 1A AD PMP22 17p12 Cystická fibróza CF AR CFTR 7q31.2 Marfanův syndrom MS AD FBN1 15q21.1 Huntingtonova chorea HCH AD IT15 4p16.3 RhD aloimunizace RhD AD RHD 1p36.11 Myotonická dystrofie typu 1 MD1 AD DMPK 19q13.32 Syndrom fragilního X FRAXA XD FMR1 Xq27.3 X-vázaná těžká kombinovaná imunodeficience SCID XR IL2RG Xq13.1 5

8 Název onemocnění Zkratka Typ dědičnosti Hemofilie A XR Factor VIII Xq28 Polycystické ledviny ARPKD AR PKHD1 6p12.2 autozomálně recesivní forma AR dědičná hluchota AR GJB2 (Connexin26) 13q12.11 Hereditární sensorická neuropatie 1 HSN1 AD SPTLC1 9q22.31 Morbus Crouzon AD FGFR2 10q26.13 BRCA1 BRCA1 AD BRCA1 17q21.31 Duchennova svalová dystrofie DMD XR dystrofin Xp21.1 Neurofibromatóza 1 NF1 AD NF1 17q11.2 Spinální muskulární atrofie SMA AR SMN1 5q Currarino syndrom CS AD HLXB9 7q36.3 Treacher Collins syndrom TCS AD TCOF1 5q33.1 Erytropoetická protoporfýrie EPP AD FECH 18q21.3 IPEX syndrom IPEX XR FOXP3 Xp11.23 Propionová acidémie PA AR PCCB 3q21-3q22.3 Alagillův syndrom AS AD JAG-1 20p12 Epidermolysis bullosa EB AD keratin 14 (KRT14) 17q21.2 Lynchův syndrom HNPCC AD MLH1 3p22.2 Pelizaeus-Merzbacher syndrom PMD XR PLP1 Xq22.2 Charcot-Marie-Tooth gonozomálně dominantní typ CMTX1 XD GJB1,Cx32 Xq13.1 Leidenská mutace, faktor V FV AR Factor V 1q24.2 Fabryho choroba FD XD GLA Xq22.1 Polycystické ledviny autozomálně dominantní forma ADPKD AD PKD1 16p13.3 Hemofilie B XR Factor IX Xq27.1 Junkční epidermolysis bullosa JEB AR LAMB3 1q32.2 BRCA2 BRCA2 AD BRCA2 13q13.1 Porucha mitochondriální beta-oxidace MK, deficit LCHAD LCHAD AR HADHA 2p23.3 Alportův syndom AS XR COL4A5 Xq22.3 Deficit adenylosukcinátlyázy AR ADSL 22q13.1-q13.2 Von Hippel-Lindaův syndrom VHL AD VHL 3p25-p26 Deficit adenosindeaminázy AR ADA 20q13.12 Mukopolysacharidóza I MPS1 AR IDUA 4p16.3 Incontinentia pigmenti IP XD NEMO Xq28 MYH9 related disorders (e.g. Epstain syndrome) AD MYH9 22q12.3 Facioscapulohumerální FSHD AD FRG1 4q35 muskulární dystrofie Smith-Lemli-Opitz syndrom SLOS AR DHCR7 11q13.4 Kongenitální adrenální hyperplazie CAH AR CYP21 6p2.1-3 Mukopolysacharidóza III, typ A (Sanfilipův syndrom) MPS3 AR SGSH 17q25.3 Deficit alfa1-antitrypsinu A1AT AR SERPINA1 14q32.1 Mnohočetná endokrinní neoplázie 2A MEN2A AD RET 10q11.2 Zadní polymorfní dystrofie rohovky PCCD1 AD celý lokus 20p11.2 Gen Chromozom V. POSTNATÁLNÍ LABORATORNÍ DIAGNOSTIKA Cytogenetická laboratoř provedla celkem kultivací, z toho karyotypizací. V nich bylo nalezeno 76 patologií (2,5 %). Metody molekulární cytogenetiky (FISH) byly použity v 59 případech (včetně prenatálních). Metodou SNP array byli vyšetřeni 443 pacienti a metodou array CGH 64 pacienti. U 105 (21 %) byl nález pozitivní. Molekulárně genetická laboratoř vyšetřila postnatálně celkem 9500 vzorků. Seznam provedených vyšetření Vyšetření trombofilních mutací 4014 Vyšetření mutací CFTR genu 2846 Vyšetření delecí dlouhého raménka chrom. Y 240 Vyšetření polymorfismu N680S pro FSHr 469 Vyšetření expanze v genu pro FRAXA 167 Vyšetření delecí genu SMN Vyšetření skupin onkogenů metodou NGS 278 Prediktivní test NGS sekvenační analýza genu 60 Vyšetření mikrosatelitové nestability MSI 5 Vyšetření nejčastějších mutací HFE genu 23 Vyšetření genů SPG3, SPG4, SPG31 62 Vyšetření genu COX Vyšetření genu SOD1 3 Vyšetření genu MARVELD2 2 Vyšetření genu NBS1 10 Vyšetření mutace CMS_1267del G 7 Postnatální vyšetření trizomie 21 0 Celkem

