pûvodní práce p fi e h l e d
|
|
- Marcel Staněk
- před 8 lety
- Počet zobrazení:
Transkript
1 pûvodní práce p fi e h l e d STUDIUM MUTACÍ A POLYMORFISMÒ DIHYDROPYRIMIDINDEHYDROGENÁZY (DPD) V PREDIKCI TOXICITY SPOJENÉ S PODÁNÍM FLUOROPYRIMIDINÒ ANALYSIS OF MUTATIONS AND POLYMORPHISMS OF DIHYDROPYRIMIDINE DEHYDROGENASE (DPD) IN PREDICTION OF TOXICITY CAUSED BY FLOUROPYRIMIDINES KLEIBLOVÁ P. 1,2, FIDLEROVÁ J 2,3, BÍLEK M. 4, SPRINGER D. 5, NOVOTN J. 3, KLEIBL Z. 2 1 GYNEKOLOGICKO-PORODNICKÁ KLINIKA VFN A 1. LF UK, 2 ÚSTAV BIOCHEMIE A EXPERIMENTÁLNÍ ONKOLOGIE 1. LF UK, 3 ONKOLOGICKÁ KLINIKA VFN A 1. LF UK, 4 ÚSTAV SOUDNÍHO LÉKA STVÍ 1. LF UK, 5 ÚSTAV KLINICKÉ BIOCHEMIE A LABORATORNÍ DIAGNOSTIKY VFN A 1. LF UK Souhrn V chodisko: ZávaÏná toxicita po podání 5-fluorouracilu (5FU) a jeho derivátû je pravdûpodobnû zpûsobena poruchou enzymû katabolické cesty jejich metabolizmu. Zásadní v znam pfiináleïí dihydropyrimidindehydrogenáze (DPD), klíãovému enzymu urãujícímu rychlost degradace 5FU. Metody: Provedli jsme mutaãní anal zu kódující sekvence genu pro DPD (DPYD) pomocí sekvenování cdna u 31 pacientû s projevy závaïné toxicity po aplikaci fluoropyrimidinû (Grade III-IV, NCIC CTC). Nalezené genetické varianty jsme vy etfiili ve vzorcích 21 nemocn ch s dobrou tolerancí léãby 5FU a jeho deriváty (Grade 0-I; NCIC CTC) a v panelu vzorkû neselektované nenádorové populace pomocí DHPLC anal zy. V sledky: Celkem bylo charakterizováno 8 typû genetick ch alterací - jedna sestfiihová mutace, 6 missense variant a jedna tichá mutace. S v jimkou mutace IVS14+1G>A (exon 14del) nalezené u 1/31 pacientû s toxicitou a novû charakterizované alterace c.187a>g (K63E) nebyl nalezen rozdíl v poãtu a zastoupení jednotliv ch mutací mezi skupinou pacientû s toxicitou a bez toxicity. Populaãní screening nalezen ch mutací a polymorfismû prokázal podobné zastoupení ãetnosti genetick ch alterací, jako u obou kohort léãen ch pacientû. Závûry: Pfies vysok poãet nalezen ch genetick ch alterací v genu DPYD tyto nevysvûtlují vznik toxicity po podání fluoropyrimidinû. Proto samotná mutaãní anal za DPYD zatím není vhodn m klinicky pouïiteln m testem pro predikci toxicity. Klíãová slova: DPD, DPYD, 5-fluorouracil, toxicita. Summary Backgrounds: Development of serious toxicity during treatment with 5-fluorouracil (5FU) and its derivates is probably caused by impaired metabolic activities of the fluoropyrimidines catabolic enzymes. The crucial role in this pathway is played by rate-limiting enzyme dihydropyrimidine dehydrogenase (DPD). Methods: We performed a mutation analysis in 31 patients with serious toxicity (Grade III-IV, NCIC CTC) following flouropyrimidine treatment, based on sequencing of cdna derived from DPD mrna. The characterized genetic alterations were screened via DHPLC analysis in a cohort of 21 patients with good fluoropyrimidine treatment tolerance (Grade 0-I; NCIC CTC) and in a panel of unselected population controls. Results: We detected 8 different sequence variants one splicing, 6 missense and one silent mutation. Except for the IVS14+1G>A (exon 14del) mutation found in 1/31 toxicity patients, and the newly characterized unclassified alteration c.187a>g (K63E), we have failed to find differences in frequency and type of mutations between fluoropyrimidine-treated patients with vs. without toxicity. Conclusion: Despite the high number of genetic alterations found in the DPYD gene we conclude that these could not explain the development of fluoropyrimidines toxicity in our population. Therefore, we think that currently the mutation analysis itself is not a predictive test for clinical assessment of patients at risk of 5FU toxicity development. Keywords: DPD, DPYD, 5-fluorouracil, toxicity. Úvod Fluoropyrimidiny napfi. 5-fluorouracil (5FU) a jeho derivát fluoropyrimidinkarbamát (kapecitabin) - patfií mezi ãasto pouïívaná protinádorová léãiva. Roãnû jsou jimi léãeny tisíce nemocn ch, obvykle s ãast mi malignitami - karcinomy trávicího traktu, nádory v oblasti hlavy a krku nebo karcinomem prsu. Pfies nespornou terapeutickou úãinnost fluoropyrimidinû se u pfiibliïnû 5-15% léãen ch pacientû setkáváme s projevy závaïné lékové toxicity, a pfiibliïnû 1% pacientû umírá na komplikace spojené s léãbou tûmito preparáty (1). Obzvlá tû tragická b vají úmrtí nemocn ch, ktefií jsou léãeni v adjuvantních reïimech v kompletní remi- KLINICKÁ ONKOLOGIE 20 2/
2 si bez projevû nádorového onemocnûní. Vedlej í úãinky léãby jsou závaïn m klinick m problémem. V USA tvofií ãtvrtou nejãastûj í pfiíãinu úmrtí, po kardiovaskulárních onemocnûních, nádorov ch onemocnûních a cerebrovaskulárních komplikacích (2). Mechanizmus pûsobení fluoropyrimidinû je zaloïen na jejich pfiemûnû ve fluorované nukleotidy resp. deoxynukleotidy v cílov ch buàkách. Nejv znamnûj í úãinky jsou pfiipisovány inhibici tymidylátsyntázy 5-fluorodeoxyuridin-5 -monofosfátem. Inhibice tohoto enzymu vede k depleci tymidin-5 -monofosfátu, coï se projeví zástavou syntézy de novo vznikající DNA v dûlících se buàkách. Kromû tohoto úãinku v ak fluoropyrimidinové nukleotidy interferují i pfiímo se syntézou DNA; jejich inkorporace do fietûzce DNA zpûsobuje inhibici elongace s následnou fragmentací fietûzce. Inkorporace 5-fluoruridin-5 -trifosfátu do RNA vede k závaïn m po kozením v syntéze RNA, negativnû ovlivàuje její stabilitu a maturaci. Za pfiíãinu fatálních komplikací léãby fluoropyrimidiny se povaïuje vrozená porucha metabolizmu 5FU nebo jeho derivátû. Za normálních okolností je 85% podaného 5FU degradováno v katabolické cestû a pouze 15% podstupuje pfiemûnu na biologicky (a terapeuticky) aktivní metabolity. Kritické místo katabolické cesty fluoropyrimidinû je iniciální hydrogenace enzymem dihydropyrimidindehydrogenázou (DPD resp. DPYD; EC ). Vznikající fluoro-5,6-dihydrouracil je následnû degradován dihydropyrimidinázou (DPYS; EC ) na fluoro-β-ureidopropionát a vyluãován ve formû fluoro-β-alaninu (3). SníÏení aktivity DPD, vlivem vrozené mutace genu ãi díky pouïití inhibitorû, vede ke zv ení biologické dostupnosti farmakologicky aktivních