Cíl lekce. Historie. Osnova přednášky. DNA analýza. Lidský genom. Profilování DNA. Po této lekci byste měli: doc. Mgr. Jiří Drábek, PhD.
|
|
- Erik Růžička
- před 9 lety
- Počet zobrazení:
Transkript
1 Profilování DNA doc. Mgr. Jiří Drábek, PhD. Laboratoř experimentální medicíny, Ústav molekulární a translační medicíny, LF UP a Fakultní nemocnice Olomouc Cíl lekce Po této lekci byste měli: znát vlastnosti DNA a genů vědět, jak zjistit dědičné rozdíly mezi lidmi znát postup genotypizace znát diskriminační schopnost DNA. Osnova přednášky Genom Nepřímé a přímé testy Požadavky na genotypizační vyšetření Kdy se DNA profilování používá Procesní kroky DNA profilování Historie 1980 Wyman AR, White R: RFLP marker 1985 Jeffreys A: multilokusové sondy pro minisatelity 1985 Mullis K: PCR 1988 FBI a DNA 1991 Edwards A: STR a mapování 1995 anglická databáze UK DNA 1998 americká databáze CODIS 2001 česká kriminalistická DNA databáze 201? český DNA zákon DNA analýza Vysoká diskriminační schopnost Malé nároky na vzorek každá buňka má stejný genom Malé nároky na odběr Standardní, citlivé metody Databáze Pravděpodobnostní modely. Lidský genom Všechny molekuly DNA, které se vyznačují replikací a dědí se na potomstvo Kompletní soubor genů jedince, lokalizovaných v jádře (1n) 3*10 9 nukleotidů Geny a genové sekvence Extragenová DNA 1
2 Geny a genové sekvence Extragenová DNA Kódující oblasti Introny, promotory, pseudogeny, genové fragmenty DNA je složena z nukleotidů Struktura DNA Párování bází Eukaryontní geny mají introny 2
3 Organizace DNA Jaká část genetického materiálu se u lidí testuje? Autozomální chromozomy (22 párů) Gonozomální chromozomy (1 pár) amelogenin chromozom Y Mitochondriální DNA Pojmy Genotyp genetická konstituce organismu reprezentovaná souborem alel specificky uspořádaných v jeho genomu (soubor konkrétních forem genů jednotlivce, alely lokusu) Lokus chromozomová adresa Heterozygot, homozygot Dominance a recesivita na DNA úrovni irelevantní. Polymorfní úseky Co se testuje? úseky DNA s variabilitou, charakteristickou pro danou osobu (alely) polymorfismus délkový Indely CNV satelity mini (6-100 bp, Variable Number of Tandem Repeats VNTR) mikro (2-5 bp, Short Tandem Repeats - STR). polymorfismus sekvenční SNPs (průměrně 1 polymorfismus na bp) Typy polymorfismů Nepřímé DNA testy Dva významy: testování na úrovni proteinu vs testování formy znaku dle markeru na úrovni DNA Krevní skupiny (ABO, MNSs, Rh, Kell, Duffy, Kidd) Proteiny krevní plasmy (PLG, Gm/Km, C3, Tf, Pi, Hp, Gc) Enzymy červených krvinek (PGM, GPT, ACP, AK, ADA, EsD, PGD) Major Histocompatibility Complex, HLA (HLA-DRB1, -DQB1, -DQA1, -A, -B, -C). 3
4 HLA-DQA1 Různé úrovně rozlišení: sérologie, 7 alel, 23 alel *010101/2 * *0504 *010201/2 *0302 *0505 *0103 *0303 *060101/2 *010401/2 *040101/2 *0105 *050101/2 *0106 *0502 *0201 *0503 Přímé DNA Testy Testování na úrovni DNA RFLP Multilokusové minisatelitové sondy Polymarker VNTR (např. D1S80) STR. Polymarker VNTR D1S80 Multiplexní PCR (LDLR, GYPA, HBGG, D7S8, GC) Dotblot hybridizace se sondami Restrikční štěpení Při analýze RFLP Molekulární nůžky Restriktáza rozpoznávající je sonda DNA je totiž dlouhá molekula, která je hustě namotaná. DNA totiž dlouhá molekula, která hustě namotaná. 4
5 Druhá alela Po elektroforéze, přesátí a hybridizaci sonda DNA je totiž dlouhá molekula, která jo hustě namotaná. ztráta restrikčního místa RFLP Satelity Polymorfismus v délce restrikčních fragmentů gdna naštěpíme restriktázou Fragmenty rozdělíme elektroforeticky Z gelu je přesajeme na membránu Membránu hybridizujeme se sondou Navázanou sondu detekujeme Satelity jako text (restrikce) Alela 2:DNA je totiž dlouhá, dlouhá molekula, která je hustě namotaná. Satelity jako text (PCR) Alela 2:DNA je totiž dlouhá, dlouhá molekula, která je hustě namotaná. Alela 3: DNA je totiž dlouhá, dlouhá, dlouhá molekula, která je hustě namotaná. Alela 3: DNA je totiž dlouhá, dlouhá, dlouhá molekula, která je hustě namotaná. 5
6 Satelity jako bloky Sekvence mikrosatelitu TH01 Výhody mikrosatelitů Velká diskriminační schopnost TPOX: 8, 11 Mikrosatelity TH01: 9,9.3 D16S539: 5, 8 vwa: 16, 17 Výhody mikrosatelitů Zvláštnosti detekce mikrosatelitů Velká diskriminační schopnost Kompetitivní cena Snadná interpretace (ve srovnání s VNTR) Standardnost a zároveň rozmanitost Slučování testů (multiplexing) Citlivost (<1 ng DNA), směsi a degradované vzorky Používané mikrosatelity nejsou ve vazbě s nemocemi. Prokluz polymerázy koktavé proužky (stutter) Extra adenin Mikrovarianty Nulové (tiché) alely 6
7 Bezchybná replikace Prokluz Zadrhlé píky Na horizontální elektroforéze vytváří amplikon proužky, při kapilární elektroforéze s laserovým odečtem vytváří vrcholy elektroferogramu. DNA Size (bp) Chybová replikace s prokluzem Walsh et al (1996) Nucleic Acids Res. 24: Vyboulení jednotky repetice při dýchání dvouřetězcové sekvence Relative Fluorescence Units Stutter Product 6.3% 6.2% 5.4% Adenin z pilnosti Mikrovarianty Taq polymeráza přidává ještě jeden adenin navíc Alely, které nemají přesný násobek jednotky repetice anebo mají některou jednotku repetice s jinou sekvencí než ostatní Indel, záměna nukleotidu, 3 alely na osobu Tři proužky na osobu D21S11 D18S51 Nulové alely Alely, které naší metodou nejsme schopni otypovat Polymorfismus v místě vazby primeru Stejná výška vrcholů Součet výšek dvou vrcholů je roven výšce třetího vrcholu 7