9 VI. KONTROLA KVALITY Naším cílem je, aby výsledek každé léčby byl úspěšný. K dosažení tohoto cíle je nutné, abychom pacientům poskytovali kvalitní a odbornou péči, což potvrzujeme každý rok při absolvování auditu certifikace systému řízení jakosti podle normy ČSN EN ISO 9001:2009. Zároveň jsme také držiteli akreditace ČSN EN ISO 15189:2013 pro naši zdravotnickou laboratoř č Každoročně se cytogenetická a molekulárně genetická laboratoř účastní mezilaboratorních kontrol kvality, a to na republikové i mezinárodní úrovni. This certificate confirms that: GENNET, s.r.o. Kostelni 9 Praha Czech Republic Performance Certificate 2015 achieved the following in the 2015 CEQAS EQA round: Scheme Achievement 2015 Blood -postnatal (online) EQA Satisfactory 2015 Constitutional microarray analysis -postnatal sample 2015 Satisfactory Please note that laboratories are expected to attain a satisfactory performance. 31 March 2016 Signed by: Dr. Rosalind Hastings, PhD, FRC Path Cytogenetic External Quality Assessment Service Scheme Director CEQAS, Level 2 Women's Centre, Oxford University Hospitals NHS Trust, Headington, OXFORD, OX3 9DU, United Kingdom Tel: Fax ros.hastings@ouh.nhs.uk Web site: Page 1 of 1 CEQAS: Blood - postnatal (online) EQA; Constitutional microarray analysis -postnatal sample DAkkS: Molecular genetics sets 9; 10; 12; 13 7

10 DAkkS: Haemochromatosis FN Brno: Mezilaboratorní kontrola kvality práce v rámci DNA laboratoří: Vyšetření mikrodelecí azoospermatického faktoru FN Brno: Mezilaboratorní externí kontrola kvality: Stanovení vrozených genetických trombofilních markerů UK NEQAS: PGD Stage 2 DM 8

11 Nová alergoimunologická laboratoř má pro rok 2015 následující osvědčení kvality: SEKK: Cyklus EHK: TIE2/15 Stanovení celkového lge SEKK: Cyklus EHK: APLA2/15 Antifosfolipidové protilátky SEKK: Cyklus EHK: AIM2/15 Autoimunita SEKK: Cyklus EHK: IGIT2/15 Imunopatologie GIT 9

12 RfB: Survey for allergologic determinations in serum Splněním podmínek a kritérií potřebných pro získání certifikátů kontroly kvality a akreditace jsme potvrdili svou odbornost, objektivitu a nezávislost nezbytnou pro vykonávání naší práce. 10

13 VII. PUBLIKAČNÍ ČINNOST Postery na mezinárodních konferencích BŘEZINOVÁ S. and coll. A contribution of SNP array in prenatal diagnosis in fetuses with agenesis corpus callosum. 14th World Congress in Fetal Medicine Crete , June nd June DOLEŽAL M. and coll., Skeletal dysplasia case report. 