metabolitû fluoropyrimidinû, pûsobících nadprahov m efektem na fiadu, pfiedev ím mitogennû aktivních, nenádorov ch tkání. V sledkem tohoto pûsobení je rozvoj toxick ch symptomû charakterizovan ch pfiedev ím mukositidou, prûjmy a neutropenií (4). Vztah mezi inhibicí DPD a rozvojem toxick ch symptomû po podání fluoropyrimidinû vypl vá jak z farmakokinetick ch studií in vitro a na zvífiecím modelu, tak z klinické zku enosti z letálních komplikací, kdy pacientûm léãen m 5FU bylo aplikováno virostatikum sorivudin - metabolizované na bromvinyluracil - potentní inhibitor DPD (5,6). Gen pro DPD (oznaãovan jako DPYD, OMIM ) se nachází v oblasti 1q22, kde zabírá úsek 950 kbp. Kódující sekvence (3078 bp) je rozprostfiena po celé délce genu v 23 exonech. DPD je cytosolov, ubikvitnû exprimovan enzym. Od konce 90. let je v zahraniãí problematika DPD intenzivnû studována. Doposud bylo nalezeno pfies 40 alterací sekvence DPYD u pacientû se závaïnou toxicitou po podání fluoropyrimidinû. Z toho 7 mutací (M166V, M182K, V335L, I560S, A777S, D949V a IVS 14+1G>A) je povaïováno za patogenní mutace, které se podílejí na rozvoji toxicity po podání 5FU (7). V nedávné dobû byla charakterizována krystalografická struktura praseãího enzymu DPD, kter vykazuje v znamnou homologii s lidsk m proteinem (8). V pfiirozené podobû se DPD vyskytuje jako homodimer s podjednotkami o 111kDa. Charakterizace 3D proteinové struktury DPD umoïnila ozfiejmení dopadû fiady mutací a polymorfismû v DPYD (které obvykle mají charakter missense mutací) na zmûny ve struktufie proteinu (9,10). Intenzivnû je studována exprese genu DPYD. ada studií prokázala, Ïe u pacientû s toxicitou 5FU se ãasto setkáváme se sníïenou expresí enzymu (11). Tento závûr v ak nelze pfiijmout zcela. Z více neï 20 prací studujících v znam exprese DPD na úrovni mrna nebo proteinu vypl vají rozporuplné v sledky pfii studiu jednotliv ch populací pacientû (12). Epigenetická inaktivace DPYD na úrovni hypermetylací promotorov ch sekvencí genu byla doposud studována pouze ojedinûle (13,14,15). Noguchi et al. prokázali negativní vliv hypermetylací promotorové sekvence na expresi DPD in vitro (14). Studium enzymatické aktivity DPD je pomûrnû komplikované. Z jeho v sledkû vypl vá, Ïe heterozygotiãtí nosiãi nejãastûj í patogenní západoevropské alely zpûsobující v padek exonu 14 (DPYD*IVS 14+1G>A) mají 2,5x sní- Ïenou clearance 5FU. U homozygotû je clearance desetinásobnû niï í ve srovnání s nosiãi nemutované (wt) formy genu. Testy enzymatické aktivity mutantních forem v bakteriálních buàkách bohuïel neodráïejí skuteãnou aktivitu DPD v lidsk ch tkáních (16). V souãasné dobû není dostupn vhodn a pfiesn test aktivity DPD, uplatniteln v klinické praxi. Mutaãní anal za genu pro DPYS, kódující dal í enzym katabolické cesty pfiemûny pyrimidinû, je provádûna pouze ojedinûle (17). Expresní vzorec tohoto enzymu u pacientû s v skytem toxicity popsán nebyl. Cíl studie Cílem na í studie byla charakterizace mutací a polymorfismû v genu DPYD u populací pacientû s/bez závaïné toxicity po podání fluoropyrimidinû a charakterizace neselektované populace z hlediska genotypu se zamûfiením na nalezené varianty DPYD. Metody Na základû v skytu závaïné toxicity byli o etfiujícím lékafiem vybráni pacienti pro molekulárnû genetické vy etfiení. Pacienti vstupující do studie vyjádfií svûj souhlas s vy etfiením na základû informovaného souhlasu schváleného etickou komisí. Údaje o pacientech (popis toxické reakce, schéma léãby, patologicko-anatomické a klinické údaje o onkologickém onemocnûní) byly referovány pomocí elektronického rozhraní ( (18). Provedli jsme mutaãní anal zu kódující sekvence DPYD pomocí sekvenování cdna u 31 pacientû s projevy závaïné toxicity po aplikaci fluoropyrimidinû (Grade III-IV, NCIC CTC). Genetick materiál neselektované nenádorové populace a pacientû s dobrou tolerancí léãby 5FU (Grade 0-I, NCIC CTC) pochází z DNA banky pracovi tû. Izolace genetického materiálu (DNA a celkové RNA) z periferní krve byla provedena standardními postupy. Celková RNA, preservovaná pomocí PAXGene odbûrov ch vakuov ch zkumavek (Qiagen) byla izolována dle protokolu v robce. Komplementární cdna byla z celkové DNA pfiipravena pomocí Superscript III reverzní transkriptázy (Invitrogen) s pouïitím náhodn ch hexanukleotidû (Roche). Pro stanovení zmûn v kódující sekvenci DPD byla u pacientû s toxicitou cdna amplifikována s primery v sedmi, vzájemnû se pfiekr vajících, fragmentech (Tabulka 1). Následnû byly PCR amplikony sekvenovány pomocí automatického sekvenování (ABI310, Applied Biosystems) s vyuïitím BigDye ver.3.1 (Applied Biosystems). 216 KLINICKÁ ONKOLOGIE 20 2/2007
3 Nalezené mutace byly potvrzeny sekvenováním z genomové DNA. Pro zji tûní frekvence nalezen ch alterací u pacientû léãen ch 5FU a jeho deriváty bez známek toxicity a v obecné nenádorové populaci byla provedena anal za PCR amplikonû exonû obsahujících mutace/polymorfismy pomocí denaturaãní vysokotlaké kapalinové chromatografie (DHPLC) systému WAVE (Transgenomic; Tabulka 2). Tabulka ã.1.: Primery a podmínky amplifikace z cdna pfiekr vajících se fragmentû kódující sekvence DPD. Stejné primery byly pouïity pro oboustranné sekvenování. Primer Sekvence Amplikon TA MgCl2 (bp) ( C) (mm) DPD1 5 -TTG AGG ACG CAA GGA GGG TTT G-3 DPD2 5 -TAA TGG GTC CCT CTT CAG TGG C ,0 DPD3 5 -ACC CAC TTG GTC TGA CTT GTG G-3 DPD4 5 -ACT GCC TTT GGC TAC AAG TGG C ,5 DPD5 5 -GAT GCC ATC TTC CAA GGC CTG A-3 DPD6 5 -CAC CAC CTG CAA ATA CCC ATG C ,5 DPD7 5 -AAC AGA TGG GGT CTC CCA GAA G-3 DPD8 5 -TCT TGG CAA GTT CCG TCC AGT C ,5 DPD9 5 -ACG GCT GCA TAT TGG TGT CAA AG-3 DPD10 5 -TTC AGC AGA GTC AAT TCC ACC AG ,5 DPD11 5 -TGC TTT GAG AGC TGT GAC CTC C-3 DPD12 5 -GAA ACC CAC CTG CCC ACC ATA A ,5 DPD13 5 -GCA ACG TAG AGC AAG TTG TGG C-3 DPD14 5 -AAG ACA ACT GGC AGT GAA CATC C ,5 Pozn: TA anelaãní teplota primeru Diskuse Zajímav m nálezem na í anal zy byla nejen vysoká ãetnost genetick ch zmûn u pacientû s toxicitou a jejich multiplicita, ale také nízk v skyt delece exonu 14, která je nejãastûj í patogenní zmûnou nacházenou v