8 Nulová alela: mutace v místě vazby primeru * * Heterozygous alleles are well balanced 6 8 Imbalance in allele peak heights Allele 6 amplicon has dropped out standard mutace uprostřed mutace naproti 3 konci primeru (allele dropout, nulová alela) Příklady mikrosatelitů Názvy: D3S1358 D znamená, že není součástí genu 3 číslo chromosomu S jedinečná sekvence v rámci genomu 1358 identifikační číslo D3S1358: alely 13; 14; 15; 16; 17; 18; 19; 20 Historické názvy před konvencí CSF1PO: 7; 8; 9; 10; 11; 12; 13; 14; 15 TH01: 5; 6; 7; 8; 9; 10; 11 TPOX: 6; 7; 8; 9; 10; 11; 12; 13 DNA profil celý profil modré zelené Chromozom Y Po meči Příjmení Nerekombinuje Znásilnění Cohen, Lemba, Jefferson T., rodinné projekty černé místo žlutého Struktura chromozomu Y SRY AMEL ~60 Mb total DNA sequence (only chromosome 22 is smaller) ~2.5 Mb on tips recombine with X (pseudoautosomal regions) STR markery na chromozomu Y Nucleic Acids Res. 28(2), e8 (2000) Mb euchromatin 9.5 Mb sequenced (27%) heterochromatin Genetic variation at multiple points along the Y chromosome is combined to form a Y haplotype for a sample Nucleic Acids Res. 28(2), e8 (2000) 8
9 Rodokmen se znaky na chromozomu Y Mitochondriální DNA Kruhová, bp Více mitochondriíí na buňku, více kopií mtdna na mitochondrii Bez reparačního systému heteroplazmie Andersonova (cambridgská) sekvence Variabilita v D-loop (1000 bp) HV1 a HV2 hypervariable regions (300 bp každý) Po přeslici (selektivní destrukce mužských mitochondrií v oplozeném vajíčku) Romanovci, hrob neznámého vojína (26 let po zabití ve Vietnamu identifikován jako Michael J. Blassie) Sekvencování, minisekvencování Cytochrom b pro rozlišení druhu. mtdna mt DNA rodokmen Rodokmen s mtdna Zjednodušený zápis mtdna sekvenačního výsledku heteroplazmie 9
10 Požadavky na genotypizační vyšetření Mendelistická dědičnost Hardy-Weinbergova rovnováha Vysoká diskriminační schopnost Nízká frekvence mutací Neměnnost genu, nezávislost na prostředí Metodická robustnost Mendelistická dědičnost Zákon o jednotce dědičnosti Dědičné vlastnosti jsou určeny nedělitelnou jednotkou informace (genem), která má různé formy (alely) Zákon dominance Alely jsou u každého jedince v páru, ale účinek jedné alely může být překryt jinou alelou Zákon segregace Během tvorby gamet se každý pár alel rozejde (oddělí), takže libovolná gameta nese pouze jednu alelu z každého páru. Páry alel se obnovují při fertilizaci. Zákon volné kombinovatelnosti Různé geny řídí různé fenotypické znaky a alely různých genů se kombinují navzájem nezávisle. Výjimky mendelistické dědičnosti Gamety jsou haploidní Na pohlaví vázané geny Mitochondriální dědičnost Vazba Multifaktoriální dědičnost Expanze trinukleotidových repeticí (dynamické mutace) Genomový imprinting Neúplná penetrance Hardy Weinbergova rovnováha (HWE) Vzorec popisující populaci v rovnováze Za splnění určitých podmínek (panmixie, velká populace, není migrace populace) se po jedné generaci fixují genotypové frekvence jako funkce alelických frekvencí.... haploidní 10
11 Hardy Weinbergova rovnováha Mutace Počet alel Názvy alel Frekvence alel Frekvence genotypů Genotypy 2 P, Q p, q (p+q) 2 =p 2 +2pq+q 2 PP+PQ+QQ Změna v DNA sekvenci v zárodečné linii somatická. 3 P, Q, R p, q, r (p+q+r) 2 =p 2 +2pq+2qr+2pr+q 2 +r 2 PP+PQ+QR+PR+QQ+RR 4 P, Q, R, S p, q, r, s (p+q+r+s) 2 =p 2 +2pq+2qr+2pr+2ps+2rs+ 2qs+q 2 +r 2 +s 2 PP+PQ+QR+PR+PS+RS+ QS+QQ+RR+SS Frekvence mutací a rekombinací SNP, indel M: 1/10 8 meióz Mikrosatelity M: 1/10 3 meióz Minisatelity MR: 1/10 2 meióz HLA R: 1/10 2 meióz Low copy number (LCN), Low template DNA (LTDNA) Malé množství DNA, které při standardním postupu poskytuje nespolehlivé výsledky se stochastickými efekty Zvýšení citlivosti pomocí zvýšení počtu cyklů PCR 1981 zavražděna 14-tiletá Marion Crofts ve Fleet, Hampshire, UK; 2002 Tony Jasinskyj odhalen a odsouzen jako násilník 1995 John Anthony Cook se vykálel po vraždě, Birmingham, UK; 2002 odhalen a odsouzen. Případ Joseph Kappen 1973 znásilněny a zavražděny 3 šestnáctileté slečny v Jižním Walesu 2001 low copy number DNA úplná shoda nebyla nalezena v databázi neúplná shoda může ukazovat na příbuzného vraha (nalezeno 100 potenciálně příbuzných) v roce 1991 Joseph Kappen zemřel na rakovinu plic 2002 exhumace potvrdila shodu. Vývoj ohledně LCN/LTDNA LCN/LTDNA by se neměla ve forenzněgenetické praxi používat (Budowle) Vs. Ke stochastickým efektům dochází i při dostatečném množství DNA ve vzorku, proto by se k LCN/LTDNA mělo přistupovat stejně jako k jiným vzorkům (expertní systémy) (Gill) 11
12 D3S1358 Směs VWA FGA blue panel Neměnnost genu, nezávislost na prostředí - nesplňují Relative Fluorescence Units Amel D8S1179 D5S818 D21S11 D13S317 green panel D18S51 yellow panel D7S820 Expanze trinukleotidových repeticí (dynamická mutace) TCR, imunoglobuliny Metodická robustnost Množství vzorku Kvalita vzorku Stabilita v čase Obrátkovost Kontrola kvality DNA typizace Dokumentace od prvního kroku (získání stopy) každé otevření zkumavky je před svědky a zapsáno Dodržování antikontaminačních opatření Pozitivní a negativní kontrola při každé analýze Kontrola softwarového určení délky a přiřazování jmen alel k délkám amplikonu Použití objektivních standardů Účast v externí kontrole kvality (zaslepené vzorky) Expertní systémy Akreditace dle normy ISO Kdy se DNA profilování používá? Identifikace (ztotožnění) kriminální případy: důkaz a podezřelý historické a evoluční studie určení živočišného druhu, posmrtného stadia zmizelé osoby ztracené osoby, hromadná neštěstí: puzzle vojenská psí známka databáze zločinců vyšetření rodičovství, příbuznosti. Otázky Který podezřelý to byl odpovídá soud Kterého nemůžeme vyloučit? Je to důkaz pro anebo proti? Jak silný je to důkaz? 12
13 Kterého podezřelého nevyloučíme? Hromadná neštěstí Letecké havárie WTC Tsunami Nutno kvantifikovat Tsunami obětí Identifikace obětí označit číslem věci na sobě (hodinky, řetízky, mobil) tetování chrup pitva (s RTG) DNA Faktory tropické počasí cena (Číňani zdarma?) management referenční materiál (celé rodiny) Předchozí neštěstí o stejné škále Irák 1985: Kurdů Irák 1992: Šiitů DNA analýza? Forenzní zpracování DNA Získání vzorku Izolace a kvantifikace DNA Namnožení pomocí PCR Elektroforéza Detekce a určení genotypu Interpretace, výpočet, referování výsledku 01.htm Každý krok je důležitý Obhájci O. J. Simpsona a jiných bohatých prominentů prokázali, že zaváhání v jakémkoliv kroku forenzního využití DNA je možno úspěšně napadnout. 13