14th World Congress in Fetal Medicine Crete , June nd June HLAVOVÁ E. Unbalanced translocation associated with acrania in two subsequent pregnancies. European Human Genetics Conference, Glasgow, KRUTÍLKOVÁ V., BEČVÁŘOVÁ V., TRKOVÁ M., KULOVANÝ E. a STEJSKAL D. Prenatal case of 17q12 deletion detected by SNP array (Centre for Medical Genetics and Reproductive Medicine GENNET, Praque, Czech Republic), J01.33: European Human Genetics Conference. Glasgow, United Kingdom, SOLDÁTOVÁ I., PUTZOVÁ M., MAREŠOVÁ I., HORÁČKOVÁ S., ZEMBOL F. a STEJSKAL D. The first experience with detection of aneuploidy using next- -generation sequencing within preimplantation genetic diagnosis. European Human Genetics Conference, Glasgow, Publikace v odborných časopisech BASÁK A., HANCAROVÁ M., ULIRSCH JC., BALCI T.B., TRKOVÁ M., PELÍŠEK M., VLČKOVÁ M., MUZIKOVÁ K., ČERMÁK J., TRKA J., DYMENT D.A., ORKIN S.H., DALY M.J., SEDLÁČEK Z. a SANKARAN V.G., BCL11A deletions result in fetal hemoglobin persistence and neurodevelopmental alterations. J Clin Invest Jun;125(6): doi: /JCI Epub 2015 May 4. BORGULOVÁ I., PUTZOVÁ M., KRAUTOVÁ L., PECNOVÁ L., MÍKA L., KŘEN R., POTUŽNÍKOVÁ P. a STEJSKAL D. Experimental study Preimplantation genetic diagnosis of X-linked diseasesexamined by indirect linkage analysis. Bratisl Med J (9). HYNEK M., ZEMBOL F., PUTZOVÁ M., MAREŠOVÁ I., HORÁČKOVÁ S., ZVÁROVÁ J. a STEJSKAL D. MoM-based approach to non-invasive prenatal testing using exponentially weighted moving average chart and chromosomal fingerprint. Intern J Biomed Healthcare 2015, 3(2), HYNEK M., ZEMBOL F., MAREŠOVÁ I., HORÁČKOVÁ S., PUTZOVÁ M. a STEJSKAL D. MoM-based approach to non-invasive prenatal testing using exponentially weighted moving average chart and chromosomal fingerprint. Ultrasound Obstet Gynecol (Suppl. 1): 9. (conference abstract). HYNEK M., LONG J. D., STEJSKAL D. a ZVÁROVÁ J. Statistické metody pro tvorbu časově závislých percentilových grafů pro hodnocení velikosti plodu a dataci gravidity na základě longitudinálních dat. Sborník semináře Sémantická interoperabilita v biomedicíně a zdravotnictví. 2015, HYNEK M., SMETANOVÁ D. a STEJSKAL D. Chorionic villus sampling: an overview of the 11-year period in a single centre and identifying risk factors for miscarriage. Ultrasound Obstet Gynecol 2015., 46 (Suppl. 1): 157. (conference abstract). LIŠKOVÁ P., EVANS C.J., DAVIDSON A.E., ZALIOVÁ M., DUDÁKOVÁ L, TRKOVÁ M., STRANECKÝ V., CARNT N., PLAGNOL V., VINCENT AL, TUFT S.J. a HARDCASTLE A.J., Heterozygous deletions at the ZEB1 locus verify haploinsufficiency as the mechanism of disease for posterior polymorphous corneal dystrophy type 3. Eur J Hum Genet Oct 28. doi: /ejhg [Epub ahead of print] SMETANOVÁ D., HYNEK M., BŘEZINOVÁ S., DOLEŽAL M., VÁVROVÁ J. a STEJSKAL D. Modified sequential test for prenatal screening of chromosomal abnormalities: a 5-year study. Ultrasound Obstet Gynecol (Suppl. 