16 Semiempirické přístupy

Podobné dokumenty
METODY VÝPOČETNÍ CHEMIE

Operátory a maticové elementy

Od kvantové mechaniky k chemii

Ab initio výpočty v chemii a biochemii

17 Vlastnosti molekul

Atomové a molekulové orbitaly Ion molekuly vodíku. Molekula vodíku Heitler-Londonovou metodou. Metoda LCAO. Báze atomových orbitalů.

Mul$determinantální metody: CASSCF

Přehled Ab Initio a semiempirických metod

Modelové výpočty na H 2 a HeH +

Teorie chemické vazby a molekulární geometrie Molekulární geometrie VSEPR

Atom vodíku. Nejjednodušší soustava: p + e Řešitelná exaktně. Kulová symetrie. Potenciální energie mezi p + e. e =

Teorie hybridizace. Vysvětluje vznik energeticky rovnocenných kovalentních vazeb a umožňuje předpovědět prostorový tvar molekul.

Molekuly 1 12/4/2011. Molekula definice IUPAC. Molekuly. Proč existují molekuly? Kosselův model. Představy o molekulách

Nekovalentní interakce

Co je obsahem numerických metod?

Vzpěr jednoduchého rámu, diferenciální operátory. Lenka Dohnalová

Nekovalentní interakce

ANALYTICKÁ GEOMETRIE LINEÁRNÍCH ÚTVARŮ V ROVINĚ

Hamiltonián popisující atom vodíku ve vnějším magnetickém poli:

a počtem sloupců druhé matice. Spočítejme součin A.B. Označme matici A.B = M, pro její prvky platí:

Věta 12.3 : Věta 12.4 (princip superpozice) : [MA1-18:P12.7] rovnice typu y (n) + p n 1 (x)y (n 1) p 1 (x)y + p 0 (x)y = q(x) (6)

ATOM VODÍKU MODEL : STOJÍCÍ BODOVÉ JÁDRO A ELEKTRON VZÁJEMNĚ ELEKTROSTATICKY INTERAGUJÍCÍ SCHRÖDINGEROVA ROVNICE PRO PŘÍPAD POTENCIÁLNÍ ENERGIE.

Připomenutí co je to soustava lineárních rovnic

Nejdřív spočítáme jeden příklad na variaci konstant pro lineární diferenciální rovnici 2. řádu s kostantními koeficienty. y + y = 4 sin t.

Optické spektroskopie 1 LS 2014/15

13 Elektronová struktura molekul

Diferenciální rovnice 1

Lingebraické kapitolky - Analytická geometrie

1 Tyto materiály byly vytvořeny za pomoci grantu FRVŠ číslo 1145/2004.

1 Projekce a projektory

2. Polarita vazeb, rezonance, indukční a mezomerní

Emise vyvolaná působením fotonů nebo částic

Základy maticového počtu Matice, determinant, definitnost

Teoretická chemie 1. cvičení

Orbitaly, VSEPR 1 / 18

Integrace. Numerické metody 7. května FJFI ČVUT v Praze

14. přednáška. Přímka

Orbitaly, VSEPR. Zdeněk Moravec, 16. listopadu / 21

VEKTORY. Obrázek 1: Jediný vektor. Souřadnice vektoru jsou jeho průměty do souřadných os x a y u dvojrozměrného vektoru, AB = B A

19 Eukleidovský bodový prostor

Definice. Vektorový prostor V nad tělesem T je množina s operacemi + : V V V, tj. u, v V : u + v V : T V V, tj. ( u V )( a T ) : a u V které splňují

2. Určete jádro KerL zobrazení L, tj. nalezněte alespoň jednu jeho bázi a určete jeho dimenzi.

1 Analytická geometrie

Polynomy a interpolace text neobsahuje přesné matematické definice, pouze jejich vysvětlení

(Cramerovo pravidlo, determinanty, inverzní matice)