14 O. J. Simpson Orenthal James O. J. Simpson, s přezdívkou džus je bývalý hráč amerického fotbalu a odsouzený kriminálník. V roce 1985 se dostal do Síně slávy amerického fotbalu a slavil úspěchy jako herec a sportovní komentátor V roce 1995 byl v trestním soudním procesu the People vs Simpson osvobozen z obvinění, že zavraždil svou bývalou manželku Nicole Brown Simpson a jejího přítele Ronalda Goldmana V roce 1997 byl v civilním soudním procesu shledán vinným. Jako trest měl zaplatit 33,5 milionů $, což zatím neučinil. V roce 2007 byl zatčen v Las Vegas, Nevada a obviněn z loupeže a únosu. V roce 2008 byl odsouzen k 33 letům vězení s možností být propuštěn na podmínku nejdříve po 9 letech. Sedí v the Lovelock Correctional Center in Lovelock, Nevada. Získání vzorku Včasnost Značení Kontaminace Záměna (nechtěná, záměrná) Bezpečnost Kontrolní vzorky (viz ohledání) Kontrolní vzorek Krev do EDTA (zdravotnické zařízení) Sliny - ponecháním průklepového papíru v ústech (kriminalistický technik) Bukální výtěr: štětečkem/kartáčkem SOBIMA nebo Bode Odběr vzorků dříve 42e odst.1 písm. e policista je oprávněn u osob obviněných ze spáchání trestného činu, nebo u osob nalezených, po nichž bylo vyhlášeno pátrání a které nemají způsobilost k právním úkonům v plném rozsahu, odebírat biologické vzorky umožňující získat informaci o genetickém vybavení, navíc zákon č.239/2000 Sb. o integrovaném záchranném systému Bukální stěr SOBIMA Vymahatelnost proti vůli dotyčné osoby - pokuta do Kč ( Kč při zajišťování stop trestného činu). Odběr vzorků dnes Zákon 321/2006 Sb. Oprávněnost násilných odběrů Způsob překonání odporu musí být přiměřený jeho intenzitě Obviněný nebo podezřelý musí být poučen dle 114 odst.5tr.ř. o oprávněnosti překonat odpor Sběrná výbava Páska k ohraničení území Fotoaparát Tužky, papír, podložka pro nakreslení scény Jednorázové ochranné oblečení, masky, rukavice Baterka, laser, UV, infračervené světlo Lupa Pinzeta a vata Papírové a plastové sáčky, zkumavky Souprava pro otisky prstů (karty, argentorát, luminol, kafr, kyanoakrylát, inkoust, páska) Souprava pro odlévání stop (Lukopren) Sérologická souprava Entomologická souprava Hazmat souprava Souprava pro stopy po znásilnění 14
15 Zdroj DNA Izolace DNA Bílé krvinky Semeno Tkáně, zuby, kosti Výtěr bukální sliznice Kořínky vlasů a chlupů, nehty Žvýkačka, poštovní známka, zubní kartáček, špaček, balzám na rty, moč Postup Uvolnit DNA z jádra buňky Zbavit se proteinů tuků RNA inhibitorů PCR. Znásilnění a pohlavní zneužívání Zákon z r podle 241 trestního zákoníku se znásilnění dopustí ten, kdo násilím nebo pohrůžkou násilí donutí jiného k souloži, nebo k jinému obdobnému pohlavnímu styku, nebo kdo k takovému činu zneužije bezbrannosti jiného. 242 tr.z. se trestného činu pohlavního zneužívání dopustí ten, kdo vykoná soulož s osobou mladší než patnáct let nebo kdo takové osoby jiným způsobem pohlavně zneužije 243 tr.z. se trestného činu pohlavního zneužívání dopustí ten, kdo zneužívaje závislosti osoby mladší než osmnáct let nebo osoby svěřené jeho dozoru, přiměje ji k mimomanželské souloži, nebo kdo takové osoby, zneužívaje její závislosti, jiným způsobem pohlavně zneužije (učitel, vychovatel, trenér) 245 tr. z. se trestného činu soulože mezi příbuznými dopustí ten, kdo vykoná soulož s příbuzným v pokolení přímém nebo se sourozencem. Kvalita zdroje DNA Semeno > krev, vlasy s kořínky, vaginální sekret, nosní sekret > potní skvrny, moč > lupy, vypadané vlasy, lejno (mtdna). Kontaminace Nutné zlo PCR laboratoře? 15
16 Kvantifikace DNA Dot-blot radiograficky Změření množství a čistoty Inhibitory PCR indigo huminové kyseliny hem Spektrofotometricky, fluorescenčně, kolorimetricky, qpcr. Spektrofotometricky Spektrofotometricky Absorbance OD=1 při 260 nm v 1 cm kyvetě odpovídá 50 µg/ml dsdna Poměr absorbancí A 260 /A 280 1,8 až 2,0 znamená čistou DNA. Fluorimetricky Kolorimetricky Hoechst 33258, PicoGreen, SybrGreen Dipstick 16
17 Pomocí kvantitativní PCR (qpcr) Real-time PCR PCR amplifikace Polymerázová řetězová reakce (Polymerase Chain Reaction) Namnožení úseku DNA pomocí cyklických změn teplot v programovatelném termostatu (cykléru) Cyklické střídání teplot Vlastní PCR Teplota 94 C 60 o C 72 C 94 C 94 C 94 C 72 C 72 C 60 C 60 C Jeden cyklus Denaturace Hybridizace Extenze Složení PCR směsi PCR Templát Primery (značené) Nukleotidy Polymeráza Pufr s hořčíkem Vše v nadbytku 17
18 Multiplexní PCR směsi PowerPlex TM 16 (Promega) Profiler (Applied Biosystems) Identifiler (Applied Biosystems) Minifiler (Applied Biosystems) PowerPlex bp 200 bp 300 bp 400 bp D3 TH01 D21 D5 D13 D7 D16 D18 CSF Penta E Penta D Součástí setů je test na amelogenin A vwa D8 TPOX FGA PCR STR Elektroforéza DNA je záporně nabitá Elektroforetický gel Gelová elektroforéza Agaróza rychlé, levné Polyakrylamid větší rozlišovací schopnost Performance-optimized polymer kapalina v kapiláře 18
19 Pohyb DNA v gelu Gel Tři osoby Nevyloučení Vyloučení Kapilární elektroforéza Vstříknutí příprava vzorku (denaturace) elektrokineticky Separace kapilára POP-4 polymer pufr Detekce fluorescentní barviva s nepřekrývajícími se emisními délkami filtry (skutečné a virtuální). 19