1): 87. (conference abstract). TRKOVÁ M., PUTZOVÁ M., BEČVÁŘOVÁ V., HORÁČEK J., SOLDÁTOVÁ I., KRAUTOVÁ L., SEKOWSKÁ M., HODÁČOVÁ J., HNYKOVÁ L., HLAVOVÁ E., SMETANOVÁ D., a STEJSKAL D., Implementation of arrays in first trimester prenatal diagnosis. Česká Gynekol Jun;80(3): Czech. TRKOVÁ M., KRUTÍLKOVÁ V., SMETANOVÁ D., BEČVÁŘOVÁ V., HLAVÁČOVÁ E., JENČÍKOVÁ N., HODAČOVÁ J., HNYKOVÁ L, HRONCOVÁ H., HORÁČEK J. a STEJSKAL D. ISPD gene homozygous deletion identified by SNP array confirms prenatal manifestation of Walker-Warburg syndrome. Eur J Med Genet Aug;58(8): doi: /j.ejmg Epub 2015 Jun 16. Přednášky na tuzemských konferencích BEČVÁŘOVÁ V., DVOŘÁČKOVÁ N., GŘEGOŘOVÁ A., et al. Změny počtu kopi v oblastech 3p26.3 a 8p23.1 ve vztahu k neuropsychickým poruchám. Brno, Celostátní sjezd lékařské genetiky a 48. výroční cytogenetická konference. BŘEZINOVÁ S., SMETANOVÁ D., HYNEK M., HLAVOVÁ E., BEČVÁŘOVÁ V., TRKOVÁ M. a STEJSKAL D. SNP array v prenatální diagnostice u plodů s agenezí corpus callosum. 36. celostátní konference SEKCE ULTRAZVUKOVÉ DIAGNOSTIKY, 2015, Brno. DOLEŽAL M., SMETANOVÁ D., HYNEK M., BŘEZINOVÁ S., KILIJÁNOVÁ D., LANGEROVÁ A., BRANDEJSKÁ M. a JAROŠOVÁ R. Je 3D diagnostika vrozených vývojových vad dělohy jednoznačnou indikací. 36. celostátní konference SEKCE ULTRAZVUKOVÉ DIAGNOSTIKY, 2015, Brno. HYNEK M., Přehled současného stavu neinvazivního prenatálního testování. State-of-the-art přednáška: Konference Ultrazvuk a zobrazování v gynekologii a porodnictví, Česká společnost pro ultrazvuk v porodnictví a gynekologii ČLS JEP. Olomouc, Září HYNEK M., Klinický význam růstových a datačních křivek v I., II. a III. trimestru. Přednáška. Konference Ultrazvuk a zobrazování v gynekologii a porodnictví, Česká společnost pro ultrazvuk v porodnictví a gynekologii ČLS JEP. Olomouc, Září HYNEK M., LONG J. D., STEJSKAL D. a ZVÁROVÁ J. Statistické metody pro tvorbu časově závislých percentilových grafů pro hodnocení velikosti plodu a dataci gravidity na základě longitudinálních dat. Přednáška. Semantická interoperabilita v biomedicíně a zdravotnictví VI. Praha, Září HYNEK M., ZEMBOL F., PUTZOVÁ M., MAREŠOVÁ I., HORÁČKOVÁ S. a STEJSKAL D. Neinvazivní prenatální testování aneuploidií cfdna test. Přednáška. 32. celostátní konference perinatologie a fetomaternální medicíny. Liberec, Duben HYNEK M., ZEMBOL F., MAREŠOVÁ I., HORÁČKOVÁ S. a STEJSKAL D. Distribuce volné DNA v plazmě těhotných neinvazivní prenatální testování aneuploidií. Přednáška. 15. Kaprasův den Klinická genetika. Praha, 1. LF UK, Únor HYNEK M. Využití a zneužití statistických metod v medicíně. Přednáška. 15. konference Sekce Fetální medicíny ČGPS ČLS JEP. Praha, Nemocnice na Homolce, Leden HORÁČEK J., TRKOVÁ M., BEČVÁŘOVÁ V., HYNKOVÁ L., HRONCOVÁ H., PUTZOVÁ M. a STEJSKAL D. Array v prenatální diagnostice jak dál? Pracovní den SLG ČLS JEP Kaprasův den.praha. HORÁČKOVÁ S., MAREŠOVÁ I., ZEMBOL F., VÁVROVÁ J., STEJSKAL D., HYNEK M. a PUTZOVÁ M. CfDNA test - screening distribuce volné DNA v maternální plazmě. 19. celostátní konference DNA diagnostiky, Praha, KILIJÁNOVÁ D., SMETANOVÁ D., KRUTÍLKOVÁ V. a KOČÍ M. Prenatální diagnostika DiGeorgova syndromu s ukončením těhotenství. 36. celostátní konference SEKCE ULTRAZVUKOVÉ DIAGNOSTIKY, 2015, Brno. MAREŠOVÁ I. Neinvazivní prenatální testování aneuploidií cfdna test. Kaprasův den, LHOTA F., ČERNÁ L., HONYSOVÁ B., ZEMBOL F., STEJSKAL D., KOUDOVÁ M., BITTÓOVÁ M. a PUTZOVÁ M. Klinická analýza hereditárních malignit zkušenosti s novým NGS panelem CZECANCA. 