západoevropské populaci. Je tû pfiekvapivûj ím nálezem je v ak skuteãnost, Ïe s v jimkou této patogenní mutace a námi novû popsané mutace K63E se ãetnosti ostatních alterací v znamnû neli ily ve skupinách pacientû léãen ch 5FU a jeho deriváty s v skytem závaïné toxicity a s dobrou tolerancí léãby. Navíc, provedená populaãní studie prokázala, Ïe ãasto nacházené genetické varianty ve skupinách nemocn ch léãen ch 5FU bez ohledu na rozvoj vedlej ích pfiíznakû jsou zároveà frekventní, a pravdûpodobnû popup Û v p o fi d e n h í l p e dr á c e V sledky Celkem bylo nalezeno 8 typû genetick ch alterací - jedna sestfiihová mutace, 6 missense variant a jedna tichá mutace. Nalezené mutace/polymorfismy byly potvrzeny sekvenováním z genomové DNA. Genetické varianty DPD nalezené ve skupinû nemocn ch s toxicitou jsme analyzovali pomocí DHPLC ve skupinû 21 pacientû s velmi dobrou tolerancí léãby (Grade 0-I; NCIC CTC) a na panelu vzorkû kontrolní nenádorové populace. Celkem jsme diagnostikovali 41 genetick ch alterací ovlivàujících aminokyselinovou sekvenci proteinu ve skupinû 31 pacientû s projevy závaïné toxicity a 29 ve skupinû 21 pacientû bez toxicity Ve skupinû pacientû se závaïnou toxicitou byly dvû zmûny nalezeny u 10 z 31 pacientû (32,3%), a tfii zmûny u 4 z 31 (12,9%) pacientû. Ve skupinû pacientû bez toxicity byla kombinace dvou zmûn charakterizována u 9 z 21 (42,9%) pacientû, a tfií zmûn u 2 z 21 (9,5%) pacientû. Novû jsme rovnûï popsali missense mutaci c.187a>g vedoucí k zámûnû K63E, která se vyskytla pouze u jednoho pacienta se závaïnou toxicitou. Kromû zmiàovan ch zmûn byla nalezena rovnûï tichá mutace c.1896c>t. Provedli jsme populaãní anal zu, abychom zjistili ãetnost nalezen ch genetick ch variant v neselektované populaci. Její v sledky jsou souãástí Tabulky 3. Tabulka ã.2. Podmínky PCR z genomové DNA pro anal zu vybran ch exonû genu DPYD a chromatogramy DHPLC anal zy. T A MgCl 2 T w Exon Primer Sekvence (bp) Chromatogramy a ( C) (mm) ( C) 2 DPYD01 DPYD02 5 -GGT ATG CAT ATT TTT CAT GAG TCC G-3 5 -GTG GCA ATG AAC TCA TTT GTT C ,5 59,2 3 DPYD03 DPYD04 5 -GGT ATG CAT ATT TTT CAT GAG TCC G-3 5 -GTG GCA ATG AAC TCA TTT GTT C ,5 57,0 6 DPYD05 5 -TTT AAC CAT GAC AAT TGA TTT CCC -3 DPYD06 5 -GTT TTG CTC CAT CAT TTC TGA C ,5 57,0 14 DPYD09 DPYD10 5 -CTT TGT CAA AAG GAG ACT CAA TAT C-3 5 -TCA CCA ACT TAT GCC AAT TCT C ,5 57,6 18 DPYD11* 5 -TGA ATG GGT TTT AAC TAT CGT GTC -3 DPYD12* 5 -AAG TGG GCA ACA CCT ACC AG ,5 60,4 Pozn: TA anelaãní teplota primeru, Tw teplota anal zy na DNASep kolonû (DHPLC), a ãervenû (modfie) mutovaná sekvence; edû wt sekvence, * primery z publikace Fischer J. et al. (19) KLINICKÁ ONKOLOGIE 20 2/
4 Tabulka ã.3.: V sledky mutaãní anal zy ve skupinû pacientû s v skytem závaïné toxicity po fluoropyrimidinech, ve skupinû pacientû bez toxicity a u nenádorov ch kontrol [poãet pozitivit/celkov poãet vy etfien ch osob ve skupinû (%)]. Exon 2 Exon 3 Exon 6 Exon 13 Exon 13 Exon 14 Intron 14 Exon 18 Mutace v DPD c.85t>c c.187a>g c.496a>g c. 1601G>A c. 1627A>G c.1896t>c IVS14+1G>A c.2194g>a Zmûna proteinové sekvence C29R K63E M166V S534N I543V - e14 del V732I Charakter genetické zmûny PM M? PM? PM PM PM M PM Pac. s toxicitou 12/31 (38,7) 1/31 (0,3) 14/31 (45,2) 1/31 (3,2) 9/31 (29,0) 4/31 (12,9) 1/31 (3,2) 3/28 (9,7) Pac. bez toxicity 12/21 (57,1) 0/21 (0) 8/21 (38,1) 1/21 (4,8) 6/21 (28,6) NS 0/21 (0) 2/21 (9,5) Kontrolní populace 74/184 (40,2) 0/218 (0) 39/161 (24,2) 4/184 (2,2) 41/184 (22,3) 17/138 (12,3) 1/138 (0,7) 9/136 (6,7) Vysvûtlivky: PM polymorfismus, M mutace, NS nebylo stanoveno laãnû specifické varianty genu DPYD. Jejich ãetnost v znamnû sniïuje pravdûpodobnost, Ïe by se mohlo jednat o patogenní genetické varianty vysvûtlující toxicitu 5FU a jeho derivátû. To se zvlá tû t ká mutace c.496a>g (M166V) v exonu 6, jejíï ãetnost se v znamnû neli í u skupiny pacientû s toxicitou (45,2%) ve srovnání se skupinou pacientû bez známek toxicity (38,1%; test o shodû relativní ãetnosti P=0,3864). V na í populaci má tedy tato genetická zmûna rozhodnû charakter polymorfismu. Z nalezen ch genetick ch variant je pak pravdûpodobnû jediná (a u nás neãastá) delece exonu 14 prokazatelnû patogenní alterací. Námi novû popsaná alterace K63E sice leïí ve funkãnû exponované ãásti proteinu (lysin 63 se nachází v N-terminální oblasti s Fe-S doménami), av ak její pfiím funkãní v znam není jasn. Aãkoliv pro hlub í závûry je nezbytné provést vy etfiení mutací v rozsáhlej í populaci, z dosavadních v sledkû vypl vá, Ïe mutace genu DPYD velmi pravdûpodobnû nejsou jedin m faktorem podílejícím se na vzniku závaïné toxicity po podání 5FU a jeho derivátû. Závûr Pro vypracování vhodného screeningového vy etfiení predikujícího vznik závaïné toxicity po podání 5FU a jeho derivátû je nezbytné charakterizovat nejen spektrum mutaãních zmûn genu DPYD (v znamnû se odli ující od genotypového profilu západoevropské populace) s urãením jejich moïného dopadu na strukturní charakteristiky proteinu DPD, ale rovnûï ãetnost nalezen ch alterací u pacientû bez známek toxicity po podání 5FU a v obecné populaci. Na základû na ich dosavadních v sledkû (limitovan ch poãtem vy etfien ch pacientû) se domníváme, Ïe mutaãní anal za genu DPYD zatím neumoïàuje sama o sobû selekci populace pacientû ohroïen ch vznikem závaïn ch komplikací léãby 5FU. Podûkování Dûkujemei v em na im kolegûm z klinick ch pracovi È za poskytnutí biologického materiálu a klinick ch dat. Tato práce byla podpofiena prostfiedky Bûhu Terryho Foxe 2005 Ligy proti rakovinû Praha a grantem IGA MZ âr 1A/ Literatura 1. Meta-Analysis Group In Cancer: Toxicity of fluorouracil in patients with advanced colorectal cancer: effect of administration schedule and prognostic factors. J Clin Oncol 16, 1998, Lazarou J., Pomeranz B.H., Corey P.N.: Incidence of adverse drug reactions in hospitalized patients: a meta-analysis of prospective studies. JAMA 279, 1998, Omura K.: Clinical implications of dihydropyrimidine dehydrogenase (DPD) activity in 5-FU-based chemotherapy: mutations in the DPD gene, and DPD inhibitory fluoropyrimidines. Int J