20 Fill with Polymer Solution Kapilární Elektroforéza (CE) Inlet (cathode) µm x 27 cm - Burn capillary + window DNA Separation occurs in minutes kv Data Acquisition and Analysis Argon Ion Laser Outlet (anode) - Mechanismus separace DNA DNA- DNA- DNA- DNA- DNA- + Zamotaná vlákna polymerů zpomalují pohyb DNA v závislosti na délce molekuly (náboji) Polymer (gel) je tekutý, bez příčných vazeb (které jsou u plochých gelů), není připojen ke stěně kapiláry Polymer lze vypumpovat po každém běhu Separační charakteristiky jsou dány koncentrací polymeru a délkou vláken ABI Prism 310 Genetic Analyzer ABI Prism 310 Genetic Analyzer Kapilára Zaostřeno na podavač zkumavek Injekční stříkačka s polymerem Laser Elektroda Kapilára Pufr na výstupu Podavač zkumavek Injekční elektroda Vstupní pufr Podavač zkumavek Zkumavky Gelová elektroforéza s laserem Separace podle délky Fluorescenčně značené amplikony Kapilára Schéma CCD Panel Detekce Ar+ LASER (488 nm) Detekční okénko Fluorescence Hranol Separace barev 20
21 Fluorescentní značky při 4 detekčních kanálech Fluorescenční emisní spektra 5-FAM JOE NED ROX FAM (FL) JOE TAMRA (NED) ROX (CXR) 0 Laser excitation (488, nm) WAVELENGTH (nm) ABI 310 Filter Set F Elektroforeogram (elektroferogram) Jednotlivé barevné kanály TH01 TPOX CSF D3 D5 AMEL VWA D7 D13 D8 D21 D16 D18 FGA Penta E Penta D Kalibrační křivka z vnitřního standardu DNA Size bp bp Délka fragmentů se počítá z kalibrační křivky vnitřního standardu Algoritmus výpočtu délky fragmentu Lokální Southernova metoda používá 2 vrcholy standardu delší než náš fragment a 2 vrcholy kratší než náš fragment STR Allele Internal size standard DNA fragmenty vrcholy elektroferogramu Data Point X 1 X 2 X 1 + X 2 2 = Size of STR Allele 21
22 Vnitřní standardy GS500 ROX (Applied Biosystems) DNA profil ILS600 CXR (Promega) LTI ROX (Life Technologies) Detekce a určení genotypu Databáze zločinců Ethidiumbromid stříbření laserové odečítání Srovnání se standardem Lidský faktor Informace v databázích Kdo lže, ten krade,...? Databáze NDNAD National DNA Database (UK) nevyřešené případy podezřelí odsouzení obžalovaní nevinní CODIS Combined DNA Index System (USA) NDIS National DNA Index System (k prosinci profilů delikventů, profilů zatčených a profilů stop shod, které pomohly ve vyšetřováních) Národní databáze DNA 2001 (2002) (Česká republika) 22
23 FBI s CODIS DNA Database 13 lokusů CODIS STR Combined DNA Index System Used for linking serial crimes and unsolved cases with repeat offenders Launched October 1998 Links all 50 states Requires >4 RFLP markers and/or 13 core STR markers Current backlog of >600,000 samples TPOX D3S1358 D5S818 FGA D8S1179 D7S820 CSF1PO D13S317 D16S539 D18S51 D21S11 TH01 VWA AMEL AMEL Vývoj databází zločinců v USA States States States 2004: DNA Database Expansion Bills States States (est.) * States (est.) Considering all felons legislation in 2004 (12) Considering limited expansion legislation (3) * Currently an all-felons state (31) Through a voters initiative Národní databáze DNA ND DNA 2001 Andy Williams ve fci twinnera projektu PHARE Rozhodnutí padlo v rezoluci Rady Evropy č.193/1997, spolupráce Interpol, European Network of Forensic Science Institutes (ENFSI) Kriminalistický ústav Praha, Policie České republiky (ISO9000, QA), Závazný pokyn policejního prezidenta k používání databáze květen letá lhůta věk 80 let u odsouzených CODIS bezplatně (za přístup) Zákon č.101/2000 Sb. o ochraně osobních údajů Euronovela zákona o policii č.60/2001 Sb. Pomocná informační databáze INFO-DNA, propojená 15-místným kódem Zabezpečení vůči neoprávněnému vstupu do databáze, zálohování. Photofit Dle dědičných znaků usuzovat na fenotyp (vzhled) Rusovlasost Ušní maz Plešatění Etnogeografický původ ancestry informative markers (AIM) 23
24 Děkuji vám za pozornost! 24
Cíl lekce. Osnova přednášky. DNA analýza. Profilování DNA. Po této lekci byste měli: doc. Mgr. Jiří Drábek, PhD.
Profilování DNA doc. Mgr. Jiří Drábek, PhD. Laboratoř experimentální medicíny, Ústav molekulární a translační medicíny, LF UP a Fakultní nemocnice Olomouc Cíl lekce Po této lekci byste měli: znát vlastnosti
DNA TECHNIKY IDENTIFIKACE ŽIVOČIŠNÝCH DRUHŮ V KRMIVU A POTRAVINÁCH. Michaela Nesvadbová
DNA TECHNIKY IDENTIFIKACE ŽIVOČIŠNÝCH DRUHŮ V KRMIVU A POTRAVINÁCH Michaela Nesvadbová Význam identifikace živočišných druhů v krmivu a potravinách povinností každého výrobce je řádně a pravdivě označit
Genetický polymorfismus jako nástroj identifikace osob v kriminalistické a soudnělékařské. doc. RNDr. Ivan Mazura, CSc.
Genetický polymorfismus jako nástroj identifikace osob v kriminalistické a soudnělékařské praxi doc. RNDr. Ivan Mazura, CSc. Historie forenzní genetiky 1985-1986 Alec Jeffreys a satelitní DNA 1980 Ray
Genetický polymorfismus
Genetický polymorfismus Za geneticky polymorfní je považován znak s nejméně dvěma geneticky podmíněnými variantami v jedné populaci, které se nachází v takových frekvencích, že i zřídkavá má frekvenci
Aplikace DNA profilování na adna
Aplikace DNA profilování na adna Workshop adna S sebou:!čistý! plášť, přezůvky, laboratorní kalhoty a triko, popř. čisté tepláky Sraz 10 min. před začátkem v před místností 347, A36 koridor Zkušební termíny
Centrum aplikované genomiky, Ústav dědičných metabolických poruch, 1.LFUK
ové technologie v analýze D A, R A a proteinů Stanislav Kmoch Centrum aplikované genomiky, Ústav dědičných metabolických poruch, 1.LFUK Motto : "The optimal health results from ensuring that the right
MENDELOVA ZEMĚDĚLSKÁ A LESNICKÁ UNIVERZITA V BRNĚ Agronomická fakulta
MENDELOVA ZEMĚDĚLSKÁ A LESNICKÁ UNIVERZITA V BRNĚ Agronomická fakulta Ústav morfologie, fyziologie a genetiky zvířat Určování a ověřování paternity u koní. Bakalářská práce Brno 2006 Vedoucí bakalářské
Pohled na DNA profilování v kriminalistice
Pohled na DNA profilování v kriminalistice doc. Mgr. Jiří Drábek, PhD. Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem České republiky 1 CV 1993 1999: konzultant pro určení