19. celostátní konference DNA diagnostiky, Praha, PUTZOVÁ M., SOLDÁTOVÁ I., ZEMBOL F. a MAREŠOVÁ I. Využití NGS v preimplantační diagnostice. CELOSTÁTNÍ SJEZD LÉKAŘSKÉ GENETIKY A 48. VÝROČNÍ CYTOGENETICKÉ KONFERENCE BRNO SMETANOVÁ D. a STEJSKAL D. Prenatální diagnostika častých aneuploidií v centru GENNET Konference fetální medicíny, Kongresové Centrum Nemocnice na Homolce, Praha, SMETANOVÁ D. a STEJSKAL D. Vývoj screeningu a diagnostiky nejčastějších chromosomálních aberací za posledních 10 let. XXXII. Celostátní konference perinatologie a fetomaternální medicíny s mezinárodní účastí, Liberec, SMETANOVÁ D. VVV dělohy, nová klasifikace, indikace k operační hysteroskopii. 36. celostátní konference SEKCE ULTRAZVUKOVÉ DIAGNOSTIKY, 2015, Brno. SMETANOVÁ D. Modifikovaný sekvenční test překonaná metoda skríningu VVV v ČR. ULTRAZVUK A ZOBRAZOVÁNÍ V GYNEKOLOGII A PORODNICTVÍ, Čechova ultrazvuková konference, Česká společnost pro ultrazvuk v porodnictví a gynekologii ČLS JEP, Celostátní konference s mezinárodní účastí ve spolupráci s Fetal MEdicine Foundation (Londýn), Olomouc, TRKOVÁ M., HYNEK M., DUDÁKOVÁ L., HLOŽÁNEK M., BEČVÁŘOVÁ V., HARDCASTLE A.J. a LIŠKOVÁ P.. Kombinace genomických metod odhaluje skutečnou genetickou příčinu bilaterální katarakty u dvou prenatálně vyšetřených plodů. České Budějovice, 19. celostátní konference DNA diagnostiky. 11

14 Publikace v impaktovaných časopisech FULKA H., KYOGOKU H., ZATSEPINA O. a LANGEROVÁ A. Can nucleoli be markers of developmental potential in human zygotes?: Trends in Molecular Medicine 21, 2015, A.1 - Fulka, Jr., J. 1GENNET, Prague, Czech Republic. Přednášky na mezinárodních konferencích HODAČOVÁ J., TRKOVÁ M., BEČVÁŘOVÁ V., PEKOVÁ H., JENČÍKOVÁ N., HNYKOVÁ L., FILIPOVÁ M., HRONCOVÁ H., HRONCOVÁ E. a HORÁČEK J., Preimplantační genetický screening aneuploidií u embryí vyšetřovaných metodami 24sure a 24sure+ microarray na pracovišti GENNET v období XXVI. Izakovičov memoriál, Zemplínska Šírava, Slovensko HYNEK M., ZEMBOL F., MAREŠOVÁ I., HORÁČKOVÁ S., PUTZOVÁ M. a STEJSKAL D. Chorionic villus sampling: an overview of the 11-year period in a single centre and identifying risk factors for miscarriage. 25th World Congress in Ultrasound in Obstetrics and Gynecology. Montreal, Canada, October 15. HYNEK M., ZEMBOL F., PUTZOVÁ M., MAREŠOVÁ I., HORÁČKOVÁ S. a STEJSKAL D. MoM-based approach to noninvasive prenatal testing using exponentially weighted moving average chart and chromosomal fingerprint. International joint Meeting EuroMISE Praha, Červen HYNEK M., ZEMBOL F., HORÁČKOVÁ S., MAREŠOVÁ I., PUTZOVÁ M. a STEJSKAL D. MoM-based approach to non-invasive prenatal testing using exponentially weighted moving average chart and chromosomal fingerprint. 25th World Congress in Ultrasound in Obstetrics and Gynecology. October 2015, Montreal, Canada., prezentace byla oceněna cenou Free Communication Award za nejlepší prezentaci ve své kategorii HYNEK M., SMETANOVÁ D. a STEJSKAL D. Chorionic villus sampling: an overview of the 11-year period in a single centre and identifying risk factors for miscarriage. 