VYBRANÉ PARTIE Z NUMERICKÉ MATEMATIKY

Balmerova série. F. Grepl 1, M. Benc 2, J. Stuchlý 3 Gymnázium Havlíčkův Brod 1, Gymnázium Mnichovo Hradiště 2, Gymnázium Šumperk 3

7. Derivace složené funkce. Budeme uvažovat složenou funkci F = f(g), kde některá z jejich součástí

9 Kolmost vektorových podprostorů

Operace s maticemi. 19. února 2018

Vektory a matice. Obsah. Aplikovaná matematika I. Carl Friedrich Gauss. Základní pojmy a operace

Kvantová fyzika atomárních soustav letní semestr VIII. KOTLÁŘSKÁ 23. DUBNA 2014

10 Více-elektronové atomy

Laserová technika prosince Katedra fyzikální elektroniky.

Matematika (CŽV Kadaň) aneb Úvod do lineární algebry Matice a soustavy rovnic

Born-Oppenheimerova aproximace

Nebojte se kvant. Technische Universität Carolo Wilhelmina zu Braunschweig. Michal Kolář

Diskutujte, jak široký bude pás spojený s fosforescencí versus fluorescencí. Udělejte odhad v cm -1.

VÍTEJTE V MIKROSVĚTĚ

1 0 0 u 22 u 23 l 31. l u11

Balmerova série vodíku

9.2. Zkrácená lineární rovnice s konstantními koeficienty

Balmerova série, určení mřížkové a Rydbergovy konstanty

Metoda nejmenších čtverců Michal Čihák 26. listopadu 2012

Arnoldiho a Lanczosova metoda

Teorie Molekulových Orbitalů (MO)

Elektronový obal atomu

1 Řešení soustav lineárních rovnic

Gymnázium Vysoké Mýto nám. Vaňorného 163, Vysoké Mýto

0.1 Úvod do lineární algebry

Oddělení pohybu elektronů a jader

stránkách přednášejícího.

INVESTICE DO ROZVOJE VZDĚLÁVÁNÍ. Modernizace studijního programu Matematika na PřF Univerzity Palackého v Olomouci CZ.1.07/2.2.00/28.

ATOMOVÁ SPEKTROMETRIE

Lineární algebra : Metrická geometrie

Lineární stabilita a teorie II. řádu

Soustavy. Terminologie. Dva pohledy na soustavu lin. rovnic. Definice: Necht A = (a i,j ) R m,n je matice, b R m,1 je jednosloupcová.

Úvodní informace Soustavy lineárních rovnic. 12. února 2018

1 Linearní prostory nad komplexními čísly

6 PŘEDNÁŠKA 6: Stav kvantového systému, úplná množina pozorovatelných. Operátor momentu hybnosti a kvadrátu momentu hybnosti.

jádro a elektronový obal jádro nukleony obal elektrony, pro chemii významné valenční elektrony

Řešit atom vodíku znamená nalézt řešení Schrödingerovy rovnice s příslušným hamiltoniánem. 1 4πǫ 0. 2m e

4.1 Řešení základních typů diferenciálních rovnic 1.řádu

Vazby v pevných látkách

John Dalton Amadeo Avogadro

Matematika 1 MA1. 1 Analytická geometrie v prostoru - základní pojmy. 4 Vzdálenosti. 12. přednáška ( ) Matematika 1 1 / 32

1. Kvantové jámy. Tabulka 1: Efektivní hmotnosti nosičů v krystalech GaAs, AlAs, v jednotkách hmotnosti volného elektronu m o.

Otázku, kterými body prochází větev implicitní funkce řeší následující věta.

Operace s maticemi

SPECIÁLNÍCH PRIMITIVNÍCH FUNKCÍ INTEGRACE RACIONÁLNÍCH FUNKCÍ

Příklady pro předmět Aplikovaná matematika (AMA) část 1

Maticí typu (m, n), kde m, n jsou přirozená čísla, se rozumí soubor mn veličin a jk zapsaných do m řádků a n sloupců tvaru:

Cvičení 5 - Inverzní matice

Soustavy linea rnı ch rovnic

IB112 Základy matematiky

Afinita je stručný název pro afinní transformaci prostoru, tj.vzájemně jednoznačné afinní zobrazení bodového prostoru A n na sebe.