6. Kde v DNA nalézáme rozdíly, zodpovědné za obrovskou diverzitu života?
6. Kde v DNA nalézáme rozdíly, zodpovědné za obrovskou diverzitu života? Pamatujete na to, co se objevilo v pracích Charlese Darwina a Alfreda Wallace ohledně vývoje druhů? Aby mohl mechanismus přírodního
Vzdělávání středoškolských pedagogů a studentů středních škol jako nástroj ke zvyšování kvality výuky přírodovědných předmětů
Vzdělávání středoškolských pedagogů a studentů středních škol jako nástroj ke zvyšování kvality výuky přírodovědných předmětů Registrační číslo: CZ.1.07/1.1.00/14.0016 Proces forenzní identifikace pomocí
Analýza DNA. Co zjišťujeme u DNA DNA. PCR polymerase chain reaction. Princip PCR PRINCIP METODY PCR
o zjišťujeme u DN nalýza DN enetickou podstatu konkrétních proteinů Mutace bodové (sekvenční delece nebo inzerce nukleotidů), chromosomové aberace (numerické, strukturální) Polymorfismy konkrétní mutace,
USING OF AUTOMATED DNA SEQUENCING FOR PORCINE CANDIDATE GENES POLYMORFISMS DETECTION
USING OF AUTOMATED DNA SEQUENCING FOR PORCINE CANDIDATE GENES POLYMORFISMS DETECTION VYUŽITÍ AUTOMATICKÉHO SEKVENOVÁNÍ DNA PRO DETEKCI POLYMORFISMŮ KANDIDÁTNÍCH GENŮ U PRASAT Vykoukalová Z., Knoll A.,
Molecular Ecology J. Bryja, M. Macholán MU, P. Munclinger - UK
MODULARIZACE VÝUKY EVOLUČNÍ A EKOLOGICKÉ BIOLOGIE CZ.1.07/2.2.00/15.0204 Molecular Ecology J. Bryja, M. Macholán MU, P. Munclinger - UK Co je molekulární ekologie? Uměle vytvořený obor vymezený technickým
Genetické mapování. v přírodních populacích i v laboratoři
Genetické mapování v přírodních populacích i v laboratoři Funkční genetika Cílem je propojit konkrétní mutace/geny s fenotypem Vzniklý v laboratoři pomocí mutageneze či vyskytující se v přírodě. Forward
2 Inkompatibilita v systému Rhesus. Upraveno z A.D.A.M.'s health encyclopedia
2 Inkompatibilita v systému Rhesus Upraveno z A.D.A.M.'s health encyclopedia 3 Inkompatibilita v systému Rhesus Úkol 7, str.119 Které z uvedených genotypových kombinací Rh systému u manželů s sebou nesou
Molekulární genetika II zimní semestr 4. výukový týden ( )
Ústav biologie a lékařské genetiky 1.LF UK a VFN, Praha Molekulární genetika II zimní semestr 4. výukový týden (27.10. 31.10.2008) prenatální DNA diagnostika presymptomatická Potvrzení diagnózy Diagnostika
Tok GI v buňce. Genetický polymorfizmus popis struktury populací. Organizace genetického materiálu. Definice polymorfismu
Genetický olymorfizmus ois struktury oulací Tok GI v buňce Dr. Ing. Urban Tomáš ÚSTAV GEETIKY MZLU Brno urban@mendelu.cz htt://www.mendelu.cz/af/genetika/ Seminář doktorského grantu 53/03/H076 : Molekulárn
Co zjišťujeme u DNA ACGGTCGACTGCGATGAACTCCC ACGGTCGACTGCGATCAACTCCC ACGGTCGACTGCGATTTGAACTCCC
Analýza DNA Co zjišťujeme u DNA genetickou podstatu konkrétních proteinů mutace bodové, sekvenční delece/inzerce nukleotidů, chromosomové aberace (numerické, strukturální) polymorfismy konkrétní mutace,
Analýza DNA. Co zjišťujeme u DNA
Analýza DNA Co zjišťujeme u DNA Genetickou podstatu konkrétních proteinů Mutace bodové (sekvenční delece nebo inzerce nukleotidů, záměny), chromosomové aberace (numerické, strukturní) Polymorfismy konkrétní
Testování lidské identity
Testování lidské identity Brno, 2009 J.M.Butler Forensic DNA Typing workshop, 2006 Bryan Sykes Sedm dcer Eviných, 2005 Využití testování lidské identity Řešení trestních činů shoda mezi podezřelým a stopou
Genetický screening predispozice k celiakii
VETERINÁRN RNÍ A FARMACEUTICKÁ UNIVERZITA BRNO Farmaceutická fakulta Ústav humánn nní farmakologie a toxikologie Genetický screening predispozice k celiakii RNDr. Ladislava Bartošov ová,ph.d. 1, PharmDr.
UNIVERZITA KARLOVA V PRAZE Přírodovědecká fakulta. Studijní program: Biologie. Katedra antropologie a genetiky člověka.
UNIVERZITA KARLOVA V PRAZE Přírodovědecká fakulta Studijní program: Biologie Katedra antropologie a genetiky člověka Lenka Dvořáková Využití metod PCR ve forenzní genetické analýze Use of PCR in forensic
KVANTIFIKACE ZMĚN GENOVÉ EXPRESE
KVANTIFIKACE ZMĚN GENOVÉ EXPRESE Northern bloty Genové čipy pracné a zdlouhavé nákladné Semikvantitativní RT-PCR nepřesné qpcr vysoké dynamické rozpětí metodiky real-time PCR Vysokoučinné sekvenování transkriptomu
Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti NUKLEOVÉ KYSELINY
Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti NUKLEOVÉ KYSELINY 3 složky Nukleotidy dusík obsahující báze (purin či pyrimidin) pentosa fosfát Fosfodiesterová vazba. Vyskytuje se mezi
ZDRAVOTNÍ NEZÁVADNOST POTRAVIN
ZDRAVOTNÍ NEZÁVADNOST POTRAVIN Možnosti stanovení Listeria monocytogenes popis metod a jejich princip Mária Strážiková Aleš Holfeld Obsah Charakteristika Listeria monocytogenes Listerióza Metody detekce
Mgr. et Mgr. Lenka Falková. Laboratoř agrogenomiky. Ústav morfologie, fyziologie a genetiky zvířat Mendelova univerzita
Mgr. et Mgr. Lenka Falková Laboratoř agrogenomiky Ústav morfologie, fyziologie a genetiky zvířat Mendelova univerzita 9. 9. 2015 Šlechtění Užitek hospodářská zvířata X zájmová zvířata Zemědělství X chovatelství
Metody studia historie populací. Metody studia historie populací
1) Metody studia genetické rozmanitosti komplexní fenotypové znaky, molekulární znaky. 2) Mechanizmy evoluce mutace, přírodní výběr, genový posun a genový tok 3) Anageneze x kladogeneze - co je vlastně
Využití molekulárních markerů v systematice a populační biologii rostlin. 10. Další metody
Využití molekulárních markerů v systematice a populační biologii rostlin 10. Další metody Další molekulární markery trflp ISSRs (retro)transpozony kombinace a modifikace různých metod real-time PCR trflp
Mendelova genetika v příkladech. Genetické markery
Mendelova genetika v příkladech Genetické markery Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a Státním rozpočtem ČR InoBio CZ.1.07/2.2.00/28.0018 Hodnocení genetické proměnlivosti Fenotypový
Základy genetiky 2a. Přípravný kurz Komb.forma studia oboru Všeobecná sestra
Základy genetiky 2a Přípravný kurz Komb.forma studia oboru Všeobecná sestra Základní genetické pojmy: GEN - úsek DNA molekuly, který svojí primární strukturou určuje primární strukturu jiné makromolekuly
v oboru KLINICKÁ GENETIKA PRO ODBORNÉ PRACOVNÍKY V LABORATORNÍCH METODÁCH
RÁMCOVÝ VZDĚLÁVACÍ PROGRAM PRO ZÍSKÁNÍ SPECIALIZOVANÉ ZPŮSOBILOSTI v oboru KLINICKÁ GENETIKA PRO ODBORNÉ PRACOVNÍKY V LABORATORNÍCH METODÁCH 1. Cíl specializačního vzdělávání Cílem specializačního vzdělávání
Genetika - maturitní otázka z biologie (2)
Genetika - maturitní otázka z biologie (2) by jx.mail@centrum.cz - Ned?le, B?ezen 01, 2015 http://biologie-chemie.cz/genetika-maturitni-otazka-z-biologie-2/ Otázka: Genetika I P?edm?t: Biologie P?idal(a):
Genetické markery, markery DNA
Obecná genetika Genetické markery, markery DNA Prof. Ing. Dušan GÖMÖRY, DrSc. Ing. Roman LONGAUER, CSc. Ústav zakládání a pěstění lesů LDF MENDELU Brno Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním
ZÁKLADY BIOLOGIE a GENETIKY ČLOVĚKA
učební texty Univerzity Karlovy v Praze ZÁKLADY BIOLOGIE a GENETIKY ČLOVĚKA Berta Otová Romana Mihalová KAROLINUM Základy biologie a genetiky člověka doc. RNDr. Berta Otová, CSc. MUDr. Romana Mihalová
Co zjišťujeme u DNA ACGGTCGACTGCGATGAACTCCC ACGGTCGACTGCGATCAACTCCC ACGGTCGACTGCGATTTGAACTCCC
Analýza DNA Co zjišťujeme u DNA Genetickou podstatu konkrétních proteinů Mutace bodové (sekvenční delece nebo inzerce nukleotidů), chromosomové aberace (numerické, strukturální) Polymorfismy konkrétní
Využití molekulárních markerů v systematice a populační biologii rostlin. 12. Shrnutí,
Využití molekulárních markerů v systematice a populační biologii rostlin 12. Shrnutí, Přehled molekulárních markerů 1. proteiny isozymy 2. DNA markery RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism) založené
BioArray Molecular. Graham Smallridge, Immucor Prague November 2013
BioArray Molecular Immunohaematology Graham Smallridge, Immucor Prague November 2013 1 BioArray Solutions BioArray Solutions Ltd. Bylo založeno ve městě Warren, New Jersey, (USA) v roce 1997 skupinou vědeckých
Crossing-over. over. synaptonemální komplex
Genetické mapy Crossing-over over v průběhu profáze I meiózy princip rekombinace genetického materiálu mezi maternálním a paternálním chromosomem synaptonemální komplex zlomy a nová spojení chromatinových
Vypracované otázky z genetiky
Vypracované otázky z genetiky 2015/2016 Dana Hatoňová 1. Základní zákony genetiky 2. Dihybridismus 3. Aditivní model polygenní dědičnosti 4. Interakce nealelních genů 5. Genová vazba 6. Genotyp a jeho
Genetické markery. pro masnou produkci. Mgr. Jan Říha. Výzkumný ústav pro chov skotu, s.r.o.