25th World Congress in Ultrasound in Obstetrics and Gynecology. October 2015, Montreal, Canada., HYNEK M., ZEMBOL F., PUTZOVÁ M., MAREŠOVÁ I., HORÁČKOVÁ S. a STEJSKAL D.. MoM-based approach to noninvasive prenatal testing using exponentially weighted moving average chart and chromosomal fingerprint. International joint Meeting EuroMISE Červen 2015, Praha., TRKOVÁ M., PUTZOVÁ V., BEČVÁŘOVÁ V., HORÁČEK J., SOLDÁTOVÁ I., KRAUTOVÁ L., SEKOWSKÁ M., HODAČOVÁ J., HNYKOVÁ L., HLAVOVÁ E., SMETANOVÁ D. a STEJSKAL D. Array vyšetření v prenatální diagnostice I. Trimestru XXVI. Izakovičov memoriál, Zemplínska Šírava, Slovensko SMETANOVÁ D., HYNEK M., KULOVANÝ E., BŘEZINOVÁ S., KILIJÁNOVÁ D., DOLEŽAL M., VÁVROVÁ D. a STEJSKAL D. Modified sequential test for prenatal screening of chromosomal abnormalities: a 5-year study. 25th World Congress on Ultrasound in Obstetrics and Gynecology, Canada, Montréal, TRKOVÁ M., BAXOVÁ A., HEJTMÁNKOVÁ M., BEČVÁŘOVÁ, E. KULOVANÝ, M. DOLEŽAL M., HORÁČEK J. a STEJSKAL D. Prenatal detection of likely causal 4q28.3q31.21 microdeletion in a foetus with skeletal dysplasia. Glasgow, Scotland, RAŠKOVÁ D., HYNEK M., LÍSKOVÁ G., TRKOVÁ M., PUTZOVÁ M. a STEJSKAL D. Warburg micro syndrome in two siblings with cataract detected by prenatal ultrasound investigation. 26. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft fur Humangenetik, Graz, April 15-17, Spoluautorství v publikacích (včetně publikovaných abstraktů) ŠÍPEK A. Jr., GREGOR V., HORÁČEK J., JÍROVÁ J. a ŠÍPEK A., Czech registry of congenital anomalies. Reproductive Toxicology. 2015, 57:210. (abstrakt). Abstrakt konferenčního příspěvku v časopise s impakt faktorem. ŠÍPEK A. Jr., GREGOR V., HORÁČEK J., ŠÍPEK A. a CALDA P. Impact of first trimester screening on Trisomy 21 detection and incidence of invasive procedures in the years (population based data). Ultrasound in Obstetrics and Gynecology 2015, 46(S1): (abstrakt). Abstrakt konferenčního příspěvku v časopise s impakt faktorem. ŠÍPEK A. Jr., GREGOR V., HORÁČEK J., VENCÁLEK O., ŠÍPEK A. Trends in the prenatal diagnostics of the Down syndrome in the Czech Republic: What is the association with the maternal age? EJHG 2015; 23(Suppl1):468. (abstrakt). Abstrakt konferenčního příspěvku v časopise s impakt faktorem. ŠÍPEK A. Jr., GREGOR V., HORÁČEK J., ŠÍPEK A. Mezinárodní den vrozených vad. Časopis lékařů českých. 2015, 154(2):101. ŠÍPEK A. Jr., GREGOR V., HORÁČEK J., ŠÍPEK A. Jr., KLASCHKA j., Malý M., Prevalence vybraných vrozených vad v České republice vývojové vady centrálního nervového systému a zažívacího traktu. Epidemiologie, mikrobiologie, imunologie. 2015, 64(1): ŠÍPEK A. Jr., GREGOR V., HORÁČEK J., ŠÍPEK A. Významná výročí v oblasti registrace vývojových vad. Aktuální gynekologie a porodnictví. 