SOUSTAVY LINEÁRNÍCH ALGEBRAICKÝCH ROVNIC

Transkript:

16 Semiempirické přístupy V této kapitole se podíváme na skupinu semiempirických metod. Ačkoli semiempirické metody také vycházejí z řešení elektronové Schrödingerovy rovnice, jejich rovnice obsahují dodatečné parametry, jejichž hodnoty se typicky získávají z přesnějších ab initio výpočtů nebo se z experimentálních dat. Semiempirické metody jsou přibližné na dvou úrovních. V první řadě, většina semiempirických metod nevychází z přesného molekulárního hamiltoniánu, ale určitého efektivního hamiltoniánu, ve kterém jsou zanedbány některé členy. Většina semiempirických metod se například soustředí pouze na valenční elektrony (příspěvek ostatních elektronů je brán jako konstanta), což celkový hamiltonián systému značně zjednoduší. Po určení hamiltoniánu se při odvození typické semiempirické metody postupuje obdobně jako při odvození HF rovnic. Zvolíme si konkrétní tvar vlnové funkce a zvolíme bázi (metoda MO-LCAO) a aplikací variačního principu odvodíme pracovní rovnice. V tomto kroku ale u semiempirických metod dojde k výše zmíněnému dalšímu zjednodušení. Některé členy z rovnic můžeme úplně zanedbat a položit rovno nule, anebo je můžeme považovat za parametry, se kterými dosáhneme nejlepšího souladu s experimenty pro určitý vybraný soubor molekul. Experimentálním údajem, vůči kterému se srovnáváme, mohou být termodynamické parametry daných látek. Při použití semiempirických metod je proto třeba být velmi obezřetný. Mohou fungovat skvěle pro látky, na které byla metoda parametrizována a látky jím podobné, ale pro odlišné struktury mohou hanebně selhávat. Motivací k vývoji semiempirických metod bylo zmenšení výpočetních nároků ab initio metod s pokud možno co nejmenším ovlivněním přesnosti. Dnes již mají vrchol své popularity za sebou. Nicméně i metody, které byly kvantitativně nepřesné, se ukázaly jako velmi užitečné, neboť dovolily kvalitativní pochopení zákonitostí chemických vazeb a jiných vlastností molekul. Na jednu takovou metodu, která nám dala známé Hückelovo pravidlo 4n +2 pro určení aromaticity, se nyní podíváme. 16.1 Hückelova metoda Hückelova metoda (dále jen HM) je historicky první a asi i nejjednodušší semiempirická metoda. Pro menší molekuly je pro použití této metody potřeba doslova jen tužka a papír. soustředíme se pouze na určitou skupinu elektronů, energeticky dobře oddělenou od ostatních elektronů. Typickým příkladem jsou π vazebné elektrony v konjugovaných uhlovodících, tedy elektrony v molekulových orbitalech složených z atomových p orbitalů. Hamiltonián HM metody má tvar H HMO = h π i,eff, (16.1) kde h π i,eff je jednoelektronový potenciál π elektronu, který v sobě obsahuje jak kinetickou energii, tak interakce s ostatními elektrony. Z tvaru hamiltoniánu coby součtu jednoelektronových členů je zřejmé, že elektrony jsou zde považovány za nezávislé (to je zásadní rozdíl oproti metodě HF, ve které je nezávislost elektronů vyjádřena pouze tvarem vlnové funkce). Konkrétní tvar těchto efektivních elektronových hamiltoniánů není specifikován, neboť, jak uvidíme dále, vlastně ani není potřeba. Dalším krokem je výběr báze. V případě metody HM to budou p z orbitaly všech uhlíkových atomů φ = c i χ i. (16.2) i 129