Genetické markery ve šlechtění skotu pro masnou produkci Mgr. Jan Říha Výzkumný ústav pro chov skotu, s.r.o. Genetické markery Polymorfní místa v DNA, které vykazují asociaci na sledované znaky Příčinné
Mikrosatelity (STR, SSR, VNTR)
Mikrosatelity (STR, SSR, VNTR) Repeats Více než polovina našeho genomu Interspersed (transposony) Tandem (mini- a mikrosatelity) Minisatellites (longer motifs 10 100 nucleotides) mikrosatelity Tandemová
Fragment Analyzer UNIKÁTNÍ KAPILÁROVÝ FRAGMENTAČNÍ ANALYZÁTOR VÝBORNÉ VÝSLEDKY UNIKÁTNÍ VLASTNOSTI
Fragment Analyzer UNIKÁTNÍ KAPILÁROVÝ FRAGMENTAČNÍ ANALYZÁTOR VÝBORNÉ VÝSLEDKY UNIKÁTNÍ VLASTNOSTI Výborný přístroj, výborné výsledky Fragmentační analyzátor je automatizovaný kapilárový systém s CE značkou
LABORATORNÍ PŘÍRUČKA. Laboratoř HLA systému a PCR diagnostiky
LABORATORNÍ PŘÍRUČKA Transfuzní oddělení Laboratoř systému a PCR diagnostiky Účinnost od 15. 9. 2015 Verze č. 4 Tímto předpisem se ruší Verze č. 3, platnost od 1. 4. 2014 Odborný garant Jméno a příjmení,
Populační genetika II
Populační genetika II 4. Mechanismy měnící frekvence alel v populaci Genetický draft (genetické svezení se) Genetický draft = zvýšení frekvence alely díky genetické vazbě s výhodnou mutací. Selekční vymetení
Polymerázová řetězová reakce. Základní technika molekulární diagnostiky.
Polymerázová řetězová reakce Základní technika molekulární diagnostiky. Kdo za to může? Kary Mullis 1983 Nobelova cena 1993 Princip PCR Polymerázová řetězová reakce (polymerase chain reaction PCR) umožňuje
MOLEKULÁRNĚ BIOLOGICKÉ METODY V ENVIRONMENTÁLNÍ MIKROBIOLOGII. Martina Nováková, VŠCHT Praha
MOLEKULÁRNĚ BIOLOGICKÉ METODY V ENVIRONMENTÁLNÍ MIKROBIOLOGII Martina Nováková, VŠCHT Praha MOLEKULÁRNÍ BIOLOGIE V BIOREMEDIACÍCH enumerace FISH průtoková cytometrie klonování produktů PCR sekvenování
RIGORÓZNÍ OTÁZKY - BIOLOGIE ČLOVĚKA
RIGORÓZNÍ OTÁZKY - BIOLOGIE ČLOVĚKA 1. Genotyp a jeho variabilita, mutace a rekombinace Specifická imunitní odpověď Prevence a časná diagnostika vrozených vad 2. Genotyp a prostředí Regulace buněčného
Resort Připomínky Reakce Iuridicum Remedium Zásadní připomínka k podnětu jako celku Ministerstvo vnitra s návrhem usnesení zásadně
Resort Připomínky Reakce Iuridicum Remedium Ministerstvo vnitra Zásadní připomínka k podnětu jako celku Ministerstvo vnitra s návrhem usnesení zásadně nesouhlasí. Ministerstvo vnitra právní úpravu považuje
Kameyama Y. et al. (2001): Patterns and levels of gene flow in Rhododendron metternichii var. hondoense revealed by microsatellite analysis.
Populační studie Kameyama Y. et al. (2001): Patterns and levels of gene flow in Rhododendron metternichii var. hondoense revealed by microsatellite analysis. Molecular Ecology 10:205 216 Proč to studovali?
Genetika pohlaví genetická determinace pohlaví
Genetika pohlaví Genetická determinace pohlaví Způsoby rozmnožování U nižších organizmů může docházet i k ovlivnění pohlaví jedince podmínkami prostředí (např. teplotní závislost pohlavní determinace u
Imunogenetika imunologie. imunity imunitních reakcí antigenů protilátek. imunogenetika. erytrocytárních antigenů histokompatibilitních antigenů
Imunogenetika Vědní odvětví zabývající se imunitním systémem obratlovců, který je výrazně odlišuje od nižších organizmů se nazývá imunologie. Její náplní je zejména studium imunity mechanizmů stálosti
Elektroforéza Sekvenování
Elektroforéza Sekvenování Výsledek PCR Elektroforéza V molekulární biologii se používá k separaci nukleových kyselin a bílkovin Principem je pohyb nabitých molekul v elektrickém poli Gelová, polyakrylamidová
MENDELOVSKÁ DĚDIČNOST
MENDELOVSKÁ DĚDIČNOST Gen Část molekuly DNA nesoucí genetickou informaci pro syntézu specifického proteinu (strukturní gen) nebo pro syntézu RNA Různě dlouhá sekvence nukleotidů Jednotka funkce Genotyp
Dědičnost pohlaví Genetické principy základních způsobů rozmnožování
Dědičnost pohlaví Vznik pohlaví (pohlavnost), tj. komplexu znaků, vlastností a funkcí, které vymezují exteriérové i funkční diference mezi příslušníky téhož druhu, je výsledkem velmi komplikované série
Možná uplatnění proteomiky směrem do klinické praxe
Možná uplatnění proteomiky směrem do klinické praxe Formy uplatnění proteomiky do klinické praxe Přímé uplatnění proteomických technologií Metody pro studium proteinů tu byly dřív něž proteomika jako obor
Hardy-Weinbergův princip
1) Modelová populace 2) Hardy-Weinbergův princip 3) Hardy-Weinbergův princip využití Testování HW poměru Stanovení četnosti heterozygotů při úplné dominanci Interpretace DNA profilů 4) Snyderovy podíly
Využití genetické rozmanitosti při identifikaci člověka
Kurz genetiky a molekulární biologie pro učitele středních škol 9.9.2014 Využití genetické rozmanitosti při identifikaci člověka RNDr. Pavel Lízal, Ph.D. Přírodovědecká fakulta MU Ústav experimentální
Mendelistická genetika
Mendelistická genetika Základní pracovní metodou je křížení křížení = vzájemné oplozování organizmů s různými genotypy Základní pojmy Gen úsek DNA se specifickou funkcí. Strukturní gen úsek DNA nesoucí
BIO: Genetika. Mgr. Zbyněk Houdek
BIO: Genetika Mgr. Zbyněk Houdek Nukleové kyseliny Nukleové kyseliny = DNA, RNA - nositelky dědičné informace. Přenos dědičných znaků na potomstvo. Kódují bílkoviny. Nukleotidy - základní stavební jednotky.