Clin Oncol 8, 2003, van Kuilenburg A.B., Haasjes J., Richel D.J. et al.: Clinical implications of dihydropyrimidine dehydrogenase (DPD) deficiency in patients with severe 5-fluorouracil-associated toxicity: identification of new mutations in the DPD gene. Clin Cancer Res 6, 2000, Okuda H., Ogura K., Kato A. et al.: A possible mechanism of eighteen patient deaths caused by interactions of sorivudine, a new antiviral drug, with oral 5-fluorouracil prodrugs. J Pharmacol Exp Ther 287, 1998, Diasio R.B.: Sorivudine and 5-fluorouracil; a clinically significant drug-drug interaction due to inhibition of dihydropyrimidine dehydrogenase. Br J Clin Pharmacol 46, 1998, van Kuilenburg A.B.: Dihydropyrimidine dehydrogenase and the efficacy and toxicity of 5-fluorouracil. Eur J Cancer 40, 2004, Dobritzsch D., Schneider G., Schnackerz K.D. et al.: Crystal structure of dihydropyrimidine dehydrogenase, a major determinant of the pharmacokinetics of the anti-cancer drug 5-fluorouracil. EMBO J 20, 2001, van Kuilenburg A.B., Dobritzsch D., Meinsma R. et al.: Novel disease-causing mutations in the dihydropyrimidine dehydrogenase gene interpreted by analysis of the three-dimensional protein structure. Biochem J 364, 2002, Gross E., Ullrich T., Seck K. et al.: Detailed analysis of five mutations in dihydropyrimidine dehydrogenase detected in cancer patients with 5-fluorouracil-related side effects. Hum Mutat 22, 2003, Scherf U., Ross D.T., Waltham M. et al.: A gene expression database for the molecular pharmacology of cancer. Nat Genet 24, 2000, Zimovjanova M., Sykora V., Novotny J. et al.: Comparative analysis of thymidylate synthase, thymidine phosphorylase and dihydropyrimidine dehydrogenase expression in colorectal cancer and surrounding normal tissue. Neoplasma 52, 2005, Shestopal S.A., Johnson M.R., Diasio R.B.: Molecular cloning and characterization of the human dihydropyrimidine dehydrogenase promoter. Biochim Biophys Acta 1494, 2000, Noguchi T., Tanimoto K., Shimokuni T. et al.: Aberrant methylation of DPYD promoter, DPYD expression, and cellular sensitivity to 5-fluorouracil in cancer cells. Clin Cancer Res 10, 2004, Ezzeldin H.H., Lee A.M., Mattison L.K. et al.: Methylation of the DPYD promoter: an alternative mechanism for dihydropyrimidine 218 KLINICKÁ ONKOLOGIE 20 2/2007
5 dehydrogenase deficiency in cancer patients. Clin Cancer Res 11, 2005, Vreken P., van Kuilenburg A.B., Meinsma R. et al.: Dihydropyrimidine dehydrogenase deficiency. Identification of two novel mutations and expression of missense mutations in E. coli. Adv Exp Med Biol 431, 1998, Hamajima N., Kouwaki M., Vreken P. et al.: Dihydropyrimidinase deficiency: structural organization, chromosomal localization, and mutation analysis of the human dihydropyrimidinase gene. Am J Hum Genet 63, 1998, Novotny J., Kleibl Z., Sykora V. et al.: Projekt DPD online : moïnost predikce toxicity 5-fluorouracilu a jeho derivátû. Klin Onkol 16, 2003, Fischer J., Schwab M., Eichelbaum M. et al.: Mutational analysis of the human dihydropyrimidine dehydrogenase gene by denaturing highperformance liquid chromatography. Genet Test 7, 2003, Do lo: Pfiijato: I n f o r m a c e Onkologické oddûlení pod zá titou Spoleãnosti radiaãní onkologie, biologie a fyziky a âeské onkologické spoleãnosti pofiádají XIV. Jihoãeské onkologické dny âesk Krumlov - Zámecká jízdárna Téma DIAGNOSTIKA A LÉâBA MALIGNÍCH LYMFOMÒ Odpovídá MUDr.Hana IFFNEROVÁ, zástupkynû primáfie onkologického oddûlení âeskobudûjovické nemocnice. Jde o onemocnûní imunitního systému, které patfií mezi pomûrnû vzácné choroby, ale jejich incidence se postupnû zvy uje. Na kongresu budou probírány léãebné modality a postupy, ale av ak také prevence a fie ení neïádoucích úãinkû, které jsou ãasto spojeny agresivní terapií. Abstrakta pfiihla ovan ch pfiedná ek a posterû do programu XIV. JOD, za lete do na adresu Nemocnice âeské Budûjovice, a. s. Podrobné informace o poplatcích, ubytování, doprovodném programu a p., poskytuje: Informaãní odd.- Nemocnice â. Budûjovice a. s., PhDr. Marie otolová, ul. B. Nûmcové ã. 54, âeské Budûjovice, tel: , fax: , mobil: , pr@ nemcb.cz KLINICKÁ ONKOLOGIE 20 2/
Autoindex nad DNA sekvencemi
Autoindex nd DNA sekvenemi do. Ing. Jn Holub, Ph.D. ktedr teoretiké informtiky Fkult informčníh tehnologií České vysoké učení tehniké v Prze ENBIK 2014 10. 6. 2014 ENBIK 2014, 10. 5. 2014 J. Holub: Autoindex
Studium genetické predispozice ke vzniku karcinomu prsu
Univerzita Karlova v Praze 1. lékařská fakulta Studium genetické predispozice ke vzniku karcinomu prsu Petra Kleiblová Ústav biochemie a experimentální onkologie, 1. LF UK - skupina molekulární biologie
USING OF AUTOMATED DNA SEQUENCING FOR PORCINE CANDIDATE GENES POLYMORFISMS DETECTION
USING OF AUTOMATED DNA SEQUENCING FOR PORCINE CANDIDATE GENES POLYMORFISMS DETECTION VYUŽITÍ AUTOMATICKÉHO SEKVENOVÁNÍ DNA PRO DETEKCI POLYMORFISMŮ KANDIDÁTNÍCH GENŮ U PRASAT Vykoukalová Z., Knoll A.,
Molekulární genetika IV zimní semestr 6. výukový týden ( )
Ústav biologie a lékařské genetiky 1.LF UK a VFN, Praha Molekulární genetika IV zimní semestr 6. výukový týden (5.11. 9.11.2007) Nondisjunkce u Downova syndromu 2 Tři rodokmeny rodin s dětmi postiženými
Inovace studia molekulární a buněčné biologie
Inovace studia molekulární a buněčné biologie I n v e s t i c e d o r o z v o j e v z d ě l á v á n í reg. č. CZ.1.07/2.2.00/07.0354 Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním
ACTIVATION OF DEHYDRIN GENES OF GERMINATE PLANTS OF BARLEY TO DROUGHT AND COLD AKTIVACE DEHYDRINOVÝCH GENŮ KLÍČNÍCH ROSTLIN JEČMENE SUCHEM A CHLADEM
ACTIVATION OF DEHYDRIN GENES OF GERMINATE PLANTS OF BARLEY TO DROUGHT AND COLD AKTIVACE DEHYDRINOVÝCH GENŮ KLÍČNÍCH ROSTLIN JEČMENE SUCHEM A CHLADEM Dokoupilová Z., Holková L., Chloupek O. Ústav pěstování
Využití rep-pcr v bakteriální taxonomii
Využití rep-pcr v bakteriální taxonomii Pavel Švec Česká sbírka mikroorganismů Přírodovědecká fakulta MU rep-pcr založeny na shlukové analýze PCR produktů získaných s primery komplementárními k rozptýleným
Polymerázová řetězová reakce