Matematický tvar těchto orbitalů nás ale opět nezajímá. Tím převedeme problém nalezeni vlnové funkce na jednodušší problém najití koeficientů c i. Pokud tuto vlnovou funkci dosadíme do Schrödingerovy s hamiltoniánem (16.1) a aplikujeme variační princip, dostaneme soustavu sekulárních rovnic. Z podmínky pro netriviální řešení této soustavy pak platí H ɛs =0. (16.3) Pro lepší ilustraci budeme nadále uvažovat výpočet pro molekulu butadienu. Elektronová báze se zde skládá ze čtyř p z orbitalů. Sekulární determinant zde má tvar H 11 ɛs 11 H 21 ɛs 21 H 31 ɛs 31 H 41 ɛs 41 H 12 ɛs 12 H 22 ɛs 22 H 32 ɛs 32 H 42 ɛs 42 H 11 ɛs 13 H 23 ɛs 23 H 33 ɛs 33 H 43 ɛs 43 =0. (16.4) H 11 ɛs 14 H 24 ɛs 24 H 34 ɛs 34 H 44 ɛs 44 Nyní bychom měli spočítat integrály H ij a S ij, které v principu závisí na geometrii systému. V rámci Hückelovy aproximace na ně ale pohlížíme jako na parametry metody a naložíme s nimi takto: zanedbáme překryvové integrály mezi AO na různých atomech tj. S ij = δ ij ; integrály H ii položíme rovny parametru α, těmto integrálům říkáme coulombovské integrály; integrály H ij položíme rovno nule, pokud orbitaly nepatří sousedním atomům. Nenulové integrály položíme rovno parametru β. Nazýváme je rezonančními integrály. Takto zjednodušené rovnice poté vyřešíme. Nejprve najdeme vlastní čísla přes sekulární determinant a následně určíme koeficienty c i. V případě butadienu bude Hückelův sekulární determinant vypadat následovně α ɛ β 0 0 β α ɛ β 0 0 β α ɛ β =0. (16.5) 0 0 β α ɛ Ve druhém kroku jsme determinant vydělili β a zavedli substituci x = α β. Nyní rozvojem ɛ determinantu podle prvního řádku dostaneme x 1 0 x 1 x 1 0 1 x x 1 0 1 x 1 0 1 x = x4 3x 2 +1=0 Tuto kvartickou rovnici můžeme naštěstí převést na kvadratickou pomocí substituce y = x 2 a tedy Z toho vyplývají následující hodnoty energií y 2 3y +1=0; y 1 =2, 62; y 2 =0.382 x 1,2 =1, 62x 3,4 =0, 62 ɛ 1 = α +1, 62β ɛ 2 = α +0, 62β 130

Obrázek 33: Energetické hladiny butadienu dle Hückelovy metody a znázornění excitovaného stavu. ɛ 3 = α 0, 62β ɛ 4 = α 1, 62β Zpětným dosazením do sekulárních rovnic bychom poté dopočítali koeficienty c i a tím získali molekulové orbitaly. Ty potom obsadíme elektrony v souladu s Pauliho vylučovacím principem a celkovou energii dostaneme jako součet orbitálních energií. Jak nyní získáme parametry α a β? Vyjdeme z experimentálních dat. Parametr α má jednoduchou fyzikální interpretaci; jedná se o ionizační energii atomového orbitalu p z, která je experimentálně známá. Důležitější je parametr β, který určuje vzájemnou separaci molekulových orbitalů. Můžeme jej získat v zásadě dvěma způsoby: 1. Ze spektroskopických dat. Parametr zvolíme tak, aby nám seděly zvolené elektronové přechody (podrobnosti viz níže). Například fitováním na molekulu naftalenu získáme hodnotu β = 3, 48eV. 2. Z termochemických dat. K tomu se využívá konceptu delokalizační energie dvojných vazeb. Tuto energii můžeme experimentálně naměřit například pomocí hydrogenačního tepla. Její teoretický výpočet v rámci HM si ukážeme níže. Pojďme se nyní podívat na výpočet některých vlastností butadienu pomocí HM. 16.1.1 Excitační energie Jak můžeme pomocí HM spočítat excitační energii? Formálně excitujeme jeden elektron z obsazeného do neobsazeného orbitalu (viz obrázek 33) a potom spočítáme celkovou energii a od ní odečteme celkovou energii základního stavu. Pokud chceme spočítat nejnižší excitační energii butadienu, přesuneme jeden elektron z orbitalu 3 do orbitalu 2. Výsledná energie potom bude ΔE = ɛ 3 ɛ 4 =1, 24β = hc ν Vlnová délka excitujícího záření vyjde 287 nm, zatímco experimentální hodnota je kolem 200 nm. Soulad to není ideální, ale není ani tragický, na to že jsme jej získali tak jednoduše. HM také správně zachycuje experimentální fakt, že excitační energie se snižuje se zvyšující se délkou řetězce obsahující konjugované dvojné vazby. 16.1.2 Delokalizační energie Z organické chemie si ještě možná vzpomeneme, že konjugované dvojné vazby mají jiné vlastnosti než vazby izolované. Tuto delokalizaci můžeme vyjádřit pomocí poněkud nefyzikální veličiny delokalizační energie. 131