Část. Molekulární biologie a imunologie. Základy dědičnosti. Struktura nukleových kyselin
Část Molekulární biologie a imunologie 6. Základy dědičnosti Mendelovská dědičnost (autozomálně recesivní, autozomálně dominantní a X-vázaný přenos mutací). Nemendelovská dědičnost (uniparentální disomie,
Tematické okruhy k SZZ v bakalářském studijním oboru Zdravotní laborant bakalářského studijního programu B5345 Specializace ve zdravotnictví
Tematické okruhy k SZZ v bakalářském studijním oboru Zdravotní laborant bakalářského studijního programu B5345 Specializace ve zdravotnictví Dle čl. 7 odst. 2 Směrnice děkana pro realizaci bakalářských
Genetické metody v zoologii
Genetické metody v zoologii M. Macholán J. Bryja M. Vyskočilová Sylabus 1. Analýza fenotypu (signální fenotypy, epigenetické znaky, kvantitativní znaky, analýza landmarků) MM 2. Cytogenetika (analýza karyotypu,
Genetická diverzita masného skotu v ČR
Genetická diverzita masného skotu v ČR Mgr. Jan Říha Výzkumný ústav pro chov skotu, s.r.o. Ing. Irena Vrtková 26. listopadu 2009 Genetická diverzita skotu pojem diverzity Genom skotu 30 chromozomu, genetická
MOLEKULÁRNÍ TAXONOMIE - 4
MOLEKULÁRNÍ TAXONOMIE - 4 V této přednášce si představíme metody, které získávají molekulární znaky bez použití sekvenace. Všechny tyto metody je teoreticky možné sekvenací nahradit. Oproti sekvenaci celých
Jiří Drábek Katedra biochemie PřF UP
Náčrt předmp edmětu FOC: Forenzní chemie Jiří Drábek Katedra biochemie PřF UP 13.11.2006 Forum Starořímské místo setkání kupců, politiků, učenců a občanů k projednání právních věcí. Forenzní týkající se
Crossing-over. Synaptonemální komplex. Crossing-over a výměna genetického materiálu. Párování homologních chromosomů
Vazba genů Crossing-over V průběhu profáze I meiózy Princip rekombinace genetického materiálu mezi maternálním a paternálním chromosomem Synaptonemální komplex Zlomy a nová spojení chromatinových řetězců
MOLEKULÁRNÍ BIOLOGIE. 2. Polymerázová řetězová reakce (PCR)
MOLEKULÁRNÍ BIOLOGIE 2. Polymerázová řetězová reakce (PCR) Náplň praktik 1. Izolace DNA z buněk bukální sliznice - izolační kit MACHEREY-NAGEL 2. PCR polymerázová řetězová reakce (templát gdna) 3. Restrikční
Implementace laboratorní medicíny do systému vzdělávání na Univerzitě Palackého v Olomouci. reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/
Implementace laboratorní medicíny do systému vzdělávání na Univerzitě Palackého v Olomouci reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/28.0088 Hybridizační metody v diagnostice Mgr. Gabriela Kořínková, Ph.D. Laboratoř molekulární
Genetické markery - princip a využití
Genetika a šlechtění lesních dřevin Genetické markery - princip a využití Doc. Ing. RNDr. Eva Palátová, PhD. Ing. R. Longauer, CSc. Ústav zakládání a pěstění lesů LDF MENDELU Brno Tento projekt je spolufinancován
Seminář izolačních technologií
Seminář izolačních technologií Zpracoval: Karel Bílek a Kateřina Svobodová Podpořeno FRVŠ 2385/2007 a 1305/2009 Úpravy a aktualizace: Pavla Chalupová ÚMFGZ MZLU v Brně 1 Lokalizace jaderné DNA 2 http://www.paternityexperts.com/basicgenetics.html
Mendelova zemědělská a lesnická univerzita v Brně Agronomická fakulta Ústav morfologie, fyziologie a genetiky zvířat
Mendelova zemědělská a lesnická univerzita v Brně Agronomická fakulta Ústav morfologie, fyziologie a genetiky zvířat Genetické markery ve studiu genetické diverzity v populacích hospodářských zvířat Bakalářská
polymorfní = vícetvarý, mnohotvárný
Genetický polymorfismus s Řeckyy morphos = tvar polymorfní = vícetvarý, mnohotvárný Genetický polymorfismus je tedy označení pro výskyt téhož znaku ve více tvarech, formách, přičemž tato mnohotvárnost
Výukový materiál zpracován v rámci projektu EU peníze školám
http://vtm.zive.cz/aktuality/vzorek-dna-prozradi-priblizny-vek-pachatele Autorem materiálu a všech jeho částí, není-li uvedeno jinak, je Mgr. Eva Strnadová. Dostupné z Metodického portálu www.rvp.cz ;
Genotypování markerů užitkovosti a zdraví u skotu
Mezinárodní odborný seminář Využití chovatelských dat onemocnění skotu pro management stád, šlechtění a pro racionální užívání antimikrobik. Genotypování markerů užitkovosti a zdraví u skotu Jitka Kyseľová
Polymorfismus délky restrikčních fragmentů
Polymorfismus délky restrikčních fragmentů Princip: Chemikálie: PCR produkt z předchozího praktického cvičení Endonukleáza KpnI 10 U μl -1 Pufr pro KpnI 10 koncentrovaný (Tris-HCl 100 mmol l -1 ph 7,5,
KVANTIFIKACE ZMĚN GENOVÉ EXPRESE
KVANTIFIKACE ZMĚN GENOVÉ EXPRESE Northern bloty pracné a zdlouhavé Genové čipy nákladné; http://www.molbio.upol.cz/ Semikvantitativní RT-PCR qpcr nepřesné metodiky real-time PCR vysoké dynamické rozpětí
Inovace studia molekulární a buněčné biologie
Inovace studia molekulární a buněčné biologie I n v e s t i c e d o r o z v o j e v z d ě l á v á n í reg. č. CZ.1.07/2.2.00/07.0354 Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním
Obr. 1. Struktura glukosaminu.