Polymerázová řetězová reakce doc. RNDr. Milan Bartoš, Ph.D. bartosm@vfu.cz Přírodovědecká fakulta MU, 2013 Obsah přednášky 1) Co je to PCR, princip, jednotlivé kroky 2) Technické provedení PCR 3) Fyzikální
ANALYSIS OF SERPINE1 GENE VARIABILITY IN PIGS
ANALYSIS OF SERPINE1 GENE VARIABILITY IN PIGS Weisz F., Knoll A. Department of Animal Morphology, Physiology and Genetics, Faculty of Agronomy, Mendel University of Agriculture and Forestry in Brno, Zemedelska
Základy genomiky II, Identifikace genů
Základy genomiky II. Identifikace genů Jan Hejátko Masarykova univerzita, Laboratoř funkční genomiky a proteomiky Laboratoř molekulární fyziologie rostlin Základy genomiky II. Zdrojová literatura ke kapitole
Molekulární diagnostika pletencové svalové dystrofie typu 2A
Molekulární diagnostika pletencové svalové dystrofie typu 2A Lenka Fajkusová Centrum molekulární biologie a genové terapie Fakultní nemocnice Brno Pletencové svalové dystrofie (Limb Girdle Muscular Dystrophy
Havarijní plán PřF UP
Havarijní plán PřF UP v němž se nakládá s geneticky modifikovanými organismy (GMO), zpracovaný podle 20, odst. 4 zákona č. 78/2004 Sb. pro pracoviště kateder Buněčné biologie a genetiky a Oddělení molekulární
Populační genetika. ) a. Populační genetika. Castle-Hardy-Weinbergova zákonitost. Platí v panmiktické populaci za předpokladu omezujících podmínek
Poulační genetika Poulační genetika ORGANISMUS Součást výše organizované soustavy oulace POPULACE Soubor jedinců jednoho druhu Genotyově heterogenní V určitém čase má řirozeně vymezený rostor Velký očet
MasarykÛv onkologick ústav v Brnû. pod zá titou. pofiádá XXIII. KONFERENCÍ PRO NELÉKA SKÉ ZDRAVOTNICKÉ PRACOVNÍKY. s mezinárodní úãastí
MasarykÛv onkologick ústav v Brnû pod zá titou âeské onkologické spoleãnosti âls JEP Spoleãnosti radiaãní onkologie, biologie a fyziky âeské asociace sester Lékafiské fakulty Masarykovy univerzity Univerzitního
MOLEKULÁRNÍ BIOLOGIE. 2. Polymerázová řetězová reakce (PCR)
MOLEKULÁRNÍ BIOLOGIE 2. Polymerázová řetězová reakce (PCR) Náplň praktik 1. Izolace DNA z buněk bukální sliznice - izolační kit MACHEREY-NAGEL 2. PCR polymerázová řetězová reakce (templát gdna) 3. Restrikční
Základy proteomiky 2011
Základy proteomiky 2011 Proč právě proteomika? Jan Hejátko Základy proteomiky 2011 Schéma přednášek ze Základů proteomiky 2011 Proč právě proteomika? (Jan Hejátko) Exprese a purifikace rekombinantních
Mgr. Veronika Peňásová vpenasova@fnbrno.cz Laboratoř molekulární diagnostiky, OLG FN Brno Klinika dětské onkologie, FN Brno
Retinoblastom Mgr. Veronika Peňásová vpenasova@fnbrno.cz Laboratoř molekulární diagnostiky, OLG FN Brno Klinika dětské onkologie, FN Brno Retinoblastom (RBL) zhoubný nádor oka, pocházející z primitivních
ZPŮSOB DETOXIKACE SULFIDICKÉHO YPERITU ÚČINKEM HALOGENALKANDEHALOGENÁZ
Patentová přihláška CZ 2005 352 ZPŮSOB DETOXIKACE SULFIDICKÉHO YPERITU ÚČINKEM HALOGENALKANDEHALOGENÁZ Číslo přihlášky: CZ 2005 352 A1 Datum předložení: 3. června 2005 Abstrakt: Způsob detoxikace sulfidického
AUG STOP AAAA S S. eukaryontní gen v genomové DNA. promotor exon 1 exon 2 exon 3 exon 4. kódující oblast. introny
eukaryontní gen v genomové DNA promotor exon 1 exon 2 exon 3 exon 4 kódující oblast introny primární transkript (hnrna, pre-mrna) postranskripční úpravy (vznik maturované mrna) syntéza čepičky AUG vyštěpení
Mutageneze vznik chyby na DNA mutagen (chemická látka / záření)
Genotoxicita - úvod Genotoxicita: toxická látka ovlivňuje genetický materiál buňky (nukleové kyseliny) Při působení vyšších koncentrací genotoxických látek dochází k přímému úhynu buněk Nižší koncentrace
GENOTOXICITA LÉČIV. Klára A. Mocová. VŠCHT Praha Fakulta technologie ochrany prostředí Ústav chemie ochrany prostředí
GENOTOXICITA LÉČIV Klára A. Mocová VŠCHT Praha Fakulta technologie ochrany prostředí Ústav chemie ochrany prostředí Centralizovaný rozvojový projekt MŠMT č. C29: Integrovaný systém vzdělávání v oblasti
velké fragmenty střední fragmenty malé fragmenty
velké fragmenty střední fragmenty malé fragmenty Southern 1975 Northern Western denaturace DNA hybridizace primerů (annealing) (mají délku kolem 20 bází) syntéza nové DNA termostabilní polymerázou vstup
Lucie Kárná, Michal Křížek, Pavel Křížek
genetika Genetický kód z pohledu matematiky Lucie Kárná, Michal Křížek, Pavel Křížek RNDr. Lucie Kárná, Ph.D. (*1969) vystudovala obor matematická analýza na Matematickofyzikální fakultě UK a v současnosti
NGS analýza dat. kroužek, Alena Musilová
NGS analýza dat kroužek, 16.12.2016 Alena Musilová Typy NGS experimentů Název Materiál Cílí na..? Cíl experimentu? amplikon DNA malý počet vybraných genů hledání variant exom DNA všechny geny hledání
Beličková 1, J Veselá 1, E Stará 1, Z Zemanová 2, A Jonášová 2, J Čermák 1
Beličková 1, J Veselá 1, E Stará 1, Z Zemanová 2, A Jonášová 2, J Čermák 1 1 Ústav hematologie a krevní transfuze, Praha 2 Všeobecná fakultní nemocnice, Praha MDS Myelodysplastický syndrom (MDS) je heterogenní
Molekulárn. rní genetika
Molekulárn rní genetika Centráln lní dogma molekulárn rní biologie cesta přenosu genetické informace: DNA RNA proteiny výjimkou reverzní transkripce retrovirů: RNA DNA Chemie nukleových kyselin dusíkaté
Genetický kód. Jakmile vznikne funkční mrna, informace v ní obsažená může být ihned použita pro syntézu proteinu.
Genetický kód Jakmile vznikne funkční, informace v ní obsažená může být ihned použita pro syntézu proteinu. Pravidla, kterými se řídí prostřednictvím přenos z nukleotidové sekvence DNA do aminokyselinové
Přínos molekulární genetiky pro diagnostiku a terapii malignit GIT v posledních 10 letech
Přínos molekulární genetiky pro diagnostiku a terapii malignit GIT v posledních 10 letech Minárik M. Centrum aplikované genomiky solidních nádorů (CEGES), Genomac výzkumný ústav, Praha XXIV. JARNÍ SETKÁNÍ
VARIANTY NEZNÁMÉHO V ZNAMU A INTRAGENOVÁ P ESKUPENÍ V GENECH BRCA1 A BRCA2
VARIANTY NEZNÁMÉHO V ZNAMU A INTRAGENOVÁ P ESKUPENÍ V GENECH BRCA1 A BRCA2 VARIANTS OF UNKNOWN CLINICAL SIGNIFICANCE AND INTRAGENIC REARRANGEMENTS IN BRCA1 AND BRCA2 GENES VA ÍâKOVÁ P. 1, MACHÁâKOVÁ E.