2015, 7: Publikace Trková TRKOVÁ M., SMETANOVÁ D., KRUTÍLKOVÁ V., BEČVÁŘOVÁ V., HLAVOVÁ E., HRONCOVÁ E., STEJSKAL D. a HORÁČEK J. ISPD gene homozygouts deletion identified by SNP array confirms prenatal manifestation of Walker Warburg syndrome. European Journal of Medical Genetics, 2015 TRKOVÁ M., PUTZOVÁ M, SOLDÁTOVÁ I., KRAUTOVÁ L., SEKOWSKÁ M., HODAČOVÁ J., HYNKOVÁ L., SMETANOVÁ D., BEČVÁŘOVÁ V., HLAVOVÁ E., STEJSKAL D. a HORÁČEK J. Implementace array vyšetření doprenatální diagnostiky v I. trimestru. Česká Gynekologie, 80 (3): , BASAK A., TRKOVÁ M., HANCAROVA M., ULIRSCH J. C., BALCI T. B., PELÍŠEK M., VLČKOVÁ M., MUZIKOVÁ K., ČERMÁK J., TRNKA J., DYMENT D. A., ORKIN S. H., DALY M. J., SEDLÁČEK Z. a SANKARAN V. G. BCL11A deletions result in fetal hemoglobin persistence and neurodevelopmental alterations. J Clin Invest,

15 VIII. PERSONÁLNÍ OBSAZENÍ GENNET (STAV K ) Generální ředitelka GENNET, s.r.o. Ivana Kavková Vedoucí lékař MUDr. David Stejskal Vedoucí IVF programu a GENNET Scientific Board MUDr. Milada Brandejská Vedoucí lékař oddělení fetální medicíny MUDr. Dagmar Smetanová, CSc. Vedoucí lékař genetického programu MUDr. Monika Koudová 13

16 VIII. PERSONÁLNÍ OBSAZENÍ GENNET (STAV K ) PRAHA LETNÁ Lékařská genetika MUDr. Monika Koudová MUDr. Eva Hlavová MUDr. Jan Diblík, Ph.D. MUDr. Michaela Hejtmánková MUDr. Věra Krutílková MUDr. Dagmar Rašková MUDr. David Stejskal Fetální medicína MUDr. Dagmar Smetanová, CSc. MUDr. Markéta Bahníková MUDr. Sabina Březinová MUDr. Martin Doležal MUDr. Martin Hynek MUDr. Dita Kilijánová MUDr. Eduard Kulovaný, CSc. Centrum asistované reprodukce MUDr. Milada Brandejská MUDr. Veronika Hrochová MUDr. Radka Jarošová MUDr. Alena Langerová, Ph.D. MUDr. Kateřina Rožníčková MUDr. Lenka Vykysalá Laboratoř IVF vedoucí laboratoře Ing. Josef Míka, CSc. Laboratoř molekulárně genetická vedoucí laboratoře Mgr. Martina Bittóová Laboratoř cytogenetická vedoucí laboratoře RNDr. Jiří Horáček Fetální kardiologie (privátní) MUDr. Viktor Tomek Dětská kardiologie MUDr. Jiří Gilík Andrologie MUDr. Viktor Vik Hlavní sestra Ivana Hrodějová Vrchní sestra IVF Hana Šímová PRAHA ARCHA Centrum asistované reprodukce MUDr. Martin Valachovič MUDr. Michaela Bartošová MUDr. Simona Bukvová MUDr. Kateřina Bláhová MUDr. Milan Daněk MUDr. Miroslav Landfeld MUDr. Jiří Vokroj Laboratoř IVF vedoucí laboratoře Ing. Vlastimil Weber Laboratoř imunologická vedoucí laboratoře Ing. Štěpánka Luxová Lékařská genetika Doc. MUDr. Alice Baxová, CSc. MUDr. Jan Diblík, Ph.D. MUDr. Eva Raušová Urologie a andrologie MUDr. Viktor Vik Vrchní sestra Pavla Vlková LIBEREC Lékařská genetika MUDr. David Stejskal MUDr. Jan Diblík, Ph.D. MUDr. Gabriela Křečková Fetální medicína MUDr. Vendula Johannová MUDr. Jaroslav Soukeník MUDr. Kateřina Lebedová Centrum asistované reprodukce MUDr. Veronika Mokrá MUDr. Petra Holcová Laboratoř IVF vedoucí laboratoře Ing. Dagmar Milická Laboratoř cytogenetická vedoucí laboratoře Ing. Jitka Zatloukalová Vrchní sestry Jana Vacková Jana Stránská GENNET CITY FERTILITY Centrum asistované reprodukce Dr. Martin Hrehorčák Dr. Safaa Maxwell Vrchní sestra Jane Holman Laboratoř IVF vedoucí laboratoře Shaun Rogers 14

17 GENNET Letná Kostelní Praha 7 tel.: GENNET Archa Na Poříčí Praha 1 tel.: GENNET Liberec Liliová Liberec tel.: člen skupiny