3. Stanovení glukosaminu ve výživových doplňcích pomocí kapilární elektroforézy Glukosamin (2-amino-2-deoxyglukózamonosacharid je široce distribuován ve tkáních lidského organismu jako složka je klíčovou
Chromosomy a karyotyp člověka
Chromosomy a karyotyp člověka Chromosom - 1 a více - u eukaryotických buněk uložen v jádře karyotyp - soubor všech chromosomů v jádře jedné buňky - tvořen z vláknem chromatinem = DNA + histony - malé bazické
Základní škola a Mateřská škola G.A.Lindnera Rožďalovice. Za vše mohou geny
Základní škola a Mateřská škola G.A.Lindnera Rožďalovice Za vše mohou geny Jméno a příjmení: Sandra Diblíčková Třída: 9.A Školní rok: 2009/2010 Garant / konzultant: Mgr. Kamila Sklenářová Datum 31.05.2010
Sure-MeDIP I. with magnetic beads and MNase. www.krd.cz
Sure-MeDIP I with magnetic beads and MNase www.krd.cz 1 Obsah soupravy a skladování MeDIP souprava obsahuje reagencie na provedení 25 reakcí. Souprava je rozdělen do dvou částí, jedna je distribuována
Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti. Translace, techniky práce s DNA
Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti Translace, techniky práce s DNA Translace překlad z jazyka nukleotidů do jazyka aminokyselin dá se rozdělit na 5 kroků aktivace aminokyslin
Využití kapilární elektroforézy v rámci forenzních molekulárně genetických zkoumání
Bakalářská práce Využití kapilární elektroforézy v rámci forenzních molekulárně genetických zkoumání Application of Capillary Electrophoresis in Forensic Molecular Genetic Investigation ANNA GRAFNETTEROVÁ
1. Téma : Genetika shrnutí Název DUMu : VY_32_INOVACE_29_SPSOA_BIO_1_CHAM 2. Vypracovala : Hana Chamulová 3. Vytvořeno v projektu EU peníze středním
1. Téma : Genetika shrnutí Název DUMu : VY_32_INOVACE_29_SPSOA_BIO_1_CHAM 2. Vypracovala : Hana Chamulová 3. Vytvořeno v projektu EU peníze středním školám Genetika - shrnutí TL2 1. Doplň: heterozygot,
Mikrosatelity (STR, SSR, VNTR)
Mikrosatelity (STR, SSR, VNTR) Repeats Více než polovina našeho genomu Interspersed (transposony) Tandem (mini- a mikrosatelity) Minisatellites (longer motifs 10 100 nucleotides) mikrosatelity Tandemová
Kvantitativní detekce houbových patogenů v rostlinných pletivech s využitím metod molekulární biologie
Kvantitativní detekce houbových patogenů v rostlinných pletivech s využitím metod molekulární biologie Leona Leišová Přírodovědecká fakulta UK, Praha 2009 Metody kvantifikace: Nepřímé metody odhad míry
Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a Státním rozpočtem ČR InoBio CZ.1.07/2.2.00/
Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a Státním rozpočtem ČR InoBio CZ.1.07/2.2.00/28.0018 Genetické markery Genetické markery = znaky, které informují o genotypu - vhodné jsou znaky,
Biofyzikální ústav AV ČR, Laboratoř molekulární epigenetiky, Královopolská 135, 612 65 Brno, tel.: 541 517 230, e-mail: matyasek@ibp.
BIOLOGICKÉ LISTY 68 (3): 207-211, 2003 Způsoby detekce polymorfismu homologních DNA a jejich využití při studiu změn ve struktuře rodičovských genomů u modelových allotetraploidních druhů rodu Nicotiana
Metody studia historie populací. Metody studia historie populací. 1) Metody studiagenetickérozmanitosti komplexní fenotypové znaky, molekulární znaky.
1) Metody studiagenetickérozmanitosti komplexní fenotypové znaky, molekulární znaky. 2)Mechanizmy evoluce mutace, p írodnívýb r, genový posun a genový tok 3) Anagenezex kladogeneze-co je vlastn druh 4)Dva
Yi TPMT. Diagnostická souprava. Návod k použití. Haasova 27 Brno Česká republika. tel.:
Yi TPMT Diagnostická souprava Návod k použití Výrobce: YBUX s.r.o. Haasova 27 Brno 616 00 Česká republika IČ 63487951 tel.: +420 541 423 710 e-mail: ybux@ybux.eu Název: Yi TPMT Popis: Diagnostická souprava
Referenční lidský genom. Rozdíly v genomové DNA v lidské populaci. Odchylky od referenčního genomu. Referenční lidský genom.
Referenční lidský genom Rozdíly v genomové DNA v lidské populaci Zdroj DNA: 60% sekvencí pochází ze sekvenování DNA od jednoho dárce (sekvenování a sestavování BAC klonů) některá místa genomu se nepodařilo
Genetický polymorfismus
Genetický polymorfismus Řecky morphos = tvar polymorfní = vícetvarý, mnohotvárný Genetický polymorfismus je tedy označení pro výskyt téhož znaku ve více tvarech, formách, přičemž tato mnohotvárnost je
Návrh směrnic pro správnou laboratorní diagnostiku Friedreichovy ataxie.
Návrh směrnic pro správnou laboratorní diagnostiku Friedreichovy ataxie. Připravila L.Fajkusová Online Mendelian Inheritance in Man: #229300 FRIEDREICH ATAXIA 1; FRDA *606829 FRDA GENE; FRDA Popis onemocnění
Využití DNA markerů ve studiu fylogeneze rostlin
Mendelova genetika v příkladech Využití DNA markerů ve studiu fylogeneze rostlin Ing. Petra VESELÁ Ústav lesnické botaniky, dendrologie a geobiocenologie LDF MENDELU Brno Tento projekt je spolufinancován
3) Analýza mtdna mitochondriální Eva, kdy a kde žila. 8) Haploskupiny mtdna a chromozomu Y v ČR
p 1) Jak to, že máme společného předka 2) Metodika výzkumu mtdna 3) Analýza mtdna mitochondriální Eva, kdy a kde žila 4) Problémy a názory proti 5) Analýza chromozomu Y 6) Jak jsme osídlili svět podle
Bi5130 Základy práce s lidskou adna
Bi5130 Základy práce s lidskou adna Mgr. et Mgr. Kristýna Brzobohatá pizova@sci.muni.cz Laboratoř biologické a molekulární antropologie, ÚEB, PřF, Mu Bi5130 Základy práce s lidskou adna PCR polymerase
Aplikace elektromigračních technik
Aplikace elektromigračních technik Capillary electrophoresis D.L.Barker High Performance Capillary electrophoresis M.G. Khaledi Analysis and detection by capillary electrophoresis M.L.Marina (ed.) Electrophoresis
Izolace genomové DNA ze savčích buněk, stanovení koncentrace DNA pomocí absorpční spektrofotometrie
Izolace genomové DNA ze savčích buněk, stanovení koncentrace DNA pomocí absorpční spektrofotometrie IZOLACE GENOMOVÉ DNA Deoxyribonukleová kyselina (DNA) představuje základní genetický materiál většiny
UTILIZATION OF DNA MICROSATELLITES USED IN PARENTITY PANEL IN EVALUATION OF DIVERZITY AND DISTANCES BETWEEN THE BREEDS OF PIGS IN CZECH REPUBLIC
UTILIZATION OF DNA MICROSATELLITES USED IN PARENTITY PANEL IN EVALUATION OF DIVERZITY AND DISTANCES BETWEEN THE BREEDS OF PIGS IN CZECH REPUBLIC VYUŽITÍ DNA MIKROSATELITŮ POUŽÍVANÝCH V PANELU NA URČOVÁNÍ