Schéma průběhu transkripce
Molekulární základy genetiky PROTEOSYNTÉZA A GENETICKÝ KÓD Proteosyntéza je složitý proces tvorby bílkovin, který zahrnuje proces přepisu genetické informace z DNA do kratšího zápisu v informační mrna
MENDELOVA ZEMĚDĚLSKÁ A LESNICKÁ UNIVERZITA V BRNĚ. Agronomická fakulta BAKALÁŘSKÁ PRÁCE
MENDELOVA ZEMĚDĚLSKÁ A LESNICKÁ UNIVERZITA V BRNĚ Agronomická fakulta BAKALÁŘSKÁ PRÁCE BRNO 2006 Petra PŘICHYSTALOVÁ MENDELOVA ZEMĚDĚLSKÁ A LESNICKÁ UNIVERZITA V BRNĚ Agronomická fakulta Ústav morfologie,
Grantové projekty řešené OT v současnosti
Grantové projekty řešené OT v současnosti Grantové projekty řešené OT v současnosti GAČR č. P303/12/G163: Centrum interakcí potravních doplňků s léčivy a nutrigenetiky Doc. Doba řešení: 2012-2018 Potravní
Terapeutické klonování, náhrada tkání a orgánů
Transfekce, elektroporace, retrovirová infekce Vnesení genů Vrstva fibroblastů, LIF Terapeutické klonování, náhrada tkání a orgánů Selekce ES buněk, v nichž došlo k začlenění vneseného genu homologní rekombinací
Sekvenace aplikace ve virologické diagnostice. Plíšková Lenka FN Hradec Králové
Sekvenace aplikace ve virologické diagnostice Plíšková Lenka FN Hradec Králové Vývoj sekvenačních technik 2.generace sekvenování až tisíců molekul najednou 1.generace detekce DNA bazí za sebou Stratton
VYUŽITÍ JEDNOKAPILÁROVÉHO OBOUSMĚRNÉHO SEKVENOVÁNÍ PRO GENOTYPIZACI TGF 1 GENU
VYUŽITÍ JEDNOKAPILÁROVÉHO OBOUSMĚRNÉHO SEKVENOVÁNÍ PRO GENOTYPIZACI TGF 1 GENU MARTIN BERÁNEK a, MONIKA DRASTÍKOVÁ a, IGOR SIRÁK b, SIMONA PAULÍKOVÁ b, MILAN VOŠMIK b a JIŘÍ PETERA b a Ústav klinické biochemie
ný syndrom nádoru prsu a/nebo ovaria Molekulární analýza BRCA1 a BRCA2 gen Prohlášení Informace k onemocn BRCA1 gen
Dědičný syndrom nádoru prsu a/nebo ovaria Molekulární analýza BRCA1 a BRCA2 genů. Foretová L., Macháčková E. Oddělení epidemiologie a genetiky nádorů, Masarykův onkologický ústav, Brno foretova@mou.cz
Epigenetika mění paradigma současné medicíny i její budoucnost
Epigenetika mění paradigma současné medicíny i její budoucnost pokračování z čísla 1 a 2 /2014 Epigenetika v onkologii MUDr. Jozef Čupka Společnost všeobecného lékařství ČLS JEP, Sekce preventivní onkologie
Molekulární genetika
Molekulární genetika Upozornění: ukončení semestru ZÁPOČTOVÝ TEST a) Dědičnost krevně skupinových systémů (AB0, MN, Rh) b) Přepis úseku DNA do sekvence aminokyselin c) Populační genetika výpočet frekvence
DNA microarrays Josef Srovnal, Michaela Špenerová, Lenka Radová, Marián Hajdúch, Vladimír Mihál
DNA microarrays Josef Srovnal, Michaela Špenerová, Lenka Radová, Marián Hajdúch, Vladimír Mihál Laboratoř experimentální medicíny při Dětské klinice LF UP a FN Olomouc Cíle Seznámit posluchače s: 1. Technologií
INFORMACE PRO PACIENTY
INFORMACE PRO PACIENTY Technologie prizpusobená ˇ pacientovi technologie od Artrotické zmûny Pfiesné fiezací bloãky Technologie Visionaire Optimálnû usazen implantát O spoleãnosti Smith&Nephew je celosvûtovû
Polymerázová řetězová reakce. Základní technika molekulární diagnostiky.
Polymerázová řetězová reakce Základní technika molekulární diagnostiky. Kdo za to může? Kary Mullis 1983 Nobelova cena 1993 Princip PCR Polymerázová řetězová reakce (polymerase chain reaction PCR) umožňuje
Mutace jako změna genetické informace a zdroj genetické variability
Obecná genetika Mutace jako změna genetické informace a zdroj genetické variability Doc. RNDr. Ing. Eva PALÁTOVÁ, PhD. Ing. Roman LONGAUER, CSc. Ústav zakládání a pěstění lesů LDF MENDELU Brno Tento projekt
Amplifikační metody v molekulární diagnostice mikroorganismů. doc. RNDr. Milan Bartoš, Ph.D.
Amplifikační metody v molekulární diagnostice mikroorganismů doc. RNDr. Milan Bartoš, Ph.D. bartosm@vfu.cz Přírodovědecká fakulta MU, 2012 Doporučená literatura 1) Persing et al. (1993): Diagnostic Molecular
Univerzita Palackého v Olomouci. Diplomová práce
Univerzita Palackého v Olomouci Diplomová práce Olomouc 2010 Bc. Barbora Klocová Univerzita Palackého v Olomouci Přírodovědecká fakulta Katedra buněčné biologie a genetiky Mapování genů kvantitativních
REPREZENTACE A ZPRACOVÁNÍ GENOMICKÝCH SIGNÁLŮ REPRESENTATION AND PROCESSING OF GENOMIC SIGNALS
VYSOKÉ UČENÍ TECHNICKÉ V BRNĚ BRNO UNIVERSITY OF TECHNOLOGY FAKULTA ELEKTROTECHNIKY A KOMUNIKAČNÍCH TECHNOLOGIÍ ÚSTAV BIOMEDICÍNSKÉHO INŽENÝRSTVÍ FACULTY OF ELECTRICAL ENGINEERING AND COMMUNICATION DEPARTMENT
Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/
Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/07.0354 Genomika (KBB/GENOM) Úvod do studia genomiky Ing. Hana Šimková, CSc. Cíl přednášky - seznámení studentů s náplní vědního oboru
VÝZNAM NĚKTERÝCH FAKTORŮ PREANALYTICKÉ FÁZE V MOLEKULÁRNÍ BIOLOGII
VÝZNAM NĚKTERÝCH FAKTORŮ PREANALYTICKÉ FÁZE V MOLEKULÁRNÍ BIOLOGII Plíšková L., Hrochová K., Kutová R. Ústav klinické biochemie a diagnostiky FN Hradec Králové PREANALYTICKÁ FÁZE V MOLEKULÁRNÍ BIOLOGII
NEUROGENETICKÁ DIAGNOSTIKA NERVOSVALOVÝCH ONEMOCNĚNÍ
NEUROGENETICKÁ DIAGNOSTIKA NERVOSVALOVÝCH ONEMOCNĚNÍ Doc. MUDr. A. Šantavá, CSc. Ústav lékařské genetiky a fetální medicíny LF a UP Olomouc Význam genetiky v diagnostice neuromuskulárních onemocnění Podílí
Činnost radiační onkologie a klinické onkologie v České republice v roce 2006
Aktuální informace Ústavu zdravotnických informací a statistiky České republiky Praha 14. 8. 27 38 Činnost radiační onkologie a klinické onkologie v České republice v roce 26 Activity in X-ray oncology
Kdy a jak se projeví HPV vakcinace
Kdy a jak se projeví HPV vakcinace Borek Sehnal Onkogynekologické centrum Gynekologicko-porodnická klinika 1. LF UK a Nemocnice Na Bulovce Praha Prohlášení Uvedená prezentace NENÍ sponzorována žádnou společností.