Pokud by se dvojné vazby vzájemně neovlivňovaly, tak by mělo platit, že HM energie nkrátkonjugovaného systému by se rovnala n-násobku energie ethenu, který má dvojnou vazbu jen jednu. Tato rovnost ale neplatí a rozdíl je právě delokalizační energie. Pojďme si vše ukázat na příkladě butadienu, jehož energii již známe. Musíme tedy dopočítat energii molekuly ethenu. Pro ten vychází následující sekulární determinant. α ɛ β β α ɛ =0 (16.6) z čehož (α ɛ) 2 = β 2 α ɛ = ±βɛ 1,2 = α ± β Pro butadien poté vychází delokalizační energie E D =0, 472β =35, 4kJ/mol. Experimentálně můžeme míru delokalizace určit pomocí hydrogenačních tepel butadienu a ethenu. Hydrogenační teplo ethenu (tj. entalpie reakce ethen + H 2 = ethan) je -136,94 kj/mol, zatímco hydrogenační teplo butadienu je -240 kj/mol. Experimentální delokalizační energie je tedy: E exp D =2 139, 9 240 = 33, 8 kj/mol, což je v dobrém souladu s námi vypočtenou hodnotou. 16.1.3 Cyklické systémy a aromaticita Asi největším úspěchem HM bylo vysvětlení aromaticity cyklických molekul. Na obrázku 34 jsou znázorněny energetické hladiny cyklických systémů typu C n H n. Parametr α představuje energii elektronu v samostatném atomu uhlíku. jestliže elektron má energii nižší než α, interakce s okolními atomu vede k poklesu energie. Jinými slovy, dochází ke vzniku chemické vazby. energie větší než α indikuje destabilizaci. Pohled na diagram přitom pěkně ukazuje, odkud se vzalo známé Hückelovo pravidlo 4n +2. Je totiž hned patrné, že molekuly s 4n+2 elektrony jsou stabilní, molekuly s 4n+1 elektrony představují radikály, molekuly s 4n elektrony představují biradikály. Příklad 20 Zadání: Jak to bude s aromaticitou cyklopropenylového radikálu? A co cyklopentadienylový radikál? Řešení: V cyklopropenylu máme tři elektrony v p z orbitalech, stabilnější tedy bude cyklopropenylový kation. V cyklopentadienylu máme elektronů pět, stabilnější tedy bude cyklopendienylový anion, který se opravdu často vyskytuje jako ligand v komplexech kovů. 132