laboratorní technologie
20 Farmakogenetika v laboratorní praxi P. Riedlová, R. Richterová Úvod Sledování vztahu mezi genetickou predispozicí jedince a variabilní odpovědí na podávané léky je hlavním předmětem zájmu odborníků
Molekulární genetika (Molekulární základy dědičnosti)
Molekulární genetika (Molekulární základy dědičnosti) Struktura nukleové kyseliny Cukerná pentóza: 2-deoxy-D-ribóza D-ribóza Fosfátový zbytek: PO 4 3- Purin Pyrimidin Dusíkatá báze Adenin Guanin Tymin
Stanovení autoprotilátek proti TSH receptoru
Stanovení autoprotilátek proti TSH receptoru Fejfárková Z., Pikner R. Oddělení klinických laboratoří, Klatovská nemocnice a.s., Klatovy, pikner@nemkt.cz Stanovení autoprotilátek proti TSH receptoru (anti
Proteinové znaky dětské leukémie identifikované pomocí genových expresních profilů
Proteinové znaky dětské leukémie identifikované pomocí genových expresních profilů M.Vášková a spol. Klinika dětské hematologie a onkologie 2.LF UK a FN Motol Childhood Leukemia Investigation Prague Průtoková
Propojení výuky oborů Molekulární a buněčné biologie a Ochrany a tvorby životního prostředí. Reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/
Propojení výuky oborů Molekulární a buněčné biologie a Ochrany a tvorby životního prostředí Reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/28.0032 Molekulární genetika (Molekulární základy dědičnosti) 0 Gen - historie 1909 Johanssen
2. pražské mezioborové onkologické kolokvium Prague ONCO 2011
Záštitu nad kolokviem převzaly: Evropská onkologická společnost Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR Ministerstvo zdravotnictví ČR Česká onkologická společnost Česká urologická společnost Česká
Detekce Leidenské mutace
Detekce Leidenské mutace MOLEKULÁRNÍ BIOLOGIE 3. Restrikční štěpení, elektroforéza + interpretace výsledků Restrikční endonukleasy(restriktasy) bakteriální enzymy štěpící cizorodou dsdna na kratší úseky
Bioinformatika a výpočetní biologie KFC/BIN. I. Přehled
Bioinformatika a výpočetní biologie KFC/BIN I. Přehled RNDr. Karel Berka, Ph.D. Univerzita Palackého v Olomouci Definice bioinformatiky (Molecular) bio informatics: bioinformatics is conceptualising biology
Využití DNA markerů ve studiu fylogeneze rostlin
Mendelova genetika v příkladech Využití DNA markerů ve studiu fylogeneze rostlin Ing. Petra VESELÁ Ústav lesnické botaniky, dendrologie a geobiocenologie LDF MENDELU Brno Tento projekt je spolufinancován
Metody studia exprese mrna. jádro a genová exprese 2007
Metody studia exprese mrna Buněčné jádro a genová exprese 2007 Aktivita genu je primárn ě vyjád ř ena jeho transkripcí-prvním krokem vedoucím k syntéze kódovaného proteinu. Cíle metod Ur č ení mno ž ství
Inovace studia molekulární a buněčné biologie
Investice do rozvoje vzdělávání Inovace studia molekulární a buněčné biologie Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem České republiky. Investice do rozvoje vzdělávání
VĚDA A VÝZKUM V PERIOPERAČNÍ PÉČI. Mgr. Markéta Jašková Dana Svobodová Gynekologicko-porodnická klinika Fakultní nemocnice Ostrava
VĚDA A VÝZKUM V PERIOPERAČNÍ PÉČI Mgr. Markéta Jašková Dana Svobodová Gynekologicko-porodnická klinika Fakultní nemocnice Ostrava VĚDA A VÝZKUM NA GOS Detekce mutace genu BRCA1 a BRCA2, a to přímo z nádorové
Klonování DNA a fyzikální mapování genomu
Klonování DNA a fyzikální mapování genomu. Terminologie Klonování je proces tvorby klonů Klon je soubor identických buněk (příp. organismů) odvozených ze společného předka dělením (např. jedna bakteriální
Genetický screening predispozice k celiakii
VETERINÁRN RNÍ A FARMACEUTICKÁ UNIVERZITA BRNO Farmaceutická fakulta Ústav humánn nní farmakologie a toxikologie Genetický screening predispozice k celiakii RNDr. Ladislava Bartošov ová,ph.d. 1, PharmDr.
Základní charakteristiky zdraví, nemocnosti a úmrtnosti (Tabulka 5)
24 ÎENY Kapitola 2: Zdraví A MUÎI V DATECH Metodická poznámka: Skuteãnost, Ïe poslední data v tabulkách a grafech jsou nûkde za rok 2003 ãi dokonce 2002, je zpûsobena tím, Ïe nûkterá etfiení ve zdravotní
Epidemiologie zhoubného novotvaru prûdu ky a plíce (C34) v âr
Epidemiologie zhoubného novotvaru prûdu ky a plíce (C34) v âr 19 6 2009 Prof. MUDr. Jitka Abrahámová, DrSc. 1 ; MUDr. Markéta Černovská 1,2 ; doc. RNDr. Ladislav Dušek, Ph.D. 3 ; RNDr. Jan Mužík 3 ; RNDr.
EVM. VERTIKÁLNÍ VÍCESTUPŇOVÁ ČERPADLA z litiny, AISI 304, AISI 316
Vertikální vícestupàová odstfiedivá ãerpadla v rûzn ch verzích: litinová (EVMG), nerezová z AISI 304 (EVM), nerezová z AISI 316 (EVML) a s certifikací WRAS (EVMW). Spolehlivá, tichá a se snadnou údrïbou.
Bioptická laboratoř s.r.o. a Šiklův ústav patologie Lékařské fakulty UK v Plzni
Genové fúze NCOA4-RET a TRIM27- RETdiferencují intraduktální karcinom slinných žláz na duktální a apokrinní podtyp: analýza 18 případů pomocí sekvenování nové generace (NGS) Skálová A, Baněčková M, Martínek
Možnosti využití technologie DNA microarrays v predikci odpovědi na neoadjuvantní terapii u pacientů s karcinomem jícnu
Možnosti využití technologie DNA microarrays v predikci odpovědi na neoadjuvantní terapii u pacientů s karcinomem jícnu Srovnal J. 1, Cincibuch J. 2, Cwierkta K. 2, Melichar B. 2, Aujeský R. 3, Vrba R.
Molekulární genetika II zimní semestr 4. výukový týden ( )
Ústav biologie a lékařské genetiky 1.LF UK a VFN, Praha Molekulární genetika II zimní semestr 4. výukový týden (27.10. 31.10.2008) prenatální DNA diagnostika presymptomatická Potvrzení diagnózy Diagnostika
Personalizovaná medicína Roche v oblasti onkologie. Olga Bálková, Roche s.r.o., Diagnostics Division Pracovní dny, Praha, 11.
Personalizovaná medicína Roche v oblasti onkologie Olga Bálková, Roche s.r.o., Diagnostics Division Pracovní dny, Praha, 11. listopadu 2013 Personalizovaná vs standardní péče Cílená léčba Spojení diagnostiky
Genetický polymorfismus jako nástroj identifikace osob v kriminalistické a soudnělékařské. doc. RNDr. Ivan Mazura, CSc.
Genetický polymorfismus jako nástroj identifikace osob v kriminalistické a soudnělékařské praxi doc. RNDr. Ivan Mazura, CSc. Historie forenzní genetiky 1985-1986 Alec Jeffreys a satelitní DNA 1980 Ray
19.b - Metabolismus nukleových kyselin a proteosyntéza
19.b - Metabolismus nukleových kyselin a proteosyntéza Proteosyntéza vyžaduje především zajištění primární struktury. Informace je uložena v DNA (ev. RNA u některých virů) trvalá forma. Forma uskladnění
Specifická izolace microrna pomocí magnetizovatelných mikročástic
Název: Školitel: Specifická izolace microrna pomocí magnetizovatelných mikročástic Veronika Vlahová Datum: 21. 3. 214 Reg.č.projektu: CZ.1.7/2.3./2.148 Název projektu: Mezinárodní spolupráce v oblasti
1. Definice a historie oboru molekulární medicína. 3. Základní laboratorní techniky v molekulární medicíně
Obsah Předmluvy 1. Definice a historie oboru molekulární medicína 1.1. Historie molekulární medicíny 2. Základní principy molekulární biologie 2.1. Historie molekulární biologie 2.2. DNA a chromozomy 2.3.
Přehled výzkumných aktivit
Přehled výzkumných aktivit ROK 2004 Lenka Zahradová Laboratoř experimentální hematologie a buněčné imunoterapie Oddělení klinické hematologie FNB Bohunice Přednosta: prof. MUDr. M. Penka, CSc. Oddělení
Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/
I n v e s t i c e d o r o z v o j e v z d ě l á v á n í Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/07.0354 Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním
Roman Hájek. Zbytkové nádorové onemocnění. Mikulov 5.září, 2015
Roman Hájek Zbytkové nádorové onemocnění Mikulov 5.září, 2015 Zbytkové nádorové onemocnění 1. Minimal residual disease (MRD) Proč lékaře zbytkové nádorové onemocnění stále více zajímá? Protože se zásadně
MOLEKULÁRNĚ BIOLOGICKÉ METODY V ENVIRONMENTÁLNÍ MIKROBIOLOGII. Martina Nováková, VŠCHT Praha
MOLEKULÁRNĚ BIOLOGICKÉ METODY V ENVIRONMENTÁLNÍ MIKROBIOLOGII Martina Nováková, VŠCHT Praha MOLEKULÁRNÍ BIOLOGIE V BIOREMEDIACÍCH enumerace FISH průtoková cytometrie klonování produktů PCR sekvenování
Îivot cizincû... Kap. 3: Vybrané statistiky cizinců 21 % 34 % 13 % 4 % 12 % 4 % 7 % 5 % 36 Graf 19: Poãty udûlen ch azylû v letech
34 Graf 17: Îadatelé o azyl v âr v letech 1993-26 Žadatelé o azyl v ČR v letech 1993 26 (Graf 17) Azyl je forma mezinárodní ochrany, která se udûluje osobám, v jejichï pfiípadû bylo prokázáno poru ování
UPLATNĚNÁ CERTIFIKOVANÁ METODIKA. č. 94/2018
UPLATNĚNÁ CERTIFIKOVANÁ METODIKA č. 94/2018 Pentaplexní diagnostické qpcr systémy pro simultánní identifikaci a kvantifikaci tkání významných a minoritních druhů hospodářských zvířat s definovanou možností
Masivně paralelní sekvenování v diagnostice závažných časných epilepsií. DNA laboratoř KDN 2.LF a FN v Motole
Masivně paralelní sekvenování v diagnostice závažných časných epilepsií DNA laboratoř KDN 2.LF a FN v Motole Financial disclosure (konflikt zájmů) Projekt je v současné době finančně zabezpečen pouze z
základní znaky živých systémů (definice života výčtem jeho vlastností) složitá organizace a řád regulace a udržování vnitřní homeostázy získávání a
definice života živý organismus je přirozeně se vyskytující sám sebe reprodukující systém, který vykonává řízené manipulace s hmotou, energií a informací základní znaky živých systémů (definice života
Potřebné genetické testy pro výzkum a jejich dostupnost, spolupráce s neurology Taťána Maříková. Parent projekt. Praha 19.2.2009
Potřebné genetické testy pro výzkum a jejich dostupnost, spolupráce s neurology Taťána Maříková Parent projekt Praha 19.2.2009 Diagnostika MD její vývoj 1981-1986: zdokonalování diferenciální diagnostiky
OBSAH. Principy. Úvod Definice událostí po datu úãetní závûrky Úãel
23 POSOUZENÍ NÁSLEDN CH UDÁLOSTÍ OBSAH Principy Úvod Definice událostí po datu úãetní závûrky Úãel âinnosti Identifikace událostí do data vyhotovení zprávy auditora Identifikace událostí po datu vyhotovení
Ondřej Scheinost Nemocnice České Budějovice, a.s.
Ondřej Scheinost Nemocnice České Budějovice, a.s. Nové technologie přelomové období principy technologií klinická použitelnost chips (arrays) sekvenační technologie Důležitost genetických informací i další
Základy molekulární biologie KBC/MBIOZ
Základy molekulární biologie KBC/MBIOZ Ivo Frébort 5. Metody molekulární biologie II DNA footprinting hledání interakcí DNA s proteiny Polymerázová řetězová reakce (Polymerase chain reaction PCR) Malé
Patologie nádorů v 21. století problémy a úskalí diagnostiky a úhradového systému
Patologie nádorů v 21. století problémy a úskalí diagnostiky a úhradového systému A. Ryška Fingerlandůvústav patologie LF UK a FN Hradec Králové Karel Rokitansky (1804-1878) Rudolf Virchow (1821-1902)
2 Inkompatibilita v systému Rhesus. Upraveno z A.D.A.M.'s health encyclopedia
2 Inkompatibilita v systému Rhesus Upraveno z A.D.A.M.'s health encyclopedia 3 Inkompatibilita v systému Rhesus Úkol 7, str.119 Které z uvedených genotypových kombinací Rh systému u manželů s sebou nesou
Atestace z lékařské genetiky inovované otázky pro rok A) Molekulární genetika
Atestace z lékařské genetiky inovované otázky pro rok 2017 A) Molekulární genetika 1. Struktura lidského genu, nomenklatura genů, databáze týkající se klinického dopadu variace v jednotlivých genech. 2.
Molekulární základy dědičnosti. Ústřední dogma molekulární biologie Struktura DNA a RNA
Molekulární základy dědičnosti Ústřední dogma molekulární biologie Struktura DNA a RNA Ústřední dogma molekulární genetiky - vztah mezi nukleovými kyselinami a proteiny proteosyntéza replikace DNA RNA
Genetický polymorfismus
Genetický polymorfismus Za geneticky polymorfní je považován znak s nejméně dvěma geneticky podmíněnými variantami v jedné populaci, které se nachází v takových frekvencích, že i zřídkavá má frekvenci
Tématické okruhy pro státní závěrečné zkoušky
Tématické okruhy pro státní závěrečné zkoušky Obor Povinný okruh Volitelný okruh (jeden ze dvou) Forenzní biologická Biochemie, pathobiochemie a Toxikologie a bioterorismus analýza genové inženýrství Kriminalistické
ÚSTAV FYZIKÁLNÍ BIOLOGIE JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH
ÚSTAV FYZIKÁLNÍ BIOLOGIE JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH ZPRÁVA O UKONČENÍ PROJEKTU Projekt Název projektu: Multilocus sequence analysis as a tool for robust phylogeny in heterocytous cyanobacteria
FAMILIÁRNÍ ADENOMATÓZNÍ POLYPÓZA NOVINKY V MOLEKULÁRNÍ DIAGNOSTICE FAMILIAL ADENOMATOUS POLYPOSIS NOVEL MOLECULAR DIAGNOSTIC TECHNIQUES
FAMILIÁRNÍ ADENOMATÓZNÍ POLYPÓZA NOVINKY V MOLEKULÁRNÍ DIAGNOSTICE FAMILIAL ADENOMATOUS POLYPOSIS NOVEL MOLECULAR DIAGNOSTIC TECHNIQUES TEKROVÁ J 1, ULOVÁ M. 1, ZÍDKOVÁ K. 1, KLEIBL Z. 2, VANDROVCOVÁ J.
PCR IN DETECTION OF FUNGAL CONTAMINATIONS IN POWDERED PEPPER
PCR IN DETECTION OF FUNGAL CONTAMINATIONS IN POWDERED PEPPER Trojan V., Hanáček P., Havel L. Department of Plant Biology, Faculty of Agronomy, Mendel University of Agriculture and Forestry in Brno, Zemedelska
Genetické markery. pro masnou produkci. Mgr. Jan Říha. Výzkumný ústav pro chov skotu, s.r.o.
Genetické markery ve šlechtění skotu pro masnou produkci Mgr. Jan Říha Výzkumný ústav pro chov skotu, s.r.o. Genetické markery Polymorfní místa v DNA, které vykazují asociaci na sledované znaky Příčinné
Xenobiotika a jejich analýza v klinických laboratořích
Xenobiotika a jejich analýza v klinických laboratořích BERÁNEK M., BORSKÁ L., KREMLÁČEK J., FIALA Z., MÁLKOVÁ A., VOŘÍŠEK V., PALIČKA V. Lékařská fakulta UK a FN Hradec Králové Finančně podporováno programy
Molekulárn. rní. biologie Struktura DNA a RNA
Molekulárn rní základy dědičnosti Ústřední dogma molekulárn rní biologie Struktura DNA a RNA Ústřední dogma molekulárn rní genetiky - vztah mezi nukleovými kyselinami a proteiny proteosyntéza replikace
Implementace laboratorní medicíny do systému vzdělávání na Univerzitě Palackého v Olomouci. reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/
Implementace laboratorní medicíny do systému vzdělávání na Univerzitě Palackého v Olomouci reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/28.0088 Hybridizační metody v diagnostice Mgr. Gabriela Kořínková, Ph.D. Laboratoř molekulární