Obrázek 34: Energetické hladiny cyklických uhlovodíků obecného vzorce C n H n dle Hückelovy metody. Degenerované hladiny jsou pro přehlednost znázorněné jako dvě hladiny těsně nad sebou. 16.2 Rozšířená Hückelova metoda Hlavním vylepšením rozšířené Hückelovy metody (RHM) je zavrhnutí π-elektronové aproximace. Stále používáme jednoelektronový Hamiltonián a molekulové orbitaly rozvíjíme podobně jako v rovnici (16.2), ale zahrnujeme všechny valenční orbitaly. Atom uhlíku tedy do báze přispěje atomovými orbitaly 2s, 2p x,2p y a2p z. Zde jsou další pravidla pro RHM: Hodnotu coulombických integrálů opět aproximujeme ionizační energií daného orbitalu. H ii = I i Hodnoty překryvových integrálů se nezanedbávají, ale počítají se explicitně. Hodnoty rezonančních integrálů se získají dle vztahu: H ij = 1 2 K(I i + I j )S ij, (16.7) kde K je empirická konstanta, která má obvykle hodnotu 1,75. Opět řešíme sekulární rovnice (16.3), ale tentokrát již matice H neobsahuje žádné nuly (pokud náhodou není S ij =0ze symetrických důvodů). Jelikož počítáme explicitně překryvové integrály, tak řešení závisí na konkrétní geometrii molekuly. Tato metoda se tedy dá použít k minimalizaci geometrie, ale výsledky často nejsou příliš kvalitní (například molekula vody vychází jako lineární). Podobně jako v původní Hückelově metodě tvar sekulárních rovnic nezávisí na řešení, a tudíž není třeba iterovat. Rozšířená Hückelova metoda se proto i nyní rutinně využívá v kvantově chemických programech k prvotnímu nástřelu vlnové funkce. 133

16.3 Moderní semiempirické metody Modernější semiempirické metody již ve svém hamiltoniánu nezanedbávají mezielektronovou repulzi. Hamiltonián je potom téměř totožný s HF hamiltoniánem, akorát se soustředíme stále jen na valenční elektrony. Tyto metody poté iterativně řeší Roothanovy rovnice. Výpočetně nejnákladnější částí jsou stejně jako v Hartreeho-Fockově metodě dvouelektronové integrály, χ i χ j 1 r 12 χ kχ l dr 1 dr 2 (16.8) a proto se právě pro ně zavádí další aproximace. Velká část metod vychází z aproximace φ i (r)φ j (r)dr =0 i j, (16.9) které se říká zanedbání diferenciálního překryvu. Jednotlivé semiempirické metody se liší mimo jiné tím, na které orbitaly tuto aproximaci uplatňují. Pojďme si některé přiblížit: Asi nejjednodušší metodou z této třídy je metoda CNDO (z angl. Complete Neglect of Differential Overlap), která zavádí ZDO aproximaci důsledně pro všechny dvojice atomových orbitalů. Méně drastickou aproximaci představuje metoda INDO (z angl. Intermediate Neglect of Differential Overlap), která výše uvedený vztah neaplikuje na dvouelektronové integrály, ve kterých jsou všechny čtyři orbitaly na stejném atomu. Tato metoda byla Zernerem modifikována pro spektroskopické účely (metoda ZINDO). Metody CNDO a INDO byly vyvinuty ve skupině Johna Popla a byly parametrizovány tak, aby výsledky odpovídaly ab initio HF výpočtům pro minimální bázi. Jiný přistup zvolil M. Dewar, který semiempirické metody začal parametrizovat tak, aby odpovídaly experimentálním hodnotám, a tím dosáhl přesnosti často větší než samotná Hartreeho-Fockova metoda. Metody AM1 (y angl. Austin Model 1), PM3 (z angl. Parametric Model 3) a jejich novější verze PM6 a PM7 jsou využívány a rozvíjeny dodnes (jejich implementace je k nalezení například ve volně dostupném programu MOPAC). Kromě výše zmíněných metod existuje také hojně využívaná semiempirická metoda založená na DFT, takzvaná DFTB (DFT Tight Binding), a řada dalších metod, občas využívaných ke